Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9S613

Protein Details
Accession A0A1J9S613    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
396-415LEADKAKRVERDRKLKNLSAHydrophilic
418-441QRKYLEKEREKDLRRSQRKKVMRABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
378-441EIRKIKKADEEGKAEERKLEADKAKRVERDRKLKNLSADEQRKYLEKEREKDLRRSQRKKVMRA
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 11, cyto 9.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012879  CCDC47  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005509  F:calcium ion binding  
GO:0032469  P:endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis  
Pfam View protein in Pfam  
PF07946  CCDC47  
Amino Acid Sequences MANFLNNILGSKPSPSGAAGDADFADFAGAPDPSPVSISPASVVGEAAQDAFATGAAVPYTKWYRVWERTTLADFYQEAFILPVIIVIVLLHVWGTKANRRKAQAFAKAHSPLLRQEFASVGYSGRKAPTVEDVQASGLAKLSAEELGNSNEVLKEVSANEYSIYATGRQNAAFVDIKLSLLKRYNPLIRYGESVLSLFFETMPAPVERVEATIYAFDGKESQLIPSAAKVSNSTFDGFVWAVVHKNLMKTLRDDRYDLSLTSTKDHPKLPISYTVMSESAEITEALLTPALVKAIEQAGDALEAIVVSDQPMDQPKKLDDTVSRKRVSLSFALPSNNDYSHVQPLFQHFLRMPDQLVNVAHFRPEALRRVKQTREDEIRKIKKADEEGKAEERKLEADKAKRVERDRKLKNLSADEQRKYLEKEREKDLRRSQRKKVMRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.17
3 0.18
4 0.17
5 0.19
6 0.16
7 0.17
8 0.16
9 0.15
10 0.14
11 0.11
12 0.1
13 0.07
14 0.07
15 0.08
16 0.07
17 0.07
18 0.09
19 0.1
20 0.09
21 0.11
22 0.11
23 0.15
24 0.15
25 0.16
26 0.15
27 0.16
28 0.17
29 0.15
30 0.15
31 0.1
32 0.1
33 0.09
34 0.09
35 0.07
36 0.06
37 0.06
38 0.06
39 0.05
40 0.05
41 0.05
42 0.05
43 0.05
44 0.06
45 0.06
46 0.12
47 0.16
48 0.17
49 0.19
50 0.24
51 0.33
52 0.41
53 0.46
54 0.46
55 0.46
56 0.49
57 0.51
58 0.47
59 0.39
60 0.33
61 0.29
62 0.24
63 0.23
64 0.17
65 0.14
66 0.12
67 0.12
68 0.09
69 0.08
70 0.06
71 0.05
72 0.05
73 0.04
74 0.03
75 0.04
76 0.03
77 0.03
78 0.03
79 0.03
80 0.04
81 0.07
82 0.1
83 0.17
84 0.26
85 0.34
86 0.4
87 0.45
88 0.49
89 0.55
90 0.61
91 0.64
92 0.61
93 0.56
94 0.57
95 0.54
96 0.53
97 0.47
98 0.4
99 0.35
100 0.35
101 0.34
102 0.27
103 0.25
104 0.24
105 0.22
106 0.23
107 0.17
108 0.13
109 0.13
110 0.14
111 0.15
112 0.15
113 0.15
114 0.13
115 0.14
116 0.19
117 0.21
118 0.22
119 0.21
120 0.21
121 0.2
122 0.21
123 0.2
124 0.14
125 0.1
126 0.09
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.06
132 0.07
133 0.08
134 0.09
135 0.1
136 0.09
137 0.09
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.07
142 0.06
143 0.06
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.09
154 0.12
155 0.13
156 0.12
157 0.12
158 0.12
159 0.15
160 0.13
161 0.13
162 0.12
163 0.11
164 0.12
165 0.13
166 0.13
167 0.12
168 0.14
169 0.16
170 0.17
171 0.22
172 0.27
173 0.26
174 0.31
175 0.31
176 0.29
177 0.3
178 0.29
179 0.25
180 0.2
181 0.19
182 0.14
183 0.12
184 0.11
185 0.08
186 0.06
187 0.06
188 0.05
189 0.05
190 0.07
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.08
198 0.06
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.05
205 0.06
206 0.06
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.08
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.12
215 0.11
216 0.11
217 0.12
218 0.1
219 0.12
220 0.13
221 0.13
222 0.1
223 0.1
224 0.11
225 0.1
226 0.1
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.07
231 0.09
232 0.08
233 0.09
234 0.12
235 0.14
236 0.15
237 0.18
238 0.25
239 0.29
240 0.3
241 0.31
242 0.29
243 0.31
244 0.32
245 0.28
246 0.25
247 0.23
248 0.22
249 0.23
250 0.26
251 0.25
252 0.26
253 0.27
254 0.26
255 0.26
256 0.28
257 0.28
258 0.31
259 0.31
260 0.3
261 0.29
262 0.28
263 0.25
264 0.22
265 0.2
266 0.13
267 0.09
268 0.09
269 0.07
270 0.06
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.04
276 0.04
277 0.05
278 0.05
279 0.04
280 0.04
281 0.05
282 0.06
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.05
290 0.04
291 0.03
292 0.03
293 0.03
294 0.03
295 0.03
296 0.03
297 0.03
298 0.05
299 0.12
300 0.15
301 0.16
302 0.19
303 0.2
304 0.25
305 0.25
306 0.28
307 0.29
308 0.36
309 0.45
310 0.51
311 0.51
312 0.46
313 0.48
314 0.47
315 0.44
316 0.39
317 0.32
318 0.28
319 0.29
320 0.31
321 0.29
322 0.29
323 0.27
324 0.23
325 0.22
326 0.19
327 0.19
328 0.25
329 0.25
330 0.23
331 0.23
332 0.28
333 0.32
334 0.31
335 0.31
336 0.24
337 0.28
338 0.31
339 0.3
340 0.26
341 0.22
342 0.23
343 0.23
344 0.23
345 0.2
346 0.2
347 0.19
348 0.18
349 0.15
350 0.15
351 0.17
352 0.2
353 0.27
354 0.32
355 0.38
356 0.45
357 0.53
358 0.59
359 0.63
360 0.66
361 0.67
362 0.7
363 0.7
364 0.72
365 0.75
366 0.77
367 0.73
368 0.7
369 0.63
370 0.6
371 0.62
372 0.62
373 0.58
374 0.56
375 0.56
376 0.62
377 0.62
378 0.55
379 0.48
380 0.41
381 0.37
382 0.34
383 0.36
384 0.35
385 0.39
386 0.47
387 0.52
388 0.58
389 0.62
390 0.67
391 0.7
392 0.72
393 0.76
394 0.77
395 0.8
396 0.81
397 0.8
398 0.79
399 0.77
400 0.74
401 0.74
402 0.74
403 0.67
404 0.62
405 0.58
406 0.55
407 0.53
408 0.54
409 0.54
410 0.55
411 0.56
412 0.62
413 0.7
414 0.72
415 0.76
416 0.78
417 0.78
418 0.8
419 0.84
420 0.85
421 0.86