Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9Q739

Protein Details
Accession A0A1J9Q739    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
234-254QSKIGKFRCRYHAQKQKFFVTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 10.5, cyto_nucl 7.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019761  DNA-dir_RNA_pol-M_15_CS  
IPR012164  Rpa12/Rpb9/Rpc10/TFS  
IPR034004  Zn_ribbon_RPA12_C  
IPR001222  Znf_TFIIS  
Gene Ontology GO:1990234  C:transferase complex  
GO:0003899  F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0006379  P:mRNA cleavage  
Pfam View protein in Pfam  
PF01096  TFIIS_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01030  RNA_POL_M_15KD  
PS51133  ZF_TFIIS_2  
CDD cd10507  Zn-ribbon_RPA12  
Amino Acid Sequences MVASGQRNSLKILSFISRRHGDSLGPDGPGKGEAHGQADGVRPSRDGGRHRLGAYEIWTGGGPGCQARSLLLPELLSPKSNLSTLEGAYPARLPSMAPQFCHDCGSILDISAERTIPCDVCGKPNPNKLMDRPIISTSNNFPSKLRTKLRSHTRELTVKDRESNRRIQVDCQKCDSNEVTWSEMQLRSADEGSTIFYRCPKCGNSLVAAGPYHTMVDTHIGGLERANSRQALVQSKIGKFRCRYHAQKQKFFVTLNGFGPSKLNVSVLSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.32
3 0.38
4 0.39
5 0.4
6 0.42
7 0.39
8 0.34
9 0.33
10 0.38
11 0.32
12 0.29
13 0.27
14 0.24
15 0.23
16 0.24
17 0.2
18 0.14
19 0.15
20 0.15
21 0.18
22 0.18
23 0.17
24 0.17
25 0.2
26 0.22
27 0.21
28 0.2
29 0.18
30 0.19
31 0.24
32 0.28
33 0.29
34 0.34
35 0.39
36 0.43
37 0.43
38 0.43
39 0.39
40 0.35
41 0.33
42 0.28
43 0.2
44 0.17
45 0.16
46 0.14
47 0.13
48 0.12
49 0.09
50 0.07
51 0.08
52 0.08
53 0.08
54 0.08
55 0.1
56 0.12
57 0.13
58 0.13
59 0.13
60 0.13
61 0.18
62 0.17
63 0.16
64 0.15
65 0.14
66 0.14
67 0.15
68 0.14
69 0.14
70 0.15
71 0.15
72 0.15
73 0.15
74 0.13
75 0.13
76 0.13
77 0.1
78 0.08
79 0.08
80 0.07
81 0.11
82 0.2
83 0.21
84 0.21
85 0.24
86 0.27
87 0.27
88 0.29
89 0.24
90 0.15
91 0.14
92 0.16
93 0.14
94 0.11
95 0.1
96 0.09
97 0.09
98 0.09
99 0.09
100 0.06
101 0.07
102 0.08
103 0.08
104 0.09
105 0.11
106 0.12
107 0.17
108 0.22
109 0.27
110 0.32
111 0.38
112 0.4
113 0.4
114 0.42
115 0.38
116 0.41
117 0.37
118 0.33
119 0.29
120 0.29
121 0.28
122 0.25
123 0.25
124 0.2
125 0.25
126 0.24
127 0.23
128 0.2
129 0.25
130 0.29
131 0.35
132 0.38
133 0.38
134 0.41
135 0.5
136 0.6
137 0.6
138 0.62
139 0.6
140 0.61
141 0.6
142 0.58
143 0.57
144 0.52
145 0.47
146 0.46
147 0.46
148 0.48
149 0.46
150 0.5
151 0.48
152 0.49
153 0.49
154 0.5
155 0.53
156 0.54
157 0.53
158 0.51
159 0.48
160 0.41
161 0.45
162 0.39
163 0.31
164 0.26
165 0.25
166 0.23
167 0.21
168 0.22
169 0.2
170 0.19
171 0.18
172 0.15
173 0.14
174 0.12
175 0.13
176 0.12
177 0.09
178 0.09
179 0.11
180 0.12
181 0.11
182 0.1
183 0.16
184 0.18
185 0.18
186 0.22
187 0.21
188 0.25
189 0.3
190 0.32
191 0.29
192 0.3
193 0.3
194 0.28
195 0.27
196 0.22
197 0.17
198 0.15
199 0.12
200 0.09
201 0.09
202 0.07
203 0.1
204 0.1
205 0.09
206 0.11
207 0.11
208 0.11
209 0.12
210 0.16
211 0.15
212 0.16
213 0.18
214 0.16
215 0.17
216 0.21
217 0.24
218 0.26
219 0.26
220 0.32
221 0.37
222 0.4
223 0.48
224 0.49
225 0.52
226 0.51
227 0.56
228 0.59
229 0.61
230 0.66
231 0.69
232 0.75
233 0.78
234 0.82
235 0.8
236 0.78
237 0.72
238 0.65
239 0.6
240 0.57
241 0.52
242 0.44
243 0.43
244 0.36
245 0.32
246 0.33
247 0.28
248 0.23
249 0.19
250 0.18