FuNGI

C4R0H8

Protein Details

Accession

C4R0H8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
397-428	VLIKKHFSRSARRAKKRAWRLRRMAKEHQDIV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
401-421	KHFSRSARRAKKRAWRLRRMA

Subcellular Location(s)

nucl 15, cyto_nucl 14, cyto 11

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039768 Nmd3 IPR007064 Nmd3_N
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0005634 C:nucleus GO:0070180 F:large ribosomal subunit rRNA binding GO:0043023 F:ribosomal large subunit binding GO:0015031 P:protein transport GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus
KEGG	ppa:PAS_chr2-1_0380 -
Pfam	View protein in Pfam PF04981 NMD3

Amino Acid Sequences

MSNYTHLEPTEQQGVATVLCCNCGVPMDGTTGLVMCYDCIKLTVDITEGIPREANVSFCRNCERFLQPPGQWIRAELESRELLALCLRRLKGLNKVRLIDASFIWTEPHSRRIKVKLTVQGEAMTNTIIQQSFEVEYVVMAMQCPDCAKSFTANTWRAAVQVRQKVPHKRTFLHLEQLILKHNAHVDTISIKEAKDGLDFYYAQKNHAAKMIDFISSVAPVKSKKSEELVSADIHSGTSTYKFTFSVEIVPICRDDLIVLPKKLAHSLGTISRLVVCSKVSNTVQFIDPNTLQIADINSNVYFRDPFPVLCNRTELIEFIVLDVEPTGETRGNYILADITVARAADMGNNDQEYYVRSHLGGLLNPGDSADGYFLANSNFNSDLFDELDSKNVLDVVLIKKHFSRSARRAKKRAWRLRRMAKEHQDIVANDESRQAKQEQEKAERDYEIFLQELEEDPELRQTVNLYKADEPPAPENEADMDEDDDAPEIGVDELLDELDEMTLDE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.21
3	0.2
4	0.19
5	0.13
6	0.14
7	0.14
8	0.13
9	0.12
10	0.13
11	0.14
12	0.12
13	0.14
14	0.16
15	0.16
16	0.16
17	0.16
18	0.15
19	0.12
20	0.11
21	0.1
22	0.07
23	0.08
24	0.09
25	0.09
26	0.1
27	0.12
28	0.12
29	0.13
30	0.14
31	0.13
32	0.14
33	0.15
34	0.19
35	0.17
36	0.18
37	0.17
38	0.16
39	0.17
40	0.17
41	0.19
42	0.18
43	0.24
44	0.25
45	0.27
46	0.35
47	0.34
48	0.35
49	0.37
50	0.4
51	0.39
52	0.43
53	0.49
54	0.42
55	0.5
56	0.53
57	0.51
58	0.45
59	0.4
60	0.38
61	0.35
62	0.36
63	0.27
64	0.27
65	0.23
66	0.24
67	0.23
68	0.19
69	0.15
70	0.17
71	0.19
72	0.16
73	0.22
74	0.21
75	0.24
76	0.28
77	0.31
78	0.37
79	0.44
80	0.51
81	0.5
82	0.52
83	0.5
84	0.5
85	0.48
86	0.4
87	0.31
88	0.26
89	0.21
90	0.19
91	0.18
92	0.15
93	0.19
94	0.19
95	0.27
96	0.27
97	0.3
98	0.36
99	0.43
100	0.5
101	0.52
102	0.57
103	0.57
104	0.57
105	0.56
106	0.51
107	0.46
108	0.39
109	0.32
110	0.25
111	0.16
112	0.12
113	0.1
114	0.12
115	0.09
116	0.08
117	0.08
118	0.09
119	0.1
120	0.1
121	0.1
122	0.08
123	0.07
124	0.08
125	0.08
126	0.06
127	0.05
128	0.06
129	0.06
130	0.06
131	0.07
132	0.08
133	0.08
134	0.1
135	0.12
136	0.14
137	0.16
138	0.2
139	0.29
140	0.31
141	0.31
142	0.31
143	0.3
144	0.28
145	0.29
146	0.29
147	0.28
148	0.33
149	0.35
150	0.39
151	0.46
152	0.54
153	0.59
154	0.62
155	0.59
156	0.54
157	0.57
158	0.59
159	0.55
160	0.53
161	0.47
162	0.41
163	0.38
164	0.38
165	0.35
166	0.28
167	0.25
168	0.18
169	0.19
170	0.18
171	0.14
172	0.13
173	0.11
174	0.1
175	0.11
176	0.12
177	0.11
178	0.1
179	0.11
180	0.12
181	0.12
182	0.11
183	0.1
184	0.1
185	0.12
186	0.12
187	0.13
188	0.21
189	0.2
190	0.2
191	0.25
192	0.24
193	0.22
194	0.26
195	0.25
196	0.17
197	0.21
198	0.21
199	0.16
200	0.15
201	0.15
202	0.11
203	0.11
204	0.11
205	0.08
206	0.08
207	0.09
208	0.11
209	0.15
210	0.16
211	0.17
212	0.2
213	0.22
214	0.23
215	0.25
216	0.25
217	0.21
218	0.2
219	0.19
220	0.15
221	0.13
222	0.1
223	0.07
224	0.06
225	0.06
226	0.07
227	0.07
228	0.08
229	0.08
230	0.09
231	0.1
232	0.1
233	0.12
234	0.12
235	0.12
236	0.12
237	0.12
238	0.11
239	0.1
240	0.09
241	0.07
242	0.06
243	0.07
244	0.13
245	0.18
246	0.17
247	0.18
248	0.19
249	0.19
250	0.2
251	0.18
252	0.13
253	0.09
254	0.11
255	0.14
256	0.15
257	0.15
258	0.14
259	0.14
260	0.14
261	0.13
262	0.12
263	0.1
264	0.08
265	0.09
266	0.13
267	0.13
268	0.14
269	0.15
270	0.16
271	0.16
272	0.16
273	0.16
274	0.16
275	0.15
276	0.15
277	0.13
278	0.12
279	0.11
280	0.11
281	0.11
282	0.08
283	0.08
284	0.09
285	0.08
286	0.08
287	0.09
288	0.09
289	0.08
290	0.08
291	0.11
292	0.11
293	0.11
294	0.15
295	0.22
296	0.24
297	0.24
298	0.26
299	0.23
300	0.23
301	0.23
302	0.2
303	0.14
304	0.13
305	0.12
306	0.1
307	0.1
308	0.08
309	0.08
310	0.07
311	0.06
312	0.04
313	0.05
314	0.06
315	0.07
316	0.07
317	0.08
318	0.09
319	0.09
320	0.09
321	0.09
322	0.08
323	0.07
324	0.08
325	0.06
326	0.06
327	0.06
328	0.06
329	0.05
330	0.05
331	0.05
332	0.07
333	0.08
334	0.09
335	0.1
336	0.11
337	0.11
338	0.11
339	0.11
340	0.11
341	0.13
342	0.13
343	0.12
344	0.12
345	0.12
346	0.15
347	0.17
348	0.16
349	0.15
350	0.15
351	0.14
352	0.14
353	0.13
354	0.1
355	0.09
356	0.08
357	0.06
358	0.06
359	0.05
360	0.06
361	0.06
362	0.07
363	0.09
364	0.08
365	0.11
366	0.11
367	0.11
368	0.12
369	0.12
370	0.13
371	0.12
372	0.14
373	0.14
374	0.13
375	0.15
376	0.14
377	0.14
378	0.12
379	0.11
380	0.1
381	0.07
382	0.11
383	0.13
384	0.19
385	0.2
386	0.21
387	0.23
388	0.26
389	0.32
390	0.33
391	0.4
392	0.44
393	0.55
394	0.65
395	0.73
396	0.78
397	0.81
398	0.86
399	0.87
400	0.88
401	0.88
402	0.87
403	0.88
404	0.91
405	0.92
406	0.9
407	0.89
408	0.88
409	0.85
410	0.77
411	0.69
412	0.64
413	0.54
414	0.51
415	0.47
416	0.38
417	0.29
418	0.33
419	0.32
420	0.27
421	0.3
422	0.26
423	0.27
424	0.33
425	0.4
426	0.43
427	0.5
428	0.54
429	0.56
430	0.58
431	0.53
432	0.46
433	0.42
434	0.35
435	0.28
436	0.23
437	0.18
438	0.15
439	0.14
440	0.14
441	0.14
442	0.13
443	0.12
444	0.12
445	0.16
446	0.16
447	0.15
448	0.14
449	0.15
450	0.2
451	0.26
452	0.28
453	0.27
454	0.3
455	0.34
456	0.39
457	0.38
458	0.37
459	0.35
460	0.36
461	0.36
462	0.32
463	0.29
464	0.26
465	0.25
466	0.22
467	0.19
468	0.16
469	0.14
470	0.15
471	0.14
472	0.12
473	0.11
474	0.09
475	0.08
476	0.07
477	0.06
478	0.06
479	0.05
480	0.05
481	0.05
482	0.05
483	0.05
484	0.05
485	0.05
486	0.05

C4R0H8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer