Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9QHW1

Protein Details
Accession A0A1J9QHW1    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
319-338GTPVRRKKRKGALTNPSAYSHydrophilic
420-444EDRGVHAKRKGAKGKRGKNGNEAVGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
323-328RRKKRK
425-438HAKRKGAKGKRGKN
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 7, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPPRRQWIDKKSATTYQLFHRSQNDPLIHDVEADDRVLHRVSGAPITESSSKPSKTSKVLAELEKEFEGAQVRKNEGEAANYGIYYDDSQYDYMQHLRDLGGSGGGQSHFVEATPVKGKGKTRSMRLEDALRETSLDDIDQFGSIHQDDILSTASTYSRKPTYQDQQDVPDVIAGFQPDMDPRLRETLEALEDDAFVDTGEDEDLFEALVQGGADAEVDPSEWRDTFIEDDDEGWESDATEKAPEQPGVSTTNAAPPTKGPTDDEQIPDTNAGEGDWLRNFAQYKKDMKVKPAVPGTQGETGSVLRAGTVASTMFTAGGTPVRRKKRKGALTNPSAYSMTSSSLARTEGHRLLDDRFEKIEALYALDEEGEDYDGSSLADDMSVVSGMSKVSEVPSLVSGGMPLRSDFNQIMDGFLDGWEDRGVHAKRKGAKGKRGKNGNEAVGIRMLDEIRQGLGPAKLPGKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.57
3 0.56
4 0.59
5 0.54
6 0.52
7 0.51
8 0.5
9 0.5
10 0.55
11 0.48
12 0.4
13 0.42
14 0.41
15 0.34
16 0.31
17 0.27
18 0.21
19 0.19
20 0.17
21 0.14
22 0.12
23 0.14
24 0.14
25 0.13
26 0.12
27 0.14
28 0.16
29 0.19
30 0.19
31 0.19
32 0.19
33 0.24
34 0.27
35 0.24
36 0.27
37 0.3
38 0.3
39 0.32
40 0.37
41 0.39
42 0.41
43 0.47
44 0.47
45 0.48
46 0.53
47 0.54
48 0.54
49 0.5
50 0.47
51 0.41
52 0.35
53 0.27
54 0.22
55 0.24
56 0.2
57 0.24
58 0.25
59 0.27
60 0.27
61 0.28
62 0.31
63 0.25
64 0.27
65 0.22
66 0.21
67 0.2
68 0.19
69 0.18
70 0.14
71 0.14
72 0.12
73 0.12
74 0.09
75 0.1
76 0.11
77 0.12
78 0.13
79 0.14
80 0.16
81 0.16
82 0.15
83 0.14
84 0.14
85 0.14
86 0.14
87 0.12
88 0.1
89 0.09
90 0.09
91 0.1
92 0.1
93 0.1
94 0.09
95 0.09
96 0.08
97 0.08
98 0.1
99 0.08
100 0.13
101 0.15
102 0.17
103 0.19
104 0.23
105 0.27
106 0.33
107 0.43
108 0.44
109 0.49
110 0.56
111 0.6
112 0.61
113 0.6
114 0.58
115 0.5
116 0.49
117 0.43
118 0.34
119 0.28
120 0.24
121 0.21
122 0.15
123 0.13
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.07
130 0.09
131 0.09
132 0.09
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.08
137 0.09
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.09
142 0.1
143 0.11
144 0.14
145 0.16
146 0.17
147 0.2
148 0.27
149 0.36
150 0.43
151 0.49
152 0.47
153 0.48
154 0.48
155 0.46
156 0.38
157 0.29
158 0.21
159 0.15
160 0.13
161 0.09
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.06
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.1
170 0.14
171 0.14
172 0.14
173 0.14
174 0.15
175 0.15
176 0.15
177 0.14
178 0.1
179 0.1
180 0.1
181 0.09
182 0.06
183 0.05
184 0.04
185 0.04
186 0.03
187 0.04
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.04
208 0.06
209 0.06
210 0.07
211 0.07
212 0.08
213 0.09
214 0.1
215 0.1
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.08
221 0.08
222 0.07
223 0.05
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.08
230 0.1
231 0.1
232 0.1
233 0.1
234 0.11
235 0.14
236 0.14
237 0.12
238 0.11
239 0.15
240 0.17
241 0.17
242 0.16
243 0.14
244 0.18
245 0.19
246 0.19
247 0.17
248 0.17
249 0.22
250 0.25
251 0.26
252 0.23
253 0.22
254 0.22
255 0.2
256 0.17
257 0.12
258 0.09
259 0.07
260 0.06
261 0.06
262 0.07
263 0.07
264 0.08
265 0.08
266 0.11
267 0.12
268 0.14
269 0.2
270 0.24
271 0.28
272 0.31
273 0.4
274 0.4
275 0.43
276 0.49
277 0.45
278 0.46
279 0.47
280 0.43
281 0.37
282 0.37
283 0.36
284 0.32
285 0.3
286 0.23
287 0.19
288 0.17
289 0.16
290 0.14
291 0.1
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.04
296 0.05
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.05
301 0.05
302 0.04
303 0.05
304 0.05
305 0.09
306 0.11
307 0.17
308 0.25
309 0.36
310 0.43
311 0.48
312 0.57
313 0.63
314 0.71
315 0.76
316 0.78
317 0.78
318 0.8
319 0.81
320 0.72
321 0.64
322 0.54
323 0.44
324 0.35
325 0.25
326 0.18
327 0.14
328 0.14
329 0.12
330 0.13
331 0.14
332 0.13
333 0.14
334 0.19
335 0.21
336 0.22
337 0.23
338 0.24
339 0.25
340 0.32
341 0.31
342 0.27
343 0.25
344 0.24
345 0.23
346 0.21
347 0.23
348 0.15
349 0.15
350 0.13
351 0.12
352 0.11
353 0.1
354 0.1
355 0.07
356 0.07
357 0.06
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.05
365 0.04
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.05
370 0.05
371 0.04
372 0.04
373 0.05
374 0.05
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.07
379 0.09
380 0.09
381 0.1
382 0.11
383 0.12
384 0.12
385 0.11
386 0.11
387 0.1
388 0.12
389 0.11
390 0.11
391 0.13
392 0.14
393 0.18
394 0.18
395 0.18
396 0.21
397 0.21
398 0.21
399 0.18
400 0.18
401 0.14
402 0.13
403 0.13
404 0.08
405 0.1
406 0.09
407 0.09
408 0.09
409 0.18
410 0.21
411 0.27
412 0.32
413 0.37
414 0.44
415 0.54
416 0.64
417 0.65
418 0.73
419 0.76
420 0.82
421 0.85
422 0.87
423 0.83
424 0.82
425 0.8
426 0.74
427 0.7
428 0.61
429 0.53
430 0.46
431 0.41
432 0.31
433 0.26
434 0.22
435 0.15
436 0.16
437 0.14
438 0.13
439 0.13
440 0.13
441 0.15
442 0.17
443 0.19
444 0.22