Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9RST1

Protein Details
Accession A0A1J9RST1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
52-80VAQEKSQKGSQYRRKRGPNRTQRVKLGHGHydrophilic
394-417EQPAQARPKSPEKRERSNSPVKTMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
65-67RKR
Subcellular Location(s) mito 11.5, cyto_mito 11, cyto 9.5, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR002501  PsdUridine_synth_N  
IPR014780  tRNA_psdUridine_synth_TruB  
IPR032819  TruB_C  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF16198  TruB_C_2  
PF01509  TruB_N  
Amino Acid Sequences MSSTGKPQLLQGVLAIHKPIGISSAQVLRDVEEHFNPSALFRPLLDAERAAVAQEKSQKGSQYRRKRGPNRTQRVKLGHGGTLDPLATGVLIAGVGSGTKALGRYLGGCQKTYESAVLFGCAADTYDNTGKIMGRAPHAHVTREAVEKALDAFKGDIMQKPPVYSAIKFNGKKAYEIMREGGAPPKMEERPVTVYKLELVDWFEPGTHSWRYPKEEMEATKEEKEAALKASAPNAKAEDAAAAATAAGEKRKRDEGGDSAEEIPEKKTKTEVGAEQPADATTVDETKDASAKAPTEEESAATLSEDGANAPAALIRMTVSSGFYVRTLCHDLGAAVGSLACMTSLVRTEQGDFELGKNVLEYEDLQAGEDVWGPKVKTLLEEWTARQQKEQKAEQPAQARPKSPEKRERSNSPVKTMKEAKEDDVPEMD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.24
3 0.17
4 0.17
5 0.16
6 0.15
7 0.11
8 0.1
9 0.1
10 0.13
11 0.19
12 0.19
13 0.21
14 0.21
15 0.2
16 0.22
17 0.24
18 0.24
19 0.21
20 0.24
21 0.22
22 0.23
23 0.22
24 0.2
25 0.22
26 0.21
27 0.19
28 0.16
29 0.2
30 0.22
31 0.25
32 0.25
33 0.2
34 0.19
35 0.2
36 0.2
37 0.16
38 0.18
39 0.15
40 0.18
41 0.26
42 0.27
43 0.29
44 0.32
45 0.38
46 0.41
47 0.51
48 0.57
49 0.61
50 0.69
51 0.75
52 0.83
53 0.87
54 0.91
55 0.91
56 0.92
57 0.92
58 0.92
59 0.9
60 0.87
61 0.84
62 0.78
63 0.74
64 0.65
65 0.57
66 0.48
67 0.41
68 0.33
69 0.28
70 0.22
71 0.15
72 0.12
73 0.08
74 0.07
75 0.05
76 0.04
77 0.03
78 0.03
79 0.03
80 0.02
81 0.02
82 0.02
83 0.03
84 0.03
85 0.03
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.06
90 0.06
91 0.08
92 0.13
93 0.2
94 0.21
95 0.22
96 0.23
97 0.24
98 0.25
99 0.24
100 0.21
101 0.14
102 0.15
103 0.14
104 0.14
105 0.12
106 0.11
107 0.09
108 0.07
109 0.07
110 0.06
111 0.06
112 0.1
113 0.12
114 0.12
115 0.12
116 0.13
117 0.13
118 0.14
119 0.18
120 0.16
121 0.18
122 0.2
123 0.23
124 0.3
125 0.31
126 0.31
127 0.27
128 0.29
129 0.28
130 0.28
131 0.25
132 0.18
133 0.17
134 0.16
135 0.16
136 0.15
137 0.12
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.11
142 0.12
143 0.14
144 0.15
145 0.19
146 0.19
147 0.19
148 0.2
149 0.21
150 0.23
151 0.2
152 0.23
153 0.26
154 0.34
155 0.34
156 0.37
157 0.4
158 0.38
159 0.38
160 0.35
161 0.36
162 0.3
163 0.31
164 0.29
165 0.23
166 0.23
167 0.22
168 0.24
169 0.18
170 0.15
171 0.14
172 0.17
173 0.17
174 0.18
175 0.18
176 0.17
177 0.22
178 0.23
179 0.25
180 0.2
181 0.2
182 0.2
183 0.2
184 0.16
185 0.11
186 0.12
187 0.11
188 0.11
189 0.11
190 0.1
191 0.09
192 0.1
193 0.12
194 0.1
195 0.11
196 0.15
197 0.19
198 0.24
199 0.25
200 0.26
201 0.25
202 0.28
203 0.29
204 0.3
205 0.3
206 0.28
207 0.27
208 0.26
209 0.23
210 0.19
211 0.19
212 0.13
213 0.11
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.14
218 0.16
219 0.16
220 0.16
221 0.16
222 0.16
223 0.15
224 0.14
225 0.09
226 0.07
227 0.07
228 0.05
229 0.04
230 0.04
231 0.03
232 0.04
233 0.04
234 0.07
235 0.09
236 0.09
237 0.12
238 0.16
239 0.17
240 0.18
241 0.22
242 0.23
243 0.28
244 0.29
245 0.28
246 0.25
247 0.24
248 0.23
249 0.2
250 0.17
251 0.15
252 0.14
253 0.13
254 0.14
255 0.15
256 0.18
257 0.22
258 0.24
259 0.27
260 0.33
261 0.32
262 0.31
263 0.29
264 0.26
265 0.22
266 0.18
267 0.12
268 0.06
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.08
273 0.08
274 0.1
275 0.09
276 0.1
277 0.11
278 0.11
279 0.13
280 0.14
281 0.14
282 0.15
283 0.15
284 0.14
285 0.13
286 0.13
287 0.11
288 0.1
289 0.09
290 0.07
291 0.07
292 0.06
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.06
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.08
309 0.09
310 0.09
311 0.1
312 0.09
313 0.14
314 0.18
315 0.17
316 0.17
317 0.16
318 0.16
319 0.15
320 0.16
321 0.11
322 0.06
323 0.06
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.04
328 0.03
329 0.03
330 0.05
331 0.06
332 0.08
333 0.1
334 0.11
335 0.13
336 0.14
337 0.15
338 0.16
339 0.16
340 0.15
341 0.19
342 0.18
343 0.16
344 0.15
345 0.14
346 0.12
347 0.12
348 0.12
349 0.1
350 0.13
351 0.12
352 0.13
353 0.12
354 0.13
355 0.12
356 0.15
357 0.13
358 0.12
359 0.15
360 0.15
361 0.16
362 0.18
363 0.18
364 0.17
365 0.19
366 0.23
367 0.25
368 0.28
369 0.3
370 0.38
371 0.45
372 0.43
373 0.47
374 0.49
375 0.52
376 0.58
377 0.63
378 0.6
379 0.63
380 0.68
381 0.67
382 0.67
383 0.67
384 0.68
385 0.65
386 0.62
387 0.58
388 0.64
389 0.67
390 0.7
391 0.73
392 0.71
393 0.77
394 0.82
395 0.85
396 0.83
397 0.84
398 0.8
399 0.79
400 0.78
401 0.7
402 0.71
403 0.7
404 0.67
405 0.65
406 0.62
407 0.57
408 0.58
409 0.57