Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9R8N3

Protein Details
Accession A0A1J9R8N3    Localization Confidence High Confidence Score 19.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
176-221YLMNPDKDPRERRRRQQGDRRNGGANEYNRRRYDDREQRRRKDNTEBasic
251-271SIDDRRRSRRREARSKNLDDLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
185-195RERRRRQQGDR
255-265RRRSRRREARS
306-312RRARRRS
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MDATNVQPTGAYAADMDIDMDIDLTTADDIEAFDTEGITIDDINAPATAGGPPNAPAIEPQLEKVNVEGVDNLTTAQVKAFALDHFPTDQYVRLEWIDDSHANIVYETGNAALEALVGLTDPNKCDPATAADTLEHALQQRDAKPFFENPEVQLKIRLAVTTDVKAARAHEASRFYLMNPDKDPRERRRRQQGDRRNGGANEYNRRRYDDREQRRRKDNTEYDMDMYDEEGPSRARNDSRRGRRGSLSDESIDDRRRSRRREARSKNLDDLLPSKADGRLRDRSASPLRDGDGRYGFGDDDSAAHRRARRRSYSPPSNRGPPGGKELFPGRGGATKELFPTSTSRATLLSSTASSPNPSTGNAKELFPGKGGHTPGKRSRELFPHKTAHSNHRRQDAYDSRDLSDASFPNSRSLEERITGGHNGNGRLNGEDQGFSVRGSADASGFSIRGAADVRELFPMKTGAGSNAGKELFEEKIQGRGGPRRKAEDMYF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.09
3 0.09
4 0.06
5 0.06
6 0.06
7 0.06
8 0.05
9 0.05
10 0.05
11 0.05
12 0.05
13 0.05
14 0.05
15 0.05
16 0.05
17 0.06
18 0.07
19 0.07
20 0.07
21 0.07
22 0.07
23 0.07
24 0.08
25 0.07
26 0.06
27 0.07
28 0.09
29 0.09
30 0.09
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.09
35 0.09
36 0.09
37 0.1
38 0.1
39 0.11
40 0.13
41 0.13
42 0.13
43 0.12
44 0.16
45 0.2
46 0.2
47 0.2
48 0.25
49 0.25
50 0.25
51 0.25
52 0.24
53 0.19
54 0.19
55 0.19
56 0.14
57 0.15
58 0.15
59 0.15
60 0.11
61 0.11
62 0.11
63 0.1
64 0.1
65 0.08
66 0.09
67 0.1
68 0.1
69 0.13
70 0.14
71 0.16
72 0.15
73 0.16
74 0.16
75 0.16
76 0.19
77 0.17
78 0.17
79 0.18
80 0.17
81 0.18
82 0.16
83 0.17
84 0.18
85 0.16
86 0.17
87 0.16
88 0.17
89 0.16
90 0.16
91 0.15
92 0.11
93 0.1
94 0.09
95 0.07
96 0.06
97 0.05
98 0.06
99 0.05
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.03
104 0.03
105 0.03
106 0.04
107 0.06
108 0.07
109 0.09
110 0.11
111 0.11
112 0.11
113 0.13
114 0.17
115 0.2
116 0.2
117 0.19
118 0.18
119 0.19
120 0.19
121 0.18
122 0.13
123 0.1
124 0.1
125 0.11
126 0.15
127 0.19
128 0.24
129 0.25
130 0.25
131 0.27
132 0.3
133 0.31
134 0.33
135 0.3
136 0.27
137 0.34
138 0.35
139 0.32
140 0.32
141 0.28
142 0.24
143 0.24
144 0.21
145 0.14
146 0.16
147 0.18
148 0.15
149 0.18
150 0.16
151 0.17
152 0.17
153 0.17
154 0.17
155 0.16
156 0.16
157 0.18
158 0.21
159 0.21
160 0.23
161 0.22
162 0.18
163 0.25
164 0.26
165 0.26
166 0.25
167 0.28
168 0.29
169 0.36
170 0.44
171 0.46
172 0.55
173 0.6
174 0.67
175 0.75
176 0.81
177 0.85
178 0.87
179 0.88
180 0.87
181 0.86
182 0.79
183 0.72
184 0.62
185 0.54
186 0.5
187 0.44
188 0.43
189 0.42
190 0.45
191 0.42
192 0.47
193 0.45
194 0.45
195 0.51
196 0.52
197 0.57
198 0.62
199 0.71
200 0.74
201 0.82
202 0.81
203 0.74
204 0.74
205 0.69
206 0.63
207 0.59
208 0.53
209 0.45
210 0.4
211 0.36
212 0.26
213 0.2
214 0.15
215 0.09
216 0.07
217 0.06
218 0.06
219 0.07
220 0.08
221 0.09
222 0.12
223 0.17
224 0.26
225 0.35
226 0.44
227 0.52
228 0.55
229 0.56
230 0.56
231 0.54
232 0.51
233 0.45
234 0.38
235 0.3
236 0.27
237 0.26
238 0.26
239 0.26
240 0.21
241 0.21
242 0.28
243 0.35
244 0.39
245 0.47
246 0.53
247 0.6
248 0.7
249 0.76
250 0.78
251 0.81
252 0.81
253 0.74
254 0.67
255 0.57
256 0.47
257 0.4
258 0.3
259 0.21
260 0.16
261 0.14
262 0.14
263 0.16
264 0.17
265 0.21
266 0.26
267 0.27
268 0.3
269 0.29
270 0.34
271 0.39
272 0.38
273 0.34
274 0.29
275 0.28
276 0.3
277 0.3
278 0.26
279 0.21
280 0.2
281 0.18
282 0.17
283 0.16
284 0.12
285 0.12
286 0.08
287 0.07
288 0.08
289 0.1
290 0.11
291 0.13
292 0.17
293 0.23
294 0.32
295 0.38
296 0.44
297 0.49
298 0.58
299 0.66
300 0.73
301 0.76
302 0.76
303 0.73
304 0.72
305 0.67
306 0.61
307 0.54
308 0.46
309 0.45
310 0.4
311 0.35
312 0.31
313 0.32
314 0.3
315 0.26
316 0.25
317 0.17
318 0.19
319 0.2
320 0.2
321 0.19
322 0.18
323 0.19
324 0.19
325 0.19
326 0.15
327 0.17
328 0.19
329 0.2
330 0.19
331 0.19
332 0.18
333 0.19
334 0.18
335 0.16
336 0.13
337 0.11
338 0.12
339 0.14
340 0.14
341 0.15
342 0.15
343 0.16
344 0.16
345 0.17
346 0.19
347 0.17
348 0.22
349 0.22
350 0.22
351 0.22
352 0.24
353 0.23
354 0.21
355 0.21
356 0.18
357 0.22
358 0.25
359 0.3
360 0.31
361 0.38
362 0.45
363 0.5
364 0.52
365 0.49
366 0.52
367 0.55
368 0.61
369 0.61
370 0.6
371 0.6
372 0.58
373 0.63
374 0.62
375 0.62
376 0.63
377 0.65
378 0.64
379 0.66
380 0.65
381 0.59
382 0.64
383 0.63
384 0.59
385 0.57
386 0.53
387 0.45
388 0.45
389 0.44
390 0.35
391 0.32
392 0.25
393 0.22
394 0.24
395 0.24
396 0.27
397 0.28
398 0.28
399 0.25
400 0.28
401 0.28
402 0.25
403 0.25
404 0.22
405 0.25
406 0.26
407 0.24
408 0.23
409 0.23
410 0.24
411 0.25
412 0.25
413 0.23
414 0.23
415 0.23
416 0.22
417 0.2
418 0.18
419 0.17
420 0.18
421 0.18
422 0.16
423 0.15
424 0.13
425 0.12
426 0.12
427 0.13
428 0.09
429 0.09
430 0.11
431 0.11
432 0.11
433 0.1
434 0.1
435 0.09
436 0.1
437 0.11
438 0.1
439 0.13
440 0.15
441 0.16
442 0.2
443 0.22
444 0.21
445 0.21
446 0.22
447 0.18
448 0.19
449 0.19
450 0.15
451 0.21
452 0.22
453 0.21
454 0.25
455 0.25
456 0.22
457 0.23
458 0.23
459 0.18
460 0.18
461 0.22
462 0.18
463 0.24
464 0.25
465 0.27
466 0.31
467 0.38
468 0.46
469 0.51
470 0.56
471 0.57
472 0.6