Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9RJ88

Protein Details
Accession A0A1J9RJ88    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
267-298LKSKIATRKKHLKETERKREERETKKRNEENABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
268-293KSKIATRKKHLKETERKREERETKKR
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto 9, pero 2, mito 1, golg 1, cysk 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044059  Csn1/TTC4_wheel  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0051879  F:Hsp90 protein binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF18972  Wheel  
CDD cd21381  CTWD_TTC4  
Amino Acid Sequences MGKIEELPDDFDESLNLNDHAVNPPPKPSDLPSGPGPSGVPSLESLLNNATQTKGSSTAEEPSDGKASAAKPPAMTETASKTADELLAELNRTPLFMTSLDESDGQGGENAALEGLKALAYEGTKAEVAGNFREQGNECARAKQWVDAREFYDKALGVLKGVGKELNEDPDMDLADGQKLDPDEEARKERQIEEASLVNKALCNLEMKNYRSCIQNCKATLLINPLNVKAWYRSATALLALDKIPEAEDSCERGLAIDASNASLKTLKSKIATRKKHLKETERKREERETKKRNEENALQLALRARNIKTRSTGADPDTGDAKIALTEPLDPSSVLSFPLILLYPLDAQSDFIQACAETDSLGQHLEYILPVPWDAKSEYTHAGTECYLETSSGGLIKAGKKVPLGKLLAGGTVEILDGLVKVNVVPKTRAQEWIAEFKKRKGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.16
3 0.15
4 0.12
5 0.13
6 0.15
7 0.17
8 0.23
9 0.26
10 0.25
11 0.32
12 0.34
13 0.35
14 0.37
15 0.38
16 0.41
17 0.39
18 0.43
19 0.42
20 0.45
21 0.43
22 0.4
23 0.36
24 0.28
25 0.27
26 0.23
27 0.18
28 0.13
29 0.16
30 0.18
31 0.18
32 0.17
33 0.17
34 0.19
35 0.18
36 0.18
37 0.16
38 0.14
39 0.15
40 0.15
41 0.18
42 0.17
43 0.19
44 0.2
45 0.24
46 0.24
47 0.26
48 0.24
49 0.23
50 0.24
51 0.21
52 0.19
53 0.19
54 0.19
55 0.23
56 0.27
57 0.26
58 0.24
59 0.25
60 0.29
61 0.26
62 0.26
63 0.22
64 0.24
65 0.27
66 0.27
67 0.26
68 0.22
69 0.22
70 0.22
71 0.19
72 0.14
73 0.12
74 0.12
75 0.13
76 0.13
77 0.14
78 0.13
79 0.13
80 0.13
81 0.1
82 0.11
83 0.11
84 0.13
85 0.13
86 0.14
87 0.15
88 0.15
89 0.14
90 0.13
91 0.13
92 0.1
93 0.08
94 0.08
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.05
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.04
104 0.03
105 0.03
106 0.05
107 0.05
108 0.07
109 0.07
110 0.08
111 0.08
112 0.09
113 0.1
114 0.1
115 0.12
116 0.13
117 0.15
118 0.15
119 0.15
120 0.17
121 0.17
122 0.2
123 0.22
124 0.26
125 0.25
126 0.27
127 0.28
128 0.3
129 0.29
130 0.3
131 0.31
132 0.3
133 0.34
134 0.33
135 0.36
136 0.36
137 0.36
138 0.31
139 0.28
140 0.22
141 0.19
142 0.19
143 0.16
144 0.11
145 0.13
146 0.14
147 0.12
148 0.12
149 0.12
150 0.09
151 0.12
152 0.13
153 0.14
154 0.14
155 0.13
156 0.13
157 0.13
158 0.14
159 0.1
160 0.1
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.06
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.09
170 0.12
171 0.15
172 0.2
173 0.2
174 0.22
175 0.24
176 0.24
177 0.27
178 0.25
179 0.23
180 0.21
181 0.23
182 0.21
183 0.2
184 0.19
185 0.14
186 0.12
187 0.11
188 0.09
189 0.07
190 0.08
191 0.08
192 0.14
193 0.2
194 0.22
195 0.24
196 0.25
197 0.27
198 0.31
199 0.32
200 0.34
201 0.33
202 0.37
203 0.34
204 0.35
205 0.33
206 0.28
207 0.28
208 0.26
209 0.23
210 0.2
211 0.2
212 0.18
213 0.19
214 0.18
215 0.18
216 0.12
217 0.13
218 0.12
219 0.13
220 0.13
221 0.13
222 0.13
223 0.12
224 0.12
225 0.1
226 0.09
227 0.08
228 0.07
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.05
233 0.06
234 0.07
235 0.08
236 0.11
237 0.11
238 0.11
239 0.1
240 0.1
241 0.1
242 0.09
243 0.08
244 0.06
245 0.06
246 0.07
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.09
251 0.09
252 0.12
253 0.14
254 0.16
255 0.18
256 0.25
257 0.35
258 0.44
259 0.52
260 0.56
261 0.65
262 0.68
263 0.75
264 0.77
265 0.77
266 0.77
267 0.8
268 0.83
269 0.82
270 0.8
271 0.75
272 0.78
273 0.77
274 0.78
275 0.77
276 0.76
277 0.75
278 0.82
279 0.83
280 0.78
281 0.75
282 0.69
283 0.65
284 0.6
285 0.52
286 0.41
287 0.36
288 0.34
289 0.28
290 0.25
291 0.21
292 0.18
293 0.23
294 0.26
295 0.28
296 0.28
297 0.31
298 0.33
299 0.35
300 0.38
301 0.33
302 0.36
303 0.34
304 0.31
305 0.29
306 0.25
307 0.2
308 0.15
309 0.13
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.06
314 0.08
315 0.09
316 0.1
317 0.11
318 0.1
319 0.1
320 0.11
321 0.11
322 0.1
323 0.09
324 0.08
325 0.07
326 0.09
327 0.08
328 0.07
329 0.06
330 0.07
331 0.08
332 0.09
333 0.1
334 0.09
335 0.1
336 0.11
337 0.14
338 0.13
339 0.11
340 0.11
341 0.1
342 0.11
343 0.11
344 0.1
345 0.07
346 0.07
347 0.08
348 0.08
349 0.09
350 0.08
351 0.07
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.07
356 0.08
357 0.08
358 0.08
359 0.09
360 0.09
361 0.11
362 0.13
363 0.14
364 0.15
365 0.18
366 0.22
367 0.23
368 0.24
369 0.22
370 0.23
371 0.2
372 0.2
373 0.17
374 0.15
375 0.13
376 0.12
377 0.12
378 0.1
379 0.11
380 0.11
381 0.11
382 0.1
383 0.13
384 0.16
385 0.22
386 0.24
387 0.25
388 0.28
389 0.34
390 0.38
391 0.42
392 0.42
393 0.37
394 0.39
395 0.37
396 0.35
397 0.29
398 0.24
399 0.16
400 0.13
401 0.12
402 0.07
403 0.06
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.06
410 0.12
411 0.16
412 0.19
413 0.22
414 0.27
415 0.34
416 0.37
417 0.43
418 0.39
419 0.43
420 0.45
421 0.52
422 0.52
423 0.55
424 0.56