Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9Q9U9

Protein Details
Accession A0A1J9Q9U9    Localization Confidence High Confidence Score 20.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
207-228DYSRRRFDDREHRRRRDRANEEBasic
302-328VMDSRERTRKPFRNRSPRNSRKRDIISHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
249-249K
251-266GTLNGGRGRERSKRER
308-324RTRKPFRNRSPRNSRKR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MEVASTLHPQPTNDLNPSTMDMSMDIDMDLDLGPLPEPEYIESEQVPNVSVEETTACSHLNEEPQFEKVHIRGVDELTTEDLKRYASEHFAVEEPSRIEWIDDTSANLVYSSADIGLQALATFSLQNSEEDPSPLTSLRLRTAKSLSTNPESVLQVRSAVKTDRKRQRAHESSRFYLMHPEHDPRERVRREFADRRRNGRRDDSDSDYSRRRFDDREHRRRRDRANEENFNDSMYDDDGGRSRARSGSKEGTLNGGRGRERSKRERRDDNELFPDDGPGSLGRLRGRSASPLRMEFDQEDPVMDSRERTRKPFRNRSPRNSRKRDIISGANEYAASDDSSERRELFPNKTTSSYLKKELFPKKTVASNHRRSDAFDAADETADLFSKHMPVPLMDGASSGEPSRKSAGHVELFPDKTDNNGISIRGAASEKQGISIRGASQGISIKGAASVRELFPSKYSGNEGKELFSDKLQGRGGRRRRAEDMFS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.33
3 0.33
4 0.35
5 0.32
6 0.25
7 0.2
8 0.16
9 0.16
10 0.16
11 0.14
12 0.11
13 0.09
14 0.09
15 0.09
16 0.08
17 0.06
18 0.05
19 0.06
20 0.06
21 0.06
22 0.07
23 0.08
24 0.09
25 0.1
26 0.15
27 0.16
28 0.18
29 0.19
30 0.19
31 0.19
32 0.18
33 0.18
34 0.13
35 0.13
36 0.11
37 0.1
38 0.09
39 0.1
40 0.11
41 0.12
42 0.12
43 0.12
44 0.12
45 0.14
46 0.16
47 0.22
48 0.22
49 0.25
50 0.25
51 0.27
52 0.28
53 0.27
54 0.29
55 0.21
56 0.28
57 0.24
58 0.25
59 0.26
60 0.27
61 0.28
62 0.24
63 0.24
64 0.2
65 0.21
66 0.19
67 0.17
68 0.15
69 0.14
70 0.14
71 0.14
72 0.14
73 0.16
74 0.18
75 0.18
76 0.19
77 0.19
78 0.21
79 0.21
80 0.21
81 0.18
82 0.17
83 0.17
84 0.15
85 0.14
86 0.12
87 0.14
88 0.14
89 0.13
90 0.14
91 0.14
92 0.15
93 0.14
94 0.14
95 0.11
96 0.08
97 0.08
98 0.07
99 0.06
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.06
112 0.07
113 0.08
114 0.09
115 0.12
116 0.12
117 0.13
118 0.15
119 0.13
120 0.14
121 0.14
122 0.14
123 0.15
124 0.16
125 0.21
126 0.24
127 0.24
128 0.26
129 0.29
130 0.31
131 0.33
132 0.36
133 0.36
134 0.36
135 0.36
136 0.33
137 0.34
138 0.31
139 0.28
140 0.24
141 0.19
142 0.18
143 0.18
144 0.18
145 0.17
146 0.2
147 0.27
148 0.34
149 0.44
150 0.5
151 0.56
152 0.61
153 0.66
154 0.73
155 0.75
156 0.76
157 0.76
158 0.73
159 0.68
160 0.69
161 0.61
162 0.51
163 0.49
164 0.4
165 0.35
166 0.31
167 0.33
168 0.3
169 0.34
170 0.36
171 0.32
172 0.41
173 0.4
174 0.39
175 0.41
176 0.43
177 0.48
178 0.55
179 0.61
180 0.62
181 0.63
182 0.69
183 0.73
184 0.73
185 0.69
186 0.68
187 0.65
188 0.62
189 0.61
190 0.6
191 0.56
192 0.54
193 0.53
194 0.5
195 0.45
196 0.4
197 0.37
198 0.32
199 0.28
200 0.33
201 0.41
202 0.46
203 0.56
204 0.64
205 0.71
206 0.77
207 0.82
208 0.82
209 0.82
210 0.79
211 0.79
212 0.78
213 0.77
214 0.71
215 0.67
216 0.59
217 0.48
218 0.39
219 0.28
220 0.19
221 0.11
222 0.09
223 0.05
224 0.06
225 0.07
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.09
230 0.12
231 0.14
232 0.16
233 0.2
234 0.24
235 0.26
236 0.27
237 0.26
238 0.28
239 0.26
240 0.26
241 0.21
242 0.2
243 0.18
244 0.18
245 0.23
246 0.25
247 0.31
248 0.4
249 0.49
250 0.57
251 0.64
252 0.72
253 0.72
254 0.76
255 0.73
256 0.68
257 0.64
258 0.56
259 0.49
260 0.39
261 0.35
262 0.25
263 0.2
264 0.15
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.1
269 0.11
270 0.12
271 0.13
272 0.14
273 0.15
274 0.21
275 0.23
276 0.27
277 0.28
278 0.29
279 0.3
280 0.29
281 0.3
282 0.25
283 0.23
284 0.19
285 0.17
286 0.15
287 0.14
288 0.14
289 0.14
290 0.12
291 0.12
292 0.16
293 0.24
294 0.26
295 0.31
296 0.41
297 0.49
298 0.6
299 0.7
300 0.74
301 0.77
302 0.85
303 0.89
304 0.9
305 0.92
306 0.92
307 0.9
308 0.83
309 0.81
310 0.78
311 0.73
312 0.66
313 0.63
314 0.56
315 0.51
316 0.48
317 0.38
318 0.32
319 0.26
320 0.22
321 0.15
322 0.11
323 0.07
324 0.08
325 0.09
326 0.11
327 0.13
328 0.13
329 0.14
330 0.2
331 0.24
332 0.28
333 0.34
334 0.37
335 0.38
336 0.39
337 0.4
338 0.4
339 0.43
340 0.42
341 0.42
342 0.41
343 0.43
344 0.5
345 0.58
346 0.59
347 0.54
348 0.54
349 0.5
350 0.52
351 0.55
352 0.56
353 0.57
354 0.6
355 0.63
356 0.64
357 0.6
358 0.57
359 0.57
360 0.51
361 0.42
362 0.33
363 0.3
364 0.25
365 0.25
366 0.22
367 0.16
368 0.11
369 0.1
370 0.09
371 0.07
372 0.07
373 0.1
374 0.11
375 0.12
376 0.13
377 0.13
378 0.17
379 0.19
380 0.19
381 0.16
382 0.15
383 0.14
384 0.14
385 0.15
386 0.11
387 0.12
388 0.12
389 0.14
390 0.17
391 0.17
392 0.19
393 0.24
394 0.31
395 0.32
396 0.32
397 0.35
398 0.39
399 0.39
400 0.37
401 0.33
402 0.26
403 0.24
404 0.27
405 0.23
406 0.19
407 0.19
408 0.19
409 0.18
410 0.19
411 0.17
412 0.15
413 0.16
414 0.13
415 0.16
416 0.2
417 0.19
418 0.22
419 0.24
420 0.23
421 0.24
422 0.26
423 0.24
424 0.23
425 0.24
426 0.2
427 0.21
428 0.24
429 0.22
430 0.21
431 0.19
432 0.15
433 0.18
434 0.19
435 0.16
436 0.15
437 0.17
438 0.17
439 0.23
440 0.24
441 0.23
442 0.24
443 0.28
444 0.26
445 0.25
446 0.31
447 0.32
448 0.34
449 0.39
450 0.38
451 0.35
452 0.37
453 0.39
454 0.34
455 0.28
456 0.32
457 0.27
458 0.33
459 0.36
460 0.39
461 0.43
462 0.52
463 0.6
464 0.62
465 0.69
466 0.69
467 0.71