Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8BH42

Protein Details
Accession G8BH42    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-26QSNRTSNKVGHRRSNSRHNGSTSHydrophilic
414-438QEQEEKKKQEEKRKQEEKQKQDEKQBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045117  ATXN2-like  
IPR009604  LsmAD_domain  
IPR025852  SM_dom_ATX  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06741  LsmAD  
PF14438  SM-ATX  
Amino Acid Sequences MKAQSNRTSNKVGHRRSNSRHNGSTSGLGGRASPVAINPKSSSQDGAIGQPPNSTDELGDNRLVFLIAKSIGKPCVITTTDGSRYKGLLLTVDWETPKAKSPSSVVIKSPQLVGKSLINEKNNLDKLPEHLVVQGKDLIDIEVDVDISEPIKHYAKEEFKTDSDISNNRDKVKSFEERELVKWEPEEEEGLQKLTLEDEATSKNGNTHWDQFKVNEEKFGVESTYDEHLYTTRIDKSAPDYEQRLARANQIAAEIEGQVTTDRHILEERGVQVDDSGMDEEDKYSGVDRRGDELMAALKLNNKASKGDNAPSATHDTSKYATPRQRAANYHNDPAIVSSSATNKKSDKRAAPDSVPAKPQVPNESFRLNAESEIHSLRQFSANFKIPHKMPQDLLPILAKDKLKQDEILKKQQQEQEEKKKQEEKRKQEEKQKQDEKQSTSHGFDASAHSAETKATPSPTPQSVPQAPTTSSEAQQSPARPHTEKKTSKVFKLNPNAASFTPSLPHNTLTSPPKAVFNNQGPVHSPHTINNRPYSSNSSSQGSIKKHYHISAQDFFGGANNVPTREKQAQKLKELKTGFNMFNTTKSKAEDKSSVILEKTFHTPPTWDATIEETHEALFPRAMFKSPSFMPSPMVPATAPMPYNFQMPPQPQFPQQVAPIWFMPPPQNFGMMPNPYQNGQPGRRFK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.78
3 0.8
4 0.86
5 0.85
6 0.84
7 0.82
8 0.76
9 0.71
10 0.64
11 0.59
12 0.5
13 0.42
14 0.34
15 0.27
16 0.23
17 0.2
18 0.18
19 0.14
20 0.12
21 0.13
22 0.21
23 0.22
24 0.25
25 0.26
26 0.3
27 0.34
28 0.35
29 0.34
30 0.27
31 0.31
32 0.29
33 0.31
34 0.32
35 0.3
36 0.29
37 0.29
38 0.28
39 0.25
40 0.25
41 0.21
42 0.16
43 0.19
44 0.23
45 0.25
46 0.27
47 0.23
48 0.22
49 0.22
50 0.22
51 0.16
52 0.12
53 0.12
54 0.12
55 0.13
56 0.15
57 0.18
58 0.19
59 0.2
60 0.2
61 0.18
62 0.22
63 0.22
64 0.24
65 0.24
66 0.3
67 0.38
68 0.41
69 0.42
70 0.36
71 0.35
72 0.34
73 0.32
74 0.25
75 0.19
76 0.16
77 0.17
78 0.18
79 0.2
80 0.19
81 0.18
82 0.19
83 0.18
84 0.25
85 0.24
86 0.23
87 0.24
88 0.27
89 0.35
90 0.41
91 0.44
92 0.39
93 0.42
94 0.44
95 0.42
96 0.43
97 0.36
98 0.3
99 0.28
100 0.28
101 0.25
102 0.27
103 0.34
104 0.36
105 0.35
106 0.36
107 0.37
108 0.44
109 0.43
110 0.39
111 0.33
112 0.28
113 0.3
114 0.34
115 0.32
116 0.24
117 0.25
118 0.3
119 0.28
120 0.29
121 0.28
122 0.21
123 0.21
124 0.2
125 0.16
126 0.11
127 0.1
128 0.09
129 0.06
130 0.06
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.09
138 0.12
139 0.13
140 0.14
141 0.23
142 0.29
143 0.32
144 0.34
145 0.36
146 0.34
147 0.39
148 0.39
149 0.32
150 0.3
151 0.32
152 0.33
153 0.37
154 0.4
155 0.38
156 0.39
157 0.37
158 0.37
159 0.4
160 0.45
161 0.4
162 0.43
163 0.45
164 0.45
165 0.46
166 0.47
167 0.41
168 0.34
169 0.3
170 0.25
171 0.21
172 0.2
173 0.19
174 0.15
175 0.16
176 0.16
177 0.16
178 0.15
179 0.13
180 0.12
181 0.1
182 0.1
183 0.07
184 0.07
185 0.08
186 0.1
187 0.11
188 0.11
189 0.11
190 0.12
191 0.13
192 0.16
193 0.18
194 0.24
195 0.27
196 0.29
197 0.3
198 0.3
199 0.37
200 0.4
201 0.37
202 0.33
203 0.29
204 0.28
205 0.27
206 0.27
207 0.19
208 0.12
209 0.12
210 0.11
211 0.13
212 0.12
213 0.11
214 0.11
215 0.11
216 0.12
217 0.13
218 0.14
219 0.13
220 0.13
221 0.13
222 0.14
223 0.19
224 0.25
225 0.25
226 0.25
227 0.26
228 0.28
229 0.31
230 0.31
231 0.3
232 0.25
233 0.26
234 0.26
235 0.24
236 0.22
237 0.2
238 0.18
239 0.14
240 0.14
241 0.1
242 0.07
243 0.07
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.07
249 0.07
250 0.08
251 0.09
252 0.09
253 0.1
254 0.13
255 0.14
256 0.13
257 0.13
258 0.12
259 0.12
260 0.11
261 0.1
262 0.07
263 0.07
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.05
271 0.06
272 0.09
273 0.11
274 0.14
275 0.15
276 0.18
277 0.18
278 0.18
279 0.16
280 0.14
281 0.14
282 0.11
283 0.1
284 0.07
285 0.1
286 0.12
287 0.14
288 0.15
289 0.14
290 0.15
291 0.17
292 0.22
293 0.22
294 0.22
295 0.24
296 0.24
297 0.24
298 0.24
299 0.27
300 0.23
301 0.21
302 0.19
303 0.17
304 0.16
305 0.19
306 0.19
307 0.21
308 0.25
309 0.27
310 0.32
311 0.36
312 0.4
313 0.4
314 0.43
315 0.47
316 0.47
317 0.46
318 0.41
319 0.36
320 0.3
321 0.27
322 0.23
323 0.12
324 0.09
325 0.08
326 0.12
327 0.17
328 0.18
329 0.19
330 0.21
331 0.25
332 0.31
333 0.36
334 0.36
335 0.38
336 0.44
337 0.45
338 0.44
339 0.46
340 0.43
341 0.39
342 0.36
343 0.3
344 0.26
345 0.25
346 0.25
347 0.25
348 0.25
349 0.25
350 0.26
351 0.27
352 0.26
353 0.24
354 0.24
355 0.18
356 0.16
357 0.15
358 0.14
359 0.14
360 0.14
361 0.15
362 0.12
363 0.12
364 0.12
365 0.14
366 0.14
367 0.15
368 0.19
369 0.25
370 0.27
371 0.28
372 0.32
373 0.28
374 0.36
375 0.36
376 0.33
377 0.27
378 0.3
379 0.34
380 0.3
381 0.3
382 0.23
383 0.2
384 0.19
385 0.22
386 0.17
387 0.14
388 0.19
389 0.21
390 0.21
391 0.24
392 0.3
393 0.35
394 0.41
395 0.49
396 0.49
397 0.48
398 0.53
399 0.54
400 0.53
401 0.53
402 0.56
403 0.57
404 0.62
405 0.62
406 0.62
407 0.67
408 0.68
409 0.69
410 0.7
411 0.69
412 0.71
413 0.79
414 0.8
415 0.82
416 0.86
417 0.84
418 0.85
419 0.83
420 0.78
421 0.77
422 0.77
423 0.7
424 0.63
425 0.61
426 0.53
427 0.46
428 0.42
429 0.33
430 0.26
431 0.24
432 0.24
433 0.19
434 0.16
435 0.13
436 0.12
437 0.12
438 0.12
439 0.12
440 0.1
441 0.09
442 0.1
443 0.11
444 0.14
445 0.18
446 0.2
447 0.21
448 0.22
449 0.28
450 0.31
451 0.33
452 0.33
453 0.32
454 0.3
455 0.3
456 0.33
457 0.28
458 0.25
459 0.26
460 0.23
461 0.23
462 0.26
463 0.26
464 0.25
465 0.28
466 0.32
467 0.31
468 0.35
469 0.41
470 0.48
471 0.52
472 0.52
473 0.58
474 0.59
475 0.63
476 0.68
477 0.66
478 0.65
479 0.7
480 0.71
481 0.64
482 0.61
483 0.58
484 0.48
485 0.45
486 0.36
487 0.27
488 0.22
489 0.19
490 0.2
491 0.19
492 0.2
493 0.17
494 0.18
495 0.23
496 0.26
497 0.28
498 0.26
499 0.26
500 0.29
501 0.3
502 0.32
503 0.34
504 0.34
505 0.4
506 0.38
507 0.39
508 0.37
509 0.4
510 0.41
511 0.36
512 0.32
513 0.29
514 0.38
515 0.43
516 0.44
517 0.47
518 0.45
519 0.44
520 0.47
521 0.49
522 0.45
523 0.43
524 0.42
525 0.38
526 0.37
527 0.39
528 0.43
529 0.38
530 0.4
531 0.37
532 0.39
533 0.41
534 0.41
535 0.43
536 0.43
537 0.47
538 0.45
539 0.43
540 0.39
541 0.35
542 0.33
543 0.28
544 0.23
545 0.15
546 0.16
547 0.15
548 0.16
549 0.17
550 0.18
551 0.24
552 0.31
553 0.35
554 0.39
555 0.48
556 0.54
557 0.62
558 0.7
559 0.67
560 0.67
561 0.65
562 0.59
563 0.57
564 0.56
565 0.48
566 0.41
567 0.42
568 0.35
569 0.39
570 0.41
571 0.36
572 0.32
573 0.34
574 0.37
575 0.36
576 0.41
577 0.38
578 0.38
579 0.4
580 0.4
581 0.4
582 0.36
583 0.34
584 0.29
585 0.27
586 0.28
587 0.25
588 0.23
589 0.22
590 0.22
591 0.23
592 0.3
593 0.28
594 0.24
595 0.23
596 0.25
597 0.26
598 0.27
599 0.25
600 0.18
601 0.17
602 0.18
603 0.18
604 0.16
605 0.15
606 0.13
607 0.16
608 0.17
609 0.18
610 0.2
611 0.2
612 0.25
613 0.25
614 0.29
615 0.29
616 0.29
617 0.3
618 0.28
619 0.32
620 0.27
621 0.26
622 0.22
623 0.2
624 0.21
625 0.22
626 0.21
627 0.17
628 0.21
629 0.21
630 0.24
631 0.23
632 0.25
633 0.29
634 0.32
635 0.36
636 0.36
637 0.39
638 0.4
639 0.46
640 0.45
641 0.42
642 0.41
643 0.43
644 0.41
645 0.41
646 0.37
647 0.33
648 0.31
649 0.28
650 0.33
651 0.28
652 0.31
653 0.28
654 0.31
655 0.29
656 0.32
657 0.38
658 0.35
659 0.35
660 0.36
661 0.37
662 0.34
663 0.36
664 0.38
665 0.39
666 0.43