Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9QNQ2

Protein Details
Accession A0A1J9QNQ2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
408-437ATWKSGKRGTYWRKRRRWERTKRVVDETRAHydrophilic
576-599GKVEARGKFTKKKRVAVEEKAESTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
414-429KRGTYWRKRRRWERTK
581-589RGKFTKKKR
Subcellular Location(s) mito 14.5, cyto_mito 12, cyto 8.5, nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MHTRIRPHSYVVLRLPSGLLKVLEVVPNTTVSIGKFGSFPANHLLGRPFNVTYEILDREDGKDETELRIVPASELHEHVIQSEDAPPTEGTPDVTPDGDAAEPASAEFDIVGENGEVLMRSNRLTVDDPSRQTLSMEEIEELKKAGTGSGKEIIAKIMAAHKALDEKTAFSLAKYTLRKTRKYLRRFTVLPMDVSMLGEVMIEREGHRVMDLREESQGLIGAWANIHYGGACELQPSDTQEGAFVGGGRWLVVDDTGGLVVASLAEKMGILHPPEEDEFDDSSEEDDVQPEDQEMADAPAAENQQEDQPADEAADGTAQKPRSFPARLNAKAVPAQSASVNTLTLLHAHAQPNVALLKYFGYDAASATPATTHPLYSHLKTLSWLQLIAPEDDVAYAEPDSATPETLATWKSGKRGTYWRKRRRWERTKRVVDETRAGGFDGLIVSSFMAPATILKHTLPLLRGGAQVVVYSPTIEPLTELMDLYSRERKTAYINRTINPKTNAKPFDPDTATEEERREFEDDFPLNPTLLLAPVLQTSRVRAWQVLPGRTHPMMTSRGGPEGYVFSATRVMPAGGKVEARGKFTKKKRVAVEEKAESTAEEGHEAKKAKVGGEDQQVAEAADTA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.41
3 0.34
4 0.31
5 0.26
6 0.2
7 0.14
8 0.17
9 0.18
10 0.2
11 0.19
12 0.2
13 0.18
14 0.18
15 0.18
16 0.17
17 0.16
18 0.13
19 0.16
20 0.14
21 0.14
22 0.14
23 0.15
24 0.22
25 0.21
26 0.22
27 0.25
28 0.28
29 0.27
30 0.29
31 0.32
32 0.27
33 0.3
34 0.31
35 0.25
36 0.23
37 0.26
38 0.24
39 0.22
40 0.24
41 0.23
42 0.21
43 0.22
44 0.23
45 0.22
46 0.25
47 0.23
48 0.2
49 0.2
50 0.2
51 0.21
52 0.23
53 0.21
54 0.18
55 0.21
56 0.19
57 0.17
58 0.18
59 0.19
60 0.18
61 0.19
62 0.2
63 0.2
64 0.19
65 0.2
66 0.2
67 0.16
68 0.15
69 0.18
70 0.17
71 0.15
72 0.17
73 0.16
74 0.15
75 0.16
76 0.15
77 0.13
78 0.13
79 0.15
80 0.15
81 0.15
82 0.14
83 0.13
84 0.14
85 0.12
86 0.11
87 0.08
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.08
92 0.06
93 0.06
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.06
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.06
105 0.08
106 0.08
107 0.09
108 0.1
109 0.11
110 0.14
111 0.17
112 0.2
113 0.26
114 0.32
115 0.33
116 0.36
117 0.37
118 0.34
119 0.32
120 0.28
121 0.25
122 0.21
123 0.19
124 0.16
125 0.17
126 0.18
127 0.18
128 0.17
129 0.12
130 0.11
131 0.1
132 0.11
133 0.13
134 0.14
135 0.17
136 0.21
137 0.22
138 0.21
139 0.21
140 0.2
141 0.16
142 0.15
143 0.12
144 0.13
145 0.13
146 0.13
147 0.13
148 0.13
149 0.17
150 0.17
151 0.2
152 0.15
153 0.15
154 0.16
155 0.2
156 0.19
157 0.15
158 0.17
159 0.16
160 0.23
161 0.24
162 0.27
163 0.32
164 0.39
165 0.44
166 0.48
167 0.57
168 0.59
169 0.65
170 0.71
171 0.69
172 0.71
173 0.68
174 0.66
175 0.65
176 0.57
177 0.49
178 0.4
179 0.34
180 0.26
181 0.24
182 0.19
183 0.09
184 0.07
185 0.06
186 0.05
187 0.04
188 0.04
189 0.05
190 0.05
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.08
195 0.1
196 0.1
197 0.17
198 0.18
199 0.17
200 0.18
201 0.18
202 0.18
203 0.16
204 0.16
205 0.08
206 0.08
207 0.07
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.05
213 0.05
214 0.04
215 0.04
216 0.05
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.07
222 0.08
223 0.11
224 0.12
225 0.11
226 0.11
227 0.11
228 0.11
229 0.1
230 0.1
231 0.07
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.02
251 0.02
252 0.02
253 0.03
254 0.03
255 0.04
256 0.06
257 0.07
258 0.07
259 0.08
260 0.09
261 0.1
262 0.11
263 0.1
264 0.11
265 0.1
266 0.1
267 0.11
268 0.09
269 0.09
270 0.08
271 0.08
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.04
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.04
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.06
299 0.05
300 0.04
301 0.06
302 0.05
303 0.05
304 0.09
305 0.1
306 0.1
307 0.1
308 0.12
309 0.16
310 0.18
311 0.19
312 0.24
313 0.33
314 0.34
315 0.38
316 0.38
317 0.34
318 0.35
319 0.33
320 0.27
321 0.17
322 0.16
323 0.13
324 0.13
325 0.12
326 0.1
327 0.09
328 0.08
329 0.08
330 0.07
331 0.08
332 0.07
333 0.08
334 0.11
335 0.12
336 0.13
337 0.12
338 0.12
339 0.13
340 0.13
341 0.11
342 0.08
343 0.07
344 0.07
345 0.07
346 0.07
347 0.05
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.07
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.07
356 0.06
357 0.09
358 0.09
359 0.08
360 0.08
361 0.13
362 0.17
363 0.17
364 0.22
365 0.19
366 0.19
367 0.2
368 0.23
369 0.21
370 0.19
371 0.18
372 0.14
373 0.17
374 0.18
375 0.18
376 0.15
377 0.11
378 0.1
379 0.1
380 0.1
381 0.06
382 0.06
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.09
394 0.1
395 0.09
396 0.12
397 0.13
398 0.17
399 0.2
400 0.2
401 0.24
402 0.34
403 0.43
404 0.51
405 0.61
406 0.68
407 0.74
408 0.84
409 0.9
410 0.9
411 0.91
412 0.91
413 0.91
414 0.92
415 0.93
416 0.88
417 0.86
418 0.82
419 0.74
420 0.68
421 0.6
422 0.5
423 0.4
424 0.35
425 0.25
426 0.19
427 0.15
428 0.1
429 0.07
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.07
440 0.07
441 0.09
442 0.09
443 0.11
444 0.12
445 0.15
446 0.15
447 0.16
448 0.17
449 0.17
450 0.18
451 0.17
452 0.16
453 0.13
454 0.13
455 0.1
456 0.1
457 0.08
458 0.09
459 0.08
460 0.09
461 0.09
462 0.09
463 0.09
464 0.08
465 0.1
466 0.1
467 0.1
468 0.08
469 0.1
470 0.11
471 0.14
472 0.21
473 0.19
474 0.19
475 0.2
476 0.21
477 0.28
478 0.36
479 0.39
480 0.42
481 0.46
482 0.48
483 0.57
484 0.59
485 0.57
486 0.54
487 0.54
488 0.5
489 0.55
490 0.56
491 0.5
492 0.54
493 0.49
494 0.53
495 0.48
496 0.44
497 0.39
498 0.4
499 0.4
500 0.37
501 0.35
502 0.29
503 0.27
504 0.28
505 0.26
506 0.22
507 0.21
508 0.26
509 0.26
510 0.25
511 0.27
512 0.26
513 0.23
514 0.22
515 0.2
516 0.12
517 0.11
518 0.11
519 0.08
520 0.08
521 0.1
522 0.11
523 0.13
524 0.13
525 0.16
526 0.19
527 0.23
528 0.24
529 0.24
530 0.25
531 0.31
532 0.38
533 0.41
534 0.4
535 0.39
536 0.44
537 0.43
538 0.41
539 0.34
540 0.32
541 0.29
542 0.29
543 0.31
544 0.26
545 0.29
546 0.28
547 0.27
548 0.24
549 0.23
550 0.22
551 0.19
552 0.17
553 0.15
554 0.19
555 0.19
556 0.18
557 0.17
558 0.16
559 0.14
560 0.16
561 0.17
562 0.15
563 0.16
564 0.17
565 0.23
566 0.25
567 0.29
568 0.35
569 0.4
570 0.48
571 0.57
572 0.66
573 0.67
574 0.73
575 0.76
576 0.8
577 0.82
578 0.83
579 0.83
580 0.8
581 0.74
582 0.68
583 0.59
584 0.48
585 0.4
586 0.33
587 0.24
588 0.19
589 0.18
590 0.17
591 0.23
592 0.25
593 0.24
594 0.25
595 0.26
596 0.25
597 0.29
598 0.31
599 0.34
600 0.4
601 0.44
602 0.4
603 0.39
604 0.37
605 0.32