Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9Q4U3

Protein Details
Accession A0A1J9Q4U3    Localization Confidence High Confidence Score 24.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
44-68WGDSNPPKKRRLSPQCDQNPPKQPAHydrophilic
266-285EETERKQKLKEQKAKEKQLAHydrophilic
446-477SSQPQQPQQQPQQQPKRQRKPKPVARPIPPVDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
235-282PKRAPKPSTVDKELRDAERQAIKERRQREKEEETERKQKLKEQKAKEK
462-467RQRKPK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR042530  EME1/EME2_C  
IPR006166  ERCC4_domain  
IPR033310  Mms4/EME1/EME2  
IPR047521  XPF_nuclease_EME1_ascomycetes  
Gene Ontology GO:0048476  C:Holliday junction resolvase complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0051321  P:meiotic cell cycle  
Pfam View protein in Pfam  
PF02732  ERCC4  
CDD cd20085  XPF_nuclease_Mms4  
Amino Acid Sequences MPEVISLLSSPLEARPSRPSPAASQRQSRASRIAILSDDSIFDWGDSNPPKKRRLSPQCDQNPPKQPAPPPKTDLLLQFSDLEESIISSPVTRLNNNYTSTTNNSKWNGDISDPIEYTSPAVDPTTTHGEDNHTRNSPDVVTIDDSVIEFDELSSPRGPLHRLPPPALKSHLSDRTASLLSRIQTRPSSVPTKPKPTTHVSKSIASSSRIRASNPIQTTDTNEDSLPSMLPELKPKRAPKPSTVDKELRDAERQAIKERRQREKEEETERKQKLKEQKAKEKQLAADLAEANKRKFDKKISTPEMIIDMSSTFEESSVGNQVTEYMRHLGVEKHFVSTRIPNLVTWRRKITAQYNNDAAHWEPCPLSIKRENHVLCLLSAQDFVDLSIANAEGDSTLESHVLRLKRRYPSCKPIYLIEGLTTWMRKNNNSKNRVYQASVLRELESSSQPQQPQQQPQQQPKRQRKPKPVARPIPPVDDDAIEDALLQLQVQHGCLIQHTAGSAESAEWIKNFTEHISTIPYRQELINLHDASFCMDVGQVKSGEDNADTYVRMLQEIQRVTAPISYGIATQYPTVGELVRQFKEQGPLLLEDVKKCANKSGVLTDARVGPAMSKRLCKVFTGLNPASTDI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.28
3 0.32
4 0.37
5 0.39
6 0.4
7 0.43
8 0.53
9 0.6
10 0.58
11 0.63
12 0.64
13 0.7
14 0.71
15 0.67
16 0.62
17 0.55
18 0.54
19 0.47
20 0.44
21 0.36
22 0.34
23 0.31
24 0.26
25 0.24
26 0.17
27 0.17
28 0.14
29 0.12
30 0.11
31 0.1
32 0.17
33 0.22
34 0.29
35 0.36
36 0.43
37 0.5
38 0.56
39 0.64
40 0.68
41 0.73
42 0.75
43 0.77
44 0.82
45 0.85
46 0.88
47 0.85
48 0.83
49 0.82
50 0.79
51 0.74
52 0.69
53 0.68
54 0.68
55 0.7
56 0.68
57 0.63
58 0.61
59 0.59
60 0.56
61 0.52
62 0.46
63 0.41
64 0.34
65 0.3
66 0.27
67 0.25
68 0.22
69 0.17
70 0.11
71 0.11
72 0.1
73 0.1
74 0.09
75 0.08
76 0.09
77 0.15
78 0.18
79 0.18
80 0.21
81 0.27
82 0.33
83 0.35
84 0.37
85 0.33
86 0.35
87 0.39
88 0.42
89 0.38
90 0.4
91 0.4
92 0.39
93 0.38
94 0.38
95 0.34
96 0.28
97 0.29
98 0.24
99 0.27
100 0.25
101 0.25
102 0.22
103 0.2
104 0.19
105 0.15
106 0.13
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.08
111 0.13
112 0.2
113 0.2
114 0.2
115 0.2
116 0.26
117 0.32
118 0.36
119 0.37
120 0.33
121 0.32
122 0.33
123 0.34
124 0.28
125 0.24
126 0.2
127 0.17
128 0.16
129 0.17
130 0.16
131 0.14
132 0.13
133 0.11
134 0.11
135 0.08
136 0.06
137 0.05
138 0.09
139 0.1
140 0.12
141 0.12
142 0.12
143 0.14
144 0.16
145 0.19
146 0.19
147 0.26
148 0.31
149 0.34
150 0.38
151 0.45
152 0.46
153 0.47
154 0.46
155 0.41
156 0.37
157 0.41
158 0.45
159 0.39
160 0.37
161 0.34
162 0.34
163 0.33
164 0.3
165 0.24
166 0.2
167 0.19
168 0.25
169 0.25
170 0.25
171 0.25
172 0.29
173 0.29
174 0.31
175 0.37
176 0.33
177 0.43
178 0.46
179 0.54
180 0.55
181 0.55
182 0.55
183 0.56
184 0.61
185 0.57
186 0.59
187 0.53
188 0.53
189 0.51
190 0.52
191 0.47
192 0.41
193 0.39
194 0.33
195 0.36
196 0.33
197 0.32
198 0.32
199 0.33
200 0.38
201 0.36
202 0.35
203 0.3
204 0.3
205 0.34
206 0.33
207 0.31
208 0.24
209 0.22
210 0.19
211 0.18
212 0.18
213 0.13
214 0.09
215 0.08
216 0.09
217 0.09
218 0.18
219 0.21
220 0.26
221 0.32
222 0.37
223 0.46
224 0.53
225 0.57
226 0.55
227 0.6
228 0.64
229 0.65
230 0.67
231 0.63
232 0.55
233 0.57
234 0.53
235 0.46
236 0.39
237 0.33
238 0.31
239 0.31
240 0.31
241 0.32
242 0.36
243 0.41
244 0.44
245 0.52
246 0.57
247 0.58
248 0.63
249 0.63
250 0.64
251 0.65
252 0.7
253 0.7
254 0.66
255 0.7
256 0.67
257 0.64
258 0.56
259 0.55
260 0.55
261 0.57
262 0.6
263 0.6
264 0.69
265 0.74
266 0.8
267 0.78
268 0.71
269 0.62
270 0.56
271 0.48
272 0.37
273 0.3
274 0.23
275 0.2
276 0.21
277 0.21
278 0.17
279 0.19
280 0.2
281 0.19
282 0.22
283 0.27
284 0.32
285 0.39
286 0.49
287 0.51
288 0.52
289 0.5
290 0.47
291 0.42
292 0.33
293 0.24
294 0.14
295 0.09
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.04
300 0.04
301 0.05
302 0.05
303 0.06
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.09
309 0.08
310 0.09
311 0.09
312 0.09
313 0.08
314 0.09
315 0.1
316 0.11
317 0.12
318 0.17
319 0.16
320 0.17
321 0.17
322 0.18
323 0.19
324 0.19
325 0.2
326 0.18
327 0.18
328 0.17
329 0.23
330 0.32
331 0.34
332 0.34
333 0.36
334 0.33
335 0.34
336 0.38
337 0.4
338 0.41
339 0.41
340 0.41
341 0.42
342 0.41
343 0.4
344 0.37
345 0.29
346 0.21
347 0.17
348 0.14
349 0.1
350 0.1
351 0.15
352 0.14
353 0.19
354 0.25
355 0.28
356 0.29
357 0.38
358 0.37
359 0.35
360 0.36
361 0.31
362 0.23
363 0.21
364 0.2
365 0.11
366 0.11
367 0.09
368 0.07
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.05
373 0.04
374 0.05
375 0.05
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.03
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.05
385 0.06
386 0.06
387 0.11
388 0.14
389 0.18
390 0.23
391 0.29
392 0.38
393 0.46
394 0.54
395 0.58
396 0.65
397 0.68
398 0.68
399 0.63
400 0.57
401 0.53
402 0.46
403 0.38
404 0.28
405 0.22
406 0.17
407 0.17
408 0.15
409 0.12
410 0.14
411 0.16
412 0.2
413 0.3
414 0.39
415 0.48
416 0.54
417 0.58
418 0.62
419 0.66
420 0.64
421 0.56
422 0.52
423 0.5
424 0.49
425 0.48
426 0.4
427 0.34
428 0.31
429 0.3
430 0.26
431 0.21
432 0.19
433 0.19
434 0.22
435 0.23
436 0.26
437 0.34
438 0.38
439 0.45
440 0.51
441 0.57
442 0.61
443 0.71
444 0.78
445 0.77
446 0.81
447 0.83
448 0.85
449 0.86
450 0.88
451 0.88
452 0.89
453 0.92
454 0.92
455 0.92
456 0.9
457 0.87
458 0.87
459 0.79
460 0.75
461 0.66
462 0.57
463 0.47
464 0.38
465 0.31
466 0.23
467 0.2
468 0.13
469 0.11
470 0.09
471 0.08
472 0.07
473 0.06
474 0.05
475 0.07
476 0.07
477 0.08
478 0.09
479 0.09
480 0.09
481 0.1
482 0.12
483 0.09
484 0.09
485 0.09
486 0.09
487 0.08
488 0.09
489 0.08
490 0.06
491 0.08
492 0.09
493 0.09
494 0.09
495 0.1
496 0.1
497 0.11
498 0.12
499 0.11
500 0.13
501 0.13
502 0.14
503 0.2
504 0.2
505 0.23
506 0.25
507 0.25
508 0.23
509 0.23
510 0.26
511 0.22
512 0.26
513 0.32
514 0.29
515 0.29
516 0.29
517 0.28
518 0.27
519 0.24
520 0.18
521 0.1
522 0.1
523 0.12
524 0.13
525 0.16
526 0.14
527 0.13
528 0.14
529 0.15
530 0.15
531 0.13
532 0.13
533 0.12
534 0.13
535 0.13
536 0.13
537 0.15
538 0.14
539 0.14
540 0.15
541 0.17
542 0.22
543 0.24
544 0.24
545 0.23
546 0.24
547 0.24
548 0.24
549 0.21
550 0.15
551 0.15
552 0.14
553 0.13
554 0.13
555 0.13
556 0.13
557 0.12
558 0.12
559 0.11
560 0.11
561 0.11
562 0.1
563 0.11
564 0.17
565 0.23
566 0.24
567 0.26
568 0.27
569 0.3
570 0.36
571 0.36
572 0.32
573 0.29
574 0.3
575 0.31
576 0.35
577 0.33
578 0.28
579 0.3
580 0.32
581 0.32
582 0.31
583 0.35
584 0.32
585 0.35
586 0.38
587 0.41
588 0.42
589 0.42
590 0.42
591 0.38
592 0.37
593 0.34
594 0.3
595 0.23
596 0.2
597 0.24
598 0.3
599 0.32
600 0.34
601 0.37
602 0.43
603 0.45
604 0.43
605 0.41
606 0.42
607 0.45
608 0.49
609 0.47
610 0.44