FuNGI

A0A1J9QBM0

Protein Details

Accession

A0A1J9QBM0

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
17-51	GPNPPFMKARRPRADPLVRPKKRPIPRPPGQGQPG	Hydrophilic
531-550	GTDTPRKKPKSKHADAQPES	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
11-47	PARHPPGPNPPFMKARRPRADPLVRPKKRPIPRPPGQ
422-434	LKNFGKRVRKALQ
510-524	KKVAPRAARKRPGSP
534-574	TPRKKPKSKHADAQPESRPMSPGPSGQRKPGAAADQSSKKR

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MDSTPPNPPPPARHPPGPNPPFMKARRPRADPLVRPKKRPIPRPPGQGQPGAGPAANGTVAAPKQRHPHAVPRSHPSAIQSKPTIPSADDLAVNGFSGPLLSESYVDYPLVTTKRAWREGLKHHVAKFASKKSIDPRDESQFTRPVRLQRRDPRASNIGPAAEKDDQPPRKPGELNEVEREELEAKKAAREKERAENLAQIAPSAAVTQKKTNAPKPRTQQVFKSEMTPEEIAKARIKYEEALPWHLDDFDNKGTWVGNYEAAMSETYAMFVLQNDGKMRMVPIDKWYKFTTKSPFKTLTIEEAEKFMAKKIKDPRWFMEKEQDRAQKKALEEYAKQSKLFTGKREGFSGVGEGFEADDLDFEEDRFADDEEHVGIFDEDEDAKTAEKRIKEDQLKANIFDLKDEKMYDEEENQERKEKEALKNFGKRVRKALQRREKNFDYSSGSDANPYSDESSEDSETERLKEEQQKLEEERLKKEKGKESDRNSGASTKGTNTPSGWPKQTDPLNKKVAPRAARKRPGSPNLSEASGTDTPRKKPKSKHADAQPESRPMSPGPSGQRKPGAAADQSSKKRVRNGPSGSGSGSDGERGAGSGGEMSDSTTTGAMKLKLKSKAGTPRDSRAASPAGLVQARTGSGSGASSPARTSTPGPGPTTAMPTSTLTFPTPLEIHSAIPPTGIASAELLKIFRPRIGDSKENHRKFIAIVRDVSIYGKEDRLLRPGVLKEGSS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.67
2	0.72
3	0.79
4	0.75
5	0.74
6	0.69
7	0.68
8	0.68
9	0.65
10	0.66
11	0.64
12	0.71
13	0.72
14	0.73
15	0.74
16	0.76
17	0.81
18	0.8
19	0.82
20	0.82
21	0.79
22	0.79
23	0.82
24	0.82
25	0.81
26	0.82
27	0.81
28	0.81
29	0.84
30	0.87
31	0.83
32	0.83
33	0.79
34	0.73
35	0.64
36	0.56
37	0.5
38	0.41
39	0.35
40	0.25
41	0.19
42	0.16
43	0.14
44	0.11
45	0.08
46	0.11
47	0.13
48	0.19
49	0.2
50	0.24
51	0.32
52	0.37
53	0.45
54	0.45
55	0.54
56	0.58
57	0.66
58	0.67
59	0.67
60	0.68
61	0.61
62	0.57
63	0.52
64	0.5
65	0.44
66	0.46
67	0.41
68	0.39
69	0.41
70	0.43
71	0.4
72	0.32
73	0.3
74	0.27
75	0.26
76	0.22
77	0.19
78	0.18
79	0.16
80	0.15
81	0.13
82	0.09
83	0.06
84	0.06
85	0.06
86	0.05
87	0.07
88	0.07
89	0.08
90	0.09
91	0.12
92	0.13
93	0.12
94	0.11
95	0.1
96	0.15
97	0.16
98	0.16
99	0.17
100	0.24
101	0.32
102	0.37
103	0.39
104	0.41
105	0.48
106	0.56
107	0.64
108	0.65
109	0.62
110	0.6
111	0.63
112	0.57
113	0.56
114	0.55
115	0.52
116	0.51
117	0.46
118	0.5
119	0.53
120	0.62
121	0.58
122	0.55
123	0.53
124	0.54
125	0.57
126	0.55
127	0.51
128	0.48
129	0.46
130	0.47
131	0.45
132	0.46
133	0.52
134	0.57
135	0.62
136	0.65
137	0.74
138	0.76
139	0.75
140	0.73
141	0.71
142	0.65
143	0.59
144	0.51
145	0.44
146	0.36
147	0.33
148	0.31
149	0.26
150	0.25
151	0.24
152	0.31
153	0.34
154	0.37
155	0.43
156	0.42
157	0.45
158	0.46
159	0.44
160	0.45
161	0.48
162	0.5
163	0.49
164	0.47
165	0.41
166	0.39
167	0.39
168	0.3
169	0.22
170	0.19
171	0.17
172	0.15
173	0.2
174	0.25
175	0.29
176	0.34
177	0.39
178	0.42
179	0.48
180	0.54
181	0.52
182	0.49
183	0.48
184	0.43
185	0.39
186	0.34
187	0.24
188	0.18
189	0.15
190	0.13
191	0.1
192	0.1
193	0.11
194	0.13
195	0.17
196	0.22
197	0.28
198	0.35
199	0.43
200	0.51
201	0.54
202	0.6
203	0.64
204	0.69
205	0.7
206	0.67
207	0.67
208	0.63
209	0.63
210	0.55
211	0.52
212	0.44
213	0.37
214	0.37
215	0.31
216	0.24
217	0.21
218	0.22
219	0.2
220	0.22
221	0.22
222	0.18
223	0.19
224	0.2
225	0.18
226	0.19
227	0.22
228	0.22
229	0.25
230	0.24
231	0.24
232	0.23
233	0.22
234	0.19
235	0.15
236	0.16
237	0.15
238	0.14
239	0.13
240	0.13
241	0.13
242	0.13
243	0.14
244	0.11
245	0.1
246	0.09
247	0.1
248	0.1
249	0.1
250	0.1
251	0.08
252	0.07
253	0.06
254	0.06
255	0.06
256	0.05
257	0.05
258	0.05
259	0.07
260	0.07
261	0.09
262	0.1
263	0.11
264	0.11
265	0.11
266	0.11
267	0.12
268	0.13
269	0.13
270	0.19
271	0.28
272	0.28
273	0.32
274	0.34
275	0.34
276	0.35
277	0.39
278	0.43
279	0.43
280	0.46
281	0.48
282	0.5
283	0.48
284	0.49
285	0.44
286	0.39
287	0.34
288	0.32
289	0.26
290	0.23
291	0.22
292	0.2
293	0.19
294	0.16
295	0.16
296	0.15
297	0.21
298	0.29
299	0.38
300	0.45
301	0.49
302	0.5
303	0.54
304	0.56
305	0.51
306	0.52
307	0.49
308	0.45
309	0.49
310	0.53
311	0.47
312	0.46
313	0.47
314	0.41
315	0.35
316	0.37
317	0.33
318	0.29
319	0.29
320	0.33
321	0.39
322	0.37
323	0.36
324	0.31
325	0.29
326	0.32
327	0.33
328	0.3
329	0.3
330	0.33
331	0.35
332	0.36
333	0.35
334	0.28
335	0.25
336	0.24
337	0.15
338	0.1
339	0.08
340	0.06
341	0.05
342	0.05
343	0.05
344	0.03
345	0.03
346	0.03
347	0.05
348	0.05
349	0.05
350	0.05
351	0.05
352	0.05
353	0.06
354	0.06
355	0.05
356	0.05
357	0.06
358	0.06
359	0.06
360	0.06
361	0.05
362	0.05
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.05
369	0.05
370	0.06
371	0.06
372	0.09
373	0.11
374	0.12
375	0.16
376	0.19
377	0.28
378	0.32
379	0.38
380	0.42
381	0.48
382	0.48
383	0.45
384	0.43
385	0.37
386	0.33
387	0.28
388	0.23
389	0.15
390	0.15
391	0.14
392	0.13
393	0.11
394	0.13
395	0.12
396	0.12
397	0.15
398	0.19
399	0.22
400	0.22
401	0.26
402	0.25
403	0.26
404	0.3
405	0.32
406	0.34
407	0.4
408	0.46
409	0.48
410	0.55
411	0.57
412	0.59
413	0.59
414	0.54
415	0.53
416	0.55
417	0.57
418	0.59
419	0.67
420	0.7
421	0.74
422	0.78
423	0.78
424	0.73
425	0.69
426	0.61
427	0.53
428	0.48
429	0.39
430	0.36
431	0.3
432	0.27
433	0.22
434	0.21
435	0.19
436	0.14
437	0.13
438	0.11
439	0.09
440	0.11
441	0.11
442	0.14
443	0.13
444	0.13
445	0.13
446	0.14
447	0.14
448	0.14
449	0.15
450	0.13
451	0.17
452	0.25
453	0.3
454	0.34
455	0.35
456	0.39
457	0.39
458	0.46
459	0.47
460	0.42
461	0.44
462	0.45
463	0.47
464	0.47
465	0.52
466	0.52
467	0.55
468	0.62
469	0.64
470	0.64
471	0.7
472	0.67
473	0.62
474	0.55
475	0.49
476	0.4
477	0.33
478	0.27
479	0.19
480	0.24
481	0.23
482	0.23
483	0.22
484	0.27
485	0.32
486	0.35
487	0.35
488	0.32
489	0.32
490	0.38
491	0.44
492	0.47
493	0.46
494	0.5
495	0.55
496	0.55
497	0.57
498	0.57
499	0.57
500	0.55
501	0.6
502	0.62
503	0.65
504	0.71
505	0.71
506	0.73
507	0.75
508	0.77
509	0.72
510	0.64
511	0.59
512	0.52
513	0.49
514	0.4
515	0.3
516	0.29
517	0.26
518	0.25
519	0.27
520	0.3
521	0.34
522	0.43
523	0.5
524	0.51
525	0.57
526	0.67
527	0.7
528	0.74
529	0.79
530	0.79
531	0.83
532	0.8
533	0.79
534	0.73
535	0.68
536	0.62
537	0.53
538	0.44
539	0.34
540	0.34
541	0.28
542	0.28
543	0.3
544	0.39
545	0.4
546	0.43
547	0.48
548	0.44
549	0.44
550	0.43
551	0.4
552	0.32
553	0.33
554	0.35
555	0.39
556	0.42
557	0.46
558	0.46
559	0.45
560	0.51
561	0.56
562	0.57
563	0.58
564	0.62
565	0.63
566	0.63
567	0.62
568	0.53
569	0.47
570	0.39
571	0.31
572	0.24
573	0.16
574	0.12
575	0.1
576	0.09
577	0.08
578	0.08
579	0.06
580	0.06
581	0.06
582	0.06
583	0.06
584	0.06
585	0.07
586	0.07
587	0.07
588	0.08
589	0.07
590	0.08
591	0.09
592	0.12
593	0.15
594	0.19
595	0.24
596	0.31
597	0.36
598	0.4
599	0.4
600	0.45
601	0.52
602	0.55
603	0.6
604	0.58
605	0.59
606	0.63
607	0.63
608	0.56
609	0.5
610	0.45
611	0.36
612	0.32
613	0.27
614	0.23
615	0.23
616	0.22
617	0.18
618	0.16
619	0.16
620	0.15
621	0.13
622	0.09
623	0.09
624	0.09
625	0.09
626	0.11
627	0.12
628	0.12
629	0.12
630	0.14
631	0.14
632	0.16
633	0.18
634	0.22
635	0.29
636	0.34
637	0.36
638	0.36
639	0.38
640	0.37
641	0.4
642	0.33
643	0.26
644	0.24
645	0.23
646	0.24
647	0.22
648	0.23
649	0.18
650	0.19
651	0.18
652	0.2
653	0.19
654	0.17
655	0.21
656	0.2
657	0.2
658	0.22
659	0.25
660	0.21
661	0.2
662	0.2
663	0.15
664	0.15
665	0.14
666	0.1
667	0.09
668	0.11
669	0.13
670	0.14
671	0.13
672	0.14
673	0.18
674	0.19
675	0.2
676	0.22
677	0.25
678	0.33
679	0.4
680	0.45
681	0.46
682	0.56
683	0.65
684	0.64
685	0.63
686	0.55
687	0.49
688	0.44
689	0.48
690	0.46
691	0.4
692	0.39
693	0.38
694	0.39
695	0.38
696	0.37
697	0.3
698	0.24
699	0.21
700	0.21
701	0.21
702	0.25
703	0.27
704	0.3
705	0.31
706	0.3
707	0.33
708	0.34
709	0.38

A0A1J9QBM0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer