Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9S8P4

Protein Details
Accession A0A1J9S8P4    Localization Confidence High Confidence Score 20.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MPPFVPRKRSRSRSPAPASAPHydrophilic
163-183LGIKGPSKKDRQLRNWTHCMHHydrophilic
332-355TKEDPPNQKKKEIKKEKTKAEEYDBasic
1210-1235VDETPKTRSRRGVRGRGRGRGRARGRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-29RKRSRSRSPAPASAPASAPKRVK
239-256NVRGKNGKLKGKGKGKER
340-348KKKEIKKEK
459-466PTAKKSSS
875-885KAKREKEEKKR
1070-1103PPRKRPASHGRDSNRGRGRGRGRGRGRGTRSVAA
1108-1111SRRK
1215-1238KTRSRRGVRGRGRGRGRARGRGPS
Subcellular Location(s) mito 13.5, nucl 11, cyto_mito 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018327  BHD_2  
IPR004583  DNA_repair_Rad4  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR018325  Rad4/PNGase_transGLS-fold  
IPR018326  Rad4_beta-hairpin_dom1  
IPR018328  Rad4_beta-hairpin_dom3  
IPR042488  Rad4_BHD3_sf  
IPR036985  Transglutaminase-like_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF10403  BHD_1  
PF10404  BHD_2  
PF10405  BHD_3  
PF03835  Rad4  
Amino Acid Sequences MPPFVPRKRSRSRSPAPASAPASAPKRVKKNVFDALDAPSGNTSSSADKAFLDALSSDGSDDSLSDADSDDFEDVDISKSKGKASKASRAKPAATGFDGGEDDEDEMDWEDALHAQADTPVADMPGPKLAPWQRGLDDADDVLEVSLGGPVEENDEIARRNALGIKGPSKKDRQLRNWTHCMHVQLLLWHNHIRNGWVCDKEVQKLLTEQLPEGVKKEIQRWRKDSGLPPDPSLEPPPNVRGKNGKLKGKGKGKERSDRYSERNQRDWGGTADRIEQGVPNLSHGDPLHRLLRYLAAYWKKRFRITAPGLRKKGYFPTAKSLATEIKAWQATKEDPPNQKKKEIKKEKTKAEEYDIERFGEMIRSKADFLEAARSCTGSRDVGAQLFTALVRGIGLEARMVTSLQPIGFGFTKMEEVSIKKGQDSKTEATKQEEHPTSESKAQADEAPSSSKAQKPVRPTAKKSSSRKSGTKPLIIDSGEDSDSSLSSAKSDISDASIIDMTPSKPAVGLGNKRYDTDLKYPVYWTEVLSPISNTYVPVSPLVISTVASTSDLLSAFEPRGAAAEKAKQVICYVVAYNADGTAKDVTVRYLKRHIWPGKTKGFRMPVEKIPIYNKHGKVKRYEEFDWFKRVMSNYTRDGRLRTEADKIEDEGDLVPVKPSAAKKAEGNEPETLQGYKNSAEYVLERHLRREEAIRPTAKPVKTFMAGKGDKAKPEPVFLRKDVVACKTAESWHKEGRAIVAGATPMKRVPTRAVTLIRKREIEEAERESGEKATQGLYAREQTEWIVPPPIRDGRIPRNAFGNIDVYVPTMVPPGAVHLPLRGAARVCKKLGVDFAEACTGFEFGRHIAVPVLTGVVVAEENGDLVREAWRAEQKAKREKEEKKRVETALKMWRKFMLGLRVIQRVREEYGEGKDGLDDVVNPFARKKREGEVGNTFERKFGDEFEDEMEEGGGFLKESERDPGPGGFFLPGQEDEGPSEGGFIREGDEHADQGGFLRDGEEGAVEGGGFVIEGDDRENLQASQDDQPTGDTHNIPFSLQSTHQNFSRANAETAEEDPEDEDQDESDSPPPRKRPASHGRDSNRGRGRGRGRGRGRGTRSVAATSAQSRRKSSRAGNPGGTTDDSDGLPSAPSGSDSPVSSTSATGKQSEPDTDAKRAQTKDTAEEMPRRTPRRAAARKSATAVKSHYFVDGEEDSQDEADSDRTGSGEVDETPKTRSRRGVRGRGRGRGRARGRGPS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.85
3 0.79
4 0.79
5 0.71
6 0.63
7 0.57
8 0.52
9 0.48
10 0.47
11 0.49
12 0.48
13 0.54
14 0.61
15 0.67
16 0.67
17 0.72
18 0.74
19 0.71
20 0.66
21 0.59
22 0.55
23 0.5
24 0.42
25 0.34
26 0.25
27 0.22
28 0.19
29 0.18
30 0.14
31 0.13
32 0.16
33 0.16
34 0.16
35 0.16
36 0.17
37 0.18
38 0.16
39 0.14
40 0.12
41 0.12
42 0.12
43 0.12
44 0.11
45 0.09
46 0.1
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.07
51 0.08
52 0.07
53 0.09
54 0.09
55 0.09
56 0.1
57 0.09
58 0.08
59 0.08
60 0.09
61 0.08
62 0.11
63 0.13
64 0.13
65 0.17
66 0.19
67 0.24
68 0.28
69 0.32
70 0.38
71 0.44
72 0.53
73 0.59
74 0.65
75 0.7
76 0.7
77 0.68
78 0.66
79 0.63
80 0.58
81 0.5
82 0.44
83 0.35
84 0.31
85 0.29
86 0.23
87 0.19
88 0.14
89 0.12
90 0.1
91 0.1
92 0.08
93 0.09
94 0.09
95 0.08
96 0.07
97 0.07
98 0.08
99 0.08
100 0.08
101 0.07
102 0.07
103 0.08
104 0.09
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.09
110 0.1
111 0.1
112 0.15
113 0.15
114 0.14
115 0.22
116 0.27
117 0.32
118 0.35
119 0.38
120 0.34
121 0.38
122 0.4
123 0.33
124 0.3
125 0.24
126 0.22
127 0.16
128 0.15
129 0.11
130 0.09
131 0.06
132 0.05
133 0.06
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.11
143 0.12
144 0.13
145 0.13
146 0.11
147 0.13
148 0.16
149 0.17
150 0.22
151 0.26
152 0.33
153 0.4
154 0.45
155 0.5
156 0.54
157 0.6
158 0.63
159 0.68
160 0.69
161 0.73
162 0.79
163 0.81
164 0.83
165 0.77
166 0.73
167 0.66
168 0.6
169 0.51
170 0.43
171 0.35
172 0.31
173 0.35
174 0.33
175 0.33
176 0.34
177 0.32
178 0.33
179 0.32
180 0.3
181 0.29
182 0.32
183 0.34
184 0.32
185 0.33
186 0.35
187 0.37
188 0.38
189 0.37
190 0.33
191 0.29
192 0.29
193 0.3
194 0.28
195 0.26
196 0.23
197 0.23
198 0.25
199 0.23
200 0.23
201 0.23
202 0.22
203 0.23
204 0.32
205 0.36
206 0.42
207 0.51
208 0.54
209 0.56
210 0.6
211 0.64
212 0.64
213 0.65
214 0.66
215 0.58
216 0.55
217 0.53
218 0.49
219 0.45
220 0.42
221 0.36
222 0.28
223 0.29
224 0.34
225 0.39
226 0.38
227 0.39
228 0.42
229 0.46
230 0.54
231 0.59
232 0.6
233 0.62
234 0.67
235 0.72
236 0.74
237 0.73
238 0.72
239 0.73
240 0.74
241 0.75
242 0.76
243 0.74
244 0.73
245 0.73
246 0.71
247 0.72
248 0.74
249 0.71
250 0.71
251 0.66
252 0.61
253 0.56
254 0.52
255 0.44
256 0.39
257 0.33
258 0.28
259 0.28
260 0.25
261 0.23
262 0.21
263 0.18
264 0.14
265 0.19
266 0.17
267 0.16
268 0.17
269 0.17
270 0.2
271 0.19
272 0.22
273 0.18
274 0.22
275 0.25
276 0.22
277 0.23
278 0.21
279 0.25
280 0.22
281 0.22
282 0.26
283 0.31
284 0.37
285 0.43
286 0.51
287 0.5
288 0.52
289 0.54
290 0.5
291 0.52
292 0.54
293 0.58
294 0.61
295 0.67
296 0.67
297 0.65
298 0.62
299 0.54
300 0.53
301 0.51
302 0.46
303 0.39
304 0.44
305 0.47
306 0.46
307 0.44
308 0.39
309 0.35
310 0.3
311 0.28
312 0.21
313 0.22
314 0.24
315 0.23
316 0.21
317 0.21
318 0.23
319 0.28
320 0.36
321 0.38
322 0.45
323 0.55
324 0.64
325 0.64
326 0.7
327 0.71
328 0.73
329 0.77
330 0.78
331 0.79
332 0.81
333 0.86
334 0.87
335 0.88
336 0.84
337 0.76
338 0.71
339 0.69
340 0.61
341 0.59
342 0.51
343 0.42
344 0.36
345 0.32
346 0.26
347 0.24
348 0.2
349 0.14
350 0.15
351 0.15
352 0.16
353 0.16
354 0.17
355 0.11
356 0.12
357 0.2
358 0.18
359 0.2
360 0.2
361 0.2
362 0.2
363 0.21
364 0.22
365 0.13
366 0.13
367 0.13
368 0.14
369 0.15
370 0.15
371 0.13
372 0.11
373 0.11
374 0.1
375 0.08
376 0.06
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.08
391 0.07
392 0.08
393 0.08
394 0.1
395 0.11
396 0.11
397 0.1
398 0.09
399 0.11
400 0.1
401 0.11
402 0.1
403 0.11
404 0.16
405 0.19
406 0.19
407 0.2
408 0.25
409 0.25
410 0.3
411 0.34
412 0.33
413 0.37
414 0.42
415 0.43
416 0.43
417 0.47
418 0.43
419 0.46
420 0.46
421 0.4
422 0.37
423 0.38
424 0.35
425 0.34
426 0.33
427 0.24
428 0.22
429 0.2
430 0.2
431 0.18
432 0.17
433 0.15
434 0.16
435 0.16
436 0.18
437 0.19
438 0.2
439 0.26
440 0.31
441 0.33
442 0.38
443 0.47
444 0.56
445 0.6
446 0.64
447 0.66
448 0.7
449 0.76
450 0.76
451 0.75
452 0.74
453 0.74
454 0.75
455 0.7
456 0.7
457 0.66
458 0.64
459 0.56
460 0.48
461 0.46
462 0.39
463 0.33
464 0.25
465 0.21
466 0.16
467 0.15
468 0.13
469 0.09
470 0.09
471 0.09
472 0.08
473 0.05
474 0.06
475 0.06
476 0.06
477 0.06
478 0.07
479 0.07
480 0.07
481 0.08
482 0.08
483 0.08
484 0.08
485 0.08
486 0.08
487 0.09
488 0.07
489 0.08
490 0.08
491 0.07
492 0.07
493 0.08
494 0.11
495 0.16
496 0.21
497 0.25
498 0.31
499 0.32
500 0.32
501 0.34
502 0.32
503 0.3
504 0.3
505 0.32
506 0.26
507 0.27
508 0.27
509 0.25
510 0.25
511 0.21
512 0.17
513 0.14
514 0.15
515 0.15
516 0.15
517 0.14
518 0.12
519 0.13
520 0.12
521 0.1
522 0.09
523 0.09
524 0.09
525 0.09
526 0.09
527 0.08
528 0.08
529 0.09
530 0.07
531 0.06
532 0.06
533 0.06
534 0.06
535 0.06
536 0.06
537 0.06
538 0.07
539 0.06
540 0.07
541 0.06
542 0.07
543 0.07
544 0.08
545 0.07
546 0.06
547 0.07
548 0.07
549 0.08
550 0.09
551 0.13
552 0.14
553 0.16
554 0.17
555 0.16
556 0.15
557 0.15
558 0.14
559 0.11
560 0.1
561 0.08
562 0.08
563 0.08
564 0.08
565 0.08
566 0.07
567 0.06
568 0.07
569 0.06
570 0.06
571 0.06
572 0.06
573 0.07
574 0.13
575 0.14
576 0.16
577 0.21
578 0.24
579 0.27
580 0.37
581 0.41
582 0.43
583 0.49
584 0.54
585 0.57
586 0.58
587 0.55
588 0.52
589 0.53
590 0.47
591 0.45
592 0.43
593 0.38
594 0.41
595 0.4
596 0.35
597 0.33
598 0.35
599 0.34
600 0.38
601 0.37
602 0.4
603 0.44
604 0.45
605 0.48
606 0.51
607 0.5
608 0.48
609 0.47
610 0.46
611 0.47
612 0.47
613 0.45
614 0.38
615 0.34
616 0.3
617 0.29
618 0.26
619 0.23
620 0.25
621 0.25
622 0.28
623 0.31
624 0.29
625 0.3
626 0.28
627 0.28
628 0.26
629 0.23
630 0.24
631 0.23
632 0.25
633 0.24
634 0.22
635 0.19
636 0.16
637 0.15
638 0.1
639 0.1
640 0.08
641 0.07
642 0.06
643 0.05
644 0.05
645 0.08
646 0.08
647 0.13
648 0.15
649 0.16
650 0.18
651 0.22
652 0.28
653 0.27
654 0.3
655 0.26
656 0.24
657 0.23
658 0.22
659 0.19
660 0.14
661 0.12
662 0.11
663 0.1
664 0.1
665 0.09
666 0.08
667 0.08
668 0.08
669 0.1
670 0.14
671 0.18
672 0.18
673 0.2
674 0.22
675 0.22
676 0.22
677 0.24
678 0.26
679 0.27
680 0.33
681 0.33
682 0.32
683 0.37
684 0.43
685 0.4
686 0.35
687 0.3
688 0.28
689 0.29
690 0.29
691 0.26
692 0.29
693 0.28
694 0.29
695 0.35
696 0.33
697 0.32
698 0.32
699 0.36
700 0.26
701 0.3
702 0.33
703 0.3
704 0.33
705 0.32
706 0.33
707 0.29
708 0.31
709 0.29
710 0.27
711 0.24
712 0.2
713 0.2
714 0.18
715 0.2
716 0.23
717 0.26
718 0.27
719 0.29
720 0.3
721 0.3
722 0.29
723 0.28
724 0.25
725 0.2
726 0.16
727 0.12
728 0.11
729 0.12
730 0.12
731 0.11
732 0.09
733 0.11
734 0.11
735 0.12
736 0.15
737 0.19
738 0.21
739 0.26
740 0.32
741 0.38
742 0.46
743 0.51
744 0.51
745 0.47
746 0.46
747 0.45
748 0.41
749 0.37
750 0.34
751 0.31
752 0.3
753 0.29
754 0.28
755 0.24
756 0.21
757 0.18
758 0.13
759 0.09
760 0.08
761 0.1
762 0.11
763 0.11
764 0.13
765 0.16
766 0.16
767 0.16
768 0.16
769 0.14
770 0.16
771 0.16
772 0.15
773 0.16
774 0.16
775 0.16
776 0.21
777 0.23
778 0.21
779 0.22
780 0.28
781 0.32
782 0.42
783 0.43
784 0.39
785 0.4
786 0.4
787 0.38
788 0.33
789 0.26
790 0.17
791 0.16
792 0.15
793 0.11
794 0.1
795 0.09
796 0.08
797 0.07
798 0.06
799 0.05
800 0.05
801 0.08
802 0.09
803 0.09
804 0.09
805 0.09
806 0.1
807 0.12
808 0.13
809 0.11
810 0.11
811 0.16
812 0.23
813 0.27
814 0.27
815 0.27
816 0.27
817 0.28
818 0.31
819 0.29
820 0.25
821 0.22
822 0.23
823 0.23
824 0.22
825 0.21
826 0.17
827 0.13
828 0.1
829 0.09
830 0.09
831 0.06
832 0.09
833 0.08
834 0.09
835 0.09
836 0.09
837 0.09
838 0.08
839 0.08
840 0.05
841 0.05
842 0.04
843 0.04
844 0.04
845 0.04
846 0.04
847 0.03
848 0.04
849 0.04
850 0.04
851 0.04
852 0.04
853 0.06
854 0.06
855 0.07
856 0.1
857 0.15
858 0.18
859 0.25
860 0.3
861 0.37
862 0.46
863 0.5
864 0.55
865 0.6
866 0.67
867 0.71
868 0.78
869 0.77
870 0.75
871 0.77
872 0.73
873 0.71
874 0.64
875 0.6
876 0.6
877 0.59
878 0.53
879 0.47
880 0.45
881 0.4
882 0.39
883 0.36
884 0.34
885 0.29
886 0.33
887 0.36
888 0.42
889 0.4
890 0.39
891 0.37
892 0.3
893 0.29
894 0.26
895 0.24
896 0.19
897 0.22
898 0.23
899 0.21
900 0.19
901 0.17
902 0.16
903 0.14
904 0.11
905 0.08
906 0.07
907 0.12
908 0.13
909 0.13
910 0.16
911 0.21
912 0.25
913 0.28
914 0.3
915 0.3
916 0.38
917 0.42
918 0.45
919 0.49
920 0.51
921 0.54
922 0.54
923 0.48
924 0.41
925 0.37
926 0.33
927 0.25
928 0.21
929 0.21
930 0.18
931 0.19
932 0.2
933 0.21
934 0.18
935 0.17
936 0.15
937 0.1
938 0.09
939 0.08
940 0.06
941 0.04
942 0.05
943 0.06
944 0.07
945 0.08
946 0.13
947 0.13
948 0.15
949 0.17
950 0.19
951 0.19
952 0.18
953 0.18
954 0.15
955 0.14
956 0.13
957 0.14
958 0.12
959 0.13
960 0.13
961 0.13
962 0.13
963 0.14
964 0.14
965 0.11
966 0.12
967 0.1
968 0.1
969 0.1
970 0.09
971 0.09
972 0.09
973 0.1
974 0.12
975 0.12
976 0.12
977 0.12
978 0.12
979 0.1
980 0.1
981 0.12
982 0.09
983 0.08
984 0.09
985 0.08
986 0.08
987 0.09
988 0.07
989 0.05
990 0.05
991 0.05
992 0.04
993 0.04
994 0.04
995 0.03
996 0.03
997 0.03
998 0.03
999 0.03
1000 0.04
1001 0.05
1002 0.06
1003 0.07
1004 0.08
1005 0.09
1006 0.09
1007 0.1
1008 0.11
1009 0.13
1010 0.19
1011 0.2
1012 0.2
1013 0.19
1014 0.2
1015 0.2
1016 0.21
1017 0.22
1018 0.17
1019 0.16
1020 0.2
1021 0.2
1022 0.19
1023 0.19
1024 0.17
1025 0.18
1026 0.19
1027 0.26
1028 0.27
1029 0.3
1030 0.32
1031 0.35
1032 0.34
1033 0.33
1034 0.37
1035 0.31
1036 0.28
1037 0.26
1038 0.26
1039 0.23
1040 0.24
1041 0.24
1042 0.18
1043 0.15
1044 0.15
1045 0.15
1046 0.14
1047 0.13
1048 0.12
1049 0.09
1050 0.11
1051 0.11
1052 0.12
1053 0.16
1054 0.22
1055 0.25
1056 0.32
1057 0.37
1058 0.43
1059 0.51
1060 0.53
1061 0.58
1062 0.63
1063 0.69
1064 0.71
1065 0.75
1066 0.73
1067 0.76
1068 0.76
1069 0.76
1070 0.73
1071 0.7
1072 0.63
1073 0.62
1074 0.64
1075 0.64
1076 0.68
1077 0.68
1078 0.67
1079 0.7
1080 0.76
1081 0.77
1082 0.76
1083 0.75
1084 0.72
1085 0.67
1086 0.62
1087 0.55
1088 0.48
1089 0.39
1090 0.36
1091 0.33
1092 0.36
1093 0.37
1094 0.39
1095 0.43
1096 0.47
1097 0.5
1098 0.54
1099 0.57
1100 0.59
1101 0.62
1102 0.65
1103 0.65
1104 0.62
1105 0.59
1106 0.56
1107 0.48
1108 0.39
1109 0.31
1110 0.26
1111 0.2
1112 0.18
1113 0.17
1114 0.13
1115 0.12
1116 0.1
1117 0.09
1118 0.08
1119 0.1
1120 0.1
1121 0.12
1122 0.14
1123 0.15
1124 0.18
1125 0.19
1126 0.21
1127 0.19
1128 0.19
1129 0.21
1130 0.24
1131 0.25
1132 0.24
1133 0.24
1134 0.26
1135 0.29
1136 0.3
1137 0.3
1138 0.33
1139 0.36
1140 0.39
1141 0.42
1142 0.44
1143 0.49
1144 0.48
1145 0.48
1146 0.47
1147 0.46
1148 0.46
1149 0.47
1150 0.47
1151 0.46
1152 0.51
1153 0.51
1154 0.53
1155 0.59
1156 0.58
1157 0.57
1158 0.57
1159 0.6
1160 0.64
1161 0.7
1162 0.69
1163 0.71
1164 0.75
1165 0.75
1166 0.74
1167 0.73
1168 0.64
1169 0.59
1170 0.56
1171 0.48
1172 0.42
1173 0.38
1174 0.35
1175 0.28
1176 0.25
1177 0.26
1178 0.23
1179 0.21
1180 0.19
1181 0.19
1182 0.17
1183 0.17
1184 0.16
1185 0.1
1186 0.1
1187 0.1
1188 0.1
1189 0.1
1190 0.09
1191 0.1
1192 0.1
1193 0.1
1194 0.11
1195 0.11
1196 0.13
1197 0.16
1198 0.18
1199 0.19
1200 0.23
1201 0.3
1202 0.32
1203 0.36
1204 0.44
1205 0.49
1206 0.57
1207 0.67
1208 0.73
1209 0.77
1210 0.84
1211 0.87
1212 0.87
1213 0.87
1214 0.86
1215 0.83
1216 0.82
1217 0.8
1218 0.79