FuNGI

A0A1J9QBL2

Protein Details

Accession

A0A1J9QBL2

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
7-71	DIDPVPLSPERKRKNKEKDGLSAKKRKHESRTTIQPEVEETSQRAKKKKEKKHKEHKHHEDLEQS	Basic
73-101	EAPDYPNARPKKTKKHKHRGPDPVNDDQG	Basic
473-496	AERAMSGKQGKQKKEKKKGKKAAS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
16-36	ERKRKNKEKDGLSAKKRKHES
50-64	RAKKKKEKKHKEHKH
80-92	ARPKKTKKHKHRG
479-496	GKQGKQKKEKKKGKKAAS

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, mito_nucl 10.5, cyto 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB

Amino Acid Sequences

MSLDAMDIDPVPLSPERKRKNKEKDGLSAKKRKHESRTTIQPEVEETSQRAKKKKEKKHKEHKHHEDLEQSAEAPDYPNARPKKTKKHKHRGPDPVNDDQGAEEPFSQSHPPTTSRKPLTKASASLWNPASTDSTESSPFHLITATLYVPLSPISISPTHALSSLQAEHLSTLLLTYYPPLRGVVLAYSNASISSTPPSLSSSTTTHNPDEDQNPQPLTLALSAGEYGVLYVYLTATFLVFRPERGQLLEGWINVQSDGFLGAVVYNLFSVGIERRRLPADWQWVAPGQEPTASMLEKTTAKSSSNEDDNDDDNEDEEEDSDFDSDKENFRPLPSNSAAMLDINIQSQNHDGTEQPFEALEDTSTGYFQTRSGRRVRGMVRFRVREVDVIPGAEPDKAFLSIEGTMLSPEEEAKLVEEERKRAGFAPSSSSSAVATAVAAGRSGNGAPGRAMMSGGLGMASAAAVVREEEAEAERAMSGKQGKQKKEKKKGKKAAS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.36
3	0.45
4	0.55
5	0.65
6	0.72
7	0.8
8	0.87
9	0.88
10	0.86
11	0.87
12	0.88
13	0.89
14	0.89
15	0.86
16	0.82
17	0.81
18	0.82
19	0.81
20	0.8
21	0.8
22	0.79
23	0.8
24	0.85
25	0.83
26	0.8
27	0.72
28	0.63
29	0.55
30	0.51
31	0.43
32	0.34
33	0.29
34	0.33
35	0.37
36	0.42
37	0.46
38	0.51
39	0.59
40	0.67
41	0.75
42	0.77
43	0.84
44	0.89
45	0.93
46	0.95
47	0.96
48	0.97
49	0.96
50	0.96
51	0.91
52	0.84
53	0.8
54	0.71
55	0.63
56	0.53
57	0.42
58	0.32
59	0.25
60	0.2
61	0.15
62	0.15
63	0.15
64	0.16
65	0.24
66	0.28
67	0.33
68	0.43
69	0.51
70	0.6
71	0.67
72	0.77
73	0.8
74	0.87
75	0.91
76	0.92
77	0.93
78	0.93
79	0.91
80	0.9
81	0.85
82	0.81
83	0.75
84	0.64
85	0.53
86	0.43
87	0.36
88	0.26
89	0.2
90	0.13
91	0.11
92	0.11
93	0.13
94	0.14
95	0.12
96	0.15
97	0.17
98	0.22
99	0.27
100	0.34
101	0.42
102	0.47
103	0.53
104	0.53
105	0.57
106	0.61
107	0.59
108	0.55
109	0.49
110	0.51
111	0.47
112	0.48
113	0.42
114	0.35
115	0.31
116	0.29
117	0.28
118	0.18
119	0.2
120	0.16
121	0.16
122	0.18
123	0.18
124	0.2
125	0.2
126	0.19
127	0.16
128	0.15
129	0.12
130	0.11
131	0.12
132	0.1
133	0.09
134	0.09
135	0.08
136	0.08
137	0.08
138	0.08
139	0.05
140	0.06
141	0.08
142	0.09
143	0.11
144	0.12
145	0.12
146	0.12
147	0.13
148	0.13
149	0.1
150	0.13
151	0.12
152	0.12
153	0.11
154	0.1
155	0.1
156	0.1
157	0.09
158	0.06
159	0.05
160	0.04
161	0.04
162	0.04
163	0.05
164	0.07
165	0.07
166	0.08
167	0.08
168	0.09
169	0.09
170	0.09
171	0.1
172	0.09
173	0.09
174	0.09
175	0.09
176	0.09
177	0.08
178	0.08
179	0.07
180	0.06
181	0.08
182	0.09
183	0.09
184	0.09
185	0.11
186	0.12
187	0.13
188	0.15
189	0.14
190	0.17
191	0.21
192	0.23
193	0.22
194	0.22
195	0.22
196	0.22
197	0.23
198	0.25
199	0.23
200	0.23
201	0.22
202	0.21
203	0.2
204	0.17
205	0.16
206	0.11
207	0.09
208	0.06
209	0.06
210	0.06
211	0.06
212	0.05
213	0.04
214	0.03
215	0.03
216	0.03
217	0.02
218	0.02
219	0.03
220	0.03
221	0.03
222	0.03
223	0.03
224	0.03
225	0.04
226	0.08
227	0.08
228	0.09
229	0.11
230	0.12
231	0.13
232	0.13
233	0.14
234	0.1
235	0.14
236	0.15
237	0.13
238	0.12
239	0.12
240	0.11
241	0.1
242	0.1
243	0.06
244	0.04
245	0.05
246	0.04
247	0.03
248	0.03
249	0.03
250	0.04
251	0.03
252	0.03
253	0.03
254	0.03
255	0.03
256	0.03
257	0.04
258	0.07
259	0.1
260	0.12
261	0.13
262	0.15
263	0.17
264	0.17
265	0.2
266	0.23
267	0.28
268	0.28
269	0.28
270	0.27
271	0.27
272	0.28
273	0.26
274	0.21
275	0.12
276	0.12
277	0.12
278	0.12
279	0.12
280	0.11
281	0.09
282	0.09
283	0.11
284	0.11
285	0.12
286	0.13
287	0.13
288	0.14
289	0.16
290	0.19
291	0.22
292	0.24
293	0.24
294	0.23
295	0.24
296	0.24
297	0.24
298	0.21
299	0.17
300	0.13
301	0.13
302	0.11
303	0.09
304	0.08
305	0.07
306	0.06
307	0.06
308	0.06
309	0.06
310	0.06
311	0.08
312	0.09
313	0.11
314	0.12
315	0.15
316	0.15
317	0.17
318	0.23
319	0.21
320	0.27
321	0.27
322	0.27
323	0.25
324	0.26
325	0.24
326	0.18
327	0.17
328	0.12
329	0.11
330	0.09
331	0.1
332	0.09
333	0.09
334	0.1
335	0.1
336	0.09
337	0.09
338	0.1
339	0.11
340	0.15
341	0.14
342	0.13
343	0.12
344	0.12
345	0.13
346	0.12
347	0.09
348	0.07
349	0.08
350	0.08
351	0.08
352	0.08
353	0.08
354	0.08
355	0.09
356	0.18
357	0.21
358	0.25
359	0.32
360	0.37
361	0.38
362	0.46
363	0.5
364	0.51
365	0.55
366	0.6
367	0.62
368	0.6
369	0.6
370	0.58
371	0.53
372	0.46
373	0.39
374	0.36
375	0.27
376	0.25
377	0.23
378	0.2
379	0.19
380	0.17
381	0.16
382	0.11
383	0.11
384	0.11
385	0.11
386	0.1
387	0.11
388	0.11
389	0.11
390	0.11
391	0.09
392	0.09
393	0.09
394	0.09
395	0.07
396	0.07
397	0.07
398	0.07
399	0.07
400	0.08
401	0.1
402	0.11
403	0.18
404	0.21
405	0.23
406	0.28
407	0.29
408	0.28
409	0.29
410	0.32
411	0.32
412	0.3
413	0.34
414	0.32
415	0.34
416	0.34
417	0.32
418	0.27
419	0.21
420	0.2
421	0.12
422	0.1
423	0.08
424	0.08
425	0.08
426	0.08
427	0.07
428	0.07
429	0.08
430	0.08
431	0.11
432	0.11
433	0.12
434	0.12
435	0.14
436	0.15
437	0.14
438	0.14
439	0.1
440	0.1
441	0.09
442	0.09
443	0.07
444	0.05
445	0.05
446	0.04
447	0.04
448	0.03
449	0.03
450	0.03
451	0.03
452	0.04
453	0.05
454	0.05
455	0.06
456	0.07
457	0.09
458	0.11
459	0.11
460	0.11
461	0.11
462	0.11
463	0.11
464	0.15
465	0.19
466	0.23
467	0.31
468	0.4
469	0.49
470	0.59
471	0.69
472	0.76
473	0.82
474	0.87
475	0.9
476	0.93

A0A1J9QBL2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer