Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9R512

Protein Details
Accession A0A1J9R512    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
95-117DTGIYVFRKQQRRKRPGHDDDLIHydrophilic
324-349VTVPGPSKKPAKIKRSKSRAGTAPTSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
330-343SKKPAKIKRSKSRA
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 5.5, cyto_mito 3.5, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences MAQIQETPLDERQWRSPVALNNLQYFGGLHSKTVHLYFMESDFFDRTSNNWALFMQHKGEPWLTDRDQFELRLRAMQGLEFMVAAEPERRPDGSDTGIYVFRKQQRRKRPGHDDDLIVLGTYYLIGENIYQAASLEDIIGNKILAATTSLSKFFAIASSLPIYTSGRGYTYYPSSTSVKQTNASANASRRSSRAGSPTGESSSAIDMNDGPASSQNQPGDIQQSQKAKNTNAAAAATSMHALTQSFHLFNQYKDEFMDTNPIIGEPGSFHFSATARHIQQTQTKQAEAAAAAAAKLSNAGAADGTKTDSKPGTPALAASPDISVTVPGPSKKPAKIKRSKSRAGTAPTSPATPTAGATPGKAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.35
3 0.38
4 0.41
5 0.46
6 0.5
7 0.47
8 0.46
9 0.46
10 0.43
11 0.37
12 0.3
13 0.24
14 0.24
15 0.2
16 0.18
17 0.19
18 0.21
19 0.23
20 0.23
21 0.22
22 0.15
23 0.17
24 0.18
25 0.17
26 0.18
27 0.16
28 0.17
29 0.17
30 0.17
31 0.15
32 0.14
33 0.13
34 0.19
35 0.22
36 0.2
37 0.2
38 0.19
39 0.22
40 0.25
41 0.26
42 0.23
43 0.22
44 0.22
45 0.25
46 0.26
47 0.24
48 0.25
49 0.29
50 0.28
51 0.31
52 0.31
53 0.32
54 0.32
55 0.33
56 0.34
57 0.31
58 0.3
59 0.29
60 0.29
61 0.27
62 0.26
63 0.24
64 0.2
65 0.15
66 0.15
67 0.1
68 0.1
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.08
73 0.08
74 0.1
75 0.12
76 0.12
77 0.14
78 0.17
79 0.19
80 0.2
81 0.2
82 0.2
83 0.2
84 0.24
85 0.22
86 0.22
87 0.25
88 0.3
89 0.39
90 0.47
91 0.54
92 0.61
93 0.71
94 0.78
95 0.82
96 0.86
97 0.84
98 0.83
99 0.78
100 0.68
101 0.59
102 0.51
103 0.41
104 0.29
105 0.21
106 0.12
107 0.08
108 0.06
109 0.04
110 0.03
111 0.03
112 0.03
113 0.03
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.06
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.04
131 0.04
132 0.05
133 0.05
134 0.07
135 0.08
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.08
141 0.08
142 0.07
143 0.07
144 0.08
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.1
149 0.1
150 0.09
151 0.1
152 0.08
153 0.07
154 0.09
155 0.1
156 0.11
157 0.13
158 0.13
159 0.13
160 0.15
161 0.17
162 0.18
163 0.21
164 0.22
165 0.21
166 0.21
167 0.22
168 0.22
169 0.22
170 0.23
171 0.22
172 0.22
173 0.24
174 0.25
175 0.24
176 0.21
177 0.23
178 0.23
179 0.22
180 0.24
181 0.23
182 0.23
183 0.24
184 0.25
185 0.23
186 0.21
187 0.18
188 0.15
189 0.13
190 0.12
191 0.1
192 0.08
193 0.07
194 0.08
195 0.08
196 0.07
197 0.06
198 0.06
199 0.09
200 0.1
201 0.14
202 0.13
203 0.14
204 0.15
205 0.15
206 0.19
207 0.17
208 0.19
209 0.2
210 0.27
211 0.28
212 0.31
213 0.34
214 0.3
215 0.35
216 0.34
217 0.3
218 0.26
219 0.24
220 0.2
221 0.17
222 0.16
223 0.11
224 0.09
225 0.07
226 0.06
227 0.05
228 0.05
229 0.06
230 0.08
231 0.1
232 0.1
233 0.1
234 0.17
235 0.18
236 0.18
237 0.26
238 0.23
239 0.22
240 0.22
241 0.24
242 0.18
243 0.18
244 0.25
245 0.17
246 0.17
247 0.17
248 0.16
249 0.14
250 0.13
251 0.12
252 0.06
253 0.09
254 0.11
255 0.11
256 0.11
257 0.13
258 0.13
259 0.16
260 0.19
261 0.24
262 0.23
263 0.25
264 0.27
265 0.29
266 0.37
267 0.41
268 0.45
269 0.41
270 0.4
271 0.38
272 0.37
273 0.35
274 0.27
275 0.21
276 0.12
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.08
281 0.06
282 0.06
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.06
289 0.07
290 0.07
291 0.1
292 0.12
293 0.12
294 0.15
295 0.16
296 0.17
297 0.19
298 0.21
299 0.21
300 0.19
301 0.2
302 0.2
303 0.21
304 0.21
305 0.19
306 0.17
307 0.13
308 0.14
309 0.13
310 0.11
311 0.08
312 0.12
313 0.15
314 0.17
315 0.19
316 0.26
317 0.32
318 0.38
319 0.48
320 0.54
321 0.62
322 0.7
323 0.79
324 0.83
325 0.87
326 0.89
327 0.86
328 0.86
329 0.83
330 0.8
331 0.75
332 0.68
333 0.65
334 0.58
335 0.51
336 0.43
337 0.36
338 0.31
339 0.25
340 0.22
341 0.17
342 0.21
343 0.2