Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G3BEN5

Protein Details
Accession G3BEN5    Localization Confidence High Confidence Score 17.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
40-61EAPKADPSKAKKKKPVTGNEGAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
36-54KKKDEAPKADPSKAKKKKP
192-202KIKQKAAKGKK
221-254STRGSPRGGRGAARGATRGARGASRGARGDSKPA
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG cten:CANTEDRAFT_115966  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSFQNKNLFHLLGNDVEDEEPSLAPRELVKNNTSSKKKDEAPKADPSKAKKKKPVTGNEGAIKEQLNNKEVPGPSSTPTSHYKKSFDRHATRTHKGGQRKPRTDPKDGEATLEDELDGEQDAEEEEAAAEVVDQTPKKSLEDYMAELKLAQATLDGQKAARTANEGAEGKWTAEELLVKQQEEYVPASVEKKIKQKAAKGKKFLEFDATFDAPSAPRPASSTRGSPRGGRGAARGATRGARGASRGARGDSKPATSRRTDSKVALDDDKKFPSL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.19
3 0.18
4 0.17
5 0.15
6 0.13
7 0.1
8 0.1
9 0.13
10 0.12
11 0.12
12 0.15
13 0.21
14 0.24
15 0.29
16 0.31
17 0.34
18 0.42
19 0.51
20 0.54
21 0.52
22 0.54
23 0.57
24 0.61
25 0.64
26 0.67
27 0.66
28 0.66
29 0.72
30 0.72
31 0.72
32 0.7
33 0.68
34 0.69
35 0.7
36 0.73
37 0.72
38 0.75
39 0.77
40 0.81
41 0.83
42 0.81
43 0.8
44 0.78
45 0.74
46 0.66
47 0.58
48 0.5
49 0.4
50 0.34
51 0.31
52 0.27
53 0.23
54 0.22
55 0.22
56 0.26
57 0.26
58 0.26
59 0.24
60 0.22
61 0.21
62 0.25
63 0.25
64 0.23
65 0.3
66 0.34
67 0.36
68 0.38
69 0.41
70 0.44
71 0.5
72 0.55
73 0.58
74 0.6
75 0.58
76 0.65
77 0.68
78 0.64
79 0.63
80 0.61
81 0.58
82 0.59
83 0.62
84 0.63
85 0.66
86 0.68
87 0.71
88 0.73
89 0.73
90 0.72
91 0.67
92 0.59
93 0.58
94 0.52
95 0.46
96 0.37
97 0.32
98 0.25
99 0.22
100 0.18
101 0.08
102 0.08
103 0.06
104 0.05
105 0.04
106 0.03
107 0.03
108 0.03
109 0.03
110 0.03
111 0.03
112 0.03
113 0.03
114 0.03
115 0.02
116 0.02
117 0.02
118 0.03
119 0.05
120 0.05
121 0.06
122 0.08
123 0.09
124 0.09
125 0.1
126 0.1
127 0.12
128 0.14
129 0.16
130 0.18
131 0.17
132 0.17
133 0.16
134 0.15
135 0.12
136 0.1
137 0.07
138 0.04
139 0.05
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.08
145 0.09
146 0.09
147 0.08
148 0.09
149 0.09
150 0.1
151 0.15
152 0.15
153 0.14
154 0.17
155 0.17
156 0.14
157 0.13
158 0.12
159 0.08
160 0.08
161 0.09
162 0.07
163 0.14
164 0.16
165 0.16
166 0.16
167 0.17
168 0.17
169 0.18
170 0.18
171 0.12
172 0.11
173 0.12
174 0.14
175 0.16
176 0.2
177 0.22
178 0.28
179 0.32
180 0.38
181 0.43
182 0.5
183 0.57
184 0.65
185 0.69
186 0.69
187 0.7
188 0.7
189 0.68
190 0.61
191 0.58
192 0.47
193 0.41
194 0.4
195 0.34
196 0.27
197 0.24
198 0.24
199 0.16
200 0.17
201 0.18
202 0.12
203 0.12
204 0.15
205 0.18
206 0.22
207 0.25
208 0.31
209 0.34
210 0.4
211 0.42
212 0.42
213 0.44
214 0.47
215 0.45
216 0.39
217 0.36
218 0.37
219 0.38
220 0.37
221 0.32
222 0.27
223 0.28
224 0.27
225 0.26
226 0.21
227 0.19
228 0.19
229 0.24
230 0.26
231 0.28
232 0.3
233 0.31
234 0.35
235 0.35
236 0.41
237 0.38
238 0.4
239 0.42
240 0.45
241 0.48
242 0.47
243 0.51
244 0.52
245 0.56
246 0.55
247 0.52
248 0.54
249 0.55
250 0.54
251 0.57
252 0.53
253 0.52
254 0.53