Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9RUN4

Protein Details
Accession A0A1J9RUN4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
304-324QLNKAKSKAARAKRKEQRITLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
308-319AKSKAARAKRKE
775-775K
Subcellular Location(s) nucl 11.5, extr 8, cyto_nucl 8, cyto 3.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040151  Gfd2/YDR514C-like  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MHHHSTSLNITIAEHNTSLNVNFFHSIPAGAASKRLAMPLSRADRLLGLLSHDILALPKAPSPPVDSEPHFANQEAQPSTECQAQASPEPSSFADTKAPAENISALADALSLDDRSPSPDGSDSSHEPDPYDDSPATNLYRGDLAPWGEAYVSILVASKFPYKFLNRAYSDPVAKKFFDRNQFWERHWELYYVWPPADVASKPLILITLTQFQLLIHEINQYKRNLDFKLTDYHRDCGLILDIPHPAFTPRFLGYSYSRDDFNDMEQRRVPPATYKAPGEPARLPVADKPTLEAYKAMIEDAIQLNKAKSKAARAKRKEQRITLQQNWGRSLKRTQRYLGLRPDRTDSSKRLEDPSLNWAELQAAEAAHYKIPPIECEKPAPFNFDKNVIFISVDIEAFEFDNNKITEVGVAILDVLDIVDIPPGRNGENWFSKIRARHFRIHEHAHLENRRHVAGCADGFEFGKSEFVRLAEAPSVVASCFRPPYSAKLTPAEAQRLWSTDGSSDPLLDPSIVNADGKRNLILIGHDPNQDIKYLQKLGYNPLNLSNLVEVLDTKLLHQHWKRDPNGTSLGRILADLDIIGWKLHNGGNDAVYTLQALLALGLREATSRGSQQVEEQRKQDHEKRMADALAETTSRINDEADGWSSPGESEADADADGGGAGSNGNGSSSGSPSVAPTGSSHTDNPLDASSDRIFVGNLPYRATPDDVAAFFAKHGAVADVHLPVNHVTGAAKGFGYVSFRSPAEARHALQKSKGVEFWSRAIRVDMAPPREKKKGDGRGSNAGGSNSNGNSNNSSDGAGAGAAARRSQRSSRGGTPPVSRPGGTPVRITDPAARAASSSLQNNTRRQGGGKAPSSEGAGRRDGDGGGGGSGGAGVGGGGGAGVGGGGGAGVGGGGGAGVVDHLTGATKNYTKQDLPNDWW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.18
3 0.18
4 0.19
5 0.18
6 0.17
7 0.16
8 0.15
9 0.17
10 0.17
11 0.18
12 0.17
13 0.16
14 0.13
15 0.16
16 0.17
17 0.15
18 0.17
19 0.16
20 0.19
21 0.2
22 0.21
23 0.19
24 0.18
25 0.23
26 0.3
27 0.36
28 0.34
29 0.34
30 0.33
31 0.32
32 0.32
33 0.29
34 0.2
35 0.17
36 0.17
37 0.17
38 0.16
39 0.15
40 0.14
41 0.12
42 0.12
43 0.12
44 0.11
45 0.13
46 0.15
47 0.16
48 0.18
49 0.22
50 0.27
51 0.29
52 0.34
53 0.34
54 0.36
55 0.38
56 0.4
57 0.37
58 0.32
59 0.32
60 0.28
61 0.32
62 0.29
63 0.27
64 0.25
65 0.26
66 0.28
67 0.28
68 0.25
69 0.19
70 0.2
71 0.22
72 0.26
73 0.26
74 0.26
75 0.22
76 0.25
77 0.24
78 0.26
79 0.24
80 0.21
81 0.23
82 0.22
83 0.25
84 0.27
85 0.27
86 0.23
87 0.23
88 0.23
89 0.19
90 0.19
91 0.16
92 0.11
93 0.1
94 0.09
95 0.08
96 0.07
97 0.07
98 0.06
99 0.06
100 0.08
101 0.09
102 0.12
103 0.14
104 0.14
105 0.15
106 0.18
107 0.19
108 0.21
109 0.27
110 0.27
111 0.3
112 0.33
113 0.3
114 0.28
115 0.28
116 0.3
117 0.25
118 0.26
119 0.22
120 0.19
121 0.21
122 0.24
123 0.24
124 0.2
125 0.19
126 0.16
127 0.18
128 0.17
129 0.16
130 0.16
131 0.16
132 0.15
133 0.15
134 0.14
135 0.12
136 0.12
137 0.12
138 0.09
139 0.07
140 0.07
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.11
145 0.15
146 0.15
147 0.16
148 0.23
149 0.25
150 0.31
151 0.37
152 0.44
153 0.41
154 0.44
155 0.49
156 0.48
157 0.51
158 0.5
159 0.49
160 0.43
161 0.41
162 0.42
163 0.43
164 0.45
165 0.48
166 0.49
167 0.51
168 0.56
169 0.58
170 0.56
171 0.58
172 0.54
173 0.48
174 0.44
175 0.38
176 0.31
177 0.35
178 0.38
179 0.31
180 0.28
181 0.23
182 0.22
183 0.22
184 0.25
185 0.16
186 0.15
187 0.15
188 0.15
189 0.15
190 0.15
191 0.14
192 0.11
193 0.12
194 0.12
195 0.15
196 0.15
197 0.15
198 0.15
199 0.15
200 0.16
201 0.16
202 0.14
203 0.09
204 0.14
205 0.17
206 0.21
207 0.26
208 0.26
209 0.26
210 0.29
211 0.33
212 0.28
213 0.31
214 0.3
215 0.27
216 0.36
217 0.37
218 0.42
219 0.41
220 0.41
221 0.38
222 0.35
223 0.33
224 0.24
225 0.23
226 0.17
227 0.14
228 0.14
229 0.15
230 0.15
231 0.15
232 0.14
233 0.13
234 0.11
235 0.12
236 0.14
237 0.13
238 0.14
239 0.14
240 0.18
241 0.19
242 0.23
243 0.26
244 0.24
245 0.23
246 0.23
247 0.24
248 0.21
249 0.23
250 0.28
251 0.25
252 0.27
253 0.29
254 0.3
255 0.31
256 0.31
257 0.27
258 0.24
259 0.29
260 0.32
261 0.32
262 0.32
263 0.31
264 0.38
265 0.4
266 0.38
267 0.34
268 0.31
269 0.31
270 0.3
271 0.29
272 0.25
273 0.28
274 0.27
275 0.25
276 0.24
277 0.25
278 0.25
279 0.25
280 0.21
281 0.17
282 0.17
283 0.17
284 0.15
285 0.1
286 0.09
287 0.11
288 0.13
289 0.13
290 0.11
291 0.11
292 0.12
293 0.15
294 0.16
295 0.16
296 0.15
297 0.24
298 0.33
299 0.43
300 0.53
301 0.57
302 0.67
303 0.73
304 0.82
305 0.8
306 0.77
307 0.76
308 0.75
309 0.78
310 0.72
311 0.73
312 0.64
313 0.6
314 0.58
315 0.52
316 0.43
317 0.37
318 0.41
319 0.4
320 0.45
321 0.46
322 0.44
323 0.49
324 0.54
325 0.58
326 0.6
327 0.59
328 0.55
329 0.53
330 0.55
331 0.49
332 0.48
333 0.46
334 0.39
335 0.37
336 0.38
337 0.38
338 0.38
339 0.37
340 0.33
341 0.31
342 0.35
343 0.3
344 0.26
345 0.24
346 0.2
347 0.18
348 0.16
349 0.15
350 0.08
351 0.05
352 0.06
353 0.08
354 0.09
355 0.08
356 0.08
357 0.08
358 0.09
359 0.1
360 0.11
361 0.16
362 0.2
363 0.21
364 0.26
365 0.27
366 0.31
367 0.32
368 0.36
369 0.31
370 0.3
371 0.3
372 0.31
373 0.29
374 0.24
375 0.24
376 0.17
377 0.16
378 0.13
379 0.13
380 0.08
381 0.07
382 0.07
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.06
387 0.06
388 0.05
389 0.1
390 0.1
391 0.1
392 0.1
393 0.1
394 0.1
395 0.09
396 0.09
397 0.05
398 0.05
399 0.04
400 0.04
401 0.03
402 0.03
403 0.02
404 0.02
405 0.02
406 0.02
407 0.03
408 0.04
409 0.04
410 0.05
411 0.06
412 0.07
413 0.09
414 0.1
415 0.14
416 0.18
417 0.21
418 0.21
419 0.21
420 0.24
421 0.27
422 0.32
423 0.37
424 0.39
425 0.43
426 0.47
427 0.53
428 0.56
429 0.57
430 0.53
431 0.47
432 0.45
433 0.44
434 0.43
435 0.39
436 0.37
437 0.33
438 0.3
439 0.26
440 0.24
441 0.18
442 0.16
443 0.14
444 0.11
445 0.1
446 0.1
447 0.1
448 0.1
449 0.09
450 0.07
451 0.09
452 0.07
453 0.08
454 0.07
455 0.07
456 0.09
457 0.08
458 0.1
459 0.08
460 0.08
461 0.08
462 0.07
463 0.07
464 0.06
465 0.07
466 0.06
467 0.07
468 0.08
469 0.08
470 0.1
471 0.11
472 0.17
473 0.23
474 0.26
475 0.27
476 0.28
477 0.3
478 0.32
479 0.33
480 0.31
481 0.24
482 0.22
483 0.2
484 0.2
485 0.2
486 0.16
487 0.14
488 0.11
489 0.12
490 0.12
491 0.11
492 0.1
493 0.08
494 0.09
495 0.08
496 0.08
497 0.07
498 0.05
499 0.07
500 0.07
501 0.07
502 0.07
503 0.09
504 0.11
505 0.11
506 0.11
507 0.1
508 0.1
509 0.1
510 0.1
511 0.11
512 0.13
513 0.15
514 0.16
515 0.16
516 0.18
517 0.18
518 0.17
519 0.14
520 0.12
521 0.13
522 0.15
523 0.15
524 0.17
525 0.17
526 0.22
527 0.27
528 0.27
529 0.23
530 0.23
531 0.24
532 0.21
533 0.2
534 0.16
535 0.11
536 0.1
537 0.09
538 0.07
539 0.06
540 0.08
541 0.07
542 0.07
543 0.1
544 0.11
545 0.19
546 0.21
547 0.28
548 0.35
549 0.44
550 0.46
551 0.49
552 0.5
553 0.47
554 0.53
555 0.46
556 0.39
557 0.31
558 0.3
559 0.23
560 0.21
561 0.17
562 0.09
563 0.07
564 0.06
565 0.05
566 0.05
567 0.05
568 0.05
569 0.04
570 0.04
571 0.06
572 0.07
573 0.08
574 0.1
575 0.11
576 0.12
577 0.12
578 0.12
579 0.11
580 0.09
581 0.08
582 0.06
583 0.05
584 0.04
585 0.04
586 0.04
587 0.05
588 0.05
589 0.04
590 0.04
591 0.04
592 0.05
593 0.05
594 0.07
595 0.07
596 0.08
597 0.11
598 0.12
599 0.12
600 0.18
601 0.27
602 0.34
603 0.35
604 0.37
605 0.38
606 0.41
607 0.48
608 0.5
609 0.5
610 0.5
611 0.51
612 0.51
613 0.5
614 0.46
615 0.4
616 0.32
617 0.24
618 0.17
619 0.14
620 0.12
621 0.09
622 0.09
623 0.09
624 0.09
625 0.08
626 0.07
627 0.08
628 0.1
629 0.11
630 0.11
631 0.11
632 0.1
633 0.1
634 0.1
635 0.09
636 0.08
637 0.06
638 0.06
639 0.07
640 0.07
641 0.07
642 0.07
643 0.06
644 0.05
645 0.05
646 0.04
647 0.03
648 0.03
649 0.03
650 0.02
651 0.03
652 0.03
653 0.03
654 0.03
655 0.05
656 0.06
657 0.07
658 0.08
659 0.08
660 0.09
661 0.09
662 0.11
663 0.1
664 0.1
665 0.1
666 0.14
667 0.16
668 0.18
669 0.18
670 0.2
671 0.21
672 0.2
673 0.21
674 0.16
675 0.16
676 0.14
677 0.18
678 0.15
679 0.15
680 0.16
681 0.14
682 0.14
683 0.12
684 0.19
685 0.21
686 0.21
687 0.21
688 0.22
689 0.23
690 0.25
691 0.26
692 0.19
693 0.16
694 0.18
695 0.16
696 0.18
697 0.17
698 0.15
699 0.13
700 0.14
701 0.12
702 0.09
703 0.09
704 0.07
705 0.07
706 0.08
707 0.1
708 0.1
709 0.11
710 0.11
711 0.11
712 0.11
713 0.11
714 0.1
715 0.09
716 0.07
717 0.09
718 0.1
719 0.09
720 0.09
721 0.08
722 0.08
723 0.09
724 0.12
725 0.12
726 0.13
727 0.15
728 0.15
729 0.18
730 0.18
731 0.19
732 0.24
733 0.27
734 0.26
735 0.33
736 0.38
737 0.37
738 0.4
739 0.43
740 0.39
741 0.37
742 0.39
743 0.33
744 0.33
745 0.34
746 0.37
747 0.38
748 0.36
749 0.34
750 0.33
751 0.31
752 0.27
753 0.33
754 0.34
755 0.34
756 0.4
757 0.45
758 0.49
759 0.54
760 0.54
761 0.53
762 0.57
763 0.61
764 0.62
765 0.66
766 0.66
767 0.68
768 0.7
769 0.65
770 0.57
771 0.47
772 0.39
773 0.31
774 0.29
775 0.2
776 0.23
777 0.22
778 0.22
779 0.23
780 0.23
781 0.24
782 0.21
783 0.21
784 0.16
785 0.15
786 0.13
787 0.1
788 0.09
789 0.07
790 0.09
791 0.09
792 0.11
793 0.13
794 0.15
795 0.2
796 0.24
797 0.31
798 0.36
799 0.42
800 0.48
801 0.55
802 0.58
803 0.59
804 0.61
805 0.59
806 0.6
807 0.56
808 0.48
809 0.4
810 0.43
811 0.46
812 0.42
813 0.38
814 0.34
815 0.38
816 0.39
817 0.4
818 0.39
819 0.34
820 0.37
821 0.36
822 0.32
823 0.26
824 0.26
825 0.28
826 0.25
827 0.26
828 0.26
829 0.33
830 0.39
831 0.44
832 0.46
833 0.46
834 0.44
835 0.42
836 0.44
837 0.45
838 0.49
839 0.5
840 0.49
841 0.46
842 0.46
843 0.47
844 0.44
845 0.4
846 0.35
847 0.32
848 0.29
849 0.28
850 0.29
851 0.25
852 0.21
853 0.18
854 0.15
855 0.11
856 0.1
857 0.09
858 0.07
859 0.07
860 0.06
861 0.03
862 0.03
863 0.02
864 0.02
865 0.02
866 0.02
867 0.02
868 0.02
869 0.02
870 0.02
871 0.02
872 0.01
873 0.01
874 0.01
875 0.01
876 0.01
877 0.01
878 0.01
879 0.01
880 0.01
881 0.01
882 0.01
883 0.01
884 0.01
885 0.02
886 0.02
887 0.02
888 0.02
889 0.02
890 0.03
891 0.03
892 0.05
893 0.05
894 0.08
895 0.13
896 0.16
897 0.21
898 0.26
899 0.32
900 0.34
901 0.4
902 0.48