Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G3B9T2

Protein Details
Accession G3B9T2    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
189-214YNDRGRYSRSPSRSPRRDRSRSPERYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
127-162SRPSREEGREGREGREGREGREGREGREGREGRERE
204-204R
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034403  Srp1p_RRM  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG cten:CANTEDRAFT_135891  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12467  RRM_Srp1p_like  
Amino Acid Sequences MPKNTLYVTGFIRESKATDLAPDFEKYGELVRLDIPPPRTDDGEKYAFVEYKSLEDSEKALELNGQHLPYSLKDGLVVQMAKSDPYSVRRASFRGRGGYRGYRGGGYGRGGYGRGYGRGGYEDGYRSRPSREEGREGREGREGREGREGREGREGREGREREPRYSEPHDGESAEPRESHGEQQPQGEYNDRGRYSRSPSRSPRRDRSRSPERY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.22
3 0.22
4 0.18
5 0.2
6 0.22
7 0.22
8 0.24
9 0.23
10 0.21
11 0.18
12 0.19
13 0.16
14 0.17
15 0.16
16 0.14
17 0.14
18 0.15
19 0.17
20 0.18
21 0.22
22 0.21
23 0.21
24 0.25
25 0.26
26 0.27
27 0.27
28 0.3
29 0.32
30 0.33
31 0.31
32 0.29
33 0.29
34 0.27
35 0.25
36 0.22
37 0.17
38 0.15
39 0.17
40 0.15
41 0.14
42 0.13
43 0.14
44 0.13
45 0.13
46 0.11
47 0.09
48 0.1
49 0.1
50 0.12
51 0.13
52 0.12
53 0.11
54 0.12
55 0.13
56 0.12
57 0.18
58 0.15
59 0.13
60 0.13
61 0.13
62 0.14
63 0.15
64 0.15
65 0.09
66 0.11
67 0.11
68 0.11
69 0.11
70 0.12
71 0.1
72 0.14
73 0.18
74 0.17
75 0.2
76 0.21
77 0.24
78 0.27
79 0.31
80 0.31
81 0.35
82 0.34
83 0.35
84 0.37
85 0.39
86 0.36
87 0.32
88 0.29
89 0.22
90 0.22
91 0.2
92 0.16
93 0.13
94 0.11
95 0.09
96 0.09
97 0.09
98 0.08
99 0.1
100 0.09
101 0.09
102 0.09
103 0.09
104 0.09
105 0.1
106 0.11
107 0.09
108 0.09
109 0.11
110 0.12
111 0.15
112 0.16
113 0.16
114 0.18
115 0.19
116 0.21
117 0.28
118 0.3
119 0.36
120 0.39
121 0.44
122 0.5
123 0.49
124 0.47
125 0.46
126 0.42
127 0.35
128 0.41
129 0.36
130 0.3
131 0.38
132 0.37
133 0.32
134 0.41
135 0.4
136 0.32
137 0.41
138 0.4
139 0.32
140 0.41
141 0.4
142 0.33
143 0.42
144 0.42
145 0.36
146 0.46
147 0.47
148 0.41
149 0.47
150 0.47
151 0.45
152 0.5
153 0.52
154 0.45
155 0.46
156 0.43
157 0.37
158 0.36
159 0.35
160 0.32
161 0.27
162 0.23
163 0.21
164 0.25
165 0.25
166 0.28
167 0.28
168 0.33
169 0.33
170 0.37
171 0.38
172 0.35
173 0.36
174 0.35
175 0.32
176 0.31
177 0.38
178 0.35
179 0.34
180 0.37
181 0.4
182 0.44
183 0.51
184 0.51
185 0.53
186 0.62
187 0.72
188 0.78
189 0.83
190 0.85
191 0.87
192 0.89
193 0.89
194 0.89