Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1J9RHC8

Protein Details
Accession A0A1J9RHC8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-53DSILEVQRPRKRTRRTRDELKQELEKEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
550-596RGGRGQDQRGGRGGGRGGAQQRGGAQQRGRGGAPAQRGRGNIARTGR
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_nucl 11.5, nucl 8.5, cysk 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
IPR040801  Ski2_N  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF00271  Helicase_C  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PF17911  Ski2_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MEDLAQAFERVSLAADSAAGSNTDWIDSILEVQRPRKRTRRTRDELKQELEKEFLTPSSAFNTQWLNELQQRWEAPINYADLFELAPTQTRTIIRFTREGLEGLVTGYKEITVPANSATAKNSTSLLRKPANRADFVRGAAGFFPFAPGGLDGVEAVAAAEDGVLQAQQAEKTRKHGGLDRVLNFGVEGGLLEIPPGFARGLDFKKKASTDQQNAEDVEIALGEEPAPVESVDGIPSEDTDGVQPSAGDSGDEESENDDDIDSLLPVEFPALAPRGNLTLASTRRAAKEWAHMVDVNRDIPNFRDLVPDMAREWPFELDTFQKEAVYHLENGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAAKHMTKAIYTSPIKALSNQKFRDFRNEFDDVGILTGDVQIRPEASCLIMTTEILRSMLYRGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDLERGVVWEEVIIMLPEHVTLILLSATVPNTYEFASWVGRTKKKNIYVISTPKRPVPLEHYLWSNKVMHKIVDADKHFIEKGWKDANDILSGKDKVKATKLEESNASRGGANQRGGRGQDQRGGRGGGRGGAQQRGGAQQRGRGGAPAQRGRGNIARTGRGGGRTTAAQDRNIWVHLVQHLRKENLLPACIFVFSKKRCEENADALANLDFCTASEKSAIHMVIEKSIARLKPEDRVLPQIRRLRELLSRGIAVHHGGMLPIVKEVVEILFAKTLVKILFATETFAMGLNLPTRTVVFSGFRKHDGRQFRDLLPGEYTQMAGRAGRRGLDAVGSVIIVAPGAEEAPPAARLRQMILGDPTKLRSQFRLTYNMILNLLRVEALKIEEMIKRSFSENATQALLPEHEKAVKLSEADLEKIKREPCEICDVDLELCHEASMKYQRLTNELHLALLATPVGKRLFDIRRLVIYKKDGIRAAGMLLRDGISKGHEPTVQILEISTNAKRQPSDLLPYLSGFTKFFASLPRNASDTKLKAASILLSDVESITAAHIKIDIADVLKGDSEALKLASDQFQPLCESWASQDWNEVDLSKFIKDMTYRGLLDERNKQAELAQARTCLKCPRFVQHFAMAHDEWLIKENIAQLRQLMSDQNLQLLPDYEQRISVLKDLGFIDEKSRVELKGKVACEIHSADELVLTELILENVLADFEPEEIAALLSAFVFQEKTDVAPTLTPRLEQGQAKIVEISEKVNQIQTLHQVILSSEDSNDFVSRPRFGMVEVVYEWARGMSFNRITDLTDVMEGTIVRVITRLDETCREVKNAARIIGDPTLYTKMQTCQELIKRDICNAASLYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.09
4 0.09
5 0.09
6 0.09
7 0.08
8 0.1
9 0.1
10 0.1
11 0.1
12 0.1
13 0.1
14 0.1
15 0.14
16 0.16
17 0.2
18 0.24
19 0.32
20 0.39
21 0.44
22 0.53
23 0.59
24 0.66
25 0.72
26 0.8
27 0.82
28 0.86
29 0.9
30 0.92
31 0.93
32 0.91
33 0.87
34 0.84
35 0.77
36 0.69
37 0.6
38 0.5
39 0.41
40 0.33
41 0.27
42 0.22
43 0.19
44 0.18
45 0.2
46 0.22
47 0.2
48 0.22
49 0.25
50 0.22
51 0.26
52 0.26
53 0.26
54 0.3
55 0.33
56 0.33
57 0.34
58 0.34
59 0.34
60 0.38
61 0.34
62 0.31
63 0.31
64 0.32
65 0.26
66 0.26
67 0.22
68 0.17
69 0.16
70 0.13
71 0.12
72 0.09
73 0.12
74 0.13
75 0.14
76 0.18
77 0.2
78 0.22
79 0.28
80 0.33
81 0.33
82 0.35
83 0.37
84 0.37
85 0.37
86 0.36
87 0.3
88 0.26
89 0.21
90 0.19
91 0.19
92 0.13
93 0.12
94 0.11
95 0.1
96 0.09
97 0.1
98 0.12
99 0.11
100 0.12
101 0.13
102 0.17
103 0.18
104 0.19
105 0.2
106 0.2
107 0.19
108 0.19
109 0.2
110 0.21
111 0.26
112 0.29
113 0.35
114 0.4
115 0.44
116 0.51
117 0.58
118 0.6
119 0.59
120 0.59
121 0.58
122 0.54
123 0.5
124 0.46
125 0.37
126 0.32
127 0.27
128 0.24
129 0.18
130 0.14
131 0.14
132 0.1
133 0.1
134 0.1
135 0.09
136 0.09
137 0.08
138 0.09
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.05
143 0.04
144 0.04
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.04
154 0.06
155 0.09
156 0.16
157 0.22
158 0.24
159 0.3
160 0.37
161 0.39
162 0.42
163 0.46
164 0.48
165 0.52
166 0.58
167 0.54
168 0.51
169 0.48
170 0.44
171 0.36
172 0.28
173 0.18
174 0.1
175 0.08
176 0.05
177 0.06
178 0.05
179 0.06
180 0.05
181 0.06
182 0.06
183 0.07
184 0.06
185 0.05
186 0.08
187 0.15
188 0.22
189 0.3
190 0.32
191 0.33
192 0.39
193 0.41
194 0.44
195 0.47
196 0.51
197 0.51
198 0.57
199 0.59
200 0.56
201 0.55
202 0.51
203 0.42
204 0.31
205 0.23
206 0.14
207 0.1
208 0.07
209 0.06
210 0.06
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.05
216 0.05
217 0.06
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.08
222 0.07
223 0.07
224 0.09
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.1
229 0.1
230 0.1
231 0.1
232 0.08
233 0.09
234 0.09
235 0.08
236 0.06
237 0.08
238 0.09
239 0.1
240 0.09
241 0.1
242 0.1
243 0.11
244 0.1
245 0.08
246 0.07
247 0.08
248 0.08
249 0.06
250 0.06
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.08
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.1
262 0.11
263 0.12
264 0.12
265 0.11
266 0.17
267 0.19
268 0.21
269 0.23
270 0.25
271 0.26
272 0.28
273 0.29
274 0.25
275 0.31
276 0.35
277 0.34
278 0.34
279 0.35
280 0.34
281 0.37
282 0.36
283 0.3
284 0.25
285 0.23
286 0.21
287 0.21
288 0.22
289 0.17
290 0.15
291 0.17
292 0.17
293 0.22
294 0.23
295 0.22
296 0.21
297 0.26
298 0.26
299 0.22
300 0.23
301 0.19
302 0.18
303 0.17
304 0.17
305 0.15
306 0.17
307 0.19
308 0.18
309 0.17
310 0.17
311 0.18
312 0.19
313 0.19
314 0.17
315 0.15
316 0.15
317 0.14
318 0.15
319 0.14
320 0.1
321 0.07
322 0.06
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.06
329 0.06
330 0.07
331 0.07
332 0.06
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.06
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.06
342 0.05
343 0.07
344 0.07
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.08
349 0.1
350 0.11
351 0.18
352 0.19
353 0.21
354 0.23
355 0.26
356 0.26
357 0.3
358 0.38
359 0.38
360 0.47
361 0.47
362 0.52
363 0.54
364 0.55
365 0.61
366 0.54
367 0.48
368 0.45
369 0.45
370 0.38
371 0.33
372 0.32
373 0.21
374 0.19
375 0.15
376 0.08
377 0.06
378 0.07
379 0.07
380 0.06
381 0.07
382 0.07
383 0.08
384 0.08
385 0.08
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.09
391 0.08
392 0.08
393 0.09
394 0.09
395 0.09
396 0.09
397 0.09
398 0.07
399 0.08
400 0.11
401 0.1
402 0.09
403 0.1
404 0.11
405 0.11
406 0.11
407 0.11
408 0.09
409 0.09
410 0.1
411 0.08
412 0.07
413 0.07
414 0.09
415 0.07
416 0.06
417 0.08
418 0.08
419 0.08
420 0.09
421 0.09
422 0.07
423 0.09
424 0.09
425 0.07
426 0.07
427 0.08
428 0.09
429 0.08
430 0.08
431 0.06
432 0.06
433 0.06
434 0.06
435 0.05
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.04
440 0.03
441 0.03
442 0.03
443 0.03
444 0.04
445 0.03
446 0.03
447 0.04
448 0.05
449 0.05
450 0.05
451 0.06
452 0.06
453 0.07
454 0.07
455 0.07
456 0.07
457 0.09
458 0.1
459 0.1
460 0.16
461 0.22
462 0.27
463 0.3
464 0.36
465 0.43
466 0.48
467 0.54
468 0.51
469 0.5
470 0.53
471 0.61
472 0.6
473 0.58
474 0.53
475 0.48
476 0.49
477 0.43
478 0.38
479 0.34
480 0.35
481 0.33
482 0.34
483 0.37
484 0.35
485 0.35
486 0.35
487 0.31
488 0.25
489 0.26
490 0.25
491 0.21
492 0.2
493 0.24
494 0.25
495 0.29
496 0.28
497 0.26
498 0.25
499 0.27
500 0.25
501 0.22
502 0.23
503 0.17
504 0.21
505 0.23
506 0.23
507 0.23
508 0.26
509 0.27
510 0.25
511 0.25
512 0.21
513 0.2
514 0.22
515 0.2
516 0.22
517 0.22
518 0.2
519 0.24
520 0.27
521 0.27
522 0.34
523 0.35
524 0.33
525 0.37
526 0.38
527 0.36
528 0.33
529 0.29
530 0.2
531 0.21
532 0.23
533 0.22
534 0.22
535 0.21
536 0.21
537 0.22
538 0.24
539 0.25
540 0.26
541 0.24
542 0.27
543 0.26
544 0.26
545 0.26
546 0.26
547 0.23
548 0.19
549 0.17
550 0.14
551 0.13
552 0.15
553 0.15
554 0.15
555 0.15
556 0.14
557 0.14
558 0.18
559 0.19
560 0.2
561 0.19
562 0.2
563 0.22
564 0.24
565 0.23
566 0.18
567 0.18
568 0.18
569 0.25
570 0.25
571 0.25
572 0.25
573 0.25
574 0.28
575 0.31
576 0.28
577 0.25
578 0.24
579 0.24
580 0.22
581 0.23
582 0.21
583 0.2
584 0.19
585 0.15
586 0.14
587 0.13
588 0.15
589 0.19
590 0.19
591 0.18
592 0.18
593 0.19
594 0.19
595 0.19
596 0.17
597 0.11
598 0.11
599 0.14
600 0.19
601 0.19
602 0.23
603 0.25
604 0.26
605 0.26
606 0.25
607 0.26
608 0.22
609 0.21
610 0.16
611 0.14
612 0.14
613 0.14
614 0.13
615 0.1
616 0.16
617 0.16
618 0.23
619 0.24
620 0.26
621 0.26
622 0.32
623 0.34
624 0.33
625 0.37
626 0.31
627 0.29
628 0.26
629 0.25
630 0.2
631 0.16
632 0.1
633 0.04
634 0.04
635 0.07
636 0.07
637 0.08
638 0.09
639 0.09
640 0.09
641 0.12
642 0.12
643 0.09
644 0.12
645 0.12
646 0.12
647 0.13
648 0.12
649 0.1
650 0.14
651 0.14
652 0.12
653 0.14
654 0.14
655 0.19
656 0.22
657 0.24
658 0.22
659 0.3
660 0.34
661 0.34
662 0.41
663 0.41
664 0.39
665 0.39
666 0.38
667 0.32
668 0.31
669 0.31
670 0.26
671 0.22
672 0.22
673 0.19
674 0.19
675 0.17
676 0.13
677 0.1
678 0.07
679 0.06
680 0.05
681 0.05
682 0.05
683 0.05
684 0.04
685 0.04
686 0.04
687 0.04
688 0.04
689 0.04
690 0.05
691 0.05
692 0.05
693 0.06
694 0.06
695 0.07
696 0.06
697 0.08
698 0.07
699 0.07
700 0.06
701 0.06
702 0.08
703 0.08
704 0.09
705 0.08
706 0.08
707 0.07
708 0.08
709 0.07
710 0.06
711 0.07
712 0.07
713 0.07
714 0.06
715 0.06
716 0.07
717 0.07
718 0.07
719 0.08
720 0.1
721 0.12
722 0.18
723 0.19
724 0.23
725 0.25
726 0.26
727 0.32
728 0.38
729 0.4
730 0.41
731 0.43
732 0.4
733 0.45
734 0.44
735 0.39
736 0.32
737 0.27
738 0.22
739 0.18
740 0.18
741 0.11
742 0.11
743 0.1
744 0.08
745 0.09
746 0.11
747 0.11
748 0.11
749 0.12
750 0.11
751 0.11
752 0.11
753 0.09
754 0.07
755 0.07
756 0.06
757 0.05
758 0.05
759 0.04
760 0.03
761 0.03
762 0.02
763 0.02
764 0.03
765 0.03
766 0.02
767 0.03
768 0.04
769 0.05
770 0.06
771 0.06
772 0.07
773 0.08
774 0.09
775 0.13
776 0.13
777 0.14
778 0.17
779 0.19
780 0.19
781 0.19
782 0.2
783 0.19
784 0.21
785 0.2
786 0.2
787 0.24
788 0.29
789 0.32
790 0.37
791 0.36
792 0.38
793 0.38
794 0.36
795 0.32
796 0.25
797 0.22
798 0.15
799 0.13
800 0.09
801 0.07
802 0.06
803 0.05
804 0.06
805 0.06
806 0.07
807 0.09
808 0.11
809 0.13
810 0.14
811 0.14
812 0.15
813 0.16
814 0.18
815 0.17
816 0.2
817 0.2
818 0.2
819 0.21
820 0.2
821 0.19
822 0.17
823 0.17
824 0.14
825 0.12
826 0.12
827 0.11
828 0.12
829 0.12
830 0.13
831 0.13
832 0.12
833 0.12
834 0.15
835 0.15
836 0.16
837 0.2
838 0.18
839 0.19
840 0.22
841 0.24
842 0.21
843 0.23
844 0.23
845 0.22
846 0.3
847 0.29
848 0.27
849 0.26
850 0.26
851 0.22
852 0.21
853 0.19
854 0.11
855 0.1
856 0.09
857 0.08
858 0.07
859 0.11
860 0.17
861 0.19
862 0.19
863 0.22
864 0.23
865 0.26
866 0.29
867 0.28
868 0.28
869 0.25
870 0.24
871 0.21
872 0.21
873 0.17
874 0.14
875 0.11
876 0.05
877 0.05
878 0.07
879 0.08
880 0.08
881 0.08
882 0.15
883 0.2
884 0.25
885 0.3
886 0.3
887 0.36
888 0.39
889 0.4
890 0.38
891 0.37
892 0.38
893 0.37
894 0.39
895 0.34
896 0.32
897 0.31
898 0.26
899 0.24
900 0.2
901 0.16
902 0.12
903 0.11
904 0.1
905 0.1
906 0.09
907 0.08
908 0.09
909 0.11
910 0.12
911 0.15
912 0.16
913 0.16
914 0.19
915 0.22
916 0.19
917 0.17
918 0.15
919 0.13
920 0.13
921 0.15
922 0.13
923 0.13
924 0.15
925 0.17
926 0.17
927 0.18
928 0.22
929 0.24
930 0.29
931 0.29
932 0.3
933 0.29
934 0.3
935 0.3
936 0.25
937 0.22
938 0.16
939 0.13
940 0.12
941 0.12
942 0.12
943 0.17
944 0.19
945 0.23
946 0.27
947 0.28
948 0.28
949 0.29
950 0.32
951 0.32
952 0.31
953 0.3
954 0.28
955 0.26
956 0.24
957 0.24
958 0.22
959 0.16
960 0.15
961 0.11
962 0.09
963 0.1
964 0.09
965 0.08
966 0.07
967 0.06
968 0.05
969 0.07
970 0.07
971 0.07
972 0.07
973 0.07
974 0.07
975 0.08
976 0.08
977 0.07
978 0.08
979 0.08
980 0.08
981 0.08
982 0.08
983 0.07
984 0.07
985 0.06
986 0.07
987 0.07
988 0.07
989 0.07
990 0.09
991 0.13
992 0.13
993 0.15
994 0.15
995 0.16
996 0.18
997 0.18
998 0.18
999 0.15
1000 0.14
1001 0.15
1002 0.2
1003 0.21
1004 0.19
1005 0.24
1006 0.21
1007 0.23
1008 0.22
1009 0.21
1010 0.16
1011 0.16
1012 0.17
1013 0.13
1014 0.13
1015 0.11
1016 0.14
1017 0.14
1018 0.16
1019 0.18
1020 0.22
1021 0.21
1022 0.23
1023 0.27
1024 0.27
1025 0.32
1026 0.39
1027 0.39
1028 0.38
1029 0.38
1030 0.36
1031 0.34
1032 0.37
1033 0.36
1034 0.32
1035 0.29
1036 0.3
1037 0.33
1038 0.34
1039 0.36
1040 0.38
1041 0.36
1042 0.39
1043 0.4
1044 0.45
1045 0.48
1046 0.53
1047 0.55
1048 0.55
1049 0.58
1050 0.51
1051 0.54
1052 0.44
1053 0.38
1054 0.34
1055 0.29
1056 0.2
1057 0.19
1058 0.17
1059 0.11
1060 0.12
1061 0.18
1062 0.2
1063 0.21
1064 0.21
1065 0.19
1066 0.21
1067 0.22
1068 0.22
1069 0.18
1070 0.16
1071 0.21
1072 0.21
1073 0.23
1074 0.21
1075 0.21
1076 0.2
1077 0.19
1078 0.19
1079 0.19
1080 0.22
1081 0.19
1082 0.19
1083 0.2
1084 0.22
1085 0.22
1086 0.22
1087 0.2
1088 0.17
1089 0.2
1090 0.2
1091 0.22
1092 0.21
1093 0.2
1094 0.21
1095 0.22
1096 0.22
1097 0.23
1098 0.25
1099 0.23
1100 0.24
1101 0.28
1102 0.32
1103 0.34
1104 0.34
1105 0.35
1106 0.34
1107 0.34
1108 0.35
1109 0.32
1110 0.28
1111 0.22
1112 0.22
1113 0.17
1114 0.17
1115 0.16
1116 0.13
1117 0.11
1118 0.09
1119 0.07
1120 0.07
1121 0.07
1122 0.06
1123 0.05
1124 0.04
1125 0.04
1126 0.05
1127 0.04
1128 0.04
1129 0.05
1130 0.05
1131 0.06
1132 0.05
1133 0.06
1134 0.06
1135 0.06
1136 0.05
1137 0.05
1138 0.05
1139 0.04
1140 0.05
1141 0.05
1142 0.05
1143 0.05
1144 0.05
1145 0.07
1146 0.08
1147 0.09
1148 0.11
1149 0.12
1150 0.13
1151 0.16
1152 0.19
1153 0.24
1154 0.25
1155 0.23
1156 0.23
1157 0.27
1158 0.31
1159 0.3
1160 0.31
1161 0.32
1162 0.32
1163 0.33
1164 0.32
1165 0.28
1166 0.25
1167 0.23
1168 0.24
1169 0.19
1170 0.21
1171 0.21
1172 0.23
1173 0.24
1174 0.23
1175 0.25
1176 0.28
1177 0.27
1178 0.25
1179 0.24
1180 0.21
1181 0.2
1182 0.23
1183 0.21
1184 0.16
1185 0.14
1186 0.14
1187 0.15
1188 0.16
1189 0.17
1190 0.13
1191 0.16
1192 0.19
1193 0.2
1194 0.2
1195 0.21
1196 0.2
1197 0.2
1198 0.26
1199 0.22
1200 0.23
1201 0.21
1202 0.23
1203 0.21
1204 0.21
1205 0.2
1206 0.14
1207 0.13
1208 0.1
1209 0.11
1210 0.17
1211 0.22
1212 0.23
1213 0.26
1214 0.26
1215 0.28
1216 0.28
1217 0.28
1218 0.21
1219 0.17
1220 0.16
1221 0.13
1222 0.14
1223 0.12
1224 0.11
1225 0.12
1226 0.1
1227 0.09
1228 0.1
1229 0.1
1230 0.11
1231 0.16
1232 0.17
1233 0.19
1234 0.24
1235 0.29
1236 0.35
1237 0.38
1238 0.38
1239 0.36
1240 0.39
1241 0.43
1242 0.44
1243 0.42
1244 0.37
1245 0.36
1246 0.38
1247 0.39
1248 0.35
1249 0.26
1250 0.24
1251 0.26
1252 0.24
1253 0.24
1254 0.23
1255 0.24
1256 0.29
1257 0.31
1258 0.3
1259 0.34
1260 0.41
1261 0.47
1262 0.48
1263 0.5
1264 0.47
1265 0.47
1266 0.51
1267 0.43
1268 0.39