Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9SHE2

Protein Details
Accession A0A1J9SHE2    Localization Confidence Low Confidence Score 6.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
387-408AEGLAKRRKLERQQSQQQADDFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 10.5, cyto_nucl 8.5, pero 8, nucl 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036915  Cyclin-like_sf  
IPR043198  Cyclin/Ssn8  
IPR031658  Cyclin_C_2  
IPR006671  Cyclin_N  
Gene Ontology GO:0016538  F:cyclin-dependent protein serine/threonine kinase regulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF16899  Cyclin_C_2  
PF00134  Cyclin_N  
CDD cd20524  CYCLIN_CCNH_rpt1  
Amino Acid Sequences MHLTEDEVYRTSTQYRLWSFTSERLRSLRDSTNVNAAERVKANIKRFRAQKSADDAAQQNGASTGADALDIDPLTPDEELKLVIKICKTCVEFADFAKKNTKFNFPTNVIATAVQYVKRFYLFNSIMVYDPKKIMPTCLFLATKTEIHWTPAGELAPLLGARMTAEDILAPEYLVAQALRFTFDIRHPYRGLNGGHMELIALAKGEAAMLPGSGRTPQAAQAEMLKLPERSAPSSTGGSSDERAMVNRIGIAYNVARTTLKSIAPISDAYFFYTPAQIWLAAMLLADEPLTLFYVDTKFPASSAGAPSSDDKQAAAAWELRTKLVATVRACAQLLEAQRRVLEGTDLDEECKRIARKRDLCSDPEKADLIGLHAAQKRGGASEGTLAEGLAKRRKLERQQSQQQADDFWGPELKKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.32
3 0.34
4 0.35
5 0.39
6 0.4
7 0.46
8 0.52
9 0.46
10 0.47
11 0.47
12 0.48
13 0.47
14 0.49
15 0.48
16 0.42
17 0.44
18 0.42
19 0.47
20 0.45
21 0.42
22 0.41
23 0.35
24 0.35
25 0.32
26 0.33
27 0.32
28 0.37
29 0.44
30 0.48
31 0.52
32 0.56
33 0.62
34 0.66
35 0.67
36 0.65
37 0.64
38 0.64
39 0.64
40 0.57
41 0.55
42 0.49
43 0.42
44 0.4
45 0.32
46 0.24
47 0.18
48 0.17
49 0.12
50 0.1
51 0.08
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.08
57 0.08
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.09
62 0.08
63 0.08
64 0.07
65 0.07
66 0.09
67 0.09
68 0.11
69 0.12
70 0.15
71 0.18
72 0.19
73 0.21
74 0.26
75 0.27
76 0.27
77 0.28
78 0.3
79 0.28
80 0.29
81 0.38
82 0.33
83 0.33
84 0.4
85 0.39
86 0.39
87 0.41
88 0.48
89 0.42
90 0.46
91 0.53
92 0.47
93 0.5
94 0.47
95 0.45
96 0.37
97 0.32
98 0.27
99 0.22
100 0.2
101 0.17
102 0.16
103 0.15
104 0.15
105 0.16
106 0.16
107 0.14
108 0.22
109 0.21
110 0.22
111 0.23
112 0.23
113 0.23
114 0.25
115 0.26
116 0.18
117 0.18
118 0.17
119 0.18
120 0.18
121 0.21
122 0.21
123 0.23
124 0.23
125 0.27
126 0.26
127 0.23
128 0.26
129 0.25
130 0.23
131 0.2
132 0.22
133 0.17
134 0.19
135 0.2
136 0.17
137 0.15
138 0.17
139 0.16
140 0.12
141 0.11
142 0.09
143 0.08
144 0.07
145 0.06
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.05
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.05
155 0.06
156 0.06
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.03
164 0.05
165 0.05
166 0.07
167 0.07
168 0.08
169 0.09
170 0.12
171 0.21
172 0.21
173 0.25
174 0.25
175 0.25
176 0.27
177 0.3
178 0.28
179 0.23
180 0.22
181 0.18
182 0.17
183 0.16
184 0.14
185 0.09
186 0.08
187 0.05
188 0.04
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.02
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.04
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.1
205 0.11
206 0.11
207 0.11
208 0.13
209 0.14
210 0.14
211 0.14
212 0.12
213 0.1
214 0.1
215 0.13
216 0.13
217 0.14
218 0.15
219 0.16
220 0.17
221 0.18
222 0.18
223 0.16
224 0.16
225 0.15
226 0.14
227 0.13
228 0.12
229 0.11
230 0.12
231 0.12
232 0.11
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.08
237 0.08
238 0.09
239 0.08
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.12
246 0.14
247 0.14
248 0.14
249 0.15
250 0.15
251 0.16
252 0.17
253 0.15
254 0.15
255 0.15
256 0.16
257 0.15
258 0.15
259 0.14
260 0.15
261 0.13
262 0.11
263 0.12
264 0.09
265 0.08
266 0.08
267 0.07
268 0.06
269 0.06
270 0.05
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.03
275 0.03
276 0.04
277 0.05
278 0.04
279 0.04
280 0.06
281 0.08
282 0.09
283 0.09
284 0.11
285 0.1
286 0.1
287 0.12
288 0.12
289 0.12
290 0.15
291 0.16
292 0.15
293 0.16
294 0.18
295 0.2
296 0.2
297 0.17
298 0.14
299 0.13
300 0.14
301 0.13
302 0.14
303 0.14
304 0.14
305 0.18
306 0.18
307 0.18
308 0.18
309 0.17
310 0.19
311 0.19
312 0.23
313 0.21
314 0.24
315 0.26
316 0.28
317 0.28
318 0.24
319 0.22
320 0.2
321 0.25
322 0.28
323 0.28
324 0.26
325 0.26
326 0.26
327 0.26
328 0.22
329 0.18
330 0.11
331 0.13
332 0.17
333 0.17
334 0.18
335 0.19
336 0.19
337 0.18
338 0.23
339 0.24
340 0.26
341 0.36
342 0.45
343 0.52
344 0.59
345 0.69
346 0.68
347 0.7
348 0.7
349 0.68
350 0.59
351 0.53
352 0.47
353 0.37
354 0.33
355 0.27
356 0.23
357 0.18
358 0.17
359 0.2
360 0.22
361 0.23
362 0.22
363 0.24
364 0.21
365 0.2
366 0.21
367 0.15
368 0.13
369 0.18
370 0.18
371 0.17
372 0.17
373 0.15
374 0.17
375 0.19
376 0.24
377 0.26
378 0.28
379 0.3
380 0.37
381 0.47
382 0.54
383 0.62
384 0.68
385 0.72
386 0.8
387 0.87
388 0.86
389 0.82
390 0.73
391 0.63
392 0.56
393 0.49
394 0.39
395 0.31
396 0.31