Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9RBK4

Protein Details
Accession A0A1J9RBK4    Localization Confidence High Confidence Score 21.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MSKSEKSSKKSKKEKPEGAVAADHydrophilic
32-90VDDGEKKRWKVERKEKKERKKQEKKEKKEKKASKEKKEPKENKYKKGKQERLEKREAREBasic
117-142SKPADEPKPEKSKKRKHEETSDEPAEBasic
144-166DVQQASKKEKKQKKAKTSSEPAEHydrophilic
286-335GAKSEARKEKLKNKNERLNEQRKRRAETEAKEKVRADKKAKRGPGKGANABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-15SSKKSKKEK
37-98KKRWKVERKEKKERKKQEKKEKKEKKASKEKKEPKENKYKKGKQERLEKREARERAKLGAAR
121-132DEPKPEKSKKRK
150-159KKEKKQKKAK
287-332AKSEARKEKLKNKNERLNEQRKRRAETEAKEKVRADKKAKRGPGKG
Subcellular Location(s) nucl 16.5, mito_nucl 11.5, mito 5.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MSKSEKSSKKSKKEKPEGAVAADAAAAVVAAVDDGEKKRWKVERKEKKERKKQEKKEKKEKKASKEKKEPKENKYKKGKQERLEKREARERAKLGAARNQLPKVEADHAPTSVPTPSKPADEPKPEKSKKRKHEETSDEPAEGDVQQASKKEKKQKKAKTSSEPAESTESAESTESAESAESAESDAQPVPEGDDKSATRFIVFIGNLPYTATKESVAKHFAKLSPTSIRAPMTNDNKKSKGFAFLEFDRYDHMKSCLKLYHHSSFDDGKSAARKINVELTVGGGGAKSEARKEKLKNKNERLNEQRKRRAETEAKEKVRADKKAKRGPGKGANAQPVGDQGPPQYDGANDEAASADNGGIHPARLAMMRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.92
2 0.87
3 0.87
4 0.8
5 0.73
6 0.65
7 0.53
8 0.42
9 0.32
10 0.25
11 0.14
12 0.09
13 0.05
14 0.03
15 0.03
16 0.02
17 0.02
18 0.02
19 0.03
20 0.06
21 0.08
22 0.15
23 0.2
24 0.21
25 0.29
26 0.38
27 0.47
28 0.56
29 0.65
30 0.71
31 0.77
32 0.87
33 0.91
34 0.94
35 0.95
36 0.95
37 0.95
38 0.95
39 0.95
40 0.95
41 0.96
42 0.96
43 0.96
44 0.96
45 0.95
46 0.95
47 0.94
48 0.93
49 0.93
50 0.93
51 0.93
52 0.93
53 0.92
54 0.92
55 0.94
56 0.92
57 0.9
58 0.91
59 0.89
60 0.88
61 0.89
62 0.88
63 0.87
64 0.89
65 0.88
66 0.85
67 0.87
68 0.88
69 0.85
70 0.87
71 0.81
72 0.77
73 0.77
74 0.76
75 0.71
76 0.68
77 0.61
78 0.54
79 0.56
80 0.52
81 0.46
82 0.47
83 0.46
84 0.44
85 0.47
86 0.45
87 0.4
88 0.37
89 0.34
90 0.3
91 0.29
92 0.24
93 0.24
94 0.23
95 0.23
96 0.22
97 0.21
98 0.19
99 0.17
100 0.17
101 0.12
102 0.15
103 0.16
104 0.19
105 0.21
106 0.27
107 0.32
108 0.41
109 0.46
110 0.5
111 0.6
112 0.62
113 0.7
114 0.74
115 0.77
116 0.77
117 0.82
118 0.84
119 0.81
120 0.86
121 0.84
122 0.82
123 0.8
124 0.71
125 0.61
126 0.5
127 0.42
128 0.33
129 0.24
130 0.16
131 0.08
132 0.07
133 0.08
134 0.1
135 0.15
136 0.2
137 0.27
138 0.37
139 0.44
140 0.54
141 0.63
142 0.72
143 0.78
144 0.83
145 0.85
146 0.84
147 0.85
148 0.8
149 0.75
150 0.65
151 0.56
152 0.49
153 0.4
154 0.32
155 0.24
156 0.19
157 0.13
158 0.12
159 0.1
160 0.08
161 0.07
162 0.06
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.04
169 0.04
170 0.05
171 0.04
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.06
176 0.06
177 0.07
178 0.09
179 0.1
180 0.09
181 0.12
182 0.13
183 0.15
184 0.17
185 0.15
186 0.12
187 0.12
188 0.12
189 0.13
190 0.13
191 0.12
192 0.13
193 0.13
194 0.13
195 0.13
196 0.13
197 0.1
198 0.11
199 0.1
200 0.08
201 0.1
202 0.12
203 0.15
204 0.2
205 0.2
206 0.2
207 0.23
208 0.25
209 0.26
210 0.25
211 0.26
212 0.25
213 0.27
214 0.28
215 0.27
216 0.26
217 0.23
218 0.26
219 0.3
220 0.35
221 0.4
222 0.44
223 0.48
224 0.49
225 0.49
226 0.48
227 0.41
228 0.4
229 0.34
230 0.32
231 0.32
232 0.32
233 0.37
234 0.34
235 0.33
236 0.27
237 0.27
238 0.24
239 0.2
240 0.22
241 0.2
242 0.21
243 0.25
244 0.26
245 0.27
246 0.32
247 0.37
248 0.41
249 0.38
250 0.39
251 0.38
252 0.37
253 0.35
254 0.33
255 0.26
256 0.22
257 0.23
258 0.24
259 0.23
260 0.21
261 0.22
262 0.21
263 0.28
264 0.26
265 0.24
266 0.22
267 0.21
268 0.19
269 0.18
270 0.15
271 0.08
272 0.07
273 0.06
274 0.08
275 0.07
276 0.12
277 0.18
278 0.22
279 0.3
280 0.37
281 0.47
282 0.56
283 0.65
284 0.71
285 0.76
286 0.81
287 0.82
288 0.85
289 0.85
290 0.86
291 0.86
292 0.85
293 0.85
294 0.82
295 0.81
296 0.74
297 0.73
298 0.71
299 0.7
300 0.7
301 0.71
302 0.68
303 0.66
304 0.65
305 0.65
306 0.64
307 0.65
308 0.64
309 0.62
310 0.69
311 0.74
312 0.81
313 0.81
314 0.79
315 0.8
316 0.8
317 0.8
318 0.78
319 0.75
320 0.74
321 0.65
322 0.59
323 0.5
324 0.42
325 0.36
326 0.28
327 0.22
328 0.16
329 0.18
330 0.19
331 0.19
332 0.17
333 0.15
334 0.17
335 0.19
336 0.19
337 0.16
338 0.14
339 0.14
340 0.14
341 0.14
342 0.12
343 0.09
344 0.08
345 0.08
346 0.11
347 0.11
348 0.1
349 0.1
350 0.1
351 0.11