Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9RNR4

Protein Details
Accession A0A1J9RNR4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
426-450QTEERKHEQERIKKRQKRAAAKGGDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
431-448KHEQERIKKRQKRAAAKG
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 12.5, cyto 4, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MVQQYPPMHPPSQPPQRPYSPYPPTASSPVQMSPGGMGVPPANKRPRLSPNPGSPYTPYHNSPYSSMPNTPAPAHTPLPFNQPQPFNQPQPPEPGFDASRGAPGSMGPPQRPADKPEKPEKEKATDINDLSDVIGASGIDLREEENYLAQTYQNQHQTGSFTASFSHSPNTQSPNTSFNALSQGSFGNYPAFQGAGPVSQPPVSQKTVEEELFEKHKAAARSLAEKAQQELNDPFCRGNNIRQKIGHHTYEQGVKFNVDGLYDRISKDSPQKVNGTQAAAPDGTGMVKAQAAALLDTNAPLAEILTLLSLATKERLRGIMEDAYALSRSRQLTSHGVVSPEFAGIATGNGTPKPTTAVSTSVTKTAWDQPDSAISPTTVPTKRPLDTDSSKKDPSRLPTPPTDTPPTPQPTVSFSSDLSSTLRKLQTEERKHEQERIKKRQKRAAAKGGDSAPGTPGAQTSPADLMPLKMTKKERERLAKAGQTDEVLHKAANTTANMAIGGFGKKYSWLSGGGGGGGGGGGSGASTPRLNTNVGGGGGGGMLSGGPGGGGAGGGGGGTQDRGLAARDRKWGDWREDGSKGKGIQMRDLIAALEQDGNEKKTLARALVRLKSDN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.6
3 0.67
4 0.71
5 0.71
6 0.71
7 0.68
8 0.67
9 0.67
10 0.63
11 0.59
12 0.59
13 0.53
14 0.45
15 0.4
16 0.36
17 0.34
18 0.29
19 0.25
20 0.2
21 0.18
22 0.16
23 0.12
24 0.12
25 0.12
26 0.17
27 0.2
28 0.27
29 0.34
30 0.39
31 0.41
32 0.49
33 0.57
34 0.61
35 0.67
36 0.68
37 0.71
38 0.75
39 0.74
40 0.69
41 0.62
42 0.59
43 0.56
44 0.52
45 0.45
46 0.42
47 0.44
48 0.43
49 0.43
50 0.42
51 0.43
52 0.41
53 0.4
54 0.38
55 0.38
56 0.39
57 0.38
58 0.33
59 0.3
60 0.31
61 0.32
62 0.31
63 0.3
64 0.3
65 0.37
66 0.39
67 0.38
68 0.4
69 0.41
70 0.41
71 0.46
72 0.51
73 0.48
74 0.51
75 0.53
76 0.48
77 0.53
78 0.52
79 0.47
80 0.42
81 0.41
82 0.36
83 0.32
84 0.32
85 0.23
86 0.26
87 0.22
88 0.2
89 0.15
90 0.14
91 0.15
92 0.19
93 0.23
94 0.2
95 0.25
96 0.28
97 0.34
98 0.36
99 0.39
100 0.43
101 0.46
102 0.53
103 0.58
104 0.66
105 0.67
106 0.73
107 0.73
108 0.7
109 0.68
110 0.65
111 0.61
112 0.57
113 0.51
114 0.45
115 0.39
116 0.32
117 0.27
118 0.22
119 0.16
120 0.09
121 0.08
122 0.05
123 0.05
124 0.07
125 0.07
126 0.06
127 0.06
128 0.07
129 0.07
130 0.09
131 0.09
132 0.08
133 0.09
134 0.1
135 0.1
136 0.1
137 0.13
138 0.16
139 0.22
140 0.27
141 0.26
142 0.26
143 0.27
144 0.29
145 0.26
146 0.28
147 0.22
148 0.16
149 0.17
150 0.19
151 0.19
152 0.18
153 0.19
154 0.16
155 0.19
156 0.22
157 0.27
158 0.26
159 0.29
160 0.29
161 0.3
162 0.3
163 0.29
164 0.25
165 0.2
166 0.24
167 0.21
168 0.19
169 0.16
170 0.15
171 0.13
172 0.14
173 0.13
174 0.1
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.08
179 0.07
180 0.08
181 0.08
182 0.07
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.09
187 0.09
188 0.12
189 0.16
190 0.17
191 0.17
192 0.18
193 0.21
194 0.25
195 0.25
196 0.23
197 0.19
198 0.2
199 0.23
200 0.22
201 0.18
202 0.16
203 0.19
204 0.19
205 0.19
206 0.22
207 0.21
208 0.25
209 0.26
210 0.27
211 0.27
212 0.27
213 0.27
214 0.25
215 0.23
216 0.22
217 0.23
218 0.25
219 0.24
220 0.24
221 0.22
222 0.19
223 0.24
224 0.22
225 0.29
226 0.33
227 0.36
228 0.39
229 0.4
230 0.43
231 0.47
232 0.5
233 0.44
234 0.35
235 0.34
236 0.32
237 0.37
238 0.34
239 0.28
240 0.22
241 0.2
242 0.18
243 0.18
244 0.16
245 0.1
246 0.1
247 0.1
248 0.13
249 0.14
250 0.14
251 0.13
252 0.13
253 0.15
254 0.22
255 0.28
256 0.27
257 0.3
258 0.33
259 0.33
260 0.37
261 0.37
262 0.32
263 0.25
264 0.23
265 0.21
266 0.17
267 0.16
268 0.11
269 0.09
270 0.06
271 0.05
272 0.05
273 0.04
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.03
289 0.03
290 0.03
291 0.03
292 0.03
293 0.03
294 0.03
295 0.03
296 0.03
297 0.03
298 0.06
299 0.06
300 0.07
301 0.08
302 0.1
303 0.1
304 0.11
305 0.14
306 0.14
307 0.14
308 0.13
309 0.12
310 0.11
311 0.11
312 0.1
313 0.08
314 0.09
315 0.1
316 0.11
317 0.11
318 0.15
319 0.18
320 0.19
321 0.23
322 0.2
323 0.2
324 0.19
325 0.19
326 0.16
327 0.12
328 0.1
329 0.06
330 0.05
331 0.04
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.06
336 0.06
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.1
341 0.09
342 0.1
343 0.11
344 0.13
345 0.15
346 0.19
347 0.19
348 0.18
349 0.18
350 0.16
351 0.17
352 0.22
353 0.23
354 0.21
355 0.21
356 0.2
357 0.23
358 0.24
359 0.23
360 0.16
361 0.13
362 0.12
363 0.13
364 0.19
365 0.16
366 0.16
367 0.22
368 0.25
369 0.26
370 0.28
371 0.29
372 0.3
373 0.35
374 0.42
375 0.43
376 0.45
377 0.47
378 0.46
379 0.49
380 0.45
381 0.46
382 0.46
383 0.44
384 0.43
385 0.45
386 0.52
387 0.51
388 0.52
389 0.52
390 0.44
391 0.42
392 0.45
393 0.43
394 0.37
395 0.34
396 0.3
397 0.28
398 0.31
399 0.31
400 0.25
401 0.2
402 0.21
403 0.2
404 0.2
405 0.18
406 0.15
407 0.13
408 0.18
409 0.2
410 0.19
411 0.21
412 0.3
413 0.38
414 0.45
415 0.52
416 0.54
417 0.6
418 0.61
419 0.67
420 0.66
421 0.65
422 0.68
423 0.72
424 0.75
425 0.74
426 0.81
427 0.82
428 0.83
429 0.84
430 0.83
431 0.82
432 0.78
433 0.73
434 0.69
435 0.62
436 0.55
437 0.44
438 0.35
439 0.25
440 0.2
441 0.17
442 0.12
443 0.11
444 0.09
445 0.1
446 0.1
447 0.11
448 0.11
449 0.11
450 0.12
451 0.12
452 0.12
453 0.14
454 0.18
455 0.17
456 0.22
457 0.27
458 0.35
459 0.44
460 0.5
461 0.55
462 0.62
463 0.66
464 0.68
465 0.71
466 0.67
467 0.6
468 0.55
469 0.47
470 0.38
471 0.35
472 0.3
473 0.24
474 0.2
475 0.17
476 0.15
477 0.15
478 0.16
479 0.17
480 0.15
481 0.15
482 0.15
483 0.15
484 0.15
485 0.14
486 0.12
487 0.11
488 0.11
489 0.09
490 0.08
491 0.08
492 0.1
493 0.12
494 0.13
495 0.13
496 0.14
497 0.15
498 0.17
499 0.18
500 0.16
501 0.14
502 0.12
503 0.1
504 0.08
505 0.06
506 0.03
507 0.02
508 0.02
509 0.02
510 0.02
511 0.03
512 0.05
513 0.06
514 0.07
515 0.11
516 0.13
517 0.14
518 0.14
519 0.17
520 0.18
521 0.18
522 0.17
523 0.13
524 0.11
525 0.1
526 0.09
527 0.06
528 0.03
529 0.03
530 0.03
531 0.03
532 0.02
533 0.02
534 0.02
535 0.02
536 0.02
537 0.02
538 0.02
539 0.02
540 0.02
541 0.02
542 0.02
543 0.03
544 0.03
545 0.03
546 0.04
547 0.04
548 0.04
549 0.05
550 0.08
551 0.16
552 0.21
553 0.27
554 0.35
555 0.39
556 0.42
557 0.5
558 0.55
559 0.54
560 0.57
561 0.57
562 0.55
563 0.59
564 0.6
565 0.55
566 0.54
567 0.49
568 0.47
569 0.46
570 0.41
571 0.41
572 0.41
573 0.38
574 0.34
575 0.33
576 0.26
577 0.23
578 0.21
579 0.16
580 0.14
581 0.11
582 0.15
583 0.19
584 0.2
585 0.2
586 0.21
587 0.2
588 0.24
589 0.27
590 0.28
591 0.3
592 0.35
593 0.44
594 0.5