Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9PDT7

Protein Details
Accession A0A1J9PDT7    Localization Confidence Low Confidence Score 5.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
261-290DALTSKPTNKPQPKKGKFLRLKECVRRWIVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) extr 19, plas 2, nucl 1.5, cyto_nucl 1.5, mito 1, pero 1, E.R. 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018392  LysM_dom  
IPR036779  LysM_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF01476  LysM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51782  LYSM  
CDD cd00118  LysM  
Amino Acid Sequences MNLQTALVVLAVLGVNVNGLPALEPKALRPPLIEINALDCEMRKPFCTQPEETGRTMSQQNSWTQRPLRSLQPTQRPTTETRPKTTEGFGLQPKPNSPKDAPPSLDTDIGTLKSTTATPSAQSSATPFGKSLDARAPPTTTHGGANFRPVTLVSGRIINDETPSRRVTTWPSQAAGGVIKRAIPSSTAAPPSSPPMRTVCLHYDVTLEGDTCDTITAQNRLTLDDLKAINNSPANICATMKPGQKYCVNDMRWLGGEHGPDALTSKPTNKPQPKKGKFLRLKECVRRWIVGPTDTCESIAKVAGISVKELVALNPEDLGDCKAISGTLCLRAATPFPPPQNASP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.04
2 0.04
3 0.04
4 0.05
5 0.03
6 0.04
7 0.05
8 0.07
9 0.11
10 0.13
11 0.14
12 0.16
13 0.26
14 0.28
15 0.27
16 0.27
17 0.28
18 0.33
19 0.36
20 0.36
21 0.26
22 0.29
23 0.3
24 0.28
25 0.23
26 0.16
27 0.16
28 0.19
29 0.2
30 0.17
31 0.21
32 0.26
33 0.34
34 0.39
35 0.4
36 0.45
37 0.53
38 0.56
39 0.52
40 0.51
41 0.43
42 0.4
43 0.41
44 0.34
45 0.29
46 0.28
47 0.34
48 0.37
49 0.4
50 0.43
51 0.44
52 0.46
53 0.47
54 0.46
55 0.49
56 0.5
57 0.56
58 0.58
59 0.64
60 0.65
61 0.64
62 0.63
63 0.58
64 0.55
65 0.57
66 0.59
67 0.53
68 0.54
69 0.54
70 0.53
71 0.52
72 0.49
73 0.43
74 0.35
75 0.36
76 0.35
77 0.38
78 0.38
79 0.37
80 0.4
81 0.41
82 0.41
83 0.41
84 0.39
85 0.4
86 0.44
87 0.49
88 0.47
89 0.43
90 0.45
91 0.41
92 0.4
93 0.31
94 0.26
95 0.2
96 0.19
97 0.17
98 0.12
99 0.1
100 0.09
101 0.1
102 0.1
103 0.1
104 0.1
105 0.1
106 0.12
107 0.14
108 0.13
109 0.13
110 0.14
111 0.18
112 0.18
113 0.18
114 0.16
115 0.16
116 0.18
117 0.18
118 0.19
119 0.19
120 0.2
121 0.22
122 0.23
123 0.23
124 0.2
125 0.24
126 0.24
127 0.19
128 0.18
129 0.18
130 0.2
131 0.19
132 0.25
133 0.22
134 0.19
135 0.18
136 0.17
137 0.17
138 0.14
139 0.15
140 0.09
141 0.12
142 0.12
143 0.13
144 0.13
145 0.11
146 0.12
147 0.13
148 0.15
149 0.15
150 0.15
151 0.16
152 0.16
153 0.17
154 0.21
155 0.26
156 0.31
157 0.3
158 0.29
159 0.28
160 0.28
161 0.27
162 0.23
163 0.15
164 0.09
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.07
171 0.08
172 0.1
173 0.14
174 0.15
175 0.15
176 0.15
177 0.16
178 0.19
179 0.21
180 0.19
181 0.17
182 0.18
183 0.21
184 0.21
185 0.24
186 0.23
187 0.24
188 0.24
189 0.23
190 0.21
191 0.18
192 0.19
193 0.15
194 0.12
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.05
201 0.06
202 0.08
203 0.1
204 0.1
205 0.13
206 0.13
207 0.14
208 0.15
209 0.16
210 0.14
211 0.17
212 0.17
213 0.16
214 0.17
215 0.16
216 0.17
217 0.16
218 0.16
219 0.12
220 0.13
221 0.14
222 0.14
223 0.14
224 0.12
225 0.15
226 0.21
227 0.24
228 0.26
229 0.27
230 0.3
231 0.33
232 0.37
233 0.4
234 0.43
235 0.4
236 0.4
237 0.39
238 0.38
239 0.35
240 0.31
241 0.27
242 0.21
243 0.2
244 0.17
245 0.17
246 0.14
247 0.12
248 0.13
249 0.11
250 0.12
251 0.12
252 0.17
253 0.23
254 0.3
255 0.41
256 0.5
257 0.58
258 0.66
259 0.77
260 0.78
261 0.82
262 0.84
263 0.85
264 0.84
265 0.84
266 0.84
267 0.82
268 0.85
269 0.85
270 0.83
271 0.8
272 0.74
273 0.66
274 0.58
275 0.56
276 0.51
277 0.47
278 0.42
279 0.37
280 0.37
281 0.36
282 0.35
283 0.28
284 0.24
285 0.2
286 0.19
287 0.15
288 0.11
289 0.12
290 0.14
291 0.13
292 0.14
293 0.13
294 0.12
295 0.13
296 0.13
297 0.12
298 0.13
299 0.14
300 0.13
301 0.12
302 0.12
303 0.12
304 0.13
305 0.15
306 0.11
307 0.1
308 0.1
309 0.1
310 0.1
311 0.1
312 0.13
313 0.14
314 0.19
315 0.2
316 0.2
317 0.21
318 0.22
319 0.24
320 0.22
321 0.27
322 0.28
323 0.31
324 0.37