Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1J9S942

Protein Details
Accession A0A1J9S942    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
150-181SDQEKRQPEPQPKKGKEPRRPAQQPKVEKPVGBasic
219-240MECAIQRYKSRRKMHQHFLNVFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
158-175EPQPKKGKEPRRPAQQPK
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_nucl 12.5, nucl 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018606  Arb1  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0033167  C:ARC complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0031047  P:RNA-mediated gene silencing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09692  Arb1  
PF05383  La  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
Amino Acid Sequences MASPESEQPAADQPAATPSVATPLDAPPSAVEIGPTQVLHQQQQLTPEHPQGDEIRRQVEYYFSDENLSFDRHLLEKCQGRLNLPVPIRSICGFPKMRRYKPYLQVVEALKKSVFLDVVEGNKIKRKLPLMGKTVLDGPDGDESDVDDASDQEKRQPEPQPKKGKEPRRPAQQPKVEKPVGFNKPHGFEEFFADAPVTPAEFQAEVGMYDPGISFRLRMECAIQRYKSRRKMHQHFLNVFAKFMRYGGVDQSQRQFTGGVNDKELEDRDAQDIALMMANHTIDTDKDDEEKWPVAFEEVAKGFLSSEWPNLVFYNMAEIRLACTVLRNFYNYLLHHDVCPEHKEDIYAARKLCSAAESEFPMVIEASANLPGDLNVACSNLFDGFYKDKFVRIGDWDDLEEPHMRGKFSEHSMEKSSIILKAAILAHGTDEQIETLEKAFDGITCTDATESIGLEVTGVEMPSSDALETYAALNAHSKGRLEVKPVGKLHCKSWDISDFTTFDLDEGYAKELLDDQKNRRYEFWVETDILQACFVGMKMQAAVRTLSLGIQVLDQVQEVFCSFYTYLANELMWKWKEPVFNADGPPETTTNGDEDDSDEQPGNSAV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.25
3 0.22
4 0.16
5 0.13
6 0.18
7 0.18
8 0.18
9 0.16
10 0.17
11 0.21
12 0.21
13 0.21
14 0.15
15 0.18
16 0.19
17 0.17
18 0.15
19 0.12
20 0.14
21 0.15
22 0.15
23 0.13
24 0.16
25 0.19
26 0.21
27 0.24
28 0.27
29 0.27
30 0.33
31 0.35
32 0.34
33 0.36
34 0.39
35 0.36
36 0.32
37 0.34
38 0.34
39 0.38
40 0.41
41 0.4
42 0.38
43 0.36
44 0.37
45 0.34
46 0.33
47 0.28
48 0.28
49 0.27
50 0.24
51 0.26
52 0.26
53 0.27
54 0.25
55 0.24
56 0.19
57 0.17
58 0.19
59 0.19
60 0.2
61 0.22
62 0.27
63 0.3
64 0.33
65 0.4
66 0.39
67 0.38
68 0.44
69 0.43
70 0.44
71 0.4
72 0.39
73 0.35
74 0.34
75 0.35
76 0.28
77 0.29
78 0.23
79 0.29
80 0.33
81 0.33
82 0.43
83 0.51
84 0.57
85 0.61
86 0.68
87 0.69
88 0.72
89 0.79
90 0.73
91 0.65
92 0.65
93 0.62
94 0.62
95 0.53
96 0.45
97 0.34
98 0.31
99 0.29
100 0.24
101 0.2
102 0.12
103 0.14
104 0.15
105 0.17
106 0.2
107 0.2
108 0.2
109 0.25
110 0.27
111 0.26
112 0.28
113 0.3
114 0.35
115 0.43
116 0.51
117 0.5
118 0.53
119 0.51
120 0.47
121 0.47
122 0.39
123 0.3
124 0.21
125 0.18
126 0.17
127 0.17
128 0.15
129 0.12
130 0.11
131 0.12
132 0.11
133 0.09
134 0.06
135 0.06
136 0.08
137 0.11
138 0.11
139 0.15
140 0.19
141 0.21
142 0.28
143 0.36
144 0.45
145 0.52
146 0.62
147 0.68
148 0.68
149 0.77
150 0.8
151 0.83
152 0.82
153 0.82
154 0.82
155 0.82
156 0.88
157 0.87
158 0.88
159 0.86
160 0.86
161 0.82
162 0.82
163 0.74
164 0.64
165 0.6
166 0.59
167 0.58
168 0.52
169 0.49
170 0.44
171 0.45
172 0.46
173 0.44
174 0.36
175 0.28
176 0.3
177 0.28
178 0.23
179 0.19
180 0.18
181 0.15
182 0.14
183 0.13
184 0.08
185 0.06
186 0.06
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.06
193 0.07
194 0.07
195 0.05
196 0.06
197 0.06
198 0.05
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.08
203 0.11
204 0.11
205 0.12
206 0.15
207 0.18
208 0.24
209 0.31
210 0.31
211 0.36
212 0.44
213 0.53
214 0.59
215 0.63
216 0.66
217 0.71
218 0.78
219 0.81
220 0.81
221 0.81
222 0.74
223 0.73
224 0.69
225 0.58
226 0.5
227 0.39
228 0.31
229 0.21
230 0.19
231 0.13
232 0.08
233 0.09
234 0.11
235 0.17
236 0.18
237 0.2
238 0.24
239 0.23
240 0.22
241 0.22
242 0.19
243 0.14
244 0.2
245 0.25
246 0.22
247 0.22
248 0.23
249 0.23
250 0.23
251 0.23
252 0.18
253 0.11
254 0.11
255 0.12
256 0.11
257 0.11
258 0.1
259 0.09
260 0.07
261 0.08
262 0.06
263 0.05
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.05
269 0.04
270 0.06
271 0.08
272 0.08
273 0.09
274 0.1
275 0.11
276 0.13
277 0.14
278 0.12
279 0.11
280 0.1
281 0.09
282 0.09
283 0.09
284 0.1
285 0.09
286 0.1
287 0.09
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.11
292 0.08
293 0.09
294 0.09
295 0.09
296 0.1
297 0.1
298 0.1
299 0.07
300 0.06
301 0.11
302 0.1
303 0.1
304 0.1
305 0.1
306 0.1
307 0.11
308 0.11
309 0.05
310 0.08
311 0.08
312 0.1
313 0.11
314 0.12
315 0.12
316 0.14
317 0.17
318 0.15
319 0.21
320 0.23
321 0.23
322 0.21
323 0.22
324 0.21
325 0.2
326 0.21
327 0.17
328 0.14
329 0.14
330 0.14
331 0.14
332 0.2
333 0.22
334 0.23
335 0.22
336 0.21
337 0.22
338 0.22
339 0.21
340 0.14
341 0.12
342 0.11
343 0.12
344 0.13
345 0.13
346 0.13
347 0.12
348 0.12
349 0.1
350 0.08
351 0.06
352 0.05
353 0.05
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.06
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.07
368 0.08
369 0.06
370 0.09
371 0.12
372 0.13
373 0.16
374 0.16
375 0.17
376 0.17
377 0.18
378 0.17
379 0.17
380 0.21
381 0.19
382 0.2
383 0.19
384 0.19
385 0.18
386 0.18
387 0.16
388 0.12
389 0.15
390 0.15
391 0.14
392 0.14
393 0.17
394 0.2
395 0.21
396 0.29
397 0.27
398 0.29
399 0.33
400 0.34
401 0.31
402 0.28
403 0.26
404 0.19
405 0.19
406 0.15
407 0.11
408 0.13
409 0.13
410 0.12
411 0.11
412 0.09
413 0.1
414 0.1
415 0.1
416 0.07
417 0.07
418 0.06
419 0.07
420 0.07
421 0.06
422 0.06
423 0.06
424 0.06
425 0.06
426 0.06
427 0.06
428 0.09
429 0.09
430 0.09
431 0.09
432 0.1
433 0.09
434 0.1
435 0.1
436 0.08
437 0.07
438 0.06
439 0.06
440 0.06
441 0.05
442 0.05
443 0.06
444 0.06
445 0.05
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.06
450 0.06
451 0.05
452 0.05
453 0.05
454 0.06
455 0.06
456 0.06
457 0.08
458 0.08
459 0.08
460 0.1
461 0.11
462 0.14
463 0.14
464 0.14
465 0.15
466 0.23
467 0.24
468 0.28
469 0.34
470 0.36
471 0.43
472 0.46
473 0.49
474 0.5
475 0.5
476 0.49
477 0.5
478 0.48
479 0.41
480 0.45
481 0.46
482 0.42
483 0.42
484 0.41
485 0.32
486 0.31
487 0.31
488 0.24
489 0.17
490 0.13
491 0.12
492 0.09
493 0.09
494 0.11
495 0.11
496 0.1
497 0.11
498 0.14
499 0.18
500 0.25
501 0.31
502 0.34
503 0.42
504 0.47
505 0.49
506 0.47
507 0.47
508 0.45
509 0.44
510 0.44
511 0.4
512 0.37
513 0.36
514 0.38
515 0.35
516 0.3
517 0.24
518 0.18
519 0.13
520 0.12
521 0.11
522 0.09
523 0.08
524 0.08
525 0.09
526 0.11
527 0.13
528 0.14
529 0.15
530 0.13
531 0.14
532 0.13
533 0.12
534 0.12
535 0.11
536 0.1
537 0.1
538 0.1
539 0.09
540 0.1
541 0.09
542 0.09
543 0.08
544 0.08
545 0.08
546 0.09
547 0.08
548 0.12
549 0.12
550 0.13
551 0.15
552 0.15
553 0.17
554 0.17
555 0.17
556 0.15
557 0.16
558 0.23
559 0.24
560 0.25
561 0.26
562 0.29
563 0.33
564 0.34
565 0.4
566 0.37
567 0.41
568 0.41
569 0.42
570 0.4
571 0.38
572 0.38
573 0.31
574 0.26
575 0.23
576 0.21
577 0.19
578 0.18
579 0.17
580 0.14
581 0.16
582 0.19
583 0.19
584 0.2
585 0.19
586 0.17