Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8BF38

Protein Details
Accession G8BF38    Localization Confidence High Confidence Score 16.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
50-77QSKLKEAKAKAKELKLRRKRNGGDPWAPHydrophilic
353-380NCVKVIHSTRKYKWNKNKLFKGHQSAGYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
53-70LKEAKAKAKELKLRRKRN
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 6, mito 1, cysk 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032847  PRPF17  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0071013  C:catalytic step 2 spliceosome  
GO:0034399  C:nuclear periphery  
GO:0071014  C:post-mRNA release spliceosomal complex  
GO:0000974  C:Prp19 complex  
GO:0000386  F:second spliceosomal transesterification activity  
GO:0000350  P:generation of catalytic spliceosome for second transesterification step  
GO:0000389  P:mRNA 3'-splice site recognition  
GO:0000348  P:mRNA branch site recognition  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MSLVQGYSSSEEEIESQEENAINHKRQKTSTNTFQKISYDPAAFDANSQQSKLKEAKAKAKELKLRRKRNGGDPWAPIHSEEEQVHKPEPAQILKEEEEEEEENTESEKFPPSSEFVGSNKRDYQGRSFMHIPSELTKKIPGDQECFVPKSVIHTFTKAHPKGVNKLQFFPHSGHLLLSCGNDATIKLWAIRDALELLRIYKGHKLAVKDISFNSTGDKFLSCGFDKIIRLWNTETGEVIKTFEMSSIPNVVRFNPNIESEFVVGLSNHKIEHYDLAAIHNPIQTYDHHIGAINDILVDKETFISTSDDKSVRVWHWQINIPIKVISDPSQFSTPSIKKHPKANYIALQSMDNCVKVIHSTRKYKWNKNKLFKGHQSAGYGIEIGFSPDGKILMSGDARGYAVFWDWQSKKIVNKLKLSTLPIKCITFHPLETSKVAIAGNSGDIYYCD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.14
3 0.13
4 0.15
5 0.16
6 0.16
7 0.22
8 0.27
9 0.3
10 0.38
11 0.44
12 0.47
13 0.5
14 0.57
15 0.6
16 0.63
17 0.68
18 0.7
19 0.7
20 0.66
21 0.65
22 0.6
23 0.53
24 0.49
25 0.44
26 0.34
27 0.29
28 0.3
29 0.3
30 0.27
31 0.25
32 0.26
33 0.27
34 0.27
35 0.27
36 0.28
37 0.26
38 0.32
39 0.35
40 0.37
41 0.38
42 0.44
43 0.53
44 0.57
45 0.66
46 0.68
47 0.72
48 0.74
49 0.76
50 0.81
51 0.81
52 0.85
53 0.84
54 0.87
55 0.84
56 0.85
57 0.85
58 0.83
59 0.8
60 0.73
61 0.69
62 0.61
63 0.55
64 0.46
65 0.38
66 0.3
67 0.28
68 0.24
69 0.26
70 0.27
71 0.29
72 0.3
73 0.27
74 0.26
75 0.27
76 0.31
77 0.29
78 0.28
79 0.26
80 0.3
81 0.31
82 0.32
83 0.27
84 0.22
85 0.22
86 0.2
87 0.19
88 0.16
89 0.14
90 0.13
91 0.13
92 0.13
93 0.1
94 0.1
95 0.14
96 0.13
97 0.14
98 0.16
99 0.18
100 0.2
101 0.21
102 0.22
103 0.21
104 0.3
105 0.31
106 0.33
107 0.32
108 0.32
109 0.34
110 0.34
111 0.37
112 0.37
113 0.37
114 0.38
115 0.38
116 0.37
117 0.37
118 0.35
119 0.29
120 0.25
121 0.28
122 0.23
123 0.22
124 0.24
125 0.22
126 0.25
127 0.3
128 0.29
129 0.28
130 0.29
131 0.32
132 0.34
133 0.34
134 0.3
135 0.24
136 0.21
137 0.23
138 0.25
139 0.25
140 0.22
141 0.23
142 0.24
143 0.3
144 0.41
145 0.36
146 0.36
147 0.35
148 0.38
149 0.42
150 0.5
151 0.51
152 0.43
153 0.46
154 0.45
155 0.44
156 0.42
157 0.38
158 0.32
159 0.25
160 0.23
161 0.2
162 0.17
163 0.15
164 0.14
165 0.12
166 0.09
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.08
177 0.09
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.08
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.1
186 0.1
187 0.11
188 0.13
189 0.14
190 0.15
191 0.18
192 0.19
193 0.22
194 0.29
195 0.29
196 0.27
197 0.27
198 0.26
199 0.25
200 0.23
201 0.2
202 0.14
203 0.13
204 0.12
205 0.11
206 0.09
207 0.1
208 0.13
209 0.11
210 0.11
211 0.12
212 0.14
213 0.14
214 0.15
215 0.22
216 0.19
217 0.21
218 0.21
219 0.24
220 0.23
221 0.22
222 0.21
223 0.15
224 0.15
225 0.13
226 0.13
227 0.09
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.07
232 0.07
233 0.08
234 0.11
235 0.11
236 0.13
237 0.13
238 0.14
239 0.17
240 0.17
241 0.19
242 0.17
243 0.19
244 0.18
245 0.18
246 0.18
247 0.15
248 0.15
249 0.12
250 0.1
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.09
259 0.1
260 0.1
261 0.1
262 0.1
263 0.12
264 0.15
265 0.14
266 0.15
267 0.15
268 0.14
269 0.12
270 0.13
271 0.12
272 0.17
273 0.18
274 0.17
275 0.16
276 0.17
277 0.17
278 0.17
279 0.17
280 0.09
281 0.07
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.05
287 0.05
288 0.06
289 0.06
290 0.07
291 0.1
292 0.1
293 0.12
294 0.17
295 0.17
296 0.17
297 0.18
298 0.21
299 0.2
300 0.26
301 0.27
302 0.27
303 0.3
304 0.35
305 0.4
306 0.43
307 0.43
308 0.37
309 0.35
310 0.31
311 0.27
312 0.25
313 0.22
314 0.18
315 0.17
316 0.19
317 0.21
318 0.21
319 0.21
320 0.29
321 0.28
322 0.31
323 0.4
324 0.46
325 0.47
326 0.56
327 0.63
328 0.63
329 0.66
330 0.68
331 0.65
332 0.61
333 0.6
334 0.52
335 0.45
336 0.37
337 0.34
338 0.28
339 0.21
340 0.16
341 0.13
342 0.13
343 0.14
344 0.21
345 0.26
346 0.33
347 0.42
348 0.47
349 0.58
350 0.67
351 0.75
352 0.79
353 0.8
354 0.83
355 0.85
356 0.9
357 0.89
358 0.9
359 0.89
360 0.87
361 0.82
362 0.76
363 0.68
364 0.59
365 0.51
366 0.41
367 0.33
368 0.23
369 0.17
370 0.12
371 0.11
372 0.1
373 0.08
374 0.08
375 0.08
376 0.09
377 0.08
378 0.09
379 0.08
380 0.11
381 0.12
382 0.12
383 0.12
384 0.13
385 0.13
386 0.12
387 0.12
388 0.09
389 0.1
390 0.11
391 0.11
392 0.2
393 0.21
394 0.25
395 0.29
396 0.33
397 0.37
398 0.45
399 0.54
400 0.52
401 0.59
402 0.61
403 0.64
404 0.65
405 0.66
406 0.66
407 0.61
408 0.6
409 0.56
410 0.53
411 0.46
412 0.44
413 0.43
414 0.37
415 0.35
416 0.35
417 0.34
418 0.36
419 0.36
420 0.36
421 0.3
422 0.28
423 0.27
424 0.19
425 0.17
426 0.15
427 0.15
428 0.13
429 0.12