Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9QWP3

Protein Details
Accession A0A1J9QWP3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
358-380REEEALKRKKLERKQMLERMNSQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
181-251EKPPVGAIKHKPLEKLTKKEKLALQEKNKQAAAAAKDPKLALKQGLKPGLKGPAKGVDAKAGEAVKEKKKA
364-385KRKKLERKQMLERMNSQAKKKR
Subcellular Location(s) mito 18.5, mito_nucl 13.5, nucl 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MSFLNSVLSSIGGGAGQSQSQSGRAAPSQAPVTKPTQTPRVGGPSNGVSSTTAPKRKAEGEPASVPAKAVRRDLDPSRSNPVSRTSTASPVVKPATPASSSSMPYRGTAQPSGSAVARKPTTYASVAKSGPSTNAAAAKPVPKPVTKPAPAVSAAPAASGPAPKKGSYQEILARAKAAQQEKPPVGAIKHKPLEKLTKKEKLALQEKNKQAAAAAKDPKLALKQGLKPGLKGPAKGVDAKAGEAVKEKKKAPDLGYQGTMRGTMRPAAKEPAYQGTMHKGAAAARRPGLDRGDRSRSGSLGPRPMEKRYRYYEDDDEEEEENYDSEGSSDMEAGIFDVDQEEQMSLRVARKEDEEALREEEALKRKKLERKQMLERMNSQAKKKRAY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.07
3 0.08
4 0.08
5 0.09
6 0.1
7 0.11
8 0.13
9 0.13
10 0.16
11 0.17
12 0.21
13 0.21
14 0.25
15 0.3
16 0.32
17 0.33
18 0.33
19 0.36
20 0.37
21 0.41
22 0.42
23 0.44
24 0.43
25 0.44
26 0.45
27 0.5
28 0.46
29 0.42
30 0.41
31 0.36
32 0.36
33 0.34
34 0.29
35 0.21
36 0.22
37 0.29
38 0.33
39 0.35
40 0.35
41 0.37
42 0.41
43 0.45
44 0.48
45 0.5
46 0.48
47 0.49
48 0.49
49 0.51
50 0.48
51 0.42
52 0.37
53 0.31
54 0.31
55 0.27
56 0.28
57 0.27
58 0.28
59 0.35
60 0.4
61 0.45
62 0.44
63 0.45
64 0.49
65 0.5
66 0.47
67 0.43
68 0.44
69 0.4
70 0.37
71 0.39
72 0.34
73 0.36
74 0.4
75 0.41
76 0.34
77 0.34
78 0.34
79 0.29
80 0.28
81 0.25
82 0.24
83 0.22
84 0.23
85 0.23
86 0.24
87 0.25
88 0.26
89 0.27
90 0.24
91 0.24
92 0.27
93 0.26
94 0.26
95 0.27
96 0.25
97 0.24
98 0.24
99 0.25
100 0.21
101 0.2
102 0.17
103 0.21
104 0.21
105 0.18
106 0.19
107 0.19
108 0.21
109 0.22
110 0.25
111 0.22
112 0.26
113 0.26
114 0.26
115 0.25
116 0.23
117 0.2
118 0.19
119 0.17
120 0.13
121 0.17
122 0.16
123 0.16
124 0.18
125 0.21
126 0.2
127 0.23
128 0.25
129 0.21
130 0.25
131 0.31
132 0.39
133 0.37
134 0.39
135 0.36
136 0.37
137 0.37
138 0.34
139 0.28
140 0.21
141 0.18
142 0.15
143 0.13
144 0.1
145 0.09
146 0.11
147 0.1
148 0.13
149 0.15
150 0.15
151 0.17
152 0.19
153 0.23
154 0.21
155 0.24
156 0.24
157 0.3
158 0.31
159 0.29
160 0.27
161 0.23
162 0.24
163 0.26
164 0.24
165 0.2
166 0.22
167 0.28
168 0.28
169 0.28
170 0.27
171 0.23
172 0.22
173 0.26
174 0.26
175 0.28
176 0.32
177 0.33
178 0.34
179 0.35
180 0.45
181 0.44
182 0.49
183 0.49
184 0.53
185 0.52
186 0.56
187 0.55
188 0.53
189 0.55
190 0.55
191 0.54
192 0.55
193 0.57
194 0.56
195 0.53
196 0.44
197 0.37
198 0.33
199 0.28
200 0.27
201 0.28
202 0.25
203 0.26
204 0.27
205 0.27
206 0.24
207 0.21
208 0.18
209 0.2
210 0.25
211 0.29
212 0.37
213 0.36
214 0.35
215 0.37
216 0.42
217 0.37
218 0.33
219 0.29
220 0.27
221 0.28
222 0.3
223 0.28
224 0.24
225 0.23
226 0.22
227 0.23
228 0.17
229 0.16
230 0.18
231 0.24
232 0.24
233 0.29
234 0.3
235 0.32
236 0.37
237 0.43
238 0.42
239 0.44
240 0.45
241 0.44
242 0.46
243 0.41
244 0.37
245 0.31
246 0.29
247 0.21
248 0.16
249 0.14
250 0.14
251 0.17
252 0.19
253 0.21
254 0.24
255 0.25
256 0.25
257 0.27
258 0.27
259 0.26
260 0.25
261 0.23
262 0.24
263 0.25
264 0.23
265 0.21
266 0.16
267 0.18
268 0.24
269 0.27
270 0.24
271 0.24
272 0.27
273 0.28
274 0.3
275 0.32
276 0.32
277 0.33
278 0.37
279 0.43
280 0.43
281 0.46
282 0.44
283 0.4
284 0.37
285 0.39
286 0.37
287 0.38
288 0.38
289 0.41
290 0.43
291 0.49
292 0.54
293 0.52
294 0.54
295 0.53
296 0.59
297 0.57
298 0.6
299 0.6
300 0.55
301 0.54
302 0.48
303 0.43
304 0.37
305 0.32
306 0.26
307 0.2
308 0.15
309 0.12
310 0.1
311 0.07
312 0.06
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.06
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.06
326 0.06
327 0.07
328 0.07
329 0.06
330 0.07
331 0.09
332 0.11
333 0.15
334 0.19
335 0.2
336 0.22
337 0.25
338 0.29
339 0.33
340 0.37
341 0.36
342 0.35
343 0.37
344 0.36
345 0.33
346 0.3
347 0.3
348 0.33
349 0.37
350 0.37
351 0.4
352 0.48
353 0.57
354 0.65
355 0.7
356 0.72
357 0.75
358 0.83
359 0.86
360 0.86
361 0.83
362 0.79
363 0.77
364 0.76
365 0.72
366 0.7
367 0.69