Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2B053

Protein Details
Accession H2B053    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-57LYQRNSNQRSRSRSPSRRYPEYNEDRYHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
65-86RRFHPRRGRGGGGFRGRGRGGF
Subcellular Location(s) extr 9, E.R. 9, golg 6, vacu 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG kaf:KAFR_0I02240  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd21605  RRM1_HRB1_GBP2  
cd21606  RRM2_HRB1_GBP2  
cd21607  RRM3_HRB1_GBP2  
Amino Acid Sequences MIVFFSNLVPILLIFIVRAPFLFGVIFFLLYQRNSNQRSRSRSPSRRYPEYNEDRYHGRDYESSRRFHPRRGRGGGGFRGRGRGGFGYRGSYGGGSGFRGSRAPRFQRREPNYALGESGIAEDKNYDNSVFVGNLSFDCTGDDLRDLFSSIGRVISANIYYSHGRSKGMGTVEFEDTADVDEAINQLNDTMFMGRNIFLKPDSPPPNQNKFPRAQPLSHQQESLPQGYEVFIINLPYSATWQDLKDLFRESGDVLRADIELDYNGYSRGFGNVFYATKEEMYSAIDRFNGYDWNGRILEVREGKFNQINETSNENEFIDYNEVPSEKPSSTFTEGVIGGGEKTNLVYISNLPFATSIDDLYDLVESLGNVVHAELKFDETGSPTGVAIVEYEDMDYAETAMEKLNDYNYGGNELSVSYAQRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.09
3 0.09
4 0.09
5 0.1
6 0.1
7 0.1
8 0.11
9 0.11
10 0.09
11 0.12
12 0.13
13 0.13
14 0.11
15 0.13
16 0.15
17 0.16
18 0.19
19 0.2
20 0.28
21 0.33
22 0.4
23 0.48
24 0.53
25 0.61
26 0.65
27 0.71
28 0.74
29 0.79
30 0.81
31 0.82
32 0.83
33 0.83
34 0.83
35 0.81
36 0.81
37 0.8
38 0.8
39 0.73
40 0.67
41 0.62
42 0.59
43 0.55
44 0.45
45 0.38
46 0.35
47 0.38
48 0.45
49 0.46
50 0.45
51 0.46
52 0.55
53 0.55
54 0.59
55 0.63
56 0.63
57 0.67
58 0.72
59 0.73
60 0.69
61 0.74
62 0.74
63 0.7
64 0.65
65 0.56
66 0.54
67 0.47
68 0.41
69 0.37
70 0.32
71 0.28
72 0.27
73 0.27
74 0.26
75 0.26
76 0.26
77 0.23
78 0.19
79 0.16
80 0.13
81 0.13
82 0.1
83 0.11
84 0.11
85 0.11
86 0.14
87 0.16
88 0.21
89 0.3
90 0.38
91 0.47
92 0.54
93 0.62
94 0.7
95 0.75
96 0.75
97 0.71
98 0.68
99 0.61
100 0.54
101 0.46
102 0.35
103 0.28
104 0.21
105 0.17
106 0.11
107 0.08
108 0.07
109 0.08
110 0.08
111 0.1
112 0.11
113 0.1
114 0.09
115 0.1
116 0.11
117 0.1
118 0.09
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.1
123 0.09
124 0.08
125 0.08
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.09
130 0.07
131 0.08
132 0.08
133 0.09
134 0.08
135 0.08
136 0.09
137 0.08
138 0.08
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.11
147 0.11
148 0.12
149 0.15
150 0.15
151 0.15
152 0.15
153 0.15
154 0.17
155 0.18
156 0.18
157 0.17
158 0.19
159 0.19
160 0.18
161 0.17
162 0.13
163 0.11
164 0.1
165 0.08
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.05
178 0.05
179 0.06
180 0.07
181 0.07
182 0.09
183 0.09
184 0.1
185 0.09
186 0.1
187 0.11
188 0.19
189 0.25
190 0.26
191 0.34
192 0.41
193 0.48
194 0.53
195 0.56
196 0.52
197 0.48
198 0.49
199 0.51
200 0.46
201 0.4
202 0.37
203 0.43
204 0.46
205 0.44
206 0.41
207 0.32
208 0.35
209 0.36
210 0.33
211 0.24
212 0.16
213 0.15
214 0.15
215 0.16
216 0.1
217 0.08
218 0.07
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.05
224 0.06
225 0.06
226 0.07
227 0.08
228 0.08
229 0.11
230 0.13
231 0.14
232 0.15
233 0.17
234 0.15
235 0.14
236 0.15
237 0.13
238 0.13
239 0.14
240 0.12
241 0.1
242 0.11
243 0.1
244 0.1
245 0.09
246 0.07
247 0.05
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.09
259 0.11
260 0.12
261 0.12
262 0.13
263 0.12
264 0.12
265 0.12
266 0.1
267 0.08
268 0.1
269 0.11
270 0.11
271 0.11
272 0.11
273 0.11
274 0.11
275 0.12
276 0.12
277 0.12
278 0.17
279 0.16
280 0.2
281 0.2
282 0.2
283 0.21
284 0.2
285 0.26
286 0.26
287 0.26
288 0.27
289 0.28
290 0.32
291 0.33
292 0.32
293 0.3
294 0.27
295 0.29
296 0.26
297 0.29
298 0.28
299 0.25
300 0.26
301 0.22
302 0.19
303 0.17
304 0.16
305 0.16
306 0.13
307 0.13
308 0.13
309 0.14
310 0.13
311 0.15
312 0.16
313 0.13
314 0.14
315 0.17
316 0.21
317 0.25
318 0.26
319 0.24
320 0.25
321 0.25
322 0.23
323 0.21
324 0.15
325 0.11
326 0.11
327 0.11
328 0.07
329 0.07
330 0.08
331 0.07
332 0.07
333 0.08
334 0.1
335 0.13
336 0.16
337 0.16
338 0.15
339 0.15
340 0.15
341 0.17
342 0.15
343 0.12
344 0.1
345 0.11
346 0.11
347 0.11
348 0.11
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.06
353 0.06
354 0.07
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.11
359 0.1
360 0.13
361 0.13
362 0.15
363 0.15
364 0.16
365 0.17
366 0.15
367 0.16
368 0.16
369 0.16
370 0.13
371 0.13
372 0.13
373 0.12
374 0.09
375 0.09
376 0.09
377 0.08
378 0.09
379 0.08
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.07
384 0.06
385 0.06
386 0.07
387 0.09
388 0.09
389 0.1
390 0.11
391 0.13
392 0.15
393 0.16
394 0.19
395 0.18
396 0.22
397 0.21
398 0.19
399 0.18
400 0.16
401 0.17
402 0.15