Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8BG42

Protein Details
Accession G8BG42    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
72-93AANGDKKKRKVERDPNAPKKPLBasic
203-232APTLSQEELKKKKRKQEKKEKKKKLAASSPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
77-90KKKRKVERDPNAPK
212-229KKKKRKQEKKEKKKKLAA
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 12, cyto 7, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0033553  C:rDNA heterochromatin  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0008301  F:DNA binding, bending  
GO:0003690  F:double-stranded DNA binding  
GO:0000400  F:four-way junction DNA binding  
GO:0044804  P:autophagy of nucleus  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
GO:0006265  P:DNA topological change  
GO:2001034  P:positive regulation of double-strand break repair via nonhomologous end joining  
GO:0070550  P:rDNA chromatin condensation  
GO:0060962  P:regulation of ribosomal protein gene transcription by RNA polymerase II  
GO:0006356  P:regulation of transcription by RNA polymerase I  
GO:0001174  P:transcriptional start site selection at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MSELKASKDALIASLFELSKAAQEAANSAVDFYKVATGGNEDITSEQLQGIQEAMKLAVDTTHGVKHNLDGAANGDKKKRKVERDPNAPKKPLTMFFAFSFHLRKMIAEERKKKGLPNLGAIDLNQLVKDRWDNISDEEKAKWKHKYEEEMKLYNVEKAKYEQSLKDGTNYKRPEHPYASGYEETETPVIEEVVEEEEADVPAPTLSQEELKKKKRKQEKKEKKKKLAASSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.16
3 0.14
4 0.14
5 0.12
6 0.12
7 0.13
8 0.13
9 0.1
10 0.1
11 0.12
12 0.13
13 0.15
14 0.13
15 0.12
16 0.12
17 0.11
18 0.11
19 0.1
20 0.1
21 0.08
22 0.09
23 0.09
24 0.11
25 0.12
26 0.13
27 0.12
28 0.11
29 0.11
30 0.13
31 0.13
32 0.11
33 0.1
34 0.1
35 0.1
36 0.1
37 0.1
38 0.08
39 0.08
40 0.08
41 0.08
42 0.07
43 0.06
44 0.06
45 0.06
46 0.06
47 0.07
48 0.09
49 0.13
50 0.14
51 0.15
52 0.16
53 0.16
54 0.2
55 0.19
56 0.17
57 0.13
58 0.14
59 0.2
60 0.23
61 0.23
62 0.25
63 0.3
64 0.33
65 0.42
66 0.47
67 0.49
68 0.58
69 0.67
70 0.71
71 0.78
72 0.86
73 0.88
74 0.87
75 0.8
76 0.69
77 0.62
78 0.55
79 0.47
80 0.4
81 0.31
82 0.27
83 0.25
84 0.27
85 0.24
86 0.22
87 0.21
88 0.16
89 0.16
90 0.13
91 0.12
92 0.14
93 0.21
94 0.28
95 0.34
96 0.42
97 0.45
98 0.5
99 0.51
100 0.48
101 0.46
102 0.45
103 0.39
104 0.37
105 0.35
106 0.31
107 0.3
108 0.29
109 0.25
110 0.17
111 0.15
112 0.09
113 0.08
114 0.07
115 0.07
116 0.08
117 0.09
118 0.1
119 0.11
120 0.12
121 0.15
122 0.2
123 0.21
124 0.22
125 0.21
126 0.26
127 0.28
128 0.31
129 0.34
130 0.33
131 0.39
132 0.42
133 0.51
134 0.52
135 0.58
136 0.59
137 0.56
138 0.52
139 0.48
140 0.44
141 0.38
142 0.34
143 0.24
144 0.2
145 0.21
146 0.23
147 0.24
148 0.26
149 0.24
150 0.25
151 0.29
152 0.28
153 0.31
154 0.36
155 0.35
156 0.41
157 0.43
158 0.42
159 0.45
160 0.5
161 0.51
162 0.48
163 0.49
164 0.42
165 0.42
166 0.45
167 0.38
168 0.34
169 0.28
170 0.23
171 0.21
172 0.19
173 0.16
174 0.1
175 0.1
176 0.09
177 0.07
178 0.07
179 0.06
180 0.08
181 0.08
182 0.07
183 0.07
184 0.08
185 0.08
186 0.09
187 0.08
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.07
194 0.13
195 0.19
196 0.29
197 0.39
198 0.49
199 0.59
200 0.65
201 0.74
202 0.8
203 0.85
204 0.87
205 0.88
206 0.9
207 0.92
208 0.96
209 0.97
210 0.97
211 0.96
212 0.94