Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9QSS9

Protein Details
Accession A0A1J9QSS9    Localization Confidence High Confidence Score 22.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-57EQPAPVKTSKKSKKEAPKQDEDAAHydrophilic
81-124AAESTPKKSKKAKKEKDEKPVEESAPAAKPVKGKKAKKEKDEEPBasic
334-359REDWDKRIEREEKRRKSKGDKLKEMGBasic
404-428EAMEAVKKSKKSKKRESNGAVEEEKHydrophilic
444-466AGKAEKADKKASKPKAKKAKTSAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-51KSKKRKSGGAVTSPSTKKLRKSEAPSPEEQPAPVKTSKKSKKEAPK
86-142PKKSKKAKKEKDEKPVEESAPAAKPVKGKKAKKEKDEEPAEVPAAAAKAVKGKKRKA
313-355KRFKAAPRNKMQGRHLRLGMVREDWDKRIEREEKRRKSKGDKL
410-465KKSKKSKKRESNGAVEEEKEKEPVKVKATKEKKDAGKAEKADKKASKPKAKKAKTS
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAPETKSKKRKSGGAVTSPSTKKLRKSEAPSPEEQPAPVKTSKKSKKEAPKQDEDAAVTRSKSSRKRATDFFDAADEEADAAESTPKKSKKAKKEKDEKPVEESAPAAKPVKGKKAKKEKDEEPAEVPAAAAKAVKGKKRKAAEEPAPVEEPAEEEEIAVDGSEGESEDEDDQTKALLKGFESDEDEEDGEDEGDLSKLPALPDSKKLAKQLKKVKEDNSTGVIYIGRVPHGFYEHQMKAYFTQFGEVKRVRVARNKKTGRSKHYAFVEFANNDVAKIVAETMDKYLMFGHILQVRYIPAEQVHPELFKGSNKRFKAAPRNKMQGRHLRLGMVREDWDKRIEREEKRRKSKGDKLKEMGYDFEAPAIKSTNKIPKRTEAPAEAEEAPKTLTDKAHDEEDQEVAEAMEAVKKSKKSKKRESNGAVEEEKEKEPVKVKATKEKKDAGKAEKADKKASKPKAKKAKTSA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.76
3 0.7
4 0.73
5 0.65
6 0.62
7 0.59
8 0.54
9 0.52
10 0.56
11 0.63
12 0.63
13 0.7
14 0.74
15 0.77
16 0.78
17 0.74
18 0.69
19 0.65
20 0.57
21 0.49
22 0.44
23 0.37
24 0.35
25 0.37
26 0.37
27 0.38
28 0.48
29 0.57
30 0.61
31 0.66
32 0.71
33 0.77
34 0.83
35 0.88
36 0.86
37 0.85
38 0.82
39 0.79
40 0.73
41 0.65
42 0.57
43 0.49
44 0.42
45 0.33
46 0.3
47 0.3
48 0.34
49 0.39
50 0.45
51 0.52
52 0.58
53 0.64
54 0.69
55 0.72
56 0.73
57 0.67
58 0.58
59 0.51
60 0.43
61 0.36
62 0.29
63 0.22
64 0.13
65 0.1
66 0.09
67 0.06
68 0.06
69 0.1
70 0.1
71 0.13
72 0.21
73 0.24
74 0.3
75 0.4
76 0.5
77 0.57
78 0.68
79 0.76
80 0.79
81 0.88
82 0.9
83 0.91
84 0.92
85 0.84
86 0.79
87 0.74
88 0.64
89 0.54
90 0.46
91 0.39
92 0.3
93 0.29
94 0.24
95 0.2
96 0.25
97 0.3
98 0.4
99 0.45
100 0.51
101 0.59
102 0.69
103 0.75
104 0.79
105 0.82
106 0.78
107 0.78
108 0.77
109 0.7
110 0.62
111 0.56
112 0.47
113 0.38
114 0.3
115 0.21
116 0.15
117 0.12
118 0.08
119 0.06
120 0.13
121 0.18
122 0.25
123 0.32
124 0.37
125 0.45
126 0.52
127 0.57
128 0.59
129 0.64
130 0.66
131 0.68
132 0.65
133 0.61
134 0.55
135 0.49
136 0.41
137 0.3
138 0.23
139 0.15
140 0.13
141 0.09
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.06
147 0.05
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.04
154 0.05
155 0.05
156 0.06
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.09
162 0.08
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.12
167 0.13
168 0.14
169 0.15
170 0.16
171 0.15
172 0.15
173 0.15
174 0.12
175 0.12
176 0.1
177 0.07
178 0.06
179 0.05
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.05
186 0.06
187 0.08
188 0.11
189 0.12
190 0.17
191 0.22
192 0.26
193 0.27
194 0.34
195 0.4
196 0.44
197 0.51
198 0.57
199 0.61
200 0.65
201 0.67
202 0.66
203 0.65
204 0.61
205 0.55
206 0.49
207 0.4
208 0.31
209 0.27
210 0.22
211 0.14
212 0.13
213 0.11
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.1
219 0.1
220 0.1
221 0.17
222 0.17
223 0.19
224 0.19
225 0.19
226 0.18
227 0.2
228 0.2
229 0.12
230 0.15
231 0.14
232 0.15
233 0.22
234 0.21
235 0.2
236 0.22
237 0.26
238 0.26
239 0.34
240 0.42
241 0.44
242 0.54
243 0.59
244 0.63
245 0.69
246 0.74
247 0.73
248 0.72
249 0.66
250 0.62
251 0.62
252 0.57
253 0.47
254 0.42
255 0.39
256 0.31
257 0.29
258 0.25
259 0.19
260 0.16
261 0.15
262 0.12
263 0.07
264 0.07
265 0.06
266 0.05
267 0.05
268 0.06
269 0.07
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.09
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.11
278 0.13
279 0.14
280 0.14
281 0.14
282 0.14
283 0.14
284 0.14
285 0.11
286 0.08
287 0.1
288 0.11
289 0.13
290 0.14
291 0.13
292 0.13
293 0.14
294 0.15
295 0.17
296 0.24
297 0.28
298 0.36
299 0.37
300 0.39
301 0.41
302 0.48
303 0.55
304 0.58
305 0.6
306 0.6
307 0.69
308 0.71
309 0.74
310 0.74
311 0.73
312 0.7
313 0.66
314 0.58
315 0.52
316 0.5
317 0.46
318 0.4
319 0.32
320 0.27
321 0.25
322 0.27
323 0.25
324 0.28
325 0.27
326 0.26
327 0.33
328 0.39
329 0.44
330 0.53
331 0.62
332 0.68
333 0.76
334 0.82
335 0.81
336 0.83
337 0.84
338 0.83
339 0.83
340 0.83
341 0.77
342 0.76
343 0.73
344 0.64
345 0.56
346 0.49
347 0.4
348 0.3
349 0.29
350 0.24
351 0.19
352 0.19
353 0.2
354 0.17
355 0.16
356 0.23
357 0.3
358 0.35
359 0.42
360 0.44
361 0.5
362 0.56
363 0.6
364 0.59
365 0.54
366 0.53
367 0.48
368 0.49
369 0.42
370 0.38
371 0.32
372 0.26
373 0.21
374 0.16
375 0.16
376 0.15
377 0.15
378 0.17
379 0.21
380 0.23
381 0.28
382 0.28
383 0.28
384 0.27
385 0.26
386 0.22
387 0.18
388 0.16
389 0.1
390 0.1
391 0.08
392 0.07
393 0.09
394 0.09
395 0.11
396 0.16
397 0.21
398 0.31
399 0.41
400 0.5
401 0.58
402 0.69
403 0.77
404 0.83
405 0.89
406 0.88
407 0.88
408 0.85
409 0.81
410 0.71
411 0.62
412 0.55
413 0.48
414 0.4
415 0.34
416 0.28
417 0.26
418 0.3
419 0.34
420 0.38
421 0.42
422 0.47
423 0.54
424 0.63
425 0.68
426 0.7
427 0.73
428 0.73
429 0.76
430 0.79
431 0.76
432 0.76
433 0.73
434 0.75
435 0.74
436 0.7
437 0.7
438 0.68
439 0.7
440 0.7
441 0.75
442 0.76
443 0.78
444 0.84
445 0.86
446 0.89