Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8B8A1

Protein Details
Accession G8B8A1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MGSTKSRGRRAEKKAQKLVDTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
688-699EKKQKLRGRRRE
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR040000  NOP9  
IPR033133  PUM-HD  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0017148  P:negative regulation of translation  
GO:0065008  P:regulation of biological quality  
GO:0000056  P:ribosomal small subunit export from nucleus  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50302  PUM  
PS50303  PUM_HD  
Amino Acid Sequences MGSTKSRGRRAEKKAQKLVDTDFSEHKDVAQSQPHEDIPNTFFGLVDASEIDYFKQAESTLNINAFESDEDREGFINSVLEEAQGKELKLVTNQICSKLMERLVLFANTQQLKSIFENFSNHFVSLAFHKYASHVLETLLVRAAALIEKEILQTDEIKYEEEDGVVIADRNDSKTVEELFIAMVNEFKSYLLTMVDHQYASHVLRLLILILAGKELPSTTVSNSVLRSKKSKIARKMIEIKDNEDFNRAFQTPSSFKDELRDYFQDLTKDLDTKKARELSIHKIASPVMQLVIQLEGLVDRERTMWHLIFAKQSDEKDSDEEAFVEYLLSDPVGSHFFEAIIKSDGSRPQYIERLYRLYMKERVLRLARRSTTGVYIIQALLFKLKPVEIEFILDQIIPELSNLISIADNQNLDLAQKVIDASISRGNYLRDEIISQLFIKFAPNYDYSTPQTDTSTEFIENVLQLTGSTLGNTRGDWPTAEERKRALFLEKLMELDNRFVICTWLNFIALPVEKFVQMCFHGVFSHVVENSLVVDKEESKPVQILRKRYLNIFQNKIVELSCNSYGSHIVDKLWDFTVLLPMYKDRIASELMNDSHKVKESQYGKLVWKNWSMELFVRKKYDWKQLVKEQEHEFLGGEENQSTRAKKPIELKLERLAEEKRIQAEKAEKAQSGYNKRKLDELTGATEKKQKLRGRRRE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.83
3 0.79
4 0.73
5 0.69
6 0.67
7 0.61
8 0.54
9 0.5
10 0.48
11 0.46
12 0.41
13 0.36
14 0.33
15 0.31
16 0.33
17 0.36
18 0.35
19 0.35
20 0.4
21 0.41
22 0.38
23 0.36
24 0.35
25 0.28
26 0.29
27 0.27
28 0.23
29 0.2
30 0.18
31 0.18
32 0.13
33 0.12
34 0.09
35 0.09
36 0.1
37 0.11
38 0.11
39 0.12
40 0.12
41 0.12
42 0.12
43 0.11
44 0.13
45 0.16
46 0.18
47 0.2
48 0.21
49 0.22
50 0.21
51 0.21
52 0.19
53 0.17
54 0.16
55 0.14
56 0.14
57 0.15
58 0.15
59 0.15
60 0.15
61 0.15
62 0.14
63 0.12
64 0.1
65 0.1
66 0.09
67 0.1
68 0.1
69 0.1
70 0.15
71 0.16
72 0.16
73 0.17
74 0.18
75 0.19
76 0.2
77 0.27
78 0.23
79 0.3
80 0.32
81 0.34
82 0.35
83 0.35
84 0.35
85 0.32
86 0.32
87 0.28
88 0.25
89 0.25
90 0.25
91 0.25
92 0.23
93 0.2
94 0.26
95 0.23
96 0.23
97 0.23
98 0.21
99 0.24
100 0.26
101 0.31
102 0.25
103 0.26
104 0.31
105 0.3
106 0.35
107 0.33
108 0.3
109 0.24
110 0.22
111 0.2
112 0.19
113 0.22
114 0.17
115 0.16
116 0.16
117 0.17
118 0.21
119 0.22
120 0.2
121 0.15
122 0.15
123 0.2
124 0.2
125 0.2
126 0.16
127 0.14
128 0.12
129 0.12
130 0.12
131 0.08
132 0.08
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.08
137 0.09
138 0.09
139 0.08
140 0.1
141 0.11
142 0.13
143 0.13
144 0.14
145 0.13
146 0.15
147 0.15
148 0.12
149 0.11
150 0.08
151 0.09
152 0.08
153 0.08
154 0.06
155 0.08
156 0.09
157 0.11
158 0.12
159 0.12
160 0.12
161 0.15
162 0.17
163 0.15
164 0.14
165 0.13
166 0.12
167 0.13
168 0.12
169 0.09
170 0.09
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.09
181 0.12
182 0.14
183 0.13
184 0.12
185 0.13
186 0.14
187 0.14
188 0.14
189 0.12
190 0.11
191 0.11
192 0.11
193 0.11
194 0.08
195 0.08
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.04
202 0.04
203 0.05
204 0.07
205 0.08
206 0.09
207 0.14
208 0.15
209 0.17
210 0.19
211 0.25
212 0.27
213 0.29
214 0.32
215 0.31
216 0.37
217 0.44
218 0.52
219 0.54
220 0.6
221 0.63
222 0.67
223 0.74
224 0.72
225 0.7
226 0.63
227 0.57
228 0.51
229 0.48
230 0.4
231 0.33
232 0.28
233 0.21
234 0.24
235 0.21
236 0.17
237 0.16
238 0.21
239 0.2
240 0.23
241 0.3
242 0.26
243 0.26
244 0.3
245 0.33
246 0.29
247 0.33
248 0.31
249 0.26
250 0.28
251 0.3
252 0.26
253 0.23
254 0.24
255 0.19
256 0.2
257 0.18
258 0.24
259 0.24
260 0.25
261 0.3
262 0.32
263 0.31
264 0.33
265 0.38
266 0.37
267 0.44
268 0.43
269 0.37
270 0.33
271 0.33
272 0.29
273 0.25
274 0.17
275 0.08
276 0.08
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.06
281 0.05
282 0.04
283 0.04
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.06
290 0.08
291 0.11
292 0.1
293 0.12
294 0.15
295 0.16
296 0.18
297 0.19
298 0.19
299 0.19
300 0.19
301 0.2
302 0.19
303 0.19
304 0.18
305 0.18
306 0.16
307 0.14
308 0.14
309 0.11
310 0.1
311 0.09
312 0.06
313 0.05
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.03
318 0.03
319 0.04
320 0.05
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.07
326 0.07
327 0.08
328 0.08
329 0.08
330 0.08
331 0.11
332 0.13
333 0.16
334 0.16
335 0.16
336 0.17
337 0.21
338 0.22
339 0.23
340 0.22
341 0.22
342 0.22
343 0.26
344 0.25
345 0.25
346 0.29
347 0.29
348 0.32
349 0.3
350 0.34
351 0.34
352 0.37
353 0.37
354 0.4
355 0.37
356 0.35
357 0.35
358 0.31
359 0.28
360 0.26
361 0.22
362 0.15
363 0.15
364 0.12
365 0.11
366 0.1
367 0.08
368 0.08
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.09
375 0.11
376 0.09
377 0.11
378 0.11
379 0.11
380 0.11
381 0.1
382 0.09
383 0.07
384 0.06
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.05
394 0.07
395 0.08
396 0.08
397 0.07
398 0.08
399 0.07
400 0.07
401 0.07
402 0.06
403 0.05
404 0.05
405 0.05
406 0.04
407 0.05
408 0.05
409 0.07
410 0.11
411 0.11
412 0.12
413 0.13
414 0.14
415 0.14
416 0.15
417 0.14
418 0.1
419 0.11
420 0.12
421 0.11
422 0.11
423 0.11
424 0.1
425 0.09
426 0.09
427 0.09
428 0.08
429 0.08
430 0.11
431 0.12
432 0.15
433 0.17
434 0.21
435 0.21
436 0.25
437 0.25
438 0.22
439 0.22
440 0.2
441 0.2
442 0.18
443 0.18
444 0.14
445 0.13
446 0.12
447 0.12
448 0.11
449 0.09
450 0.08
451 0.06
452 0.05
453 0.06
454 0.07
455 0.06
456 0.06
457 0.07
458 0.09
459 0.09
460 0.1
461 0.13
462 0.12
463 0.13
464 0.13
465 0.16
466 0.24
467 0.31
468 0.34
469 0.33
470 0.33
471 0.35
472 0.37
473 0.34
474 0.28
475 0.23
476 0.23
477 0.26
478 0.24
479 0.23
480 0.22
481 0.23
482 0.2
483 0.19
484 0.18
485 0.13
486 0.13
487 0.12
488 0.12
489 0.11
490 0.11
491 0.12
492 0.11
493 0.12
494 0.11
495 0.11
496 0.13
497 0.14
498 0.14
499 0.12
500 0.12
501 0.13
502 0.13
503 0.13
504 0.12
505 0.12
506 0.14
507 0.13
508 0.13
509 0.12
510 0.14
511 0.15
512 0.13
513 0.16
514 0.14
515 0.14
516 0.13
517 0.13
518 0.13
519 0.13
520 0.12
521 0.09
522 0.1
523 0.12
524 0.14
525 0.19
526 0.18
527 0.17
528 0.2
529 0.23
530 0.32
531 0.34
532 0.4
533 0.42
534 0.49
535 0.5
536 0.51
537 0.56
538 0.56
539 0.6
540 0.58
541 0.55
542 0.5
543 0.49
544 0.46
545 0.38
546 0.31
547 0.23
548 0.23
549 0.21
550 0.18
551 0.18
552 0.18
553 0.19
554 0.19
555 0.21
556 0.17
557 0.15
558 0.18
559 0.19
560 0.2
561 0.19
562 0.17
563 0.14
564 0.13
565 0.2
566 0.17
567 0.17
568 0.16
569 0.16
570 0.18
571 0.19
572 0.19
573 0.12
574 0.14
575 0.16
576 0.16
577 0.18
578 0.22
579 0.22
580 0.25
581 0.26
582 0.25
583 0.25
584 0.27
585 0.26
586 0.2
587 0.28
588 0.28
589 0.34
590 0.37
591 0.4
592 0.43
593 0.48
594 0.51
595 0.47
596 0.5
597 0.46
598 0.44
599 0.4
600 0.38
601 0.36
602 0.42
603 0.42
604 0.41
605 0.43
606 0.41
607 0.47
608 0.52
609 0.57
610 0.57
611 0.6
612 0.64
613 0.68
614 0.78
615 0.74
616 0.74
617 0.67
618 0.63
619 0.56
620 0.47
621 0.39
622 0.29
623 0.27
624 0.22
625 0.19
626 0.15
627 0.14
628 0.17
629 0.2
630 0.22
631 0.21
632 0.27
633 0.29
634 0.33
635 0.42
636 0.48
637 0.55
638 0.58
639 0.61
640 0.62
641 0.65
642 0.6
643 0.56
644 0.49
645 0.45
646 0.44
647 0.43
648 0.41
649 0.39
650 0.38
651 0.41
652 0.46
653 0.46
654 0.5
655 0.51
656 0.46
657 0.45
658 0.5
659 0.53
660 0.56
661 0.59
662 0.59
663 0.59
664 0.59
665 0.63
666 0.6
667 0.57
668 0.55
669 0.49
670 0.48
671 0.5
672 0.51
673 0.48
674 0.53
675 0.5
676 0.49
677 0.54
678 0.54
679 0.57