Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J8QE96

Protein Details
Accession A0A1J8QE96    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
378-404VEQASSRTPGRKRRHLSKIWRRIPGPRHydrophilic
416-452NLQAVPEPSTRRRRNPSLSRMWKRIRHPRSHKPRANPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
385-452TPGRKRRHLSKIWRRIPGPRSHKGRSTGREANLQAVPEPSTRRRRNPSLSRMWKRIRHPRSHKPRANP
Subcellular Location(s) cyto 6.5, cyto_nucl 6.5, nucl 5.5, mito 5, plas 3, extr 3, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MSSADAMTCLAFSPDSQKVASGTARLGVTITHIASQSRRQLAMSAVAHTPAIVAWSPDGAKIMSASLDNTLRCWDAISSDPLGPPFQGHKELILAASFLRDSSHAISLSKDGELLMWDTRSGEITRRETVSKYARTIFVAALSMDGTLLITSDRKECVAWDIPACMQIAAIALPDVPLLQAAIIPNSQVVLAFGNMSFWIWDTTTRDYDDARFEGLDRDAISCAMAVSPDGGLLVLEIDGVDDEYPTHFYDRKGHEFPKPNIRCIHPFAFSPDGKRFAASHVRSDSKDDSHKLVIRTVEEARTLTAHLIPTTDATNQIRGYKSRDVLATTAVADKGKQRSLPPGFFEQSPRGSGSAEGRVPATKRRGTGLAIPVANNVEQASSRTPGRKRRHLSKIWRRIPGPRSHKGRSTGREANLQAVPEPSTRRRRNPSLSRMWKRIRHPRSHKPRANP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.2
3 0.2
4 0.21
5 0.21
6 0.25
7 0.27
8 0.22
9 0.19
10 0.21
11 0.21
12 0.19
13 0.18
14 0.14
15 0.16
16 0.17
17 0.17
18 0.15
19 0.16
20 0.18
21 0.21
22 0.28
23 0.32
24 0.33
25 0.33
26 0.32
27 0.33
28 0.33
29 0.39
30 0.33
31 0.28
32 0.25
33 0.24
34 0.23
35 0.21
36 0.19
37 0.1
38 0.11
39 0.08
40 0.08
41 0.08
42 0.1
43 0.11
44 0.11
45 0.13
46 0.1
47 0.1
48 0.1
49 0.1
50 0.09
51 0.09
52 0.09
53 0.12
54 0.15
55 0.15
56 0.15
57 0.17
58 0.17
59 0.16
60 0.17
61 0.13
62 0.12
63 0.16
64 0.18
65 0.19
66 0.2
67 0.21
68 0.21
69 0.21
70 0.19
71 0.18
72 0.18
73 0.19
74 0.22
75 0.21
76 0.21
77 0.22
78 0.22
79 0.21
80 0.17
81 0.14
82 0.09
83 0.1
84 0.09
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.09
89 0.12
90 0.15
91 0.15
92 0.15
93 0.16
94 0.18
95 0.19
96 0.16
97 0.13
98 0.1
99 0.09
100 0.1
101 0.11
102 0.1
103 0.09
104 0.09
105 0.1
106 0.1
107 0.12
108 0.12
109 0.15
110 0.2
111 0.24
112 0.27
113 0.29
114 0.3
115 0.29
116 0.36
117 0.39
118 0.36
119 0.36
120 0.36
121 0.35
122 0.35
123 0.35
124 0.28
125 0.21
126 0.17
127 0.14
128 0.11
129 0.1
130 0.08
131 0.06
132 0.06
133 0.05
134 0.03
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.06
139 0.08
140 0.08
141 0.09
142 0.09
143 0.1
144 0.15
145 0.18
146 0.19
147 0.18
148 0.19
149 0.18
150 0.2
151 0.2
152 0.14
153 0.09
154 0.08
155 0.08
156 0.06
157 0.06
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.04
168 0.04
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.04
176 0.05
177 0.04
178 0.04
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.04
185 0.04
186 0.05
187 0.05
188 0.07
189 0.1
190 0.13
191 0.14
192 0.15
193 0.15
194 0.15
195 0.17
196 0.18
197 0.15
198 0.13
199 0.11
200 0.11
201 0.12
202 0.11
203 0.11
204 0.08
205 0.09
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.06
210 0.06
211 0.05
212 0.04
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.02
223 0.02
224 0.02
225 0.02
226 0.02
227 0.03
228 0.03
229 0.02
230 0.03
231 0.03
232 0.05
233 0.06
234 0.07
235 0.09
236 0.1
237 0.18
238 0.24
239 0.3
240 0.33
241 0.36
242 0.42
243 0.49
244 0.52
245 0.55
246 0.52
247 0.49
248 0.49
249 0.5
250 0.46
251 0.44
252 0.43
253 0.33
254 0.32
255 0.32
256 0.35
257 0.31
258 0.31
259 0.29
260 0.29
261 0.28
262 0.28
263 0.24
264 0.23
265 0.32
266 0.29
267 0.31
268 0.32
269 0.35
270 0.34
271 0.39
272 0.37
273 0.31
274 0.35
275 0.32
276 0.3
277 0.33
278 0.36
279 0.32
280 0.32
281 0.3
282 0.26
283 0.27
284 0.25
285 0.22
286 0.19
287 0.18
288 0.16
289 0.15
290 0.14
291 0.12
292 0.11
293 0.11
294 0.1
295 0.1
296 0.1
297 0.1
298 0.11
299 0.11
300 0.13
301 0.13
302 0.17
303 0.18
304 0.21
305 0.22
306 0.23
307 0.28
308 0.3
309 0.3
310 0.3
311 0.3
312 0.28
313 0.27
314 0.27
315 0.21
316 0.16
317 0.16
318 0.14
319 0.13
320 0.12
321 0.16
322 0.2
323 0.22
324 0.23
325 0.24
326 0.33
327 0.4
328 0.43
329 0.42
330 0.44
331 0.43
332 0.42
333 0.45
334 0.4
335 0.35
336 0.33
337 0.3
338 0.24
339 0.22
340 0.23
341 0.23
342 0.24
343 0.22
344 0.21
345 0.21
346 0.23
347 0.25
348 0.3
349 0.33
350 0.3
351 0.31
352 0.34
353 0.36
354 0.36
355 0.41
356 0.4
357 0.39
358 0.37
359 0.36
360 0.33
361 0.32
362 0.29
363 0.22
364 0.16
365 0.1
366 0.1
367 0.12
368 0.14
369 0.15
370 0.19
371 0.26
372 0.33
373 0.43
374 0.52
375 0.6
376 0.66
377 0.73
378 0.8
379 0.83
380 0.87
381 0.89
382 0.9
383 0.88
384 0.87
385 0.8
386 0.79
387 0.77
388 0.76
389 0.74
390 0.72
391 0.73
392 0.7
393 0.74
394 0.74
395 0.75
396 0.7
397 0.71
398 0.7
399 0.65
400 0.67
401 0.61
402 0.58
403 0.5
404 0.45
405 0.37
406 0.3
407 0.29
408 0.24
409 0.3
410 0.33
411 0.42
412 0.49
413 0.58
414 0.66
415 0.73
416 0.8
417 0.84
418 0.86
419 0.86
420 0.89
421 0.89
422 0.89
423 0.89
424 0.86
425 0.86
426 0.87
427 0.85
428 0.85
429 0.86
430 0.88
431 0.89
432 0.93