Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1J9QCJ2

Protein Details
Accession A0A1J9QCJ2    Localization Confidence High Confidence Score 22.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-36MPVKDEDRDRPRRSQREKDREQRRPRYRSPPSLFEGBasic
208-237PEEKRTTTVKSKDEKKKHRPKPISKESTSSBasic
614-633MAPPEPKRETPKPRDRPDAIBasic
859-889SDSASNISSSRRRRPKRRNERRTPVVFEEEEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-26RPRRSQREKDREQRRPR
217-246KSKDEKKKHRPKPISKESTSSVRRKSDEGS
280-300SKARPLGRSNSAKQSSRRKAK
869-880RRRRPKRRNERR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045138  MeCP2/MBD4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Amino Acid Sequences MPVKDEDRDRPRRSQREKDREQRRPRYRSPPSLFEGSLVEKEGSRTSDPRYERRTPRIFHRTRPSGPTKIDRELRRAATGDNRVNASNPSMPSADSNSRPSSACFLESKPSLPYPSFSKAHSKEAVGILGSRETLGHPKVDILTPEPTDITTGDETNGKARGEDISPTRQETASRRHSTHRSPPSPPLTNLDQQPTRRGTTTSGNNNPEEKRTTTVKSKDEKKKHRPKPISKESTSSVRRKSDEGSKTSSRGSGPSTPGKKLFEALQHHHNKSPTSGNPSKARPLGRSNSAKQSSRRKAKSSSPDQSSVKQVEIEVAPSAVDSDATSIAPNQQPTYQRPSMTIRAPAEPRRTPTPRGYGSPRRHSPPSALHSPSTGLPPPPPPPPNVPITIPKVDYLLNNGGLKYHVPKSFFGAGESANMPQDLFKPAAAASKLFEPYNKLLDDYGVVISKCGSLAVATGYRSVARRLLDRLEAVFARDISSESCQCVMCYPSEVSPEGVSWGEVLELVSGRQDLPAWPPFNIASKPGVADITDSNSDEPMQKMDMDIPEEFREHFVRQSRKTKHAVDKWLSCNNDQSGSPPDEIDDETLMFAMLTYLDNEQRELFSALLGISMAPPEPKRETPKPRDRPDAIVQSGAAIQRLYRLSTPPRDPETALYLLNNPGIHHVLATLAAISSDEWDILISGRFDGFLRSGADDDLPQTYSAPPVRGPRPGSARPTSQASNARLRNVSQPYGGLSNPSRTSTPAPASFGAPIYVDEDNEIAALAEIERDIYLGMEALEDAFEILHVKAEAIRGALRERGAGLQVANLTRRGGSGGVEVLSGTPALGIGGYGLNGNGWESSTDDGIDDGISEILPSDSASNISSSRRRRPKRRNERRTPVVFEEEEEDDGDIVVNHDFRTKKKY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.87
3 0.88
4 0.93
5 0.92
6 0.93
7 0.93
8 0.94
9 0.94
10 0.93
11 0.92
12 0.9
13 0.91
14 0.9
15 0.91
16 0.87
17 0.84
18 0.79
19 0.76
20 0.66
21 0.57
22 0.5
23 0.42
24 0.36
25 0.31
26 0.25
27 0.2
28 0.22
29 0.23
30 0.23
31 0.24
32 0.25
33 0.29
34 0.37
35 0.42
36 0.49
37 0.54
38 0.6
39 0.65
40 0.73
41 0.76
42 0.72
43 0.77
44 0.79
45 0.77
46 0.76
47 0.78
48 0.77
49 0.74
50 0.79
51 0.76
52 0.73
53 0.73
54 0.73
55 0.68
56 0.68
57 0.71
58 0.67
59 0.65
60 0.66
61 0.62
62 0.57
63 0.52
64 0.47
65 0.48
66 0.52
67 0.5
68 0.46
69 0.44
70 0.41
71 0.41
72 0.39
73 0.34
74 0.3
75 0.25
76 0.25
77 0.23
78 0.23
79 0.24
80 0.29
81 0.31
82 0.3
83 0.34
84 0.34
85 0.35
86 0.36
87 0.35
88 0.34
89 0.29
90 0.29
91 0.26
92 0.25
93 0.3
94 0.31
95 0.31
96 0.3
97 0.3
98 0.31
99 0.29
100 0.3
101 0.29
102 0.35
103 0.35
104 0.33
105 0.41
106 0.41
107 0.47
108 0.48
109 0.43
110 0.4
111 0.41
112 0.39
113 0.29
114 0.27
115 0.21
116 0.18
117 0.17
118 0.12
119 0.1
120 0.11
121 0.16
122 0.16
123 0.16
124 0.16
125 0.17
126 0.19
127 0.21
128 0.21
129 0.19
130 0.22
131 0.22
132 0.23
133 0.21
134 0.19
135 0.18
136 0.16
137 0.17
138 0.14
139 0.14
140 0.14
141 0.16
142 0.16
143 0.18
144 0.21
145 0.17
146 0.15
147 0.15
148 0.17
149 0.16
150 0.21
151 0.22
152 0.26
153 0.28
154 0.31
155 0.32
156 0.3
157 0.33
158 0.34
159 0.39
160 0.42
161 0.46
162 0.47
163 0.53
164 0.59
165 0.64
166 0.68
167 0.69
168 0.65
169 0.64
170 0.7
171 0.71
172 0.69
173 0.63
174 0.58
175 0.53
176 0.52
177 0.5
178 0.49
179 0.46
180 0.42
181 0.47
182 0.45
183 0.42
184 0.38
185 0.36
186 0.32
187 0.35
188 0.42
189 0.45
190 0.49
191 0.51
192 0.51
193 0.55
194 0.53
195 0.48
196 0.44
197 0.36
198 0.33
199 0.33
200 0.36
201 0.4
202 0.46
203 0.5
204 0.55
205 0.63
206 0.69
207 0.75
208 0.81
209 0.83
210 0.87
211 0.89
212 0.91
213 0.92
214 0.92
215 0.93
216 0.93
217 0.91
218 0.83
219 0.78
220 0.7
221 0.69
222 0.66
223 0.62
224 0.57
225 0.54
226 0.53
227 0.5
228 0.51
229 0.51
230 0.51
231 0.48
232 0.48
233 0.46
234 0.46
235 0.45
236 0.43
237 0.34
238 0.28
239 0.29
240 0.27
241 0.29
242 0.36
243 0.38
244 0.39
245 0.42
246 0.42
247 0.38
248 0.34
249 0.33
250 0.31
251 0.34
252 0.35
253 0.42
254 0.47
255 0.49
256 0.51
257 0.49
258 0.43
259 0.39
260 0.42
261 0.36
262 0.37
263 0.4
264 0.42
265 0.45
266 0.47
267 0.5
268 0.48
269 0.47
270 0.42
271 0.45
272 0.45
273 0.48
274 0.52
275 0.5
276 0.55
277 0.58
278 0.58
279 0.58
280 0.63
281 0.65
282 0.68
283 0.69
284 0.65
285 0.65
286 0.69
287 0.73
288 0.72
289 0.7
290 0.65
291 0.66
292 0.64
293 0.6
294 0.57
295 0.48
296 0.38
297 0.3
298 0.25
299 0.21
300 0.18
301 0.17
302 0.11
303 0.1
304 0.09
305 0.08
306 0.08
307 0.05
308 0.05
309 0.04
310 0.05
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.1
316 0.12
317 0.13
318 0.13
319 0.16
320 0.2
321 0.23
322 0.32
323 0.31
324 0.29
325 0.32
326 0.36
327 0.37
328 0.36
329 0.38
330 0.32
331 0.34
332 0.38
333 0.41
334 0.43
335 0.4
336 0.42
337 0.44
338 0.46
339 0.46
340 0.47
341 0.49
342 0.45
343 0.47
344 0.52
345 0.53
346 0.58
347 0.63
348 0.61
349 0.58
350 0.58
351 0.55
352 0.51
353 0.5
354 0.47
355 0.45
356 0.42
357 0.38
358 0.35
359 0.35
360 0.31
361 0.25
362 0.21
363 0.15
364 0.14
365 0.17
366 0.19
367 0.24
368 0.25
369 0.25
370 0.28
371 0.31
372 0.32
373 0.31
374 0.3
375 0.29
376 0.33
377 0.32
378 0.28
379 0.25
380 0.23
381 0.22
382 0.2
383 0.19
384 0.16
385 0.16
386 0.16
387 0.15
388 0.15
389 0.14
390 0.14
391 0.14
392 0.17
393 0.17
394 0.18
395 0.19
396 0.23
397 0.27
398 0.27
399 0.24
400 0.2
401 0.17
402 0.17
403 0.18
404 0.13
405 0.09
406 0.09
407 0.08
408 0.07
409 0.08
410 0.08
411 0.08
412 0.07
413 0.08
414 0.08
415 0.11
416 0.11
417 0.1
418 0.09
419 0.12
420 0.13
421 0.12
422 0.13
423 0.14
424 0.15
425 0.18
426 0.17
427 0.15
428 0.14
429 0.14
430 0.14
431 0.11
432 0.1
433 0.08
434 0.08
435 0.07
436 0.07
437 0.07
438 0.06
439 0.05
440 0.04
441 0.03
442 0.03
443 0.05
444 0.06
445 0.06
446 0.07
447 0.07
448 0.08
449 0.09
450 0.1
451 0.11
452 0.11
453 0.13
454 0.14
455 0.16
456 0.16
457 0.16
458 0.16
459 0.15
460 0.14
461 0.13
462 0.12
463 0.1
464 0.09
465 0.09
466 0.09
467 0.08
468 0.1
469 0.1
470 0.1
471 0.12
472 0.11
473 0.1
474 0.11
475 0.11
476 0.09
477 0.11
478 0.11
479 0.11
480 0.13
481 0.13
482 0.13
483 0.12
484 0.12
485 0.1
486 0.1
487 0.08
488 0.06
489 0.06
490 0.05
491 0.05
492 0.04
493 0.04
494 0.04
495 0.04
496 0.04
497 0.04
498 0.04
499 0.04
500 0.05
501 0.05
502 0.09
503 0.15
504 0.16
505 0.16
506 0.17
507 0.18
508 0.21
509 0.21
510 0.18
511 0.14
512 0.13
513 0.14
514 0.13
515 0.13
516 0.09
517 0.1
518 0.09
519 0.1
520 0.11
521 0.11
522 0.1
523 0.1
524 0.11
525 0.11
526 0.11
527 0.09
528 0.09
529 0.08
530 0.08
531 0.1
532 0.11
533 0.12
534 0.12
535 0.13
536 0.13
537 0.14
538 0.14
539 0.14
540 0.15
541 0.14
542 0.18
543 0.23
544 0.3
545 0.36
546 0.46
547 0.5
548 0.54
549 0.59
550 0.64
551 0.66
552 0.66
553 0.68
554 0.64
555 0.66
556 0.65
557 0.65
558 0.58
559 0.49
560 0.46
561 0.38
562 0.34
563 0.26
564 0.23
565 0.22
566 0.23
567 0.22
568 0.18
569 0.17
570 0.16
571 0.16
572 0.15
573 0.11
574 0.08
575 0.08
576 0.08
577 0.07
578 0.05
579 0.05
580 0.04
581 0.03
582 0.04
583 0.05
584 0.06
585 0.08
586 0.09
587 0.1
588 0.1
589 0.1
590 0.12
591 0.12
592 0.1
593 0.08
594 0.09
595 0.08
596 0.07
597 0.07
598 0.05
599 0.04
600 0.04
601 0.05
602 0.06
603 0.07
604 0.11
605 0.15
606 0.2
607 0.28
608 0.38
609 0.48
610 0.57
611 0.68
612 0.74
613 0.77
614 0.82
615 0.77
616 0.74
617 0.71
618 0.69
619 0.59
620 0.5
621 0.42
622 0.34
623 0.33
624 0.26
625 0.18
626 0.1
627 0.08
628 0.12
629 0.13
630 0.14
631 0.13
632 0.17
633 0.23
634 0.31
635 0.36
636 0.38
637 0.42
638 0.42
639 0.42
640 0.4
641 0.39
642 0.34
643 0.29
644 0.24
645 0.21
646 0.19
647 0.2
648 0.18
649 0.13
650 0.13
651 0.14
652 0.13
653 0.12
654 0.1
655 0.09
656 0.08
657 0.08
658 0.06
659 0.04
660 0.04
661 0.04
662 0.04
663 0.05
664 0.05
665 0.05
666 0.05
667 0.05
668 0.05
669 0.06
670 0.07
671 0.06
672 0.07
673 0.07
674 0.07
675 0.08
676 0.09
677 0.09
678 0.1
679 0.11
680 0.12
681 0.13
682 0.13
683 0.13
684 0.12
685 0.12
686 0.12
687 0.11
688 0.1
689 0.11
690 0.1
691 0.15
692 0.16
693 0.17
694 0.18
695 0.25
696 0.28
697 0.33
698 0.36
699 0.38
700 0.44
701 0.49
702 0.53
703 0.51
704 0.52
705 0.48
706 0.5
707 0.45
708 0.44
709 0.46
710 0.43
711 0.48
712 0.46
713 0.48
714 0.44
715 0.44
716 0.46
717 0.43
718 0.41
719 0.32
720 0.3
721 0.28
722 0.29
723 0.27
724 0.24
725 0.2
726 0.24
727 0.25
728 0.27
729 0.25
730 0.25
731 0.3
732 0.31
733 0.35
734 0.32
735 0.34
736 0.33
737 0.34
738 0.32
739 0.28
740 0.23
741 0.17
742 0.14
743 0.14
744 0.13
745 0.12
746 0.11
747 0.11
748 0.1
749 0.09
750 0.08
751 0.05
752 0.05
753 0.05
754 0.04
755 0.04
756 0.04
757 0.05
758 0.05
759 0.05
760 0.05
761 0.05
762 0.05
763 0.05
764 0.05
765 0.04
766 0.05
767 0.05
768 0.05
769 0.04
770 0.04
771 0.04
772 0.04
773 0.05
774 0.05
775 0.07
776 0.07
777 0.08
778 0.09
779 0.11
780 0.11
781 0.11
782 0.13
783 0.13
784 0.15
785 0.18
786 0.17
787 0.17
788 0.17
789 0.18
790 0.17
791 0.17
792 0.15
793 0.14
794 0.17
795 0.19
796 0.19
797 0.18
798 0.18
799 0.17
800 0.17
801 0.16
802 0.13
803 0.12
804 0.13
805 0.13
806 0.13
807 0.13
808 0.12
809 0.11
810 0.11
811 0.09
812 0.07
813 0.05
814 0.04
815 0.04
816 0.04
817 0.03
818 0.04
819 0.04
820 0.05
821 0.05
822 0.05
823 0.05
824 0.05
825 0.06
826 0.06
827 0.06
828 0.07
829 0.08
830 0.1
831 0.1
832 0.1
833 0.1
834 0.1
835 0.09
836 0.09
837 0.08
838 0.07
839 0.06
840 0.06
841 0.05
842 0.06
843 0.06
844 0.06
845 0.06
846 0.06
847 0.07
848 0.08
849 0.09
850 0.11
851 0.13
852 0.19
853 0.27
854 0.34
855 0.44
856 0.54
857 0.64
858 0.74
859 0.83
860 0.88
861 0.92
862 0.95
863 0.96
864 0.96
865 0.96
866 0.96
867 0.93
868 0.89
869 0.85
870 0.81
871 0.7
872 0.6
873 0.54
874 0.45
875 0.38
876 0.3
877 0.24
878 0.16
879 0.15
880 0.14
881 0.09
882 0.08
883 0.09
884 0.09
885 0.09
886 0.15
887 0.18