Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9Q3M0

Protein Details
Accession A0A1J9Q3M0    Localization Confidence High Confidence Score 17.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
379-402TPTAENTRPKRTGKKRSYNDSSFVHydrophilic
423-447SEEGGRGPGKKKRKKDHISGVSPSLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
427-437GRGPGKKKRKK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013942  Mediator_Med19_fun  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF08633  Rox3  
Amino Acid Sequences MSDVPQSSSSHTGPPPSPSSPAVDPAQSRQLHQQNRSKDQTPHTPTSPPLMSVSAQNYASSFSTTQTSPAQIPRPASLSSPPSSVAMSTQVSQQPTVTSTTSFPTPASSVGGHFANNHTMDEAEGVSKNATADAQKNGESSIGKESGLDFMDIDPSEHRRTDHDRQKRSPGGNLDENTMDLDYRTASSSQEEEMSLAALQKDIGTAFHLCKSSYTASGPNPNLDIVSLYGLGPVAASVARTDPVTGEKINRLRKSYEGKIKGLGLAGRNKPVKVEPGAPGGLRYLTLWPEEEWKNQKVYGKDIKVAEPDSSFFRQQLKAMKMEPGNLPNHEFWEDALGHEKPPKVIAAADVSMAKTAGTVPGSIRHPMHTNGTPPMVSTPTAENTRPKRTGKKRSYNDSSFVGYGEGFPDDEADLESGRYSNSEEGGRGPGKKKRKKDHISGVSPSLTERGGSYGVGMFGVGAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.41
3 0.38
4 0.4
5 0.36
6 0.4
7 0.36
8 0.38
9 0.35
10 0.34
11 0.34
12 0.35
13 0.42
14 0.37
15 0.37
16 0.42
17 0.49
18 0.52
19 0.59
20 0.63
21 0.63
22 0.72
23 0.76
24 0.72
25 0.7
26 0.69
27 0.7
28 0.7
29 0.68
30 0.61
31 0.58
32 0.54
33 0.54
34 0.48
35 0.39
36 0.33
37 0.29
38 0.26
39 0.27
40 0.29
41 0.26
42 0.25
43 0.23
44 0.21
45 0.21
46 0.21
47 0.19
48 0.17
49 0.13
50 0.16
51 0.16
52 0.19
53 0.19
54 0.21
55 0.21
56 0.27
57 0.31
58 0.32
59 0.34
60 0.33
61 0.34
62 0.32
63 0.31
64 0.31
65 0.3
66 0.29
67 0.28
68 0.26
69 0.24
70 0.23
71 0.22
72 0.17
73 0.16
74 0.15
75 0.14
76 0.19
77 0.21
78 0.22
79 0.22
80 0.22
81 0.19
82 0.19
83 0.21
84 0.17
85 0.15
86 0.15
87 0.17
88 0.17
89 0.17
90 0.15
91 0.15
92 0.15
93 0.14
94 0.16
95 0.14
96 0.13
97 0.15
98 0.16
99 0.14
100 0.14
101 0.15
102 0.17
103 0.17
104 0.16
105 0.14
106 0.13
107 0.13
108 0.13
109 0.12
110 0.09
111 0.08
112 0.09
113 0.08
114 0.09
115 0.09
116 0.08
117 0.09
118 0.09
119 0.12
120 0.15
121 0.17
122 0.17
123 0.17
124 0.17
125 0.18
126 0.17
127 0.16
128 0.17
129 0.15
130 0.14
131 0.14
132 0.15
133 0.15
134 0.15
135 0.14
136 0.09
137 0.08
138 0.11
139 0.11
140 0.11
141 0.1
142 0.14
143 0.16
144 0.17
145 0.17
146 0.19
147 0.28
148 0.37
149 0.45
150 0.51
151 0.58
152 0.61
153 0.7
154 0.72
155 0.67
156 0.62
157 0.58
158 0.54
159 0.52
160 0.48
161 0.41
162 0.34
163 0.32
164 0.26
165 0.2
166 0.14
167 0.08
168 0.07
169 0.05
170 0.06
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.09
175 0.1
176 0.1
177 0.1
178 0.1
179 0.09
180 0.08
181 0.08
182 0.07
183 0.07
184 0.06
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.06
192 0.07
193 0.08
194 0.11
195 0.12
196 0.11
197 0.12
198 0.15
199 0.15
200 0.15
201 0.16
202 0.16
203 0.18
204 0.25
205 0.25
206 0.22
207 0.21
208 0.2
209 0.18
210 0.15
211 0.13
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.04
220 0.04
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.04
226 0.04
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.07
231 0.09
232 0.09
233 0.11
234 0.16
235 0.23
236 0.3
237 0.32
238 0.33
239 0.33
240 0.38
241 0.43
242 0.46
243 0.49
244 0.46
245 0.45
246 0.44
247 0.43
248 0.38
249 0.32
250 0.26
251 0.2
252 0.22
253 0.23
254 0.27
255 0.28
256 0.27
257 0.27
258 0.27
259 0.27
260 0.23
261 0.25
262 0.21
263 0.23
264 0.24
265 0.23
266 0.22
267 0.18
268 0.16
269 0.12
270 0.11
271 0.08
272 0.08
273 0.09
274 0.1
275 0.1
276 0.15
277 0.17
278 0.22
279 0.26
280 0.27
281 0.28
282 0.29
283 0.33
284 0.29
285 0.35
286 0.38
287 0.36
288 0.38
289 0.38
290 0.38
291 0.37
292 0.37
293 0.3
294 0.22
295 0.21
296 0.21
297 0.22
298 0.2
299 0.19
300 0.22
301 0.22
302 0.24
303 0.31
304 0.3
305 0.3
306 0.31
307 0.35
308 0.32
309 0.34
310 0.34
311 0.31
312 0.31
313 0.29
314 0.31
315 0.26
316 0.28
317 0.26
318 0.22
319 0.17
320 0.19
321 0.17
322 0.14
323 0.18
324 0.16
325 0.16
326 0.2
327 0.21
328 0.17
329 0.18
330 0.18
331 0.14
332 0.14
333 0.15
334 0.15
335 0.14
336 0.15
337 0.15
338 0.14
339 0.13
340 0.13
341 0.1
342 0.07
343 0.06
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.09
348 0.15
349 0.17
350 0.21
351 0.21
352 0.22
353 0.24
354 0.26
355 0.31
356 0.29
357 0.3
358 0.3
359 0.32
360 0.29
361 0.26
362 0.27
363 0.22
364 0.19
365 0.18
366 0.18
367 0.21
368 0.24
369 0.26
370 0.32
371 0.38
372 0.46
373 0.51
374 0.54
375 0.6
376 0.67
377 0.75
378 0.78
379 0.82
380 0.83
381 0.87
382 0.9
383 0.85
384 0.78
385 0.71
386 0.63
387 0.52
388 0.43
389 0.34
390 0.24
391 0.19
392 0.15
393 0.12
394 0.09
395 0.08
396 0.09
397 0.08
398 0.08
399 0.09
400 0.08
401 0.08
402 0.08
403 0.09
404 0.08
405 0.08
406 0.09
407 0.1
408 0.11
409 0.13
410 0.15
411 0.15
412 0.17
413 0.24
414 0.27
415 0.31
416 0.35
417 0.41
418 0.5
419 0.59
420 0.68
421 0.72
422 0.8
423 0.84
424 0.88
425 0.91
426 0.91
427 0.89
428 0.84
429 0.79
430 0.69
431 0.59
432 0.49
433 0.4
434 0.29
435 0.22
436 0.17
437 0.15
438 0.14
439 0.13
440 0.14
441 0.13
442 0.13
443 0.13
444 0.12