Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8BDR1

Protein Details
Accession G8BDR1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
60-80FENNLEKLRKKRYTRLSKVGLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 6, vacu 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR013949  Utp6  
Gene Ontology GO:0034388  C:Pwp2p-containing subcomplex of 90S preribosome  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0042802  F:identical protein binding  
GO:0034511  F:U3 snoRNA binding  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF08640  U3_assoc_6  
Amino Acid Sequences MADKVRYYLEQSVPELEDLKVKGLFDKNEITMIMRRRTDFEHRITGRGSRPRDYLKYSEFENNLEKLRKKRYTRLSKVGLVDTKPNISDWAGVRRIMFILDRGTKKFPGDQQLWAEYLTYAKDNGAIKVVYKIYSRLLQLQPRNVDAWLSAAKYEFETNANAKGTRLLFQRGLRLNPESTALWLSYAQFELTYISKLLARRKLLGLLTESEQKKETDDMMILPQAETTLNLPDADMSMLGSPETNPALKGDVFLAIFDECVKAKGFDVVEKFLHLIDQFEDLDRDYLYSHVLNYIQREYPDDIGTAFIDITLPIRTSNDGLQLSVNKFLAYKAKNPNKELTNMFVNKLMQIDGNEKVKPLIQAIIKKINPA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.32
3 0.25
4 0.25
5 0.21
6 0.22
7 0.2
8 0.19
9 0.24
10 0.28
11 0.3
12 0.29
13 0.33
14 0.31
15 0.31
16 0.31
17 0.29
18 0.29
19 0.34
20 0.37
21 0.36
22 0.36
23 0.37
24 0.43
25 0.49
26 0.51
27 0.5
28 0.53
29 0.51
30 0.53
31 0.52
32 0.52
33 0.51
34 0.52
35 0.51
36 0.45
37 0.49
38 0.54
39 0.57
40 0.58
41 0.56
42 0.52
43 0.5
44 0.49
45 0.5
46 0.44
47 0.41
48 0.4
49 0.36
50 0.36
51 0.41
52 0.42
53 0.42
54 0.51
55 0.57
56 0.6
57 0.67
58 0.72
59 0.77
60 0.81
61 0.83
62 0.8
63 0.76
64 0.73
65 0.7
66 0.64
67 0.54
68 0.5
69 0.42
70 0.37
71 0.31
72 0.28
73 0.23
74 0.19
75 0.21
76 0.19
77 0.24
78 0.24
79 0.25
80 0.24
81 0.24
82 0.23
83 0.2
84 0.18
85 0.12
86 0.16
87 0.22
88 0.25
89 0.27
90 0.3
91 0.3
92 0.32
93 0.35
94 0.34
95 0.35
96 0.35
97 0.37
98 0.37
99 0.38
100 0.37
101 0.32
102 0.27
103 0.19
104 0.17
105 0.13
106 0.1
107 0.08
108 0.07
109 0.12
110 0.12
111 0.13
112 0.14
113 0.13
114 0.13
115 0.17
116 0.18
117 0.15
118 0.15
119 0.16
120 0.16
121 0.19
122 0.2
123 0.23
124 0.27
125 0.32
126 0.36
127 0.4
128 0.39
129 0.38
130 0.37
131 0.3
132 0.26
133 0.18
134 0.17
135 0.13
136 0.11
137 0.1
138 0.09
139 0.1
140 0.1
141 0.11
142 0.09
143 0.09
144 0.11
145 0.11
146 0.14
147 0.15
148 0.14
149 0.14
150 0.16
151 0.16
152 0.17
153 0.18
154 0.18
155 0.21
156 0.22
157 0.29
158 0.28
159 0.29
160 0.27
161 0.28
162 0.25
163 0.22
164 0.22
165 0.15
166 0.14
167 0.13
168 0.11
169 0.09
170 0.09
171 0.09
172 0.07
173 0.07
174 0.06
175 0.05
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.07
180 0.06
181 0.06
182 0.09
183 0.12
184 0.17
185 0.22
186 0.23
187 0.24
188 0.25
189 0.28
190 0.26
191 0.25
192 0.21
193 0.17
194 0.18
195 0.23
196 0.23
197 0.2
198 0.21
199 0.19
200 0.19
201 0.18
202 0.17
203 0.11
204 0.11
205 0.11
206 0.11
207 0.12
208 0.11
209 0.1
210 0.09
211 0.08
212 0.07
213 0.07
214 0.06
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.06
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.06
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.08
234 0.1
235 0.1
236 0.1
237 0.09
238 0.1
239 0.1
240 0.1
241 0.1
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.06
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.08
251 0.13
252 0.13
253 0.16
254 0.19
255 0.21
256 0.21
257 0.21
258 0.21
259 0.16
260 0.17
261 0.13
262 0.11
263 0.09
264 0.12
265 0.11
266 0.12
267 0.12
268 0.11
269 0.12
270 0.11
271 0.1
272 0.08
273 0.08
274 0.1
275 0.09
276 0.09
277 0.1
278 0.13
279 0.14
280 0.17
281 0.2
282 0.2
283 0.2
284 0.24
285 0.25
286 0.25
287 0.24
288 0.21
289 0.18
290 0.17
291 0.17
292 0.13
293 0.1
294 0.07
295 0.07
296 0.06
297 0.07
298 0.07
299 0.08
300 0.08
301 0.09
302 0.11
303 0.13
304 0.15
305 0.2
306 0.19
307 0.2
308 0.22
309 0.26
310 0.26
311 0.28
312 0.27
313 0.2
314 0.2
315 0.21
316 0.27
317 0.25
318 0.32
319 0.39
320 0.49
321 0.56
322 0.6
323 0.66
324 0.62
325 0.64
326 0.59
327 0.54
328 0.53
329 0.48
330 0.45
331 0.42
332 0.38
333 0.33
334 0.31
335 0.27
336 0.19
337 0.19
338 0.21
339 0.23
340 0.27
341 0.26
342 0.25
343 0.26
344 0.27
345 0.26
346 0.24
347 0.25
348 0.27
349 0.34
350 0.4
351 0.49