FuNGI

A0A1J9QQU8

Protein Details

Accession

A0A1J9QQU8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
105-124	GVAPRAKMNQQRSRRFRAVQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
415-438	KRRKETEDRREAAQKRRKLQEERR
1091-1118	GGGGGRGGGRRGGRGGGGGGGRGAYDRR

Subcellular Location(s)

nucl 11, mito 8, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLSQKYPKIISPVVEAEPVEYPDGTVEPVDATKPNPNGEEMDNLYLDMNGIVHPCSHPEDKDPPENEEQMMIEIFKYTDRVVNMVRPRKLLMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRAVQDAKQKDADAAEFAKMLASQNQKKGESENDDSAEAKIVKKTWDSNSITPGTPFMDILAQSLRYWCAYKLNTDPAWEKLKVIISDATVPGEGEHKIMEFVRSQRRSPYHDPNTRHVIYGLDADLIMLGLVTHEPHFRVLREDVFANDAKPRTCRRCGQVGHYADQCRGEIKKKEDDHDVKQNKVTKKPFIWLHVSILREYLAAELKVDNQGFTFDLERTLDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLEIREGGIDTLINIWRENLPEMGGYVTKDGHVDMGRAQIILQGLAKLEDGIFKRRKETEDRREAAQKRRKLQEERRNGGARFAQGGDGNQQNNSPTARKGKKGETAENFANLPMFSPGELQSKEARSLTHENFVNRKAIFQGQANVANKSAAAALKEGLLGKKPETVSVAAGQNGNAEEAPVPDTPGGDATATPPSALGKRKAELLEDDSSTPGRNTPDVASPAVKPDEPPEDTVKMWEDGYMDRYYEQKFHVDPKDLEFRHQVARDYAEGLAWVLLYYLQGCASWTWYYPHHYAPFAQDFVDLDKMELKFEKGQPFRPYEQLMGVLPAASNHAIPPVFRPLMEEADSEIIDFYPEDFRVDLNGKKMAWQGVAILPFIDEKRLLDAMATKYPLLTPDEAARNEFGKEVLLFSTRHPLYEEVAQQWYSKKQGEPQHVLNPQISEGLAGTVTKNDDYLPQSSLVFPLDSKGMPDLEEDQSISVHYEMPKSKNVHKSQLLRGVQFAPPALTQDEIHGVRNRARHGGGGGGGGRDRGFHSHNENRWQGGPPRHNNHRGGGGGGGGGGYNNNGGGYNNNNNSHNNNQPPNMNPNNPIAGFLNPNFDPQAFMQRGGPPGGPGGGPPGPGGVPPPPHLAAQMNGWQPPPPPQFGGAFPPMPAGYGGYGGPPQNSGGGGGGYGGGGGGGGGRGGGGGYGGRRDDNYRPGGGGGGGGGGGRQDDNYRPHDGYGGGGGGGGGGRGGGRRGGRGGGGGGGRGAYDRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.53
3	0.55
4	0.54
5	0.5
6	0.47
7	0.44
8	0.4
9	0.37
10	0.33
11	0.28
12	0.27
13	0.26
14	0.21
15	0.17
16	0.15
17	0.14
18	0.14
19	0.13
20	0.1
21	0.09
22	0.09
23	0.1
24	0.12
25	0.13
26	0.15
27	0.21
28	0.25
29	0.28
30	0.28
31	0.29
32	0.31
33	0.32
34	0.35
35	0.31
36	0.3
37	0.27
38	0.26
39	0.24
40	0.2
41	0.18
42	0.12
43	0.09
44	0.07
45	0.08
46	0.08
47	0.09
48	0.1
49	0.12
50	0.18
51	0.22
52	0.22
53	0.28
54	0.36
55	0.42
56	0.51
57	0.5
58	0.51
59	0.53
60	0.53
61	0.47
62	0.4
63	0.34
64	0.26
65	0.24
66	0.19
67	0.13
68	0.12
69	0.11
70	0.1
71	0.11
72	0.11
73	0.14
74	0.15
75	0.18
76	0.2
77	0.28
78	0.37
79	0.44
80	0.47
81	0.45
82	0.46
83	0.45
84	0.44
85	0.39
86	0.32
87	0.29
88	0.27
89	0.25
90	0.24
91	0.21
92	0.21
93	0.18
94	0.15
95	0.1
96	0.13
97	0.19
98	0.26
99	0.37
100	0.46
101	0.55
102	0.66
103	0.74
104	0.8
105	0.81
106	0.78
107	0.74
108	0.76
109	0.75
110	0.74
111	0.77
112	0.73
113	0.68
114	0.66
115	0.6
116	0.5
117	0.42
118	0.34
119	0.26
120	0.22
121	0.19
122	0.17
123	0.16
124	0.15
125	0.13
126	0.14
127	0.17
128	0.24
129	0.3
130	0.37
131	0.43
132	0.44
133	0.45
134	0.47
135	0.48
136	0.46
137	0.46
138	0.44
139	0.4
140	0.39
141	0.39
142	0.36
143	0.33
144	0.26
145	0.22
146	0.2
147	0.2
148	0.22
149	0.25
150	0.31
151	0.31
152	0.4
153	0.44
154	0.44
155	0.49
156	0.49
157	0.46
158	0.4
159	0.36
160	0.28
161	0.23
162	0.19
163	0.13
164	0.13
165	0.12
166	0.13
167	0.14
168	0.14
169	0.13
170	0.15
171	0.15
172	0.14
173	0.16
174	0.15
175	0.21
176	0.21
177	0.26
178	0.3
179	0.37
180	0.37
181	0.39
182	0.41
183	0.38
184	0.42
185	0.38
186	0.33
187	0.28
188	0.33
189	0.29
190	0.29
191	0.26
192	0.21
193	0.24
194	0.24
195	0.21
196	0.16
197	0.15
198	0.13
199	0.13
200	0.12
201	0.09
202	0.09
203	0.08
204	0.1
205	0.1
206	0.12
207	0.13
208	0.2
209	0.3
210	0.33
211	0.35
212	0.42
213	0.47
214	0.53
215	0.58
216	0.62
217	0.62
218	0.67
219	0.71
220	0.69
221	0.72
222	0.64
223	0.57
224	0.46
225	0.37
226	0.3
227	0.27
228	0.21
229	0.13
230	0.11
231	0.1
232	0.09
233	0.08
234	0.06
235	0.03
236	0.03
237	0.03
238	0.03
239	0.04
240	0.06
241	0.07
242	0.08
243	0.11
244	0.14
245	0.14
246	0.18
247	0.2
248	0.22
249	0.23
250	0.23
251	0.21
252	0.23
253	0.23
254	0.19
255	0.21
256	0.21
257	0.2
258	0.24
259	0.32
260	0.35
261	0.41
262	0.47
263	0.48
264	0.55
265	0.58
266	0.59
267	0.6
268	0.57
269	0.55
270	0.54
271	0.5
272	0.41
273	0.39
274	0.32
275	0.26
276	0.25
277	0.28
278	0.3
279	0.34
280	0.41
281	0.44
282	0.47
283	0.54
284	0.57
285	0.57
286	0.61
287	0.6
288	0.53
289	0.55
290	0.59
291	0.55
292	0.57
293	0.56
294	0.53
295	0.51
296	0.56
297	0.55
298	0.52
299	0.53
300	0.46
301	0.46
302	0.43
303	0.41
304	0.34
305	0.3
306	0.25
307	0.18
308	0.16
309	0.12
310	0.11
311	0.09
312	0.1
313	0.1
314	0.11
315	0.15
316	0.15
317	0.13
318	0.11
319	0.12
320	0.12
321	0.12
322	0.13
323	0.09
324	0.1
325	0.11
326	0.11
327	0.11
328	0.13
329	0.11
330	0.1
331	0.1
332	0.1
333	0.1
334	0.09
335	0.08
336	0.06
337	0.06
338	0.07
339	0.07
340	0.07
341	0.06
342	0.08
343	0.08
344	0.08
345	0.09
346	0.08
347	0.08
348	0.08
349	0.11
350	0.12
351	0.12
352	0.11
353	0.12
354	0.11
355	0.11
356	0.11
357	0.07
358	0.05
359	0.07
360	0.09
361	0.09
362	0.09
363	0.1
364	0.11
365	0.12
366	0.13
367	0.11
368	0.09
369	0.09
370	0.09
371	0.09
372	0.09
373	0.08
374	0.08
375	0.08
376	0.08
377	0.08
378	0.07
379	0.09
380	0.09
381	0.09
382	0.09
383	0.12
384	0.12
385	0.12
386	0.11
387	0.11
388	0.1
389	0.1
390	0.1
391	0.07
392	0.07
393	0.07
394	0.07
395	0.06
396	0.05
397	0.09
398	0.11
399	0.18
400	0.24
401	0.24
402	0.28
403	0.31
404	0.35
405	0.41
406	0.5
407	0.53
408	0.58
409	0.6
410	0.59
411	0.65
412	0.67
413	0.68
414	0.66
415	0.61
416	0.58
417	0.64
418	0.68
419	0.69
420	0.74
421	0.74
422	0.76
423	0.74
424	0.74
425	0.71
426	0.63
427	0.57
428	0.48
429	0.39
430	0.3
431	0.26
432	0.2
433	0.15
434	0.16
435	0.16
436	0.16
437	0.16
438	0.14
439	0.14
440	0.13
441	0.15
442	0.16
443	0.14
444	0.14
445	0.24
446	0.27
447	0.32
448	0.36
449	0.4
450	0.46
451	0.5
452	0.55
453	0.49
454	0.51
455	0.47
456	0.43
457	0.38
458	0.3
459	0.25
460	0.17
461	0.13
462	0.08
463	0.07
464	0.06
465	0.07
466	0.09
467	0.13
468	0.13
469	0.15
470	0.17
471	0.19
472	0.2
473	0.2
474	0.18
475	0.19
476	0.25
477	0.25
478	0.27
479	0.28
480	0.29
481	0.31
482	0.32
483	0.31
484	0.25
485	0.23
486	0.19
487	0.19
488	0.19
489	0.17
490	0.19
491	0.17
492	0.23
493	0.24
494	0.23
495	0.21
496	0.19
497	0.17
498	0.14
499	0.13
500	0.07
501	0.07
502	0.07
503	0.07
504	0.07
505	0.08
506	0.08
507	0.07
508	0.09
509	0.09
510	0.09
511	0.13
512	0.13
513	0.13
514	0.14
515	0.15
516	0.14
517	0.16
518	0.16
519	0.13
520	0.14
521	0.13
522	0.12
523	0.11
524	0.1
525	0.06
526	0.06
527	0.05
528	0.05
529	0.08
530	0.07
531	0.07
532	0.07
533	0.07
534	0.07
535	0.07
536	0.07
537	0.05
538	0.05
539	0.06
540	0.08
541	0.08
542	0.07
543	0.07
544	0.07
545	0.11
546	0.14
547	0.16
548	0.17
549	0.18
550	0.21
551	0.22
552	0.22
553	0.2
554	0.22
555	0.2
556	0.18
557	0.18
558	0.15
559	0.15
560	0.15
561	0.13
562	0.1
563	0.09
564	0.08
565	0.1
566	0.1
567	0.14
568	0.15
569	0.16
570	0.16
571	0.15
572	0.17
573	0.17
574	0.15
575	0.12
576	0.13
577	0.16
578	0.16
579	0.19
580	0.19
581	0.2
582	0.2
583	0.21
584	0.2
585	0.16
586	0.15
587	0.13
588	0.1
589	0.09
590	0.12
591	0.12
592	0.1
593	0.1
594	0.13
595	0.13
596	0.14
597	0.14
598	0.14
599	0.15
600	0.21
601	0.24
602	0.26
603	0.26
604	0.29
605	0.37
606	0.34
607	0.35
608	0.32
609	0.3
610	0.31
611	0.32
612	0.29
613	0.21
614	0.23
615	0.21
616	0.2
617	0.17
618	0.12
619	0.1
620	0.09
621	0.07
622	0.05
623	0.05
624	0.03
625	0.03
626	0.03
627	0.03
628	0.04
629	0.04
630	0.04
631	0.04
632	0.05
633	0.07
634	0.07
635	0.08
636	0.1
637	0.11
638	0.16
639	0.18
640	0.22
641	0.21
642	0.22
643	0.22
644	0.25
645	0.26
646	0.22
647	0.2
648	0.16
649	0.15
650	0.16
651	0.17
652	0.12
653	0.1
654	0.13
655	0.13
656	0.14
657	0.14
658	0.14
659	0.16
660	0.2
661	0.29
662	0.28
663	0.34
664	0.38
665	0.43
666	0.43
667	0.42
668	0.4
669	0.32
670	0.31
671	0.26
672	0.21
673	0.17
674	0.14
675	0.11
676	0.08
677	0.07
678	0.08
679	0.06
680	0.06
681	0.05
682	0.07
683	0.07
684	0.08
685	0.1
686	0.15
687	0.15
688	0.15
689	0.17
690	0.18
691	0.21
692	0.22
693	0.19
694	0.15
695	0.16
696	0.16
697	0.13
698	0.11
699	0.08
700	0.07
701	0.07
702	0.06
703	0.07
704	0.07
705	0.08
706	0.08
707	0.08
708	0.11
709	0.14
710	0.15
711	0.16
712	0.18
713	0.17
714	0.2
715	0.22
716	0.2
717	0.18
718	0.16
719	0.15
720	0.15
721	0.16
722	0.14
723	0.11
724	0.1
725	0.11
726	0.11
727	0.1
728	0.07
729	0.07
730	0.1
731	0.1
732	0.1
733	0.09
734	0.14
735	0.16
736	0.19
737	0.19
738	0.16
739	0.16
740	0.16
741	0.17
742	0.16
743	0.13
744	0.12
745	0.16
746	0.21
747	0.22
748	0.23
749	0.22
750	0.2
751	0.2
752	0.19
753	0.14
754	0.1
755	0.1
756	0.1
757	0.09
758	0.11
759	0.11
760	0.11
761	0.21
762	0.19
763	0.2
764	0.2
765	0.2
766	0.21
767	0.25
768	0.27
769	0.2
770	0.22
771	0.22
772	0.22
773	0.23
774	0.24
775	0.22
776	0.23
777	0.22
778	0.27
779	0.34
780	0.42
781	0.46
782	0.48
783	0.53
784	0.53
785	0.53
786	0.47
787	0.4
788	0.32
789	0.26
790	0.21
791	0.12
792	0.09
793	0.08
794	0.07
795	0.06
796	0.06
797	0.07
798	0.08
799	0.08
800	0.08
801	0.08
802	0.11
803	0.14
804	0.15
805	0.15
806	0.16
807	0.16
808	0.16
809	0.17
810	0.14
811	0.12
812	0.1
813	0.1
814	0.1
815	0.1
816	0.1
817	0.11
818	0.1
819	0.1
820	0.12
821	0.14
822	0.14
823	0.15
824	0.14
825	0.13
826	0.13
827	0.13
828	0.12
829	0.09
830	0.1
831	0.1
832	0.15
833	0.19
834	0.23
835	0.29
836	0.32
837	0.4
838	0.47
839	0.51
840	0.55
841	0.58
842	0.62
843	0.63
844	0.69
845	0.64
846	0.55
847	0.53
848	0.47
849	0.41
850	0.35
851	0.27
852	0.19
853	0.16
854	0.17
855	0.15
856	0.14
857	0.13
858	0.13
859	0.19
860	0.18
861	0.22
862	0.24
863	0.26
864	0.28
865	0.32
866	0.33
867	0.31
868	0.31
869	0.28
870	0.25
871	0.25
872	0.22
873	0.2
874	0.18
875	0.15
876	0.15
877	0.14
878	0.13
879	0.11
880	0.12
881	0.13
882	0.14
883	0.17
884	0.26
885	0.34
886	0.4
887	0.47
888	0.48
889	0.47
890	0.47
891	0.48
892	0.47
893	0.48
894	0.52
895	0.53
896	0.6
897	0.67
898	0.72
899	0.7
900	0.66
901	0.62
902	0.53
903	0.44
904	0.36
905	0.27
906	0.19
907	0.16
908	0.13
909	0.07
910	0.06
911	0.05
912	0.04
913	0.04
914	0.04
915	0.04
916	0.05
917	0.05
918	0.08
919	0.13
920	0.21
921	0.26
922	0.3
923	0.32
924	0.34
925	0.39
926	0.43
927	0.45
928	0.46
929	0.45
930	0.45
931	0.47
932	0.48
933	0.52
934	0.53
935	0.49
936	0.43
937	0.42
938	0.44
939	0.41
940	0.39
941	0.31
942	0.27
943	0.27
944	0.25
945	0.27
946	0.22
947	0.24
948	0.23
949	0.21
950	0.22
951	0.19
952	0.28
953	0.24
954	0.24
955	0.26
956	0.28
957	0.31
958	0.31
959	0.29
960	0.2
961	0.2
962	0.2
963	0.16
964	0.13
965	0.16
966	0.15
967	0.15
968	0.14
969	0.15
970	0.13
971	0.14
972	0.16
973	0.15
974	0.18
975	0.2
976	0.25
977	0.25
978	0.25
979	0.28
980	0.27
981	0.24
982	0.25
983	0.29
984	0.27
985	0.27
986	0.28
987	0.27
988	0.26
989	0.34
990	0.35
991	0.31
992	0.3
993	0.31
994	0.33
995	0.34
996	0.39
997	0.34
998	0.3
999	0.27
1000	0.27
1001	0.25
1002	0.23
1003	0.21
1004	0.15
1005	0.11
1006	0.11
1007	0.11
1008	0.1
1009	0.13
1010	0.14
1011	0.14
1012	0.13
1013	0.13
1014	0.13
1015	0.13
1016	0.13
1017	0.11
1018	0.1
1019	0.09
1020	0.08
1021	0.08
1022	0.06
1023	0.06
1024	0.04
1025	0.03
1026	0.03
1027	0.03
1028	0.03
1029	0.02
1030	0.03
1031	0.03
1032	0.03
1033	0.03
1034	0.03
1035	0.03
1036	0.03
1037	0.05
1038	0.06
1039	0.1
1040	0.11
1041	0.12
1042	0.14
1043	0.2
1044	0.25
1045	0.32
1046	0.35
1047	0.34
1048	0.33
1049	0.33
1050	0.32
1051	0.27
1052	0.21
1053	0.13
1054	0.09
1055	0.08
1056	0.06
1057	0.06
1058	0.05
1059	0.06
1060	0.06
1061	0.07
1062	0.1
1063	0.15
1064	0.21
1065	0.25
1066	0.31
1067	0.31
1068	0.31
1069	0.32
1070	0.3
1071	0.26
1072	0.23
1073	0.19
1074	0.13
1075	0.12
1076	0.11
1077	0.09
1078	0.08
1079	0.07
1080	0.04
1081	0.03
1082	0.04
1083	0.05
1084	0.07
1085	0.11
1086	0.13
1087	0.16
1088	0.19
1089	0.21
1090	0.21
1091	0.21
1092	0.21
1093	0.21
1094	0.2
1095	0.18
1096	0.16
1097	0.14
1098	0.13

A0A1J9QQU8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer