Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8BDC4

Protein Details
Accession G8BDC4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-32STVYYKKQAKYNDKRNILNKAYHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 3, pero 3, cyto_pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MTSPPATANESTVYYKKQAKYNDKRNILNKAYLVEPIVRHRIHDSIFYKQHLYLTNESTILPVITQNVQYIAGVDSIGRPSPFLQCLLRLLELEPAKEIINVYLDQLSYNEFKYLTALTLLYIRLVYPSEDIYNIFDKHAQDYRKLRFKLKTPQFNAVQQPIYYKLGYMDEFIDDLLTQERVVDLILPRLIPRLSLVERGLVAPRQYFIDDEIQKDMSRGQDNVVSGDSDTSYQSDSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.37
3 0.4
4 0.44
5 0.51
6 0.58
7 0.66
8 0.74
9 0.78
10 0.78
11 0.82
12 0.82
13 0.81
14 0.74
15 0.68
16 0.59
17 0.51
18 0.44
19 0.37
20 0.32
21 0.26
22 0.24
23 0.24
24 0.3
25 0.28
26 0.28
27 0.3
28 0.32
29 0.3
30 0.36
31 0.34
32 0.35
33 0.39
34 0.39
35 0.39
36 0.36
37 0.38
38 0.35
39 0.37
40 0.32
41 0.31
42 0.3
43 0.29
44 0.28
45 0.25
46 0.19
47 0.14
48 0.11
49 0.08
50 0.08
51 0.09
52 0.1
53 0.1
54 0.1
55 0.1
56 0.1
57 0.1
58 0.09
59 0.08
60 0.07
61 0.07
62 0.07
63 0.07
64 0.09
65 0.08
66 0.08
67 0.09
68 0.12
69 0.13
70 0.14
71 0.14
72 0.14
73 0.16
74 0.17
75 0.17
76 0.14
77 0.14
78 0.17
79 0.17
80 0.16
81 0.14
82 0.13
83 0.13
84 0.13
85 0.12
86 0.07
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.08
94 0.09
95 0.08
96 0.09
97 0.09
98 0.08
99 0.08
100 0.09
101 0.09
102 0.07
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.07
107 0.07
108 0.06
109 0.06
110 0.05
111 0.05
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.08
119 0.1
120 0.12
121 0.12
122 0.12
123 0.13
124 0.13
125 0.16
126 0.21
127 0.2
128 0.23
129 0.3
130 0.37
131 0.44
132 0.46
133 0.48
134 0.48
135 0.54
136 0.59
137 0.61
138 0.64
139 0.59
140 0.64
141 0.62
142 0.62
143 0.6
144 0.53
145 0.45
146 0.34
147 0.33
148 0.29
149 0.28
150 0.22
151 0.18
152 0.15
153 0.16
154 0.16
155 0.15
156 0.13
157 0.11
158 0.11
159 0.1
160 0.09
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.08
171 0.07
172 0.1
173 0.11
174 0.12
175 0.12
176 0.15
177 0.15
178 0.12
179 0.14
180 0.17
181 0.18
182 0.22
183 0.23
184 0.22
185 0.23
186 0.24
187 0.25
188 0.21
189 0.21
190 0.17
191 0.18
192 0.18
193 0.18
194 0.17
195 0.17
196 0.24
197 0.24
198 0.26
199 0.28
200 0.28
201 0.27
202 0.27
203 0.26
204 0.23
205 0.25
206 0.23
207 0.22
208 0.25
209 0.25
210 0.27
211 0.25
212 0.2
213 0.16
214 0.17
215 0.15
216 0.12
217 0.13
218 0.12