Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E1LPC3

Protein Details
Accession A0A1E1LPC3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-29MGSSTRKKNEKKKDFLKPKLRVGKTRAKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-28RKKNEKKKDFLKPKLRVGKTRAK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12, cyto 2.5, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR024679  Ipi1_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0097344  C:Rix1 complex  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF12333  Ipi1_N  
Amino Acid Sequences MGSSTRKKNEKKKDFLKPKLRVGKTRAKADNFTDTSFKAKRIALNKQSLTEVAPTTTTQLTHYLSLASSSKSDAQRKDALSYLVTRLSNAPSESPGLPASILLPKLLPLISDGSTGVRSQLLKLFKTLPPQDVEDRAESVILYTRAGMTHLSTEIRDDTLNILEWLLDTTGDACVKCPGGWIKTLNSFMSMMGWVRDLSTTSKWSSESKVTISNKRNKSFSKQLDLLAKFLKIGLADPVPVGPPRNLNDIKFDPATYAIPTVNDPFGYLNLFGRPRDEDGTAYMDSDSRRRVFEKRFRKDVERGSEDARKAGGETGRAGAGLVKVIKEGMAGFESVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.92
2 0.93
3 0.93
4 0.9
5 0.9
6 0.9
7 0.87
8 0.84
9 0.81
10 0.81
11 0.78
12 0.8
13 0.77
14 0.72
15 0.7
16 0.66
17 0.68
18 0.6
19 0.55
20 0.48
21 0.41
22 0.43
23 0.4
24 0.36
25 0.31
26 0.31
27 0.35
28 0.4
29 0.49
30 0.51
31 0.58
32 0.59
33 0.56
34 0.55
35 0.49
36 0.43
37 0.36
38 0.28
39 0.19
40 0.18
41 0.16
42 0.17
43 0.17
44 0.16
45 0.14
46 0.17
47 0.18
48 0.18
49 0.18
50 0.15
51 0.14
52 0.17
53 0.17
54 0.14
55 0.12
56 0.14
57 0.2
58 0.25
59 0.32
60 0.32
61 0.36
62 0.42
63 0.43
64 0.43
65 0.4
66 0.34
67 0.29
68 0.29
69 0.26
70 0.24
71 0.22
72 0.2
73 0.2
74 0.2
75 0.21
76 0.2
77 0.18
78 0.15
79 0.18
80 0.17
81 0.17
82 0.16
83 0.13
84 0.12
85 0.11
86 0.12
87 0.12
88 0.11
89 0.1
90 0.09
91 0.09
92 0.11
93 0.11
94 0.09
95 0.07
96 0.1
97 0.1
98 0.11
99 0.11
100 0.1
101 0.11
102 0.11
103 0.1
104 0.1
105 0.09
106 0.1
107 0.15
108 0.17
109 0.17
110 0.19
111 0.22
112 0.22
113 0.3
114 0.31
115 0.29
116 0.28
117 0.3
118 0.31
119 0.3
120 0.31
121 0.24
122 0.22
123 0.2
124 0.17
125 0.14
126 0.12
127 0.11
128 0.09
129 0.08
130 0.07
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.06
136 0.07
137 0.07
138 0.08
139 0.08
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.07
149 0.07
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.05
154 0.04
155 0.03
156 0.04
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.09
165 0.11
166 0.11
167 0.14
168 0.15
169 0.17
170 0.2
171 0.22
172 0.2
173 0.19
174 0.18
175 0.15
176 0.14
177 0.12
178 0.08
179 0.07
180 0.07
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.07
185 0.09
186 0.11
187 0.13
188 0.14
189 0.15
190 0.16
191 0.18
192 0.2
193 0.21
194 0.21
195 0.2
196 0.28
197 0.31
198 0.38
199 0.45
200 0.52
201 0.56
202 0.58
203 0.61
204 0.57
205 0.6
206 0.62
207 0.59
208 0.58
209 0.52
210 0.52
211 0.56
212 0.53
213 0.47
214 0.39
215 0.32
216 0.24
217 0.22
218 0.19
219 0.1
220 0.1
221 0.1
222 0.09
223 0.09
224 0.09
225 0.1
226 0.1
227 0.11
228 0.12
229 0.11
230 0.15
231 0.17
232 0.25
233 0.27
234 0.27
235 0.33
236 0.34
237 0.37
238 0.33
239 0.31
240 0.24
241 0.23
242 0.23
243 0.17
244 0.16
245 0.12
246 0.12
247 0.14
248 0.15
249 0.14
250 0.13
251 0.13
252 0.12
253 0.12
254 0.13
255 0.12
256 0.11
257 0.15
258 0.17
259 0.17
260 0.19
261 0.2
262 0.22
263 0.24
264 0.24
265 0.21
266 0.21
267 0.25
268 0.23
269 0.21
270 0.18
271 0.17
272 0.17
273 0.2
274 0.23
275 0.21
276 0.24
277 0.26
278 0.34
279 0.42
280 0.51
281 0.59
282 0.63
283 0.7
284 0.74
285 0.78
286 0.79
287 0.78
288 0.77
289 0.72
290 0.65
291 0.62
292 0.63
293 0.56
294 0.49
295 0.41
296 0.31
297 0.26
298 0.28
299 0.25
300 0.2
301 0.21
302 0.21
303 0.21
304 0.2
305 0.19
306 0.16
307 0.14
308 0.15
309 0.15
310 0.13
311 0.13
312 0.13
313 0.13
314 0.12
315 0.12
316 0.11
317 0.1