Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8BGR9

Protein Details
Accession G8BGR9    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
190-249LKKIHKALNKKSKEKPKKNQSASVSKSSKRKKVSKEEKEKKEKKEKKENKEKKDKDLQKGBasic
256-284KGKGEKEKGKEKKAKEKKMQDGKAKEKENBasic
291-319GIEKGKENQEQKKKNRNRKPQAHEPGSKVBasic
345-376KNEVSGVSKSRRRHRNRKKRGEKKEGDTPKGEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
191-311KKIHKALNKKSKEKPKKNQSASVSKSSKRKKVSKEEKEKKEKKEKKENKEKKDKDLQKGKEKGKGKGKGEKEKGKEKKAKEKKMQDGKAKEKENVKGVDNGIEKGKENQEQKKKNRNRKPQ
353-369KSRRRHRNRKKRGEKKE
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR039722  Upf3  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MTSIAPSRAPETAISSAAPKRNNRTNHNLEGTSTTKLSSKRTSQDELEQNVKLSLRLLPPGLKEDEFLNQLANIYPHHASKIQLHYFVQGSYPSTPFEVPVYSRAYVTFKNAKDSSEFCSFVKNKPFHDEKDSIIPIVEKAVFPKMITSDYIVDSKREPQKDKKLDNLEDDEIYKKFLLYLDKGVNEFDLKKIHKALNKKSKEKPKKNQSASVSKSSKRKKVSKEEKEKKEKKEKKENKEKKDKDLQKGKEKGKGKGKGEKEKGKEKKAKEKKMQDGKAKEKENVKGVDNGIEKGKENQEQKKKNRNRKPQAHEPGSKVATVASNGKDNNKSNETTPASKSENNKNEVSGVSKSRRRHRNRKKRGEKKEGDTPKGENNASTTPIDFKPIKILTKKDLSEN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.24
3 0.29
4 0.34
5 0.39
6 0.4
7 0.46
8 0.53
9 0.61
10 0.64
11 0.68
12 0.71
13 0.74
14 0.74
15 0.66
16 0.59
17 0.57
18 0.51
19 0.44
20 0.35
21 0.27
22 0.25
23 0.27
24 0.32
25 0.34
26 0.39
27 0.44
28 0.5
29 0.55
30 0.54
31 0.61
32 0.62
33 0.6
34 0.57
35 0.5
36 0.44
37 0.41
38 0.37
39 0.28
40 0.21
41 0.21
42 0.18
43 0.2
44 0.22
45 0.23
46 0.24
47 0.29
48 0.31
49 0.26
50 0.25
51 0.24
52 0.25
53 0.24
54 0.22
55 0.18
56 0.15
57 0.15
58 0.15
59 0.14
60 0.11
61 0.13
62 0.14
63 0.14
64 0.16
65 0.17
66 0.18
67 0.25
68 0.33
69 0.33
70 0.35
71 0.35
72 0.35
73 0.34
74 0.33
75 0.27
76 0.18
77 0.18
78 0.17
79 0.18
80 0.15
81 0.16
82 0.16
83 0.16
84 0.16
85 0.15
86 0.14
87 0.17
88 0.2
89 0.19
90 0.19
91 0.2
92 0.22
93 0.21
94 0.26
95 0.3
96 0.27
97 0.34
98 0.34
99 0.34
100 0.34
101 0.35
102 0.34
103 0.31
104 0.32
105 0.24
106 0.33
107 0.34
108 0.36
109 0.43
110 0.41
111 0.37
112 0.44
113 0.48
114 0.42
115 0.48
116 0.45
117 0.38
118 0.43
119 0.41
120 0.34
121 0.29
122 0.26
123 0.19
124 0.19
125 0.17
126 0.09
127 0.1
128 0.13
129 0.12
130 0.12
131 0.13
132 0.12
133 0.12
134 0.13
135 0.13
136 0.13
137 0.14
138 0.17
139 0.16
140 0.16
141 0.16
142 0.23
143 0.28
144 0.31
145 0.35
146 0.41
147 0.51
148 0.6
149 0.62
150 0.64
151 0.65
152 0.63
153 0.62
154 0.57
155 0.48
156 0.39
157 0.37
158 0.3
159 0.21
160 0.2
161 0.15
162 0.1
163 0.09
164 0.11
165 0.13
166 0.12
167 0.17
168 0.18
169 0.19
170 0.2
171 0.19
172 0.18
173 0.16
174 0.15
175 0.12
176 0.15
177 0.14
178 0.16
179 0.19
180 0.23
181 0.25
182 0.33
183 0.42
184 0.47
185 0.54
186 0.59
187 0.64
188 0.71
189 0.79
190 0.82
191 0.82
192 0.83
193 0.85
194 0.83
195 0.83
196 0.78
197 0.77
198 0.7
199 0.69
200 0.62
201 0.56
202 0.6
203 0.59
204 0.6
205 0.59
206 0.62
207 0.62
208 0.69
209 0.76
210 0.78
211 0.82
212 0.86
213 0.88
214 0.91
215 0.9
216 0.88
217 0.88
218 0.86
219 0.84
220 0.85
221 0.85
222 0.85
223 0.88
224 0.89
225 0.88
226 0.91
227 0.86
228 0.83
229 0.84
230 0.81
231 0.79
232 0.79
233 0.76
234 0.75
235 0.8
236 0.75
237 0.72
238 0.69
239 0.67
240 0.67
241 0.67
242 0.62
243 0.62
244 0.67
245 0.69
246 0.73
247 0.73
248 0.7
249 0.72
250 0.74
251 0.76
252 0.75
253 0.72
254 0.74
255 0.77
256 0.81
257 0.81
258 0.83
259 0.83
260 0.86
261 0.87
262 0.85
263 0.84
264 0.83
265 0.81
266 0.74
267 0.69
268 0.64
269 0.61
270 0.58
271 0.52
272 0.44
273 0.4
274 0.37
275 0.39
276 0.34
277 0.31
278 0.27
279 0.25
280 0.24
281 0.24
282 0.28
283 0.28
284 0.33
285 0.41
286 0.5
287 0.58
288 0.68
289 0.74
290 0.8
291 0.85
292 0.89
293 0.9
294 0.91
295 0.92
296 0.91
297 0.91
298 0.92
299 0.9
300 0.85
301 0.79
302 0.76
303 0.66
304 0.57
305 0.45
306 0.36
307 0.28
308 0.24
309 0.24
310 0.18
311 0.22
312 0.23
313 0.28
314 0.34
315 0.36
316 0.41
317 0.41
318 0.41
319 0.37
320 0.45
321 0.45
322 0.43
323 0.42
324 0.41
325 0.41
326 0.45
327 0.49
328 0.51
329 0.54
330 0.54
331 0.52
332 0.47
333 0.44
334 0.41
335 0.38
336 0.32
337 0.32
338 0.36
339 0.41
340 0.48
341 0.56
342 0.66
343 0.72
344 0.79
345 0.83
346 0.85
347 0.91
348 0.94
349 0.96
350 0.96
351 0.97
352 0.97
353 0.95
354 0.91
355 0.9
356 0.89
357 0.84
358 0.77
359 0.69
360 0.66
361 0.63
362 0.56
363 0.47
364 0.41
365 0.38
366 0.37
367 0.34
368 0.28
369 0.26
370 0.26
371 0.31
372 0.27
373 0.25
374 0.31
375 0.35
376 0.42
377 0.44
378 0.49
379 0.5
380 0.58