FuNGI

A0A1J9RFC4

Protein Details

Accession

A0A1J9RFC4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
410-433	PVPDDKPSRKRGGRRVRKAKEAYA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
414-429	DKPSRKRGGRRVRKAK

Subcellular Location(s)

cyto 17.5, cyto_nucl 12.5, nucl 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR042239 Nop_C IPR002687 Nop_dom IPR036070 Nop_dom_sf IPR012976 NOSIC IPR027105 Prp31 IPR019175 Prp31_C
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0046540 C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0000244 P:spliceosomal tri-snRNP complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF01798 Nop PF09785 Prp31_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS51358 NOP

Amino Acid Sequences

MATLADELLNDFEDSGDENEEQNGETPQDDGVASLFPADTPVQQVKAGGEEGGMDLDDDEEDVEDDEELMEGAAAKQARDVPEDEEETKARVEKMQLGSVSDVRSVAGLMKTLQPVLDKIAHYQGLPPEKQTKNIGSIEDNPEYKLLTQSNTLATQIDSEIILVHKFIRDHYSLRFPELETLVTNPLDYAKTVAIIGNGPMDAESIKKKSASSDNLVGQPLNKVLDGPSMMVVTVETTTSQGRDLTDTELNTVLKACEMTLQLDNAKKVLTEYVQSRMNIFAPNLTALIGSLTAAQLINYAGGIKGLAKTPSCNIAVLGAKRASGTGFATNTGVRNQGFLYHSEIIRNIPNDLKKQAMRIVSAKIVLAARVDSIHSSPDGSTGETLKQQCLDRLDKLTEPPPNKGIRALPVPDDKPSRKRGGRRVRKAKEAYAMTELRKAQNRVAFGKEEAEAGYGTGDGTKGLGMIGQANDGRIRATQIDQRTKAKLSKKNPGWGGATPVSGVASTMRGSGTAGNASVLKGHGLRSSGVGTAGTASTIAFTPVQGLELVDPKVREEVNRKRKAEEDRWFGGGTFTQIAGAKTETGGKKDADGFKVPSLPPKKQKQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.1
2	0.11
3	0.13
4	0.12
5	0.13
6	0.14
7	0.15
8	0.15
9	0.14
10	0.14
11	0.12
12	0.12
13	0.12
14	0.11
15	0.11
16	0.11
17	0.09
18	0.09
19	0.08
20	0.08
21	0.08
22	0.08
23	0.06
24	0.09
25	0.1
26	0.1
27	0.15
28	0.18
29	0.19
30	0.2
31	0.21
32	0.19
33	0.21
34	0.21
35	0.15
36	0.12
37	0.11
38	0.11
39	0.1
40	0.09
41	0.06
42	0.06
43	0.06
44	0.06
45	0.05
46	0.05
47	0.05
48	0.05
49	0.06
50	0.06
51	0.06
52	0.06
53	0.06
54	0.06
55	0.05
56	0.05
57	0.04
58	0.04
59	0.04
60	0.08
61	0.08
62	0.08
63	0.11
64	0.14
65	0.16
66	0.19
67	0.2
68	0.21
69	0.25
70	0.3
71	0.29
72	0.28
73	0.27
74	0.26
75	0.26
76	0.25
77	0.21
78	0.2
79	0.21
80	0.26
81	0.29
82	0.32
83	0.32
84	0.31
85	0.33
86	0.33
87	0.31
88	0.24
89	0.2
90	0.15
91	0.14
92	0.12
93	0.12
94	0.1
95	0.1
96	0.11
97	0.14
98	0.15
99	0.15
100	0.16
101	0.14
102	0.14
103	0.18
104	0.21
105	0.18
106	0.2
107	0.25
108	0.25
109	0.24
110	0.26
111	0.28
112	0.3
113	0.3
114	0.32
115	0.36
116	0.37
117	0.41
118	0.43
119	0.4
120	0.39
121	0.41
122	0.39
123	0.34
124	0.39
125	0.41
126	0.39
127	0.36
128	0.31
129	0.29
130	0.27
131	0.24
132	0.22
133	0.17
134	0.15
135	0.16
136	0.17
137	0.2
138	0.2
139	0.2
140	0.16
141	0.15
142	0.14
143	0.12
144	0.11
145	0.08
146	0.07
147	0.07
148	0.07
149	0.07
150	0.07
151	0.07
152	0.09
153	0.09
154	0.1
155	0.15
156	0.16
157	0.19
158	0.23
159	0.31
160	0.3
161	0.32
162	0.33
163	0.28
164	0.3
165	0.28
166	0.25
167	0.17
168	0.18
169	0.17
170	0.15
171	0.15
172	0.11
173	0.11
174	0.11
175	0.1
176	0.1
177	0.08
178	0.08
179	0.09
180	0.09
181	0.08
182	0.08
183	0.09
184	0.07
185	0.07
186	0.06
187	0.06
188	0.06
189	0.05
190	0.07
191	0.1
192	0.11
193	0.12
194	0.13
195	0.14
196	0.18
197	0.26
198	0.29
199	0.31
200	0.34
201	0.37
202	0.38
203	0.38
204	0.34
205	0.27
206	0.22
207	0.19
208	0.14
209	0.1
210	0.08
211	0.08
212	0.1
213	0.1
214	0.1
215	0.09
216	0.08
217	0.08
218	0.08
219	0.07
220	0.06
221	0.05
222	0.05
223	0.04
224	0.05
225	0.06
226	0.06
227	0.07
228	0.07
229	0.08
230	0.09
231	0.1
232	0.12
233	0.14
234	0.14
235	0.15
236	0.16
237	0.15
238	0.14
239	0.13
240	0.09
241	0.07
242	0.07
243	0.06
244	0.07
245	0.08
246	0.1
247	0.1
248	0.11
249	0.14
250	0.16
251	0.16
252	0.13
253	0.13
254	0.1
255	0.1
256	0.11
257	0.09
258	0.1
259	0.11
260	0.15
261	0.19
262	0.19
263	0.19
264	0.19
265	0.19
266	0.17
267	0.15
268	0.12
269	0.09
270	0.09
271	0.09
272	0.08
273	0.06
274	0.05
275	0.05
276	0.04
277	0.04
278	0.04
279	0.03
280	0.04
281	0.04
282	0.04
283	0.04
284	0.04
285	0.04
286	0.03
287	0.04
288	0.03
289	0.03
290	0.03
291	0.03
292	0.04
293	0.06
294	0.07
295	0.07
296	0.08
297	0.09
298	0.13
299	0.13
300	0.12
301	0.11
302	0.13
303	0.16
304	0.15
305	0.17
306	0.14
307	0.13
308	0.13
309	0.13
310	0.11
311	0.09
312	0.1
313	0.09
314	0.09
315	0.1
316	0.11
317	0.11
318	0.12
319	0.12
320	0.12
321	0.1
322	0.1
323	0.1
324	0.12
325	0.13
326	0.13
327	0.18
328	0.18
329	0.18
330	0.18
331	0.18
332	0.17
333	0.18
334	0.18
335	0.13
336	0.15
337	0.18
338	0.2
339	0.22
340	0.24
341	0.22
342	0.24
343	0.27
344	0.25
345	0.24
346	0.24
347	0.25
348	0.22
349	0.21
350	0.19
351	0.16
352	0.15
353	0.12
354	0.1
355	0.08
356	0.07
357	0.07
358	0.08
359	0.07
360	0.07
361	0.07
362	0.07
363	0.08
364	0.07
365	0.09
366	0.09
367	0.09
368	0.1
369	0.1
370	0.11
371	0.15
372	0.16
373	0.15
374	0.18
375	0.18
376	0.2
377	0.24
378	0.26
379	0.24
380	0.27
381	0.28
382	0.27
383	0.29
384	0.31
385	0.32
386	0.31
387	0.32
388	0.34
389	0.34
390	0.33
391	0.33
392	0.3
393	0.28
394	0.31
395	0.29
396	0.28
397	0.31
398	0.32
399	0.33
400	0.38
401	0.39
402	0.41
403	0.46
404	0.5
405	0.51
406	0.59
407	0.65
408	0.7
409	0.76
410	0.81
411	0.85
412	0.82
413	0.86
414	0.82
415	0.76
416	0.73
417	0.64
418	0.56
419	0.51
420	0.48
421	0.39
422	0.4
423	0.37
424	0.33
425	0.37
426	0.36
427	0.34
428	0.35
429	0.38
430	0.36
431	0.37
432	0.34
433	0.29
434	0.29
435	0.25
436	0.22
437	0.18
438	0.15
439	0.12
440	0.1
441	0.09
442	0.06
443	0.06
444	0.05
445	0.05
446	0.04
447	0.04
448	0.04
449	0.04
450	0.04
451	0.04
452	0.04
453	0.07
454	0.07
455	0.1
456	0.1
457	0.11
458	0.12
459	0.11
460	0.12
461	0.1
462	0.12
463	0.12
464	0.15
465	0.2
466	0.29
467	0.38
468	0.41
469	0.45
470	0.47
471	0.49
472	0.53
473	0.56
474	0.57
475	0.55
476	0.62
477	0.65
478	0.7
479	0.69
480	0.67
481	0.62
482	0.54
483	0.53
484	0.44
485	0.37
486	0.28
487	0.25
488	0.2
489	0.16
490	0.15
491	0.08
492	0.08
493	0.08
494	0.08
495	0.08
496	0.08
497	0.09
498	0.1
499	0.11
500	0.11
501	0.11
502	0.11
503	0.11
504	0.11
505	0.12
506	0.11
507	0.11
508	0.1
509	0.12
510	0.13
511	0.14
512	0.15
513	0.16
514	0.17
515	0.16
516	0.16
517	0.14
518	0.12
519	0.12
520	0.11
521	0.09
522	0.07
523	0.06
524	0.07
525	0.07
526	0.09
527	0.07
528	0.07
529	0.09
530	0.09
531	0.1
532	0.1
533	0.1
534	0.11
535	0.14
536	0.16
537	0.17
538	0.17
539	0.17
540	0.21
541	0.22
542	0.25
543	0.31
544	0.41
545	0.49
546	0.59
547	0.6
548	0.6
549	0.66
550	0.71
551	0.71
552	0.7
553	0.67
554	0.61
555	0.62
556	0.59
557	0.52
558	0.44
559	0.34
560	0.28
561	0.21
562	0.17
563	0.17
564	0.18
565	0.18
566	0.18
567	0.18
568	0.15
569	0.14
570	0.22
571	0.23
572	0.24
573	0.27
574	0.25
575	0.28
576	0.36
577	0.41
578	0.38
579	0.41
580	0.41
581	0.42
582	0.48
583	0.45
584	0.47
585	0.48
586	0.53

A0A1J9RFC4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer