Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9S933

Protein Details
Accession A0A1J9S933    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
230-250NYGVRKEKKTEYRQYMNRVGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-128KQPSRRGRADGTHARVRSRSPRDSDHHEGGGGGGSRGGHSRRGGGRARDRSGSRERSGRRRGGGGDDRARSRSPRPSDGNVRRRSPPRGPRGGGSGGGRGEGR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MPEPPASKRGRRPDSAQMWDDNDRGKQPSRRGRADGTHARVRSRSPRDSDHHEGGGGGGSRGGHSRRGGGRARDRSGSRERSGRRRGGGGDDRARSRSPRPSDGNVRRRSPPRGPRGGGSGGGRGEGRQAAGAANHANGMKKTAAAASAPPTSGRTQPSSREWTRRVQSRAGVTVAGGITNGEKDGDNQAAMDVDAGGDLDPEAKEMERMMGFSSFSSTHNTKVPGNDLNYGVRKEKKTEYRQYMNRVGGFNRPLSPSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.75
3 0.68
4 0.62
5 0.59
6 0.56
7 0.51
8 0.44
9 0.37
10 0.33
11 0.34
12 0.37
13 0.39
14 0.46
15 0.54
16 0.6
17 0.64
18 0.65
19 0.68
20 0.67
21 0.69
22 0.69
23 0.66
24 0.65
25 0.6
26 0.58
27 0.53
28 0.52
29 0.53
30 0.51
31 0.52
32 0.49
33 0.55
34 0.59
35 0.66
36 0.68
37 0.62
38 0.54
39 0.47
40 0.41
41 0.33
42 0.3
43 0.21
44 0.13
45 0.09
46 0.08
47 0.09
48 0.12
49 0.13
50 0.14
51 0.15
52 0.21
53 0.24
54 0.3
55 0.35
56 0.41
57 0.5
58 0.53
59 0.56
60 0.55
61 0.53
62 0.54
63 0.57
64 0.55
65 0.49
66 0.49
67 0.52
68 0.56
69 0.63
70 0.62
71 0.55
72 0.52
73 0.5
74 0.5
75 0.51
76 0.49
77 0.47
78 0.45
79 0.45
80 0.44
81 0.43
82 0.37
83 0.35
84 0.36
85 0.35
86 0.4
87 0.43
88 0.47
89 0.57
90 0.64
91 0.69
92 0.67
93 0.65
94 0.64
95 0.63
96 0.64
97 0.62
98 0.61
99 0.61
100 0.62
101 0.6
102 0.55
103 0.55
104 0.49
105 0.42
106 0.34
107 0.27
108 0.18
109 0.18
110 0.16
111 0.11
112 0.11
113 0.09
114 0.08
115 0.05
116 0.06
117 0.05
118 0.05
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.07
123 0.07
124 0.08
125 0.07
126 0.09
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.07
133 0.09
134 0.1
135 0.11
136 0.11
137 0.11
138 0.12
139 0.13
140 0.16
141 0.18
142 0.19
143 0.21
144 0.25
145 0.31
146 0.37
147 0.4
148 0.44
149 0.45
150 0.48
151 0.53
152 0.56
153 0.54
154 0.5
155 0.5
156 0.46
157 0.46
158 0.39
159 0.32
160 0.24
161 0.22
162 0.18
163 0.13
164 0.09
165 0.07
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.05
170 0.05
171 0.06
172 0.1
173 0.1
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.09
178 0.09
179 0.08
180 0.05
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.03
186 0.03
187 0.05
188 0.04
189 0.05
190 0.06
191 0.06
192 0.07
193 0.07
194 0.11
195 0.09
196 0.1
197 0.11
198 0.12
199 0.12
200 0.12
201 0.14
202 0.12
203 0.13
204 0.19
205 0.19
206 0.21
207 0.25
208 0.27
209 0.27
210 0.29
211 0.33
212 0.33
213 0.35
214 0.35
215 0.33
216 0.37
217 0.39
218 0.39
219 0.4
220 0.41
221 0.41
222 0.43
223 0.5
224 0.55
225 0.6
226 0.68
227 0.72
228 0.75
229 0.8
230 0.83
231 0.82
232 0.78
233 0.72
234 0.64
235 0.57
236 0.54
237 0.5
238 0.45
239 0.4