FuNGI

A0A1J9RND0

Protein Details

Accession

A0A1J9RND0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
157-183	MSYKDIMKKREREREEREKQEKKARGE	Basic
211-234	GANGAAASRKRKKRWDVSSEDTAT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
164-181	KKREREREEREKQEKKAR
219-224	RKRKKR

Subcellular Location(s)

plas 16, cyto 4.5, cyto_nucl 4.5, nucl 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1

Amino Acid Sequences

MSDGKLNALNVTSKANARTADFETIKRLQQERNAAAAGKKGSKTFDPANQRTDNSTKASLTESFDTDLYERNGGNKYDGYLASIPANDDEDMDDADDGRRLVGQYTATRAQMDEFATGDGMEEDILMDREKQAQIQSRETDYQRRRFERGTGDEEGMSYKDIMKKREREREEREKQEKKARGEDADGHQATLKDGGDKTPTGGDKTPTENGANGAAASRKRKKRWDVSSEDTATNGTNGAVESEPKKRSRWDQTPSVPVPGASDATSRKKSRWDQAPALGATPAPGAAGLATPIHPSQSGQALSFGTDISGRNAPISDEELDELLPGEDQGYRILTPPPGYEPVRAPAKKVAATPAPTASLAGGFMMQEPENARALGKQLPNEIPGVGELQFFKNEDMQYFGKLMDGQNEEELSVDEMKERKIMRLLLKVKNGTPPMRKTALRQLTDNARNFGAGPLFNQILPLLMERTLEDQERHLLVKVIDRVLYKLDDMVRPYVHKILVVIEPLLIDQDYYARVEGREIISNLAKAAGLAHMISTMRPDIDHPDEYVRNTTARAFAVVASALGIPALLPFLRAVCRSKKSWQARHTGVKIVQQIPILMGCAILPHLKGLVDCIGDNLNDEQTKVRTVTALAIAALAEAANPYGIESFDDILNPLWTGARKQRGKGLAGFLKAVGYIIPLMDEEYANYYTSQIMEILLREFSSPDEEMKKVVLKVISQCASTEGVTAGYLKESVLDDFFKSFWVRRMALDKRNYRQVVETTVDLGQKVGVSEIVERIVVNLKDESEPYRKMTVETLEKVIASLGAADIGERLEERLVDGILHAFQEQSIEDIVMLNGFGTVVNALGTRCKPYLPQIVSTILWRLNNKSATVRQQAADLVSRIALVMKQCGEDALMGKLGTVLYEYLGEEYPEVLGSILGALRSIVTVVGINQMQPPIKDLLPRLTPILRNRHEKVQENTIDLVGRIADRGPESVNAREWMRICFELLDMLKAHKKGIRRAANNTFGFIAKAIGPQDVLATLLNNLRVQERQSRVCTAVAIGIVAETCAPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKSLSFLFEYIGEMAKDYVYAVTPLLEDALIDRDQVHRQTAASVVKHVALGVVGLGCEDAMVHLLNLLYPNIFETSPHVIDRIIEAIEAVRVAVGTGVVMNYVWAGLFHPARKVRQPYWRLYNDAYVHSADAMVPYYPDMGDPNTVRHELNIIL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.28
3	0.27
4	0.27
5	0.31
6	0.31
7	0.37
8	0.37
9	0.35
10	0.39
11	0.41
12	0.43
13	0.45
14	0.45
15	0.42
16	0.47
17	0.56
18	0.52
19	0.53
20	0.51
21	0.46
22	0.43
23	0.43
24	0.4
25	0.37
26	0.35
27	0.33
28	0.36
29	0.36
30	0.41
31	0.42
32	0.45
33	0.5
34	0.53
35	0.58
36	0.58
37	0.57
38	0.58
39	0.56
40	0.51
41	0.46
42	0.44
43	0.37
44	0.34
45	0.35
46	0.32
47	0.32
48	0.31
49	0.28
50	0.26
51	0.25
52	0.26
53	0.23
54	0.25
55	0.22
56	0.22
57	0.2
58	0.22
59	0.27
60	0.26
61	0.28
62	0.24
63	0.24
64	0.26
65	0.26
66	0.27
67	0.23
68	0.24
69	0.22
70	0.22
71	0.21
72	0.17
73	0.19
74	0.14
75	0.14
76	0.13
77	0.13
78	0.12
79	0.12
80	0.11
81	0.1
82	0.1
83	0.11
84	0.1
85	0.09
86	0.1
87	0.1
88	0.11
89	0.13
90	0.17
91	0.18
92	0.25
93	0.28
94	0.27
95	0.27
96	0.27
97	0.25
98	0.25
99	0.23
100	0.18
101	0.15
102	0.15
103	0.14
104	0.14
105	0.12
106	0.09
107	0.07
108	0.06
109	0.05
110	0.05
111	0.06
112	0.07
113	0.07
114	0.08
115	0.09
116	0.14
117	0.15
118	0.17
119	0.22
120	0.3
121	0.35
122	0.41
123	0.44
124	0.44
125	0.5
126	0.51
127	0.56
128	0.56
129	0.6
130	0.63
131	0.64
132	0.65
133	0.62
134	0.65
135	0.64
136	0.62
137	0.59
138	0.53
139	0.5
140	0.44
141	0.41
142	0.36
143	0.27
144	0.21
145	0.15
146	0.15
147	0.19
148	0.23
149	0.3
150	0.38
151	0.46
152	0.55
153	0.66
154	0.7
155	0.73
156	0.79
157	0.83
158	0.84
159	0.86
160	0.86
161	0.83
162	0.84
163	0.84
164	0.82
165	0.77
166	0.76
167	0.71
168	0.64
169	0.61
170	0.59
171	0.54
172	0.57
173	0.5
174	0.42
175	0.38
176	0.35
177	0.3
178	0.27
179	0.21
180	0.15
181	0.16
182	0.18
183	0.19
184	0.19
185	0.2
186	0.22
187	0.24
188	0.24
189	0.26
190	0.27
191	0.28
192	0.32
193	0.34
194	0.31
195	0.3
196	0.27
197	0.25
198	0.24
199	0.2
200	0.15
201	0.14
202	0.15
203	0.18
204	0.26
205	0.34
206	0.42
207	0.49
208	0.59
209	0.68
210	0.75
211	0.81
212	0.82
213	0.82
214	0.8
215	0.82
216	0.76
217	0.66
218	0.55
219	0.45
220	0.36
221	0.27
222	0.2
223	0.1
224	0.07
225	0.07
226	0.08
227	0.08
228	0.1
229	0.14
230	0.2
231	0.26
232	0.28
233	0.31
234	0.35
235	0.44
236	0.52
237	0.58
238	0.58
239	0.63
240	0.68
241	0.74
242	0.7
243	0.64
244	0.54
245	0.44
246	0.39
247	0.3
248	0.25
249	0.16
250	0.17
251	0.19
252	0.26
253	0.33
254	0.33
255	0.34
256	0.42
257	0.48
258	0.54
259	0.59
260	0.61
261	0.59
262	0.64
263	0.68
264	0.59
265	0.53
266	0.44
267	0.33
268	0.25
269	0.19
270	0.13
271	0.06
272	0.05
273	0.04
274	0.04
275	0.04
276	0.04
277	0.05
278	0.06
279	0.07
280	0.08
281	0.09
282	0.09
283	0.09
284	0.1
285	0.15
286	0.16
287	0.15
288	0.17
289	0.16
290	0.16
291	0.16
292	0.14
293	0.09
294	0.09
295	0.09
296	0.11
297	0.13
298	0.12
299	0.12
300	0.13
301	0.13
302	0.13
303	0.15
304	0.13
305	0.12
306	0.12
307	0.12
308	0.12
309	0.11
310	0.1
311	0.07
312	0.06
313	0.05
314	0.05
315	0.05
316	0.06
317	0.07
318	0.08
319	0.08
320	0.09
321	0.11
322	0.12
323	0.13
324	0.14
325	0.17
326	0.21
327	0.22
328	0.23
329	0.24
330	0.28
331	0.36
332	0.35
333	0.34
334	0.35
335	0.37
336	0.37
337	0.36
338	0.35
339	0.31
340	0.34
341	0.33
342	0.29
343	0.26
344	0.24
345	0.23
346	0.18
347	0.13
348	0.09
349	0.07
350	0.06
351	0.05
352	0.05
353	0.07
354	0.06
355	0.07
356	0.09
357	0.11
358	0.12
359	0.12
360	0.11
361	0.1
362	0.13
363	0.18
364	0.19
365	0.18
366	0.22
367	0.23
368	0.24
369	0.24
370	0.22
371	0.16
372	0.14
373	0.14
374	0.1
375	0.09
376	0.09
377	0.1
378	0.11
379	0.11
380	0.12
381	0.14
382	0.14
383	0.13
384	0.17
385	0.16
386	0.17
387	0.17
388	0.16
389	0.13
390	0.14
391	0.14
392	0.15
393	0.16
394	0.16
395	0.16
396	0.16
397	0.15
398	0.14
399	0.14
400	0.1
401	0.08
402	0.07
403	0.09
404	0.1
405	0.11
406	0.15
407	0.15
408	0.15
409	0.18
410	0.23
411	0.26
412	0.34
413	0.41
414	0.43
415	0.48
416	0.49
417	0.47
418	0.48
419	0.48
420	0.45
421	0.44
422	0.42
423	0.42
424	0.44
425	0.44
426	0.42
427	0.48
428	0.5
429	0.45
430	0.43
431	0.41
432	0.46
433	0.52
434	0.5
435	0.41
436	0.33
437	0.31
438	0.3
439	0.27
440	0.19
441	0.12
442	0.1
443	0.11
444	0.12
445	0.11
446	0.11
447	0.09
448	0.08
449	0.09
450	0.09
451	0.07
452	0.07
453	0.07
454	0.07
455	0.1
456	0.11
457	0.12
458	0.12
459	0.12
460	0.14
461	0.15
462	0.15
463	0.13
464	0.14
465	0.13
466	0.17
467	0.18
468	0.17
469	0.18
470	0.17
471	0.18
472	0.17
473	0.17
474	0.13
475	0.13
476	0.14
477	0.14
478	0.15
479	0.17
480	0.16
481	0.16
482	0.18
483	0.18
484	0.16
485	0.14
486	0.13
487	0.13
488	0.14
489	0.13
490	0.12
491	0.09
492	0.09
493	0.09
494	0.08
495	0.06
496	0.04
497	0.03
498	0.04
499	0.05
500	0.05
501	0.06
502	0.06
503	0.06
504	0.07
505	0.09
506	0.1
507	0.12
508	0.12
509	0.13
510	0.14
511	0.14
512	0.13
513	0.11
514	0.09
515	0.07
516	0.07
517	0.05
518	0.05
519	0.04
520	0.04
521	0.05
522	0.05
523	0.05
524	0.06
525	0.06
526	0.05
527	0.06
528	0.06
529	0.1
530	0.14
531	0.15
532	0.15
533	0.18
534	0.2
535	0.2
536	0.22
537	0.18
538	0.14
539	0.14
540	0.14
541	0.12
542	0.12
543	0.11
544	0.1
545	0.09
546	0.09
547	0.08
548	0.07
549	0.06
550	0.05
551	0.04
552	0.04
553	0.03
554	0.03
555	0.03
556	0.03
557	0.02
558	0.03
559	0.03
560	0.04
561	0.06
562	0.07
563	0.11
564	0.16
565	0.2
566	0.22
567	0.27
568	0.37
569	0.45
570	0.52
571	0.55
572	0.57
573	0.6
574	0.65
575	0.62
576	0.57
577	0.49
578	0.45
579	0.44
580	0.37
581	0.33
582	0.25
583	0.23
584	0.19
585	0.17
586	0.13
587	0.08
588	0.06
589	0.04
590	0.04
591	0.04
592	0.05
593	0.04
594	0.04
595	0.05
596	0.05
597	0.05
598	0.06
599	0.07
600	0.07
601	0.07
602	0.07
603	0.08
604	0.07
605	0.08
606	0.08
607	0.08
608	0.07
609	0.08
610	0.08
611	0.08
612	0.1
613	0.09
614	0.09
615	0.08
616	0.08
617	0.09
618	0.09
619	0.09
620	0.07
621	0.07
622	0.06
623	0.06
624	0.05
625	0.04
626	0.02
627	0.02
628	0.02
629	0.02
630	0.02
631	0.02
632	0.03
633	0.03
634	0.04
635	0.04
636	0.05
637	0.05
638	0.06
639	0.06
640	0.06
641	0.06
642	0.06
643	0.05
644	0.05
645	0.06
646	0.08
647	0.13
648	0.22
649	0.24
650	0.25
651	0.31
652	0.34
653	0.36
654	0.36
655	0.37
656	0.32
657	0.31
658	0.3
659	0.24
660	0.2
661	0.18
662	0.15
663	0.08
664	0.05
665	0.04
666	0.03
667	0.04
668	0.03
669	0.04
670	0.05
671	0.05
672	0.04
673	0.07
674	0.08
675	0.08
676	0.08
677	0.08
678	0.08
679	0.08
680	0.08
681	0.06
682	0.06
683	0.06
684	0.06
685	0.06
686	0.06
687	0.06
688	0.06
689	0.06
690	0.06
691	0.09
692	0.09
693	0.1
694	0.13
695	0.13
696	0.13
697	0.14
698	0.16
699	0.13
700	0.15
701	0.14
702	0.13
703	0.16
704	0.21
705	0.21
706	0.19
707	0.19
708	0.18
709	0.19
710	0.17
711	0.14
712	0.09
713	0.08
714	0.08
715	0.08
716	0.06
717	0.05
718	0.05
719	0.05
720	0.05
721	0.06
722	0.06
723	0.07
724	0.08
725	0.08
726	0.09
727	0.09
728	0.1
729	0.1
730	0.11
731	0.15
732	0.19
733	0.19
734	0.21
735	0.29
736	0.34
737	0.41
738	0.48
739	0.51
740	0.5
741	0.58
742	0.57
743	0.5
744	0.47
745	0.4
746	0.36
747	0.31
748	0.27
749	0.2
750	0.21
751	0.2
752	0.17
753	0.15
754	0.1
755	0.09
756	0.08
757	0.07
758	0.05
759	0.05
760	0.06
761	0.07
762	0.07
763	0.07
764	0.07
765	0.07
766	0.12
767	0.11
768	0.12
769	0.12
770	0.12
771	0.13
772	0.14
773	0.18
774	0.18
775	0.2
776	0.21
777	0.24
778	0.23
779	0.23
780	0.25
781	0.26
782	0.27
783	0.27
784	0.26
785	0.24
786	0.23
787	0.22
788	0.19
789	0.14
790	0.08
791	0.06
792	0.04
793	0.04
794	0.03
795	0.03
796	0.04
797	0.04
798	0.04
799	0.04
800	0.04
801	0.04
802	0.04
803	0.05
804	0.06
805	0.06
806	0.06
807	0.06
808	0.06
809	0.06
810	0.07
811	0.06
812	0.05
813	0.05
814	0.06
815	0.06
816	0.06
817	0.06
818	0.05
819	0.05
820	0.06
821	0.06
822	0.05
823	0.05
824	0.04
825	0.03
826	0.03
827	0.03
828	0.03
829	0.03
830	0.03
831	0.04
832	0.04
833	0.04
834	0.08
835	0.09
836	0.12
837	0.12
838	0.13
839	0.14
840	0.2
841	0.3
842	0.29
843	0.31
844	0.3
845	0.33
846	0.33
847	0.32
848	0.29
849	0.22
850	0.22
851	0.21
852	0.22
853	0.25
854	0.26
855	0.27
856	0.3
857	0.32
858	0.37
859	0.41
860	0.39
861	0.33
862	0.33
863	0.33
864	0.29
865	0.26
866	0.2
867	0.15
868	0.12
869	0.12
870	0.1
871	0.1
872	0.09
873	0.08
874	0.1
875	0.1
876	0.11
877	0.11
878	0.11
879	0.11
880	0.1
881	0.11
882	0.09
883	0.1
884	0.09
885	0.09
886	0.09
887	0.09
888	0.07
889	0.07
890	0.06
891	0.05
892	0.06
893	0.06
894	0.07
895	0.07
896	0.08
897	0.07
898	0.07
899	0.07
900	0.06
901	0.06
902	0.05
903	0.04
904	0.04
905	0.04
906	0.05
907	0.04
908	0.04
909	0.04
910	0.04
911	0.04
912	0.04
913	0.04
914	0.04
915	0.04
916	0.05
917	0.08
918	0.08
919	0.09
920	0.1
921	0.13
922	0.14
923	0.14
924	0.16
925	0.16
926	0.16
927	0.19
928	0.2
929	0.24
930	0.26
931	0.27
932	0.28
933	0.29
934	0.34
935	0.37
936	0.46
937	0.45
938	0.51
939	0.53
940	0.59
941	0.62
942	0.64
943	0.61
944	0.61
945	0.57
946	0.53
947	0.5
948	0.42
949	0.35
950	0.28
951	0.23
952	0.14
953	0.11
954	0.08
955	0.08
956	0.08
957	0.09
958	0.1
959	0.11
960	0.14
961	0.17
962	0.2
963	0.22
964	0.23
965	0.23
966	0.26
967	0.25
968	0.24
969	0.24
970	0.22
971	0.21
972	0.19
973	0.18
974	0.19
975	0.19
976	0.19
977	0.15
978	0.18
979	0.22
980	0.22
981	0.24
982	0.22
983	0.27
984	0.33
985	0.43
986	0.5
987	0.51
988	0.59
989	0.65
990	0.72
991	0.67
992	0.6
993	0.51
994	0.41
995	0.36
996	0.28
997	0.2
998	0.11
999	0.13
1000	0.13
1001	0.12
1002	0.11
1003	0.11
1004	0.11
1005	0.1
1006	0.1
1007	0.07
1008	0.07
1009	0.08
1010	0.1
1011	0.12
1012	0.12
1013	0.13
1014	0.14
1015	0.16
1016	0.19
1017	0.26
1018	0.31
1019	0.35
1020	0.38
1021	0.42
1022	0.42
1023	0.41
1024	0.38
1025	0.29
1026	0.25
1027	0.19
1028	0.15
1029	0.11
1030	0.09
1031	0.08
1032	0.07
1033	0.06
1034	0.04
1035	0.04
1036	0.04
1037	0.05
1038	0.05
1039	0.06
1040	0.09
1041	0.1
1042	0.1
1043	0.11
1044	0.16
1045	0.16
1046	0.18
1047	0.18
1048	0.17
1049	0.18
1050	0.18
1051	0.19
1052	0.2
1053	0.23
1054	0.25
1055	0.26
1056	0.25
1057	0.28
1058	0.27
1059	0.26
1060	0.2
1061	0.17
1062	0.14
1063	0.14
1064	0.15
1065	0.11
1066	0.11
1067	0.11
1068	0.11
1069	0.13
1070	0.12
1071	0.13
1072	0.11
1073	0.11
1074	0.11
1075	0.1
1076	0.1
1077	0.09
1078	0.08
1079	0.07
1080	0.08
1081	0.08
1082	0.08
1083	0.08
1084	0.08
1085	0.08
1086	0.07
1087	0.06
1088	0.07
1089	0.1
1090	0.1
1091	0.1
1092	0.11
1093	0.14
1094	0.19
1095	0.21
1096	0.23
1097	0.2
1098	0.2
1099	0.22
1100	0.27
1101	0.3
1102	0.27
1103	0.27
1104	0.26
1105	0.26
1106	0.25
1107	0.23
1108	0.18
1109	0.11
1110	0.1
1111	0.08
1112	0.06
1113	0.05
1114	0.05
1115	0.05
1116	0.04
1117	0.04
1118	0.04
1119	0.03
1120	0.05
1121	0.05
1122	0.05
1123	0.06
1124	0.06
1125	0.07
1126	0.09
1127	0.09
1128	0.08
1129	0.08
1130	0.1
1131	0.11
1132	0.11
1133	0.1
1134	0.14
1135	0.21
1136	0.23
1137	0.24
1138	0.23
1139	0.21
1140	0.22
1141	0.24
1142	0.21
1143	0.14
1144	0.11
1145	0.11
1146	0.11
1147	0.11
1148	0.1
1149	0.08
1150	0.06
1151	0.05
1152	0.05
1153	0.05
1154	0.05
1155	0.04
1156	0.05
1157	0.05
1158	0.05
1159	0.05
1160	0.05
1161	0.05
1162	0.05
1163	0.05
1164	0.04
1165	0.06
1166	0.11
1167	0.15
1168	0.17
1169	0.25
1170	0.31
1171	0.37
1172	0.45
1173	0.53
1174	0.55
1175	0.62
1176	0.67
1177	0.69
1178	0.74
1179	0.74
1180	0.71
1181	0.66
1182	0.67
1183	0.6
1184	0.55
1185	0.49
1186	0.39
1187	0.34
1188	0.29
1189	0.26
1190	0.17
1191	0.15
1192	0.13
1193	0.1
1194	0.09
1195	0.09
1196	0.1
1197	0.1
1198	0.1
1199	0.11
1200	0.12
1201	0.18
1202	0.19
1203	0.23
1204	0.27
1205	0.29
1206	0.29
1207	0.27

A0A1J9RND0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer