Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9QXP8

Protein Details
Accession A0A1J9QXP8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-62VPPSRFPSLHLHKKRRSPRKKEREEKGTRANQLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
41-58HKKRRSPRKKEREEKGTR
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12.5, cyto 6, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR047575  Sm  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
IPR016654  U6_snRNA_Lsm2  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS52002  SM  
CDD cd01725  LSm2  
Amino Acid Sequences MPPSHPREQPACLPARPPTLPPHDAPLLQVPPSRFPSLHLHKKRRSPRKKEREEKGTRANQLEGGRARVRTLSLSLLSSFFKTLVDHEVTVELKNDISIRGTLKSVDQFLNIKLDDIHVVEELKYPHLSSVKNVFIRGSVVRYVHLPGAAVDTALLEDATRREAAQAAAKAKQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.48
3 0.44
4 0.4
5 0.41
6 0.43
7 0.45
8 0.43
9 0.44
10 0.4
11 0.38
12 0.38
13 0.37
14 0.31
15 0.29
16 0.31
17 0.26
18 0.29
19 0.33
20 0.34
21 0.27
22 0.28
23 0.37
24 0.44
25 0.53
26 0.58
27 0.63
28 0.67
29 0.77
30 0.84
31 0.85
32 0.86
33 0.86
34 0.88
35 0.89
36 0.93
37 0.93
38 0.92
39 0.92
40 0.9
41 0.86
42 0.85
43 0.8
44 0.73
45 0.65
46 0.56
47 0.5
48 0.42
49 0.4
50 0.31
51 0.29
52 0.26
53 0.24
54 0.24
55 0.19
56 0.19
57 0.15
58 0.15
59 0.12
60 0.11
61 0.12
62 0.12
63 0.12
64 0.12
65 0.11
66 0.1
67 0.08
68 0.08
69 0.07
70 0.08
71 0.1
72 0.11
73 0.1
74 0.1
75 0.12
76 0.12
77 0.12
78 0.12
79 0.08
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.06
84 0.06
85 0.07
86 0.08
87 0.09
88 0.1
89 0.1
90 0.11
91 0.12
92 0.14
93 0.13
94 0.14
95 0.14
96 0.14
97 0.18
98 0.16
99 0.15
100 0.12
101 0.13
102 0.12
103 0.11
104 0.11
105 0.08
106 0.09
107 0.09
108 0.11
109 0.11
110 0.12
111 0.12
112 0.11
113 0.14
114 0.17
115 0.17
116 0.18
117 0.25
118 0.29
119 0.31
120 0.31
121 0.29
122 0.26
123 0.29
124 0.26
125 0.22
126 0.18
127 0.17
128 0.18
129 0.19
130 0.2
131 0.18
132 0.17
133 0.14
134 0.11
135 0.15
136 0.14
137 0.12
138 0.1
139 0.09
140 0.09
141 0.08
142 0.08
143 0.04
144 0.06
145 0.07
146 0.09
147 0.1
148 0.1
149 0.11
150 0.13
151 0.16
152 0.22
153 0.26