Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9PJQ0

Protein Details
Accession A0A1J9PJQ0    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-59AASQKTKSMVQKPTKKVNPKQQTTKRKSEPEPSSHydrophilic
218-244APISKLTRPKREQPKKLKMRYKPFGSTHydrophilic
287-312IGSDKEQGERRKKYKRLHSNPADGNAHydrophilic
341-376NEQQGEKSSKKRRDETSQELRARKEDRKRKKQALASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
225-236RPKREQPKKLKM
277-302GKKRRKSSIEIGSDKEQGERRKKYKR
347-372KSSKKRRDETSQELRARKEDRKRKKQ
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 15, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013240  DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34  
Gene Ontology GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
Pfam View protein in Pfam  
PF08208  RNA_polI_A34  
Amino Acid Sequences MAPPLSKEIVTDSDSSDPEPPSSPEAASQKTKSMVQKPTKKVNPKQQTTKRKSEPEPSSSSSGSEVEDECDSPIEGGLNTPEMDSTAPKVIPAQEFKAPEGFKLVAATAPRSPDVSKVFSNLRGKQIWHITAPAFVPMSSIRELALDAVATGDSVLTHNGVDYKLREDQIGAEKNKALLLPNEQGNTYHRHRLNVAQTFHLERIVDLANGATHSEQSAPISKLTRPKREQPKKLKMRYKPFGSTNDQPETFGSNSSESEAEGVSFRMPQSLAQDREGKKRRKSSIEIGSDKEQGERRKKYKRLHSNPADGNADIQLKNGEVHAVRKSTTTKDRGATRGRTNEQQGEKSSKKRRDETSQELRARKEDRKRKKQALAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.27
3 0.27
4 0.24
5 0.24
6 0.25
7 0.24
8 0.24
9 0.26
10 0.24
11 0.27
12 0.31
13 0.35
14 0.39
15 0.39
16 0.39
17 0.4
18 0.45
19 0.47
20 0.5
21 0.55
22 0.59
23 0.67
24 0.71
25 0.78
26 0.82
27 0.84
28 0.85
29 0.86
30 0.87
31 0.86
32 0.89
33 0.89
34 0.91
35 0.89
36 0.9
37 0.88
38 0.86
39 0.83
40 0.82
41 0.8
42 0.76
43 0.74
44 0.68
45 0.64
46 0.55
47 0.49
48 0.41
49 0.33
50 0.26
51 0.21
52 0.17
53 0.15
54 0.15
55 0.15
56 0.13
57 0.13
58 0.12
59 0.1
60 0.1
61 0.08
62 0.07
63 0.07
64 0.08
65 0.09
66 0.09
67 0.08
68 0.08
69 0.08
70 0.09
71 0.09
72 0.11
73 0.13
74 0.13
75 0.13
76 0.15
77 0.18
78 0.22
79 0.24
80 0.25
81 0.27
82 0.28
83 0.29
84 0.34
85 0.3
86 0.26
87 0.26
88 0.23
89 0.19
90 0.18
91 0.17
92 0.13
93 0.14
94 0.16
95 0.14
96 0.15
97 0.15
98 0.16
99 0.16
100 0.19
101 0.22
102 0.24
103 0.22
104 0.24
105 0.26
106 0.32
107 0.38
108 0.36
109 0.38
110 0.36
111 0.36
112 0.39
113 0.42
114 0.37
115 0.31
116 0.3
117 0.25
118 0.25
119 0.24
120 0.2
121 0.14
122 0.11
123 0.12
124 0.1
125 0.12
126 0.11
127 0.11
128 0.1
129 0.1
130 0.1
131 0.09
132 0.08
133 0.05
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.05
147 0.06
148 0.07
149 0.08
150 0.1
151 0.13
152 0.14
153 0.14
154 0.13
155 0.15
156 0.22
157 0.28
158 0.26
159 0.24
160 0.24
161 0.24
162 0.25
163 0.22
164 0.15
165 0.1
166 0.13
167 0.15
168 0.16
169 0.17
170 0.16
171 0.17
172 0.17
173 0.22
174 0.2
175 0.25
176 0.24
177 0.25
178 0.26
179 0.31
180 0.37
181 0.39
182 0.37
183 0.31
184 0.32
185 0.32
186 0.31
187 0.26
188 0.18
189 0.11
190 0.12
191 0.11
192 0.09
193 0.08
194 0.07
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.05
199 0.04
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.07
204 0.11
205 0.12
206 0.13
207 0.15
208 0.17
209 0.26
210 0.33
211 0.42
212 0.42
213 0.51
214 0.61
215 0.69
216 0.78
217 0.8
218 0.84
219 0.84
220 0.9
221 0.89
222 0.87
223 0.87
224 0.85
225 0.81
226 0.76
227 0.71
228 0.67
229 0.65
230 0.62
231 0.57
232 0.54
233 0.48
234 0.42
235 0.37
236 0.35
237 0.29
238 0.24
239 0.18
240 0.14
241 0.14
242 0.15
243 0.14
244 0.1
245 0.11
246 0.09
247 0.08
248 0.07
249 0.08
250 0.07
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.09
255 0.09
256 0.15
257 0.23
258 0.25
259 0.27
260 0.36
261 0.37
262 0.48
263 0.56
264 0.58
265 0.59
266 0.66
267 0.7
268 0.7
269 0.74
270 0.73
271 0.74
272 0.75
273 0.71
274 0.66
275 0.62
276 0.56
277 0.5
278 0.45
279 0.4
280 0.39
281 0.45
282 0.51
283 0.56
284 0.63
285 0.71
286 0.76
287 0.82
288 0.84
289 0.85
290 0.86
291 0.86
292 0.86
293 0.82
294 0.78
295 0.7
296 0.58
297 0.49
298 0.41
299 0.36
300 0.26
301 0.22
302 0.17
303 0.15
304 0.15
305 0.14
306 0.15
307 0.12
308 0.16
309 0.2
310 0.21
311 0.21
312 0.24
313 0.28
314 0.32
315 0.4
316 0.42
317 0.43
318 0.47
319 0.53
320 0.58
321 0.63
322 0.63
323 0.63
324 0.67
325 0.66
326 0.67
327 0.67
328 0.68
329 0.66
330 0.63
331 0.6
332 0.59
333 0.61
334 0.64
335 0.67
336 0.68
337 0.7
338 0.73
339 0.76
340 0.77
341 0.8
342 0.8
343 0.81
344 0.82
345 0.82
346 0.79
347 0.74
348 0.7
349 0.68
350 0.67
351 0.67
352 0.68
353 0.71
354 0.77
355 0.84
356 0.87