Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8BAU1

Protein Details
Accession G8BAU1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
395-416RPLKCGWGKERPPQFQNRTSNYHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 15.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
Gene Ontology GO:0010494  C:cytoplasmic stress granule  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000932  C:P-body  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0008266  F:poly(U) RNA binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
GO:0043488  P:regulation of mRNA stability  
GO:0034063  P:stress granule assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSENEKIEATQTSPDNAVPESNQQENEVTQDESKESTPVTPASATEGGRETSNKILYVGNLPKSASEEQISELFSVSKPIKSIKLLNDKNKLGFNYAFIEFDDNQEADMALSTLNGKLLNNCEIRVNWAYQSATIASSSTPEDPTYNLFVGDLSSEVNDEALKKAFNKFDSFKEAHVMWDMQTSRSRGYGFVTFSKQEDAELALQTMNGAWLGGRAIRCNWAAHKQVNNRNSDYHSKNNNRYNQRQYRPYNGRNYNSYHSNQYSNNGSQHIAAPGLILPELNLSNGSLPLGSQQLLSSPPNGLNGNAQQTGNIVMSPQSYDIVLRQTPSWQTTVYLGNIAHATQQQEMLPLLQNFGFIVDFKFHPEKGCAFVKYDSHERAALAIIQLAGFNLNGRPLKCGWGKERPPQFQNRTSNYGQGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.23
3 0.22
4 0.22
5 0.18
6 0.24
7 0.27
8 0.29
9 0.29
10 0.29
11 0.3
12 0.28
13 0.3
14 0.24
15 0.22
16 0.19
17 0.2
18 0.19
19 0.2
20 0.2
21 0.18
22 0.17
23 0.16
24 0.18
25 0.17
26 0.18
27 0.17
28 0.16
29 0.21
30 0.24
31 0.23
32 0.22
33 0.23
34 0.22
35 0.23
36 0.24
37 0.2
38 0.22
39 0.24
40 0.22
41 0.22
42 0.22
43 0.22
44 0.29
45 0.32
46 0.3
47 0.3
48 0.29
49 0.28
50 0.32
51 0.32
52 0.27
53 0.22
54 0.19
55 0.2
56 0.22
57 0.22
58 0.18
59 0.16
60 0.15
61 0.13
62 0.17
63 0.17
64 0.16
65 0.17
66 0.19
67 0.23
68 0.26
69 0.32
70 0.36
71 0.46
72 0.53
73 0.6
74 0.65
75 0.64
76 0.63
77 0.61
78 0.53
79 0.47
80 0.39
81 0.33
82 0.28
83 0.26
84 0.24
85 0.19
86 0.23
87 0.18
88 0.2
89 0.2
90 0.16
91 0.15
92 0.14
93 0.14
94 0.09
95 0.09
96 0.07
97 0.04
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.06
102 0.07
103 0.07
104 0.09
105 0.12
106 0.19
107 0.19
108 0.19
109 0.2
110 0.2
111 0.25
112 0.25
113 0.23
114 0.18
115 0.2
116 0.2
117 0.18
118 0.19
119 0.14
120 0.13
121 0.11
122 0.11
123 0.08
124 0.09
125 0.1
126 0.1
127 0.1
128 0.1
129 0.11
130 0.11
131 0.14
132 0.16
133 0.14
134 0.13
135 0.12
136 0.11
137 0.11
138 0.1
139 0.08
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.07
148 0.07
149 0.08
150 0.09
151 0.13
152 0.16
153 0.18
154 0.23
155 0.24
156 0.26
157 0.33
158 0.33
159 0.3
160 0.3
161 0.28
162 0.23
163 0.23
164 0.2
165 0.12
166 0.16
167 0.16
168 0.15
169 0.17
170 0.18
171 0.17
172 0.18
173 0.18
174 0.14
175 0.16
176 0.18
177 0.17
178 0.19
179 0.21
180 0.2
181 0.2
182 0.21
183 0.18
184 0.14
185 0.12
186 0.11
187 0.1
188 0.1
189 0.09
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.07
194 0.05
195 0.03
196 0.03
197 0.02
198 0.03
199 0.03
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.07
204 0.1
205 0.11
206 0.12
207 0.14
208 0.19
209 0.23
210 0.26
211 0.32
212 0.38
213 0.45
214 0.49
215 0.51
216 0.46
217 0.44
218 0.44
219 0.45
220 0.41
221 0.41
222 0.46
223 0.49
224 0.55
225 0.61
226 0.66
227 0.66
228 0.69
229 0.72
230 0.72
231 0.71
232 0.72
233 0.69
234 0.71
235 0.72
236 0.71
237 0.71
238 0.68
239 0.65
240 0.6
241 0.6
242 0.54
243 0.5
244 0.45
245 0.4
246 0.35
247 0.35
248 0.32
249 0.31
250 0.32
251 0.29
252 0.29
253 0.25
254 0.23
255 0.2
256 0.21
257 0.18
258 0.13
259 0.11
260 0.09
261 0.08
262 0.08
263 0.07
264 0.05
265 0.05
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.07
274 0.05
275 0.05
276 0.06
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.08
282 0.11
283 0.12
284 0.11
285 0.11
286 0.12
287 0.15
288 0.15
289 0.15
290 0.16
291 0.18
292 0.22
293 0.22
294 0.21
295 0.18
296 0.18
297 0.2
298 0.16
299 0.13
300 0.09
301 0.07
302 0.08
303 0.09
304 0.09
305 0.08
306 0.08
307 0.08
308 0.1
309 0.13
310 0.14
311 0.14
312 0.14
313 0.17
314 0.21
315 0.22
316 0.22
317 0.18
318 0.19
319 0.2
320 0.23
321 0.2
322 0.2
323 0.17
324 0.17
325 0.17
326 0.16
327 0.16
328 0.15
329 0.16
330 0.13
331 0.15
332 0.14
333 0.15
334 0.15
335 0.15
336 0.17
337 0.16
338 0.17
339 0.15
340 0.15
341 0.13
342 0.14
343 0.12
344 0.08
345 0.1
346 0.11
347 0.11
348 0.17
349 0.21
350 0.21
351 0.23
352 0.27
353 0.27
354 0.3
355 0.35
356 0.31
357 0.31
358 0.34
359 0.34
360 0.37
361 0.43
362 0.4
363 0.38
364 0.37
365 0.34
366 0.31
367 0.29
368 0.25
369 0.17
370 0.15
371 0.13
372 0.11
373 0.11
374 0.1
375 0.09
376 0.07
377 0.08
378 0.07
379 0.13
380 0.17
381 0.18
382 0.22
383 0.22
384 0.3
385 0.34
386 0.41
387 0.42
388 0.5
389 0.57
390 0.63
391 0.72
392 0.73
393 0.76
394 0.79
395 0.8
396 0.79
397 0.82
398 0.79
399 0.76
400 0.69