Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9SAQ6

Protein Details
Accession A0A1J9SAQ6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
386-409EDNGRGAGAKKKRRKDFAAGSPLGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
391-400GAGAKKKRRK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 10.5, mito 7, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013942  Mediator_Med19_fun  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF08633  Rox3  
Amino Acid Sequences MSVDSPQKRQRQTGSFSPASPPYHLAAKTAGSAKTTLHQQPDTPTSPPYMSSTTPPHSHASTASLSTASAQALTPPSSANMSQASQPNTTNSFPTPASSAGTASFAFKPDDCDVRMTDDRMEGVAHTAARDVEMGNDGDHRHTGHDRTGTGSSASGVGPDLRLQSGSGPFYKLSETPYPMSRPHVSQDLVALYGLNRITQSVARFDPKTGEKINKLRKSYESHVKDFKISGGKSRPEAAPGQLMGLLHFPDEEYYLQRVRGNEMESAQQRILAKLNGGTLKMNPGKLSKDEDNKWKTRIGTDEAPAAKRPAADMLDGPGKKLKPGQVMQGRNSATSSPAMRPSPATKAAIRPDRAGKKRSYLDSSFKGYGEGFGDDDGVGESTGGEDNGRGAGAKKKRRKDFAAGSPLGFDERRHNVGMVGVRH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.66
3 0.62
4 0.59
5 0.56
6 0.51
7 0.46
8 0.39
9 0.32
10 0.36
11 0.35
12 0.31
13 0.27
14 0.26
15 0.27
16 0.29
17 0.28
18 0.23
19 0.23
20 0.23
21 0.25
22 0.31
23 0.32
24 0.34
25 0.34
26 0.35
27 0.41
28 0.47
29 0.45
30 0.4
31 0.36
32 0.33
33 0.32
34 0.31
35 0.29
36 0.26
37 0.24
38 0.28
39 0.33
40 0.35
41 0.37
42 0.38
43 0.38
44 0.35
45 0.35
46 0.31
47 0.28
48 0.25
49 0.23
50 0.21
51 0.18
52 0.16
53 0.16
54 0.16
55 0.11
56 0.1
57 0.08
58 0.1
59 0.13
60 0.14
61 0.13
62 0.13
63 0.14
64 0.15
65 0.16
66 0.15
67 0.16
68 0.15
69 0.2
70 0.25
71 0.27
72 0.27
73 0.28
74 0.29
75 0.3
76 0.3
77 0.28
78 0.24
79 0.24
80 0.22
81 0.22
82 0.21
83 0.18
84 0.18
85 0.16
86 0.16
87 0.13
88 0.14
89 0.13
90 0.14
91 0.13
92 0.13
93 0.14
94 0.14
95 0.18
96 0.19
97 0.23
98 0.21
99 0.23
100 0.22
101 0.27
102 0.29
103 0.25
104 0.24
105 0.21
106 0.21
107 0.19
108 0.18
109 0.11
110 0.11
111 0.11
112 0.1
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.07
119 0.06
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.1
124 0.1
125 0.11
126 0.11
127 0.11
128 0.12
129 0.15
130 0.16
131 0.19
132 0.21
133 0.21
134 0.23
135 0.24
136 0.21
137 0.19
138 0.17
139 0.13
140 0.12
141 0.11
142 0.08
143 0.07
144 0.07
145 0.06
146 0.07
147 0.08
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.09
152 0.11
153 0.13
154 0.13
155 0.13
156 0.13
157 0.14
158 0.15
159 0.13
160 0.16
161 0.17
162 0.19
163 0.2
164 0.23
165 0.25
166 0.25
167 0.29
168 0.26
169 0.24
170 0.23
171 0.26
172 0.23
173 0.21
174 0.21
175 0.17
176 0.15
177 0.14
178 0.11
179 0.07
180 0.09
181 0.08
182 0.07
183 0.06
184 0.06
185 0.07
186 0.09
187 0.1
188 0.11
189 0.12
190 0.15
191 0.16
192 0.16
193 0.2
194 0.2
195 0.23
196 0.22
197 0.25
198 0.27
199 0.36
200 0.45
201 0.47
202 0.48
203 0.47
204 0.48
205 0.51
206 0.51
207 0.53
208 0.48
209 0.47
210 0.5
211 0.48
212 0.44
213 0.38
214 0.35
215 0.31
216 0.26
217 0.28
218 0.29
219 0.3
220 0.3
221 0.32
222 0.3
223 0.26
224 0.27
225 0.22
226 0.18
227 0.16
228 0.15
229 0.13
230 0.13
231 0.11
232 0.1
233 0.09
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.05
238 0.07
239 0.07
240 0.08
241 0.11
242 0.12
243 0.13
244 0.16
245 0.16
246 0.17
247 0.2
248 0.19
249 0.18
250 0.18
251 0.23
252 0.22
253 0.24
254 0.21
255 0.21
256 0.19
257 0.19
258 0.2
259 0.15
260 0.14
261 0.13
262 0.16
263 0.15
264 0.15
265 0.15
266 0.13
267 0.2
268 0.22
269 0.22
270 0.2
271 0.21
272 0.23
273 0.25
274 0.31
275 0.29
276 0.35
277 0.39
278 0.48
279 0.53
280 0.54
281 0.54
282 0.51
283 0.46
284 0.42
285 0.41
286 0.38
287 0.35
288 0.33
289 0.37
290 0.36
291 0.37
292 0.34
293 0.31
294 0.26
295 0.21
296 0.2
297 0.18
298 0.16
299 0.15
300 0.15
301 0.17
302 0.24
303 0.23
304 0.24
305 0.25
306 0.23
307 0.24
308 0.28
309 0.3
310 0.3
311 0.33
312 0.42
313 0.46
314 0.52
315 0.53
316 0.56
317 0.51
318 0.44
319 0.42
320 0.33
321 0.25
322 0.23
323 0.23
324 0.19
325 0.24
326 0.24
327 0.24
328 0.28
329 0.3
330 0.33
331 0.34
332 0.35
333 0.32
334 0.38
335 0.46
336 0.5
337 0.49
338 0.48
339 0.53
340 0.6
341 0.64
342 0.63
343 0.58
344 0.58
345 0.63
346 0.65
347 0.63
348 0.59
349 0.6
350 0.6
351 0.62
352 0.56
353 0.48
354 0.43
355 0.35
356 0.31
357 0.25
358 0.21
359 0.15
360 0.12
361 0.13
362 0.11
363 0.11
364 0.1
365 0.08
366 0.07
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.07
371 0.07
372 0.06
373 0.06
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.07
378 0.09
379 0.18
380 0.27
381 0.38
382 0.47
383 0.57
384 0.67
385 0.75
386 0.8
387 0.82
388 0.83
389 0.83
390 0.84
391 0.76
392 0.67
393 0.59
394 0.53
395 0.45
396 0.36
397 0.27
398 0.24
399 0.28
400 0.31
401 0.32
402 0.32
403 0.29
404 0.34