Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9RHD5

Protein Details
Accession A0A1J9RHD5    Localization Confidence High Confidence Score 22.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
133-154DDDTEKKSKKRARKDDGEEEPAAcidic
323-343VAPNQKKSRAKAKKVVEEDKVHydrophilic
357-376EEAPKAKRSAPAKRGRKAKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
138-167KKSKKRARKDDGEEEPAPKKARGKKAVKAK
181-194APKKARGRKSAKAK
214-255APKKARGKKAVKAKEEDPKQEADKEAPAPKKARGKKAVKAKE
266-279PAPKKRGRKAKAAK
328-335KKSRAKAK
360-376PKAKRSAPAKRGRKAKA
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005819  H1/H5  
IPR001510  Znf_PARP  
IPR036957  Znf_PARP_sf  
Gene Ontology GO:0000786  C:nucleosome  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0030527  F:structural constituent of chromatin  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006334  P:nucleosome assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF00645  zf-PARP  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50064  ZF_PARP_2  
Amino Acid Sequences MPTGYRVEISPNKRATCKNTECKKAGVKIDKGELRFATMVTVMENTSWAYKHWGCVTPKVIGNLKDFLDGDMSMLDGFEELPDDAQEKIQKAIDEGHVDDEDWKGDVEKNREGQNGFRLTKADKKKLGIDEDDDDTEKKSKKRARKDDGEEEPAPKKARGKKAVKAKEEADEQDEEEEAPAPKKARGRKSAKAKAEEQEPEQEQIQEEEEEAPAPKKARGKKAVKAKEEDPKQEADKEAPAPKKARGKKAVKAKEADEQDEEEEAPAPKKRGRKAKAAKVEEVDVKENDNSADEDGEEPVSMPQAKASRAKKAVAEDNEEPAVAPNQKKSRAKAKKVVEEDKVEEEAPEEVPEEAPEEAPKAKRSAPAKRGRKAKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.6
3 0.62
4 0.67
5 0.69
6 0.71
7 0.77
8 0.74
9 0.75
10 0.75
11 0.72
12 0.71
13 0.7
14 0.67
15 0.63
16 0.69
17 0.67
18 0.6
19 0.58
20 0.49
21 0.44
22 0.38
23 0.32
24 0.25
25 0.2
26 0.19
27 0.14
28 0.15
29 0.1
30 0.1
31 0.11
32 0.1
33 0.1
34 0.11
35 0.11
36 0.17
37 0.18
38 0.22
39 0.27
40 0.34
41 0.35
42 0.42
43 0.44
44 0.42
45 0.44
46 0.45
47 0.44
48 0.41
49 0.42
50 0.38
51 0.35
52 0.33
53 0.3
54 0.26
55 0.22
56 0.18
57 0.15
58 0.11
59 0.11
60 0.07
61 0.07
62 0.06
63 0.04
64 0.04
65 0.04
66 0.05
67 0.05
68 0.05
69 0.06
70 0.07
71 0.07
72 0.1
73 0.13
74 0.13
75 0.15
76 0.17
77 0.17
78 0.18
79 0.21
80 0.22
81 0.21
82 0.21
83 0.21
84 0.19
85 0.19
86 0.19
87 0.16
88 0.13
89 0.1
90 0.1
91 0.08
92 0.12
93 0.17
94 0.21
95 0.26
96 0.29
97 0.32
98 0.35
99 0.35
100 0.34
101 0.37
102 0.4
103 0.35
104 0.33
105 0.31
106 0.3
107 0.38
108 0.44
109 0.44
110 0.4
111 0.42
112 0.47
113 0.51
114 0.52
115 0.46
116 0.41
117 0.36
118 0.34
119 0.32
120 0.27
121 0.22
122 0.19
123 0.22
124 0.23
125 0.22
126 0.28
127 0.34
128 0.43
129 0.54
130 0.63
131 0.68
132 0.74
133 0.8
134 0.81
135 0.8
136 0.78
137 0.68
138 0.6
139 0.52
140 0.46
141 0.39
142 0.31
143 0.31
144 0.32
145 0.4
146 0.47
147 0.52
148 0.55
149 0.64
150 0.72
151 0.69
152 0.65
153 0.57
154 0.51
155 0.48
156 0.42
157 0.34
158 0.26
159 0.22
160 0.18
161 0.17
162 0.12
163 0.09
164 0.09
165 0.07
166 0.07
167 0.08
168 0.09
169 0.11
170 0.16
171 0.23
172 0.3
173 0.4
174 0.46
175 0.53
176 0.63
177 0.7
178 0.71
179 0.69
180 0.64
181 0.58
182 0.56
183 0.5
184 0.41
185 0.37
186 0.32
187 0.29
188 0.26
189 0.23
190 0.17
191 0.16
192 0.15
193 0.09
194 0.09
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.09
202 0.12
203 0.17
204 0.24
205 0.33
206 0.42
207 0.48
208 0.53
209 0.63
210 0.69
211 0.68
212 0.66
213 0.62
214 0.62
215 0.61
216 0.58
217 0.5
218 0.44
219 0.41
220 0.38
221 0.35
222 0.27
223 0.25
224 0.25
225 0.29
226 0.29
227 0.31
228 0.32
229 0.36
230 0.44
231 0.47
232 0.52
233 0.55
234 0.59
235 0.61
236 0.7
237 0.73
238 0.69
239 0.67
240 0.6
241 0.57
242 0.54
243 0.5
244 0.41
245 0.33
246 0.28
247 0.25
248 0.23
249 0.15
250 0.13
251 0.11
252 0.12
253 0.13
254 0.15
255 0.18
256 0.25
257 0.32
258 0.42
259 0.47
260 0.55
261 0.63
262 0.71
263 0.78
264 0.76
265 0.74
266 0.65
267 0.65
268 0.58
269 0.51
270 0.44
271 0.34
272 0.3
273 0.25
274 0.23
275 0.2
276 0.16
277 0.14
278 0.11
279 0.11
280 0.1
281 0.1
282 0.1
283 0.1
284 0.09
285 0.08
286 0.08
287 0.1
288 0.1
289 0.09
290 0.12
291 0.15
292 0.19
293 0.27
294 0.3
295 0.37
296 0.4
297 0.43
298 0.43
299 0.46
300 0.52
301 0.48
302 0.52
303 0.44
304 0.45
305 0.42
306 0.38
307 0.32
308 0.25
309 0.24
310 0.22
311 0.23
312 0.27
313 0.34
314 0.43
315 0.49
316 0.53
317 0.6
318 0.66
319 0.74
320 0.75
321 0.78
322 0.79
323 0.82
324 0.84
325 0.79
326 0.74
327 0.69
328 0.64
329 0.56
330 0.46
331 0.36
332 0.29
333 0.24
334 0.19
335 0.15
336 0.12
337 0.1
338 0.11
339 0.11
340 0.12
341 0.11
342 0.11
343 0.11
344 0.13
345 0.18
346 0.22
347 0.25
348 0.27
349 0.3
350 0.36
351 0.44
352 0.52
353 0.58
354 0.65
355 0.71
356 0.76