Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1J9S8P4

Protein Details
Accession A0A1J9S8P4    Localization Confidence High Confidence Score 20.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MPPFVPRKRSRSRSPAPASAPHydrophilic
163-183LGIKGPSKKDRQLRNWTHCMHHydrophilic
332-355TKEDPPNQKKKEIKKEKTKAEEYDBasic
1210-1235VDETPKTRSRRGVRGRGRGRGRARGRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-29RKRSRSRSPAPASAPASAPKRVK
239-256NVRGKNGKLKGKGKGKER
340-348KKKEIKKEK
459-466PTAKKSSS
875-885KAKREKEEKKR
1070-1103PPRKRPASHGRDSNRGRGRGRGRGRGRGTRSVAA
1108-1111SRRK
1215-1238KTRSRRGVRGRGRGRGRARGRGPS
Subcellular Location(s) mito 13.5, nucl 11, cyto_mito 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018327  BHD_2  
IPR004583  DNA_repair_Rad4  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR018325  Rad4/PNGase_transGLS-fold  
IPR018326  Rad4_beta-hairpin_dom1  
IPR018328  Rad4_beta-hairpin_dom3  
IPR042488  Rad4_BHD3_sf  
IPR036985  Transglutaminase-like_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF10403  BHD_1  
PF10404  BHD_2  
PF10405  BHD_3  
PF03835  Rad4  
Amino Acid Sequences MPPFVPRKRSRSRSPAPASAPASAPKRVKKNVFDALDAPSGNTSSSADKAFLDALSSDGSDDSLSDADSDDFEDVDISKSKGKASKASRAKPAATGFDGGEDDEDEMDWEDALHAQADTPVADMPGPKLAPWQRGLDDADDVLEVSLGGPVEENDEIARRNALGIKGPSKKDRQLRNWTHCMHVQLLLWHNHIRNGWVCDKEVQKLLTEQLPEGVKKEIQRWRKDSGLPPDPSLEPPPNVRGKNGKLKGKGKGKERSDRYSERNQRDWGGTADRIEQGVPNLSHGDPLHRLLRYLAAYWKKRFRITAPGLRKKGYFPTAKSLATEIKAWQATKEDPPNQKKKEIKKEKTKAEEYDIERFGEMIRSKADFLEAARSCTGSRDVGAQLFTALVRGIGLEARMVTSLQPIGFGFTKMEEVSIKKGQDSKTEATKQEEHPTSESKAQADEAPSSSKAQKPVRPTAKKSSSRKSGTKPLIIDSGEDSDSSLSSAKSDISDASIIDMTPSKPAVGLGNKRYDTDLKYPVYWTEVLSPISNTYVPVSPLVISTVASTSDLLSAFEPRGAAAEKAKQVICYVVAYNADGTAKDVTVRYLKRHIWPGKTKGFRMPVEKIPIYNKHGKVKRYEEFDWFKRVMSNYTRDGRLRTEADKIEDEGDLVPVKPSAAKKAEGNEPETLQGYKNSAEYVLERHLRREEAIRPTAKPVKTFMAGKGDKAKPEPVFLRKDVVACKTAESWHKEGRAIVAGATPMKRVPTRAVTLIRKREIEEAERESGEKATQGLYAREQTEWIVPPPIRDGRIPRNAFGNIDVYVPTMVPPGAVHLPLRGAARVCKKLGVDFAEACTGFEFGRHIAVPVLTGVVVAEENGDLVREAWRAEQKAKREKEEKKRVETALKMWRKFMLGLRVIQRVREEYGEGKDGLDDVVNPFARKKREGEVGNTFERKFGDEFEDEMEEGGGFLKESERDPGPGGFFLPGQEDEGPSEGGFIREGDEHADQGGFLRDGEEGAVEGGGFVIEGDDRENLQASQDDQPTGDTHNIPFSLQSTHQNFSRANAETAEEDPEDEDQDESDSPPPRKRPASHGRDSNRGRGRGRGRGRGRGTRSVAATSAQSRRKSSRAGNPGGTTDDSDGLPSAPSGSDSPVSSTSATGKQSEPDTDAKRAQTKDTAEEMPRRTPRRAAARKSATAVKSHYFVDGEEDSQDEADSDRTGSGEVDETPKTRSRRGVRGRGRGRGRARGRGPS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.85
3 0.79
4 0.79
5 0.71
6 0.63
7 0.57
8 0.52
9 0.48
10 0.47
11 0.49
12 0.48
13 0.54
14 0.61
15 0.67
16 0.67
17 0.72
18 0.74
19 0.71
20 0.66
21 0.59
22 0.55
23 0.5
24 0.42
25 0.34
26 0.25
27 0.22
28 0.19
29 0.18
30 0.14
31 0.13
32 0.16
33 0.16
34 0.16
35 0.16
36 0.17
37 0.18
38 0.16
39 0.14
40 0.12
41 0.12
42 0.12
43 0.12
44 0.11
45 0.09
46 0.1
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.07
51 0.08
52 0.07
53 0.09
54 0.09
55 0.09
56 0.1
57 0.09
58 0.08
59 0.08
60 0.09
61 0.08
62 0.11
63 0.13
64 0.13
65 0.17
66 0.19
67 0.24
68 0.28
69 0.32
70 0.38
71 0.44
72 0.53
73 0.59
74 0.65
75 0.7
76 0.7
77 0.68
78 0.66
79 0.63
80 0.58
81 0.5
82 0.44
83 0.35
84 0.31
85 0.29
86 0.23
87 0.19
88 0.14
89 0.12
90 0.1
91 0.1
92 0.08
93 0.09
94 0.09
95 0.08
96 0.07
97 0.07
98 0.08
99 0.08
100 0.08
101 0.07
102 0.07
103 0.08
104 0.09
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.09
110 0.1
111 0.1
112 0.15
113 0.15
114 0.14
115 0.22
116 0.27
117 0.32
118 0.35
119 0.38
120 0.34
121 0.38
122 0.4
123 0.33
124 0.3
125 0.24
126 0.22
127 0.16
128 0.15
129 0.11
130 0.09
131 0.06
132 0.05
133 0.06
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.11
143 0.12
144 0.13
145 0.13
146 0.11
147 0.13
148 0.16
149 0.17
150 0.22
151 0.26
152 0.33
153 0.4
154 0.45
155 0.5
156 0.54
157 0.6
158 0.63
159 0.68
160 0.69
161 0.73
162 0.79
163 0.81
164 0.83
165 0.77
166 0.73
167 0.66
168 0.6
169 0.51
170 0.43
171 0.35
172 0.31
173 0.35
174 0.33
175 0.33
176 0.34
177 0.32
178 0.33
179 0.32
180 0.3
181 0.29
182 0.32
183 0.34
184 0.32
185 0.33
186 0.35
187 0.37
188 0.38
189 0.37
190 0.33
191 0.29
192 0.29
193 0.3
194 0.28
195 0.26
196 0.23
197 0.23
198 0.25
199 0.23
200 0.23
201 0.23
202 0.22
203 0.23
204 0.32
205 0.36
206 0.42
207 0.51
208 0.54
209 0.56
210 0.6
211 0.64
212 0.64
213 0.65
214 0.66
215 0.58
216 0.55
217 0.53
218 0.49
219 0.45
220 0.42
221 0.36
222 0.28
223 0.29
224 0.34
225 0.39
226 0.38
227 0.39
228 0.42
229 0.46
230 0.54
231 0.59
232 0.6
233 0.62
234 0.67
235 0.72
236 0.74
237 0.73
238 0.72
239 0.73
240 0.74
241 0.75
242 0.76
243 0.74
244 0.73
245 0.73
246 0.71
247 0.72
248 0.74
249 0.71
250 0.71
251 0.66
252 0.61
253 0.56
254 0.52
255 0.44
256 0.39
257 0.33
258 0.28
259 0.28
260 0.25
261 0.23
262 0.21
263 0.18
264 0.14
265 0.19
266 0.17
267 0.16
268 0.17
269 0.17
270 0.2
271 0.19
272 0.22
273 0.18
274 0.22
275 0.25
276 0.22
277 0.23
278 0.21
279 0.25
280 0.22
281 0.22
282 0.26
283 0.31
284 0.37
285 0.43
286 0.51
287 0.5
288 0.52
289 0.54
290 0.5
291 0.52
292 0.54
293 0.58
294 0.61
295 0.67
296 0.67
297 0.65
298 0.62
299 0.54
300 0.53
301 0.51
302 0.46
303 0.39
304 0.44
305 0.47
306 0.46
307 0.44
308 0.39
309 0.35
310 0.3
311 0.28
312 0.21
313 0.22
314 0.24
315 0.23
316 0.21
317 0.21
318 0.23
319 0.28
320 0.36
321 0.38
322 0.45
323 0.55
324 0.64
325 0.64
326 0.7
327 0.71
328 0.73
329 0.77
330 0.78
331 0.79
332 0.81
333 0.86
334 0.87
335 0.88
336 0.84
337 0.76
338 0.71
339 0.69
340 0.61
341 0.59
342 0.51
343 0.42
344 0.36
345 0.32
346 0.26
347 0.24
348 0.2
349 0.14
350 0.15
351 0.15
352 0.16
353 0.16
354 0.17
355 0.11
356 0.12
357 0.2
358 0.18
359 0.2
360 0.2
361 0.2
362 0.2
363 0.21
364 0.22
365 0.13
366 0.13
367 0.13
368 0.14
369 0.15
370 0.15
371 0.13
372 0.11
373 0.11
374 0.1
375 0.08
376 0.06
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.08
391 0.07
392 0.08
393 0.08
394 0.1
395 0.11
396 0.11
397 0.1
398 0.09
399 0.11
400 0.1
401 0.11
402 0.1
403 0.11
404 0.16
405 0.19
406 0.19
407 0.2
408 0.25
409 0.25
410 0.3
411 0.34
412 0.33
413 0.37
414 0.42
415 0.43
416 0.43
417 0.47
418 0.43
419 0.46
420 0.46
421 0.4
422 0.37
423 0.38
424 0.35
425 0.34
426 0.33
427 0.24
428 0.22
429 0.2
430 0.2
431 0.18
432 0.17
433 0.15
434 0.16
435 0.16
436 0.18
437 0.19
438 0.2
439 0.26
440 0.31
441 0.33
442 0.38
443 0.47
444 0.56
445 0.6
446 0.64
447 0.66
448 0.7
449 0.76
450 0.76
451 0.75
452 0.74
453 0.74
454 0.75
455 0.7
456 0.7
457 0.66
458 0.64
459 0.56
460 0.48
461 0.46
462 0.39
463 0.33
464 0.25
465 0.21
466 0.16
467 0.15
468 0.13
469 0.09
470 0.09
471 0.09
472 0.08
473 0.05
474 0.06
475 0.06
476 0.06
477 0.06
478 0.07
479 0.07
480 0.07
481 0.08
482 0.08
483 0.08
484 0.08
485 0.08
486 0.08
487 0.09
488 0.07
489 0.08
490 0.08
491 0.07
492 0.07
493 0.08
494 0.11
495 0.16
496 0.21
497 0.25
498 0.31
499 0.32
500 0.32
501 0.34
502 0.32
503 0.3
504 0.3
505 0.32
506 0.26
507 0.27
508 0.27
509 0.25
510 0.25
511 0.21
512 0.17
513 0.14
514 0.15
515 0.15
516 0.15
517 0.14
518 0.12
519 0.13
520 0.12
521 0.1
522 0.09
523 0.09
524 0.09
525 0.09
526 0.09
527 0.08
528 0.08
529 0.09
530 0.07
531 0.06
532 0.06
533 0.06
534 0.06
535 0.06
536 0.06
537 0.06
538 0.07
539 0.06
540 0.07
541 0.06
542 0.07
543 0.07
544 0.08
545 0.07
546 0.06
547 0.07
548 0.07
549 0.08
550 0.09
551 0.13
552 0.14
553 0.16
554 0.17
555 0.16
556 0.15
557 0.15
558 0.14
559 0.11
560 0.1
561 0.08
562 0.08
563 0.08
564 0.08
565 0.08
566 0.07
567 0.06
568 0.07
569 0.06
570 0.06
571 0.06
572 0.06
573 0.07
574 0.13
575 0.14
576 0.16
577 0.21
578 0.24
579 0.27
580 0.37
581 0.41
582 0.43
583 0.49
584 0.54
585 0.57
586 0.58
587 0.55
588 0.52
589 0.53
590 0.47
591 0.45
592 0.43
593 0.38
594 0.41
595 0.4
596 0.35
597 0.33
598 0.35
599 0.34
600 0.38
601 0.37
602 0.4
603 0.44
604 0.45
605 0.48
606 0.51
607 0.5
608 0.48
609 0.47
610 0.46
611 0.47
612 0.47
613 0.45
614 0.38
615 0.34
616 0.3
617 0.29
618 0.26
619 0.23
620 0.25
621 0.25
622 0.28
623 0.31
624 0.29
625 0.3
626 0.28
627 0.28
628 0.26
629 0.23
630 0.24
631 0.23
632 0.25
633 0.24
634 0.22
635 0.19
636 0.16
637 0.15
638 0.1
639 0.1
640 0.08
641 0.07
642 0.06
643 0.05
644 0.05
645 0.08
646 0.08
647 0.13
648 0.15
649 0.16
650 0.18
651 0.22
652 0.28
653 0.27
654 0.3
655 0.26
656 0.24
657 0.23
658 0.22
659 0.19
660 0.14
661 0.12
662 0.11
663 0.1
664 0.1
665 0.09
666 0.08
667 0.08
668 0.08
669 0.1
670 0.14
671 0.18
672 0.18
673 0.2
674 0.22
675 0.22
676 0.22
677 0.24
678 0.26
679 0.27
680 0.33
681 0.33
682 0.32
683 0.37
684 0.43
685 0.4
686 0.35
687 0.3
688 0.28
689 0.29
690 0.29
691 0.26
692 0.29
693 0.28
694 0.29
695 0.35
696 0.33
697 0.32
698 0.32
699 0.36
700 0.26
701 0.3
702 0.33
703 0.3
704 0.33
705 0.32
706 0.33
707 0.29
708 0.31
709 0.29
710 0.27
711 0.24
712 0.2
713 0.2
714 0.18
715 0.2
716 0.23
717 0.26
718 0.27
719 0.29
720 0.3
721 0.3
722 0.29
723 0.28
724 0.25
725 0.2
726 0.16
727 0.12
728 0.11
729 0.12
730 0.12
731 0.11
732 0.09
733 0.11
734 0.11
735 0.12
736 0.15
737 0.19
738 0.21
739 0.26
740 0.32
741 0.38
742 0.46
743 0.51
744 0.51
745 0.47
746 0.46
747 0.45
748 0.41
749 0.37
750 0.34
751 0.31
752 0.3
753 0.29
754 0.28
755 0.24
756 0.21
757 0.18
758 0.13
759 0.09
760 0.08
761 0.1
762 0.11
763 0.11
764 0.13
765 0.16
766 0.16
767 0.16
768 0.16
769 0.14
770 0.16
771 0.16
772 0.15
773 0.16
774 0.16
775 0.16
776 0.21
777 0.23
778 0.21
779 0.22
780 0.28
781 0.32
782 0.42
783 0.43
784 0.39
785 0.4
786 0.4
787 0.38
788 0.33
789 0.26
790 0.17
791 0.16
792 0.15
793 0.11
794 0.1
795 0.09
796 0.08
797 0.07
798 0.06
799 0.05
800 0.05
801 0.08
802 0.09
803 0.09
804 0.09
805 0.09
806 0.1
807 0.12
808 0.13
809 0.11
810 0.11
811 0.16
812 0.23
813 0.27
814 0.27
815 0.27
816 0.27
817 0.28
818 0.31
819 0.29
820 0.25
821 0.22
822 0.23
823 0.23
824 0.22
825 0.21
826 0.17
827 0.13
828 0.1
829 0.09
830 0.09
831 0.06
832 0.09
833 0.08
834 0.09
835 0.09
836 0.09
837 0.09
838 0.08
839 0.08
840 0.05
841 0.05
842 0.04
843 0.04
844 0.04
845 0.04
846 0.04
847 0.03
848 0.04
849 0.04
850 0.04
851 0.04
852 0.04
853 0.06
854 0.06
855 0.07
856 0.1
857 0.15
858 0.18
859 0.25
860 0.3
861 0.37
862 0.46
863 0.5
864 0.55
865 0.6
866 0.67
867 0.71
868 0.78
869 0.77
870 0.75
871 0.77
872 0.73
873 0.71
874 0.64
875 0.6
876 0.6
877 0.59
878 0.53
879 0.47
880 0.45
881 0.4
882 0.39
883 0.36
884 0.34
885 0.29
886 0.33
887 0.36
888 0.42
889 0.4
890 0.39
891 0.37
892 0.3
893 0.29
894 0.26
895 0.24
896 0.19
897 0.22
898 0.23
899 0.21
900 0.19
901 0.17
902 0.16
903 0.14
904 0.11
905 0.08
906 0.07
907 0.12
908 0.13
909 0.13
910 0.16
911 0.21
912 0.25
913 0.28
914 0.3
915 0.3
916 0.38
917 0.42
918 0.45
919 0.49
920 0.51
921 0.54
922 0.54
923 0.48
924 0.41
925 0.37
926 0.33
927 0.25
928 0.21
929 0.21
930 0.18
931 0.19
932 0.2
933 0.21
934 0.18
935 0.17
936 0.15
937 0.1
938 0.09
939 0.08
940 0.06
941 0.04
942 0.05
943 0.06
944 0.07
945 0.08
946 0.13
947 0.13
948 0.15
949 0.17
950 0.19
951 0.19
952 0.18
953 0.18
954 0.15
955 0.14
956 0.13
957 0.14
958 0.12
959 0.13
960 0.13
961 0.13
962 0.13
963 0.14
964 0.14
965 0.11
966 0.12
967 0.1
968 0.1
969 0.1
970 0.09
971 0.09
972 0.09
973 0.1
974 0.12
975 0.12
976 0.12
977 0.12
978 0.12
979 0.1
980 0.1
981 0.12
982 0.09
983 0.08
984 0.09
985 0.08
986 0.08
987 0.09
988 0.07
989 0.05
990 0.05
991 0.05
992 0.04
993 0.04
994 0.04
995 0.03
996 0.03
997 0.03
998 0.03
999 0.03
1000 0.04
1001 0.05
1002 0.06
1003 0.07
1004 0.08
1005 0.09
1006 0.09
1007 0.1
1008 0.11
1009 0.13
1010 0.19
1011 0.2
1012 0.2
1013 0.19
1014 0.2
1015 0.2
1016 0.21
1017 0.22
1018 0.17
1019 0.16
1020 0.2
1021 0.2
1022 0.19
1023 0.19
1024 0.17
1025 0.18
1026 0.19
1027 0.26
1028 0.27
1029 0.3
1030 0.32
1031 0.35
1032 0.34
1033 0.33
1034 0.37
1035 0.31
1036 0.28
1037 0.26
1038 0.26
1039 0.23
1040 0.24
1041 0.24
1042 0.18
1043 0.15
1044 0.15
1045 0.15
1046 0.14
1047 0.13
1048 0.12
1049 0.09
1050 0.11
1051 0.11
1052 0.12
1053 0.16
1054 0.22
1055 0.25
1056 0.32
1057 0.37
1058 0.43
1059 0.51
1060 0.53
1061 0.58
1062 0.63
1063 0.69
1064 0.71
1065 0.75
1066 0.73
1067 0.76
1068 0.76
1069 0.76
1070 0.73
1071 0.7
1072 0.63
1073 0.62
1074 0.64
1075 0.64
1076 0.68
1077 0.68
1078 0.67
1079 0.7
1080 0.76
1081 0.77
1082 0.76
1083 0.75
1084 0.72
1085 0.67
1086 0.62
1087 0.55
1088 0.48
1089 0.39
1090 0.36
1091 0.33
1092 0.36
1093 0.37
1094 0.39
1095 0.43
1096 0.47
1097 0.5
1098 0.54
1099 0.57
1100 0.59
1101 0.62
1102 0.65
1103 0.65
1104 0.62
1105 0.59
1106 0.56
1107 0.48
1108 0.39
1109 0.31
1110 0.26
1111 0.2
1112 0.18
1113 0.17
1114 0.13
1115 0.12
1116 0.1
1117 0.09
1118 0.08
1119 0.1
1120 0.1
1121 0.12
1122 0.14
1123 0.15
1124 0.18
1125 0.19
1126 0.21
1127 0.19
1128 0.19
1129 0.21
1130 0.24
1131 0.25
1132 0.24
1133 0.24
1134 0.26
1135 0.29
1136 0.3
1137 0.3
1138 0.33
1139 0.36
1140 0.39
1141 0.42
1142 0.44
1143 0.49
1144 0.48
1145 0.48
1146 0.47
1147 0.46
1148 0.46
1149 0.47
1150 0.47
1151 0.46
1152 0.51
1153 0.51
1154 0.53
1155 0.59
1156 0.58
1157 0.57
1158 0.57
1159 0.6
1160 0.64
1161 0.7
1162 0.69
1163 0.71
1164 0.75
1165 0.75
1166 0.74
1167 0.73
1168 0.64
1169 0.59
1170 0.56
1171 0.48
1172 0.42
1173 0.38
1174 0.35
1175 0.28
1176 0.25
1177 0.26
1178 0.23
1179 0.21
1180 0.19
1181 0.19
1182 0.17
1183 0.17
1184 0.16
1185 0.1
1186 0.1
1187 0.1
1188 0.1
1189 0.1
1190 0.09
1191 0.1
1192 0.1
1193 0.1
1194 0.11
1195 0.11
1196 0.13
1197 0.16
1198 0.18
1199 0.19
1200 0.23
1201 0.3
1202 0.32
1203 0.36
1204 0.44
1205 0.49
1206 0.57
1207 0.67
1208 0.73
1209 0.77
1210 0.84
1211 0.87
1212 0.87
1213 0.87
1214 0.86
1215 0.83
1216 0.82
1217 0.8
1218 0.79