Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9PDM1

Protein Details
Accession A0A1J9PDM1    Localization Confidence High Confidence Score 19.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
386-407LFETNRPTKKRKLEKLPADYMTHydrophilic
541-560LPVSFKKPLHIKRKHQKGKDBasic
1046-1071QFELQRLQRNKERRHARERQKGITSDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
549-558LHIKRKHQKG
Subcellular Location(s) nucl 20, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040240  TAF1  
IPR022591  TAF1_HAT_dom  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0004402  F:histone acetyltransferase activity  
GO:0001091  F:RNA polymerase II general transcription initiation factor binding  
GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF12157  DUF3591  
Amino Acid Sequences MSTTSTFPSQVTPSGERTTNGRVPEKMPHATGSEGGESEDEDFNNVMRQMNAPTNEASFDFLQRELEPGEKADDAVNYEDIDDDDLPDEELELPALGVGDGKTAAVGDGWGAMEGMEGILTAEDLEQRPGGDELDDLFGDVPSSPVGGQADKIDELPPVGSEDILPNSAVDMFDVESPAKDIGIKETVHGRDMDSVIAPTDMDPATFKEYQLQQALFAMSSYGPDNPPAPPENHEELLASLWPKFDRNAMPRFLELLPPKKSHFVGKTPLKPPKRIVPTKLNLELAQDQERAFRATGQTQKRALDFENPSIVVITPPADSTSSSSDNMNIDGDLDEELPGGVTMQDLQFICADWDIKTPVTEEEETEAVVEVASDAEPGAEDSDWLFETNRPTKKRKLEKLPADYMTYVPIDMPLFDDPISETARVARKIHIDLNDPYLLLDERPTEAAMQAPKRLGTVNRDKTAGSFTKRLTKRYNISNDDAYDMLKENHQNKVRSTLGSVALEHSLPAVRLQWPYYKTKLARQEARSFHRPSLSFYPNLPVSFKKPLHIKRKHQKGKDIKTLYNSTKSLSLADNSHVLLLEYSEEHPTMMSNFGMGSRLINYYRRKNMEDPARPKAEIGETAVLLPQDKSPFSIFGHIDPGETTTAIATAMFRAPVFQQEAKPTDFLVIRNSTGIDGSSYYIRNIENLYVAGQEFPSVDVPGPHSRKVTTAAKNRLKMICYRLLRRNKNHRISVADITEHFPESSDMQNRQKMKEFLQFSKDHKEWEMRPGEPIPDEDVLRGYVKAEDICLLEAMQVGQQHLHDAGYDREEDDADDDEKEGESFEQQLSPWKITRNFLLATQGKAMLQLHGEGDPTGRGEGFSFIKTSMKGGFRAVGESVEDKLDAQRLKELGGHSYNVARQQKSYEESIRRVWEAQKSSLSSTIEHSDEESDLDQEETDETFAKPSARSEHPTPGLGRRDDETTSQFSRLSTASQTGKVMKITRKVRNSKGGYDEVLEIVKDPRVIKQYAKQRHEAESRNLILGDIKPTGDPETDARRMKQLQFELQRLQRNKERRHARERQKGITSDSAERSPGAANSPTAGPKGGGTQRKCANCGQVGHIKTNKKLCPLLNGTMKADDGISGSAFAMGAPPAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.38
3 0.36
4 0.37
5 0.41
6 0.39
7 0.42
8 0.42
9 0.41
10 0.42
11 0.5
12 0.52
13 0.48
14 0.46
15 0.42
16 0.39
17 0.38
18 0.37
19 0.31
20 0.26
21 0.22
22 0.21
23 0.18
24 0.16
25 0.18
26 0.17
27 0.14
28 0.13
29 0.13
30 0.13
31 0.16
32 0.17
33 0.15
34 0.14
35 0.16
36 0.19
37 0.26
38 0.28
39 0.27
40 0.27
41 0.27
42 0.27
43 0.26
44 0.25
45 0.2
46 0.2
47 0.19
48 0.18
49 0.2
50 0.18
51 0.2
52 0.18
53 0.19
54 0.17
55 0.17
56 0.2
57 0.17
58 0.18
59 0.17
60 0.17
61 0.17
62 0.18
63 0.18
64 0.15
65 0.15
66 0.14
67 0.13
68 0.15
69 0.12
70 0.11
71 0.11
72 0.11
73 0.11
74 0.11
75 0.11
76 0.09
77 0.09
78 0.08
79 0.07
80 0.07
81 0.06
82 0.06
83 0.05
84 0.06
85 0.05
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.05
93 0.05
94 0.04
95 0.05
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.03
104 0.03
105 0.03
106 0.03
107 0.03
108 0.04
109 0.04
110 0.07
111 0.08
112 0.1
113 0.1
114 0.11
115 0.13
116 0.13
117 0.13
118 0.11
119 0.1
120 0.1
121 0.13
122 0.12
123 0.11
124 0.11
125 0.1
126 0.1
127 0.09
128 0.08
129 0.06
130 0.07
131 0.06
132 0.08
133 0.1
134 0.1
135 0.11
136 0.13
137 0.15
138 0.15
139 0.16
140 0.14
141 0.13
142 0.13
143 0.13
144 0.11
145 0.11
146 0.11
147 0.1
148 0.1
149 0.12
150 0.13
151 0.14
152 0.13
153 0.1
154 0.11
155 0.12
156 0.11
157 0.08
158 0.07
159 0.08
160 0.08
161 0.1
162 0.09
163 0.09
164 0.11
165 0.11
166 0.1
167 0.1
168 0.1
169 0.13
170 0.17
171 0.17
172 0.17
173 0.25
174 0.26
175 0.26
176 0.26
177 0.23
178 0.23
179 0.23
180 0.23
181 0.16
182 0.15
183 0.14
184 0.13
185 0.12
186 0.08
187 0.11
188 0.1
189 0.09
190 0.1
191 0.12
192 0.17
193 0.18
194 0.18
195 0.22
196 0.24
197 0.29
198 0.33
199 0.31
200 0.26
201 0.27
202 0.27
203 0.2
204 0.17
205 0.13
206 0.08
207 0.09
208 0.1
209 0.1
210 0.1
211 0.11
212 0.13
213 0.13
214 0.17
215 0.18
216 0.19
217 0.21
218 0.27
219 0.31
220 0.31
221 0.3
222 0.27
223 0.24
224 0.24
225 0.22
226 0.15
227 0.11
228 0.12
229 0.12
230 0.13
231 0.13
232 0.17
233 0.23
234 0.29
235 0.35
236 0.37
237 0.38
238 0.38
239 0.41
240 0.36
241 0.35
242 0.35
243 0.37
244 0.38
245 0.38
246 0.4
247 0.41
248 0.41
249 0.42
250 0.42
251 0.4
252 0.45
253 0.52
254 0.59
255 0.63
256 0.71
257 0.68
258 0.67
259 0.66
260 0.66
261 0.67
262 0.66
263 0.65
264 0.66
265 0.67
266 0.7
267 0.7
268 0.62
269 0.52
270 0.49
271 0.44
272 0.37
273 0.34
274 0.27
275 0.23
276 0.23
277 0.23
278 0.21
279 0.18
280 0.17
281 0.16
282 0.22
283 0.3
284 0.35
285 0.4
286 0.41
287 0.43
288 0.42
289 0.41
290 0.36
291 0.36
292 0.34
293 0.31
294 0.31
295 0.29
296 0.28
297 0.26
298 0.24
299 0.16
300 0.12
301 0.1
302 0.07
303 0.07
304 0.08
305 0.08
306 0.09
307 0.11
308 0.15
309 0.17
310 0.17
311 0.17
312 0.19
313 0.19
314 0.19
315 0.17
316 0.12
317 0.1
318 0.09
319 0.09
320 0.08
321 0.07
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.05
326 0.05
327 0.04
328 0.04
329 0.03
330 0.04
331 0.04
332 0.08
333 0.08
334 0.09
335 0.09
336 0.09
337 0.1
338 0.09
339 0.1
340 0.08
341 0.1
342 0.11
343 0.11
344 0.11
345 0.11
346 0.12
347 0.15
348 0.15
349 0.14
350 0.15
351 0.15
352 0.14
353 0.13
354 0.12
355 0.08
356 0.07
357 0.06
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.03
362 0.03
363 0.03
364 0.03
365 0.04
366 0.05
367 0.04
368 0.04
369 0.05
370 0.06
371 0.06
372 0.07
373 0.08
374 0.09
375 0.16
376 0.23
377 0.3
378 0.34
379 0.39
380 0.47
381 0.57
382 0.65
383 0.69
384 0.72
385 0.75
386 0.8
387 0.83
388 0.81
389 0.73
390 0.65
391 0.56
392 0.45
393 0.36
394 0.26
395 0.18
396 0.11
397 0.1
398 0.08
399 0.07
400 0.09
401 0.07
402 0.08
403 0.08
404 0.08
405 0.08
406 0.1
407 0.11
408 0.1
409 0.09
410 0.13
411 0.17
412 0.2
413 0.2
414 0.21
415 0.23
416 0.26
417 0.3
418 0.28
419 0.28
420 0.27
421 0.3
422 0.28
423 0.24
424 0.21
425 0.18
426 0.16
427 0.11
428 0.11
429 0.07
430 0.08
431 0.08
432 0.09
433 0.08
434 0.08
435 0.1
436 0.14
437 0.14
438 0.16
439 0.16
440 0.16
441 0.16
442 0.18
443 0.17
444 0.21
445 0.3
446 0.35
447 0.36
448 0.37
449 0.37
450 0.35
451 0.39
452 0.36
453 0.29
454 0.26
455 0.25
456 0.35
457 0.37
458 0.41
459 0.41
460 0.44
461 0.45
462 0.5
463 0.57
464 0.52
465 0.54
466 0.51
467 0.46
468 0.41
469 0.35
470 0.26
471 0.18
472 0.15
473 0.12
474 0.11
475 0.15
476 0.16
477 0.23
478 0.29
479 0.3
480 0.29
481 0.36
482 0.35
483 0.31
484 0.3
485 0.26
486 0.23
487 0.22
488 0.21
489 0.16
490 0.15
491 0.14
492 0.12
493 0.09
494 0.07
495 0.06
496 0.06
497 0.06
498 0.08
499 0.09
500 0.11
501 0.15
502 0.18
503 0.22
504 0.24
505 0.29
506 0.29
507 0.35
508 0.42
509 0.45
510 0.5
511 0.51
512 0.57
513 0.57
514 0.62
515 0.62
516 0.55
517 0.5
518 0.47
519 0.42
520 0.39
521 0.4
522 0.36
523 0.31
524 0.28
525 0.31
526 0.27
527 0.27
528 0.24
529 0.17
530 0.19
531 0.25
532 0.25
533 0.25
534 0.32
535 0.4
536 0.5
537 0.58
538 0.64
539 0.66
540 0.77
541 0.82
542 0.78
543 0.79
544 0.79
545 0.79
546 0.79
547 0.74
548 0.64
549 0.61
550 0.62
551 0.55
552 0.49
553 0.4
554 0.31
555 0.28
556 0.26
557 0.23
558 0.17
559 0.16
560 0.12
561 0.13
562 0.13
563 0.11
564 0.11
565 0.09
566 0.08
567 0.07
568 0.06
569 0.05
570 0.05
571 0.06
572 0.06
573 0.06
574 0.06
575 0.06
576 0.06
577 0.06
578 0.07
579 0.05
580 0.05
581 0.05
582 0.05
583 0.06
584 0.06
585 0.06
586 0.06
587 0.08
588 0.09
589 0.15
590 0.2
591 0.26
592 0.32
593 0.35
594 0.37
595 0.39
596 0.45
597 0.49
598 0.53
599 0.52
600 0.52
601 0.52
602 0.48
603 0.45
604 0.4
605 0.31
606 0.23
607 0.19
608 0.14
609 0.12
610 0.12
611 0.12
612 0.1
613 0.09
614 0.09
615 0.08
616 0.08
617 0.08
618 0.1
619 0.1
620 0.12
621 0.12
622 0.17
623 0.16
624 0.15
625 0.19
626 0.17
627 0.17
628 0.15
629 0.16
630 0.11
631 0.1
632 0.09
633 0.05
634 0.05
635 0.05
636 0.05
637 0.04
638 0.04
639 0.05
640 0.05
641 0.05
642 0.06
643 0.06
644 0.09
645 0.13
646 0.14
647 0.15
648 0.19
649 0.22
650 0.23
651 0.23
652 0.2
653 0.19
654 0.18
655 0.17
656 0.18
657 0.16
658 0.16
659 0.16
660 0.16
661 0.13
662 0.12
663 0.11
664 0.07
665 0.06
666 0.07
667 0.09
668 0.09
669 0.09
670 0.1
671 0.1
672 0.1
673 0.11
674 0.1
675 0.09
676 0.09
677 0.09
678 0.08
679 0.08
680 0.08
681 0.07
682 0.06
683 0.06
684 0.06
685 0.07
686 0.06
687 0.06
688 0.07
689 0.11
690 0.19
691 0.22
692 0.23
693 0.23
694 0.23
695 0.25
696 0.3
697 0.34
698 0.35
699 0.41
700 0.5
701 0.56
702 0.58
703 0.61
704 0.58
705 0.51
706 0.47
707 0.43
708 0.41
709 0.39
710 0.43
711 0.47
712 0.55
713 0.62
714 0.68
715 0.74
716 0.76
717 0.79
718 0.78
719 0.72
720 0.67
721 0.63
722 0.58
723 0.48
724 0.39
725 0.31
726 0.29
727 0.26
728 0.22
729 0.17
730 0.12
731 0.11
732 0.12
733 0.16
734 0.18
735 0.22
736 0.27
737 0.32
738 0.35
739 0.36
740 0.41
741 0.39
742 0.39
743 0.42
744 0.42
745 0.4
746 0.45
747 0.46
748 0.43
749 0.49
750 0.45
751 0.39
752 0.36
753 0.39
754 0.34
755 0.38
756 0.39
757 0.31
758 0.34
759 0.33
760 0.32
761 0.27
762 0.27
763 0.21
764 0.18
765 0.18
766 0.15
767 0.14
768 0.14
769 0.14
770 0.12
771 0.1
772 0.09
773 0.1
774 0.1
775 0.09
776 0.09
777 0.09
778 0.1
779 0.09
780 0.08
781 0.07
782 0.08
783 0.07
784 0.07
785 0.08
786 0.07
787 0.08
788 0.08
789 0.09
790 0.09
791 0.09
792 0.08
793 0.09
794 0.1
795 0.11
796 0.11
797 0.1
798 0.11
799 0.11
800 0.1
801 0.1
802 0.11
803 0.1
804 0.1
805 0.1
806 0.1
807 0.1
808 0.09
809 0.08
810 0.07
811 0.07
812 0.08
813 0.08
814 0.09
815 0.09
816 0.17
817 0.19
818 0.22
819 0.23
820 0.27
821 0.3
822 0.31
823 0.34
824 0.3
825 0.28
826 0.27
827 0.34
828 0.3
829 0.28
830 0.28
831 0.26
832 0.21
833 0.22
834 0.22
835 0.14
836 0.12
837 0.12
838 0.11
839 0.1
840 0.11
841 0.09
842 0.09
843 0.09
844 0.09
845 0.08
846 0.07
847 0.07
848 0.07
849 0.11
850 0.12
851 0.12
852 0.12
853 0.13
854 0.15
855 0.15
856 0.16
857 0.18
858 0.19
859 0.19
860 0.2
861 0.23
862 0.21
863 0.23
864 0.21
865 0.16
866 0.15
867 0.15
868 0.15
869 0.12
870 0.11
871 0.1
872 0.11
873 0.16
874 0.15
875 0.15
876 0.18
877 0.18
878 0.19
879 0.22
880 0.22
881 0.22
882 0.23
883 0.23
884 0.2
885 0.23
886 0.24
887 0.29
888 0.34
889 0.29
890 0.28
891 0.3
892 0.34
893 0.35
894 0.39
895 0.39
896 0.39
897 0.42
898 0.46
899 0.47
900 0.43
901 0.43
902 0.42
903 0.41
904 0.4
905 0.4
906 0.39
907 0.38
908 0.38
909 0.4
910 0.37
911 0.3
912 0.28
913 0.28
914 0.24
915 0.22
916 0.21
917 0.18
918 0.17
919 0.17
920 0.14
921 0.11
922 0.11
923 0.11
924 0.09
925 0.08
926 0.09
927 0.08
928 0.08
929 0.09
930 0.08
931 0.09
932 0.11
933 0.12
934 0.12
935 0.15
936 0.21
937 0.25
938 0.31
939 0.34
940 0.42
941 0.43
942 0.46
943 0.46
944 0.47
945 0.49
946 0.44
947 0.42
948 0.35
949 0.35
950 0.34
951 0.34
952 0.31
953 0.3
954 0.3
955 0.3
956 0.28
957 0.25
958 0.26
959 0.23
960 0.21
961 0.18
962 0.22
963 0.23
964 0.25
965 0.28
966 0.28
967 0.3
968 0.31
969 0.35
970 0.35
971 0.41
972 0.48
973 0.55
974 0.62
975 0.69
976 0.73
977 0.77
978 0.76
979 0.73
980 0.71
981 0.66
982 0.57
983 0.51
984 0.44
985 0.34
986 0.3
987 0.23
988 0.17
989 0.15
990 0.15
991 0.15
992 0.15
993 0.19
994 0.24
995 0.26
996 0.3
997 0.37
998 0.46
999 0.53
1000 0.58
1001 0.6
1002 0.59
1003 0.66
1004 0.69
1005 0.67
1006 0.65
1007 0.63
1008 0.59
1009 0.53
1010 0.49
1011 0.41
1012 0.35
1013 0.3
1014 0.26
1015 0.19
1016 0.17
1017 0.16
1018 0.18
1019 0.2
1020 0.17
1021 0.18
1022 0.19
1023 0.26
1024 0.33
1025 0.37
1026 0.37
1027 0.43
1028 0.47
1029 0.5
1030 0.53
1031 0.51
1032 0.54
1033 0.57
1034 0.61
1035 0.62
1036 0.63
1037 0.67
1038 0.63
1039 0.65
1040 0.63
1041 0.66
1042 0.69
1043 0.71
1044 0.75
1045 0.75
1046 0.82
1047 0.85
1048 0.88
1049 0.89
1050 0.88
1051 0.87
1052 0.84
1053 0.78
1054 0.73
1055 0.7
1056 0.64
1057 0.6
1058 0.55
1059 0.48
1060 0.41
1061 0.38
1062 0.33
1063 0.27
1064 0.24
1065 0.21
1066 0.19
1067 0.18
1068 0.19
1069 0.22
1070 0.23
1071 0.22
1072 0.21
1073 0.17
1074 0.16
1075 0.24
1076 0.29
1077 0.35
1078 0.37
1079 0.44
1080 0.51
1081 0.56
1082 0.58
1083 0.54
1084 0.54
1085 0.51
1086 0.51
1087 0.5
1088 0.51
1089 0.49
1090 0.54
1091 0.57
1092 0.54
1093 0.55
1094 0.61
1095 0.59
1096 0.57
1097 0.6
1098 0.55
1099 0.58
1100 0.58
1101 0.6
1102 0.6
1103 0.59
1104 0.55
1105 0.51
1106 0.48
1107 0.39
1108 0.32
1109 0.23
1110 0.16
1111 0.14
1112 0.11
1113 0.1
1114 0.1
1115 0.1
1116 0.09
1117 0.08
1118 0.08