FuNGI

G8BI03

Protein Details

Accession

G8BI03

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
69-89	VKDFEKPVRLHRKDPRNMQFH	Basic
150-176	APDGGARKNKKKLFKRKTKQINLMDEA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
155-168	ARKNKKKLFKRKTK
383-395	RKVDKEGKKLRKV

Subcellular Location(s)

nucl 27

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSQPDSQVKKEVTVKNENTNNTLTKNGSPSPSKSEEWQTIPLKSCGPEEIEDVRIHLMKFATKQDVDIVKDFEKPVRLHRKDPRNMQFHLTRQELDQRRKEKEEADKERLQREAEGDLEASSSAQGAAPNTTTEDTKFNNKSQADLSQVAPDGGARKNKKKLFKRKTKQINLMDEAKRKLRYEEHYPWVIEDYTGKNVYVGNYEAGSTESQHVLFVFDKDGFKMIPAEKVYRFTPRNRYATLTLEEAEAKMERNSSVPRWLMKHMENDSIAEGSPDQRFRNNSPSANGRVISNGGAQNRRMRTVMGGDSRSVEERDSDHDDLDFEEEFADDEEAPIMDGDEEENKMSEKKIKKDMLKASAFNAENEDDEDYDLDDLFETEKSRKVDKEGKKLRKVLNKREGGIYDSDGDDEQGMLPYLSKSDLESEEESDDESRVKVKEEPTEDTLKKDAQRSNVRSFVVSLISDGYVVLKAPKEFLSTLPRGEWNPNVPKRSTPEPSSPRKKIRLEENSSPVTVKKEPSPAASSVPGSPVDTSALSDLRDAGPNNLLVTVDDVLKIVKDHPLTTRELLGGLKSRVSAHPDNKQRIIAIVKQNLKLVDGKLVLKS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.59
2	0.62
3	0.67
4	0.63
5	0.58
6	0.56
7	0.52
8	0.44
9	0.43
10	0.36
11	0.34
12	0.37
13	0.37
14	0.38
15	0.4
16	0.42
17	0.46
18	0.48
19	0.46
20	0.46
21	0.5
22	0.5
23	0.49
24	0.54
25	0.5
26	0.5
27	0.52
28	0.49
29	0.44
30	0.39
31	0.37
32	0.31
33	0.3
34	0.26
35	0.27
36	0.28
37	0.28
38	0.27
39	0.26
40	0.26
41	0.25
42	0.23
43	0.21
44	0.19
45	0.2
46	0.23
47	0.28
48	0.32
49	0.29
50	0.3
51	0.35
52	0.39
53	0.38
54	0.38
55	0.37
56	0.31
57	0.35
58	0.35
59	0.31
60	0.33
61	0.3
62	0.38
63	0.45
64	0.48
65	0.54
66	0.63
67	0.7
68	0.73
69	0.82
70	0.81
71	0.76
72	0.74
73	0.72
74	0.69
75	0.65
76	0.63
77	0.55
78	0.47
79	0.43
80	0.5
81	0.52
82	0.54
83	0.57
84	0.56
85	0.6
86	0.64
87	0.64
88	0.62
89	0.64
90	0.65
91	0.66
92	0.66
93	0.67
94	0.67
95	0.67
96	0.63
97	0.53
98	0.44
99	0.37
100	0.32
101	0.26
102	0.22
103	0.19
104	0.16
105	0.15
106	0.12
107	0.1
108	0.07
109	0.06
110	0.05
111	0.06
112	0.07
113	0.07
114	0.09
115	0.09
116	0.1
117	0.12
118	0.13
119	0.13
120	0.13
121	0.16
122	0.18
123	0.26
124	0.3
125	0.31
126	0.38
127	0.37
128	0.38
129	0.36
130	0.37
131	0.33
132	0.32
133	0.3
134	0.25
135	0.25
136	0.23
137	0.2
138	0.17
139	0.15
140	0.16
141	0.24
142	0.27
143	0.35
144	0.44
145	0.51
146	0.6
147	0.68
148	0.75
149	0.78
150	0.84
151	0.86
152	0.88
153	0.93
154	0.93
155	0.92
156	0.89
157	0.86
158	0.8
159	0.78
160	0.73
161	0.67
162	0.6
163	0.55
164	0.5
165	0.42
166	0.41
167	0.39
168	0.39
169	0.44
170	0.48
171	0.49
172	0.49
173	0.48
174	0.45
175	0.41
176	0.35
177	0.25
178	0.2
179	0.17
180	0.17
181	0.18
182	0.17
183	0.15
184	0.16
185	0.16
186	0.15
187	0.14
188	0.11
189	0.1
190	0.1
191	0.1
192	0.1
193	0.1
194	0.09
195	0.1
196	0.1
197	0.09
198	0.1
199	0.09
200	0.1
201	0.1
202	0.1
203	0.1
204	0.11
205	0.11
206	0.11
207	0.12
208	0.1
209	0.1
210	0.13
211	0.13
212	0.16
213	0.17
214	0.21
215	0.21
216	0.24
217	0.25
218	0.29
219	0.32
220	0.33
221	0.41
222	0.46
223	0.49
224	0.48
225	0.51
226	0.45
227	0.46
228	0.42
229	0.33
230	0.26
231	0.22
232	0.2
233	0.16
234	0.14
235	0.1
236	0.09
237	0.08
238	0.08
239	0.08
240	0.1
241	0.12
242	0.13
243	0.18
244	0.19
245	0.21
246	0.23
247	0.25
248	0.28
249	0.28
250	0.33
251	0.3
252	0.32
253	0.3
254	0.27
255	0.25
256	0.21
257	0.18
258	0.12
259	0.09
260	0.08
261	0.1
262	0.12
263	0.12
264	0.15
265	0.18
266	0.21
267	0.29
268	0.31
269	0.3
270	0.3
271	0.34
272	0.35
273	0.34
274	0.31
275	0.23
276	0.19
277	0.19
278	0.16
279	0.15
280	0.13
281	0.14
282	0.16
283	0.17
284	0.22
285	0.22
286	0.23
287	0.21
288	0.19
289	0.17
290	0.19
291	0.22
292	0.2
293	0.2
294	0.19
295	0.19
296	0.2
297	0.19
298	0.16
299	0.12
300	0.09
301	0.09
302	0.13
303	0.18
304	0.17
305	0.17
306	0.16
307	0.16
308	0.16
309	0.16
310	0.12
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.06
315	0.06
316	0.06
317	0.04
318	0.04
319	0.04
320	0.04
321	0.04
322	0.04
323	0.04
324	0.03
325	0.03
326	0.04
327	0.05
328	0.05
329	0.05
330	0.06
331	0.06
332	0.07
333	0.08
334	0.15
335	0.19
336	0.24
337	0.33
338	0.4
339	0.44
340	0.52
341	0.58
342	0.6
343	0.58
344	0.53
345	0.46
346	0.47
347	0.43
348	0.34
349	0.29
350	0.21
351	0.18
352	0.18
353	0.16
354	0.09
355	0.09
356	0.09
357	0.07
358	0.07
359	0.06
360	0.05
361	0.04
362	0.04
363	0.05
364	0.06
365	0.07
366	0.08
367	0.13
368	0.15
369	0.18
370	0.19
371	0.25
372	0.34
373	0.41
374	0.51
375	0.57
376	0.65
377	0.7
378	0.76
379	0.77
380	0.78
381	0.79
382	0.79
383	0.78
384	0.73
385	0.67
386	0.64
387	0.57
388	0.49
389	0.42
390	0.32
391	0.23
392	0.18
393	0.17
394	0.13
395	0.12
396	0.1
397	0.08
398	0.07
399	0.06
400	0.06
401	0.05
402	0.05
403	0.05
404	0.06
405	0.07
406	0.06
407	0.07
408	0.1
409	0.11
410	0.15
411	0.16
412	0.17
413	0.17
414	0.17
415	0.17
416	0.14
417	0.13
418	0.1
419	0.09
420	0.1
421	0.1
422	0.12
423	0.16
424	0.19
425	0.25
426	0.29
427	0.33
428	0.35
429	0.43
430	0.41
431	0.4
432	0.39
433	0.37
434	0.36
435	0.38
436	0.38
437	0.39
438	0.48
439	0.52
440	0.56
441	0.57
442	0.54
443	0.48
444	0.46
445	0.38
446	0.3
447	0.23
448	0.17
449	0.13
450	0.12
451	0.11
452	0.1
453	0.09
454	0.07
455	0.07
456	0.08
457	0.09
458	0.1
459	0.12
460	0.13
461	0.15
462	0.16
463	0.2
464	0.26
465	0.26
466	0.28
467	0.28
468	0.3
469	0.29
470	0.32
471	0.32
472	0.32
473	0.4
474	0.45
475	0.47
476	0.46
477	0.49
478	0.51
479	0.55
480	0.53
481	0.48
482	0.53
483	0.57
484	0.67
485	0.72
486	0.75
487	0.76
488	0.78
489	0.79
490	0.76
491	0.78
492	0.78
493	0.76
494	0.76
495	0.73
496	0.68
497	0.62
498	0.56
499	0.46
500	0.41
501	0.35
502	0.3
503	0.28
504	0.33
505	0.34
506	0.39
507	0.42
508	0.38
509	0.39
510	0.39
511	0.35
512	0.28
513	0.28
514	0.24
515	0.21
516	0.19
517	0.17
518	0.16
519	0.14
520	0.14
521	0.14
522	0.14
523	0.14
524	0.13
525	0.14
526	0.14
527	0.18
528	0.18
529	0.18
530	0.19
531	0.2
532	0.2
533	0.19
534	0.17
535	0.13
536	0.15
537	0.13
538	0.11
539	0.11
540	0.1
541	0.1
542	0.1
543	0.11
544	0.1
545	0.15
546	0.16
547	0.18
548	0.24
549	0.27
550	0.31
551	0.33
552	0.34
553	0.29
554	0.28
555	0.27
556	0.25
557	0.28
558	0.24
559	0.23
560	0.22
561	0.24
562	0.26
563	0.33
564	0.38
565	0.4
566	0.48
567	0.57
568	0.63
569	0.64
570	0.63
571	0.56
572	0.52
573	0.5
574	0.49
575	0.49
576	0.5
577	0.53
578	0.53
579	0.56
580	0.51
581	0.47
582	0.43
583	0.35
584	0.33
585	0.3

G8BI03

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer