FuNGI

H2AVI0

Protein Details

Accession

H2AVI0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
398-430	PDVVLVKKLYKRKNKKNRNWKLKRMARERADID	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
405-424	KLYKRKNKKNRNWKLKRMAR

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039768 Nmd3 IPR007064 Nmd3_N
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0043023 F:ribosomal large subunit binding GO:0015031 P:protein transport
KEGG	kaf:KAFR_0E02270 -
Pfam	View protein in Pfam PF04981 NMD3

Amino Acid Sequences

MEFNQAQYGQALQGQEQMGATVLCCNCGTPIDGSGGLVMCYDCIKMTVDISEGIPREANVSFCRNCERFLQPPGQWIRADLESRELLAICLRRLKGLTKVRLVDASFIWTEPHSRRIRVKLTVQGEAMAGTIIQQTFEVEYIVIAMQCPDCARSYTTNTWRATVQIRQKVPHKRTFLFLEQLILKHNAHVDTISISESRDGLDFFYAQKNHAVKMIDFLNSVVPIKYKKSEELISQDTHTGSSTYKFSYSVEIVPICRDDLVVLPKKLAKSMGDISQFVLCSKISNTVQFIDPTTLQIADLSPSVYWRYNFPPLADASQLVEFIVLDVESTGISRGKNVLADVCVARASDLGVNDQVYYIKSHLGGIIHAGDTVMGYFVSNSNYNSDLFDGLQLDYVPDVVLVKKLYKRKNKKNRNWKLKRMARERADIDASQDYNDRTQRQEMERAERDYELFLQELEEDEELRQKINLYKNQKQPENGVQSTVDDGDDEDEDAPEINIDELLDELDEMTLEDTPMED

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.18
3	0.16
4	0.15
5	0.14
6	0.13
7	0.12
8	0.14
9	0.13
10	0.15
11	0.15
12	0.15
13	0.15
14	0.16
15	0.18
16	0.13
17	0.15
18	0.16
19	0.16
20	0.16
21	0.16
22	0.15
23	0.13
24	0.12
25	0.1
26	0.07
27	0.08
28	0.08
29	0.07
30	0.08
31	0.1
32	0.1
33	0.12
34	0.12
35	0.13
36	0.14
37	0.15
38	0.19
39	0.17
40	0.17
41	0.17
42	0.16
43	0.17
44	0.17
45	0.19
46	0.18
47	0.24
48	0.24
49	0.27
50	0.35
51	0.33
52	0.34
53	0.37
54	0.39
55	0.38
56	0.43
57	0.49
58	0.41
59	0.49
60	0.53
61	0.51
62	0.45
63	0.4
64	0.38
65	0.35
66	0.35
67	0.27
68	0.27
69	0.23
70	0.24
71	0.23
72	0.19
73	0.15
74	0.17
75	0.19
76	0.16
77	0.22
78	0.21
79	0.22
80	0.24
81	0.27
82	0.32
83	0.39
84	0.45
85	0.46
86	0.48
87	0.48
88	0.5
89	0.47
90	0.4
91	0.31
92	0.28
93	0.21
94	0.19
95	0.18
96	0.14
97	0.19
98	0.19
99	0.27
100	0.27
101	0.32
102	0.38
103	0.45
104	0.51
105	0.53
106	0.57
107	0.56
108	0.56
109	0.55
110	0.48
111	0.41
112	0.35
113	0.28
114	0.22
115	0.13
116	0.09
117	0.06
118	0.07
119	0.06
120	0.06
121	0.06
122	0.07
123	0.07
124	0.08
125	0.07
126	0.05
127	0.05
128	0.06
129	0.06
130	0.06
131	0.05
132	0.06
133	0.06
134	0.06
135	0.07
136	0.07
137	0.08
138	0.1
139	0.13
140	0.16
141	0.22
142	0.3
143	0.38
144	0.44
145	0.44
146	0.44
147	0.41
148	0.4
149	0.37
150	0.36
151	0.37
152	0.38
153	0.4
154	0.43
155	0.5
156	0.58
157	0.61
158	0.62
159	0.6
160	0.53
161	0.55
162	0.57
163	0.53
164	0.47
165	0.4
166	0.35
167	0.29
168	0.28
169	0.26
170	0.23
171	0.19
172	0.16
173	0.18
174	0.15
175	0.13
176	0.13
177	0.11
178	0.09
179	0.1
180	0.1
181	0.08
182	0.08
183	0.08
184	0.08
185	0.08
186	0.07
187	0.07
188	0.07
189	0.07
190	0.07
191	0.08
192	0.14
193	0.13
194	0.14
195	0.19
196	0.19
197	0.19
198	0.22
199	0.22
200	0.17
201	0.2
202	0.21
203	0.16
204	0.15
205	0.15
206	0.12
207	0.12
208	0.12
209	0.09
210	0.09
211	0.09
212	0.12
213	0.15
214	0.16
215	0.17
216	0.2
217	0.22
218	0.24
219	0.28
220	0.29
221	0.27
222	0.26
223	0.25
224	0.21
225	0.19
226	0.17
227	0.12
228	0.09
229	0.09
230	0.1
231	0.09
232	0.1
233	0.1
234	0.1
235	0.12
236	0.13
237	0.12
238	0.13
239	0.13
240	0.12
241	0.12
242	0.12
243	0.1
244	0.08
245	0.07
246	0.06
247	0.07
248	0.13
249	0.18
250	0.17
251	0.18
252	0.2
253	0.2
254	0.21
255	0.2
256	0.14
257	0.14
258	0.16
259	0.21
260	0.2
261	0.21
262	0.21
263	0.21
264	0.2
265	0.16
266	0.14
267	0.09
268	0.08
269	0.08
270	0.13
271	0.12
272	0.14
273	0.15
274	0.16
275	0.17
276	0.17
277	0.17
278	0.13
279	0.13
280	0.12
281	0.11
282	0.1
283	0.09
284	0.08
285	0.08
286	0.06
287	0.06
288	0.06
289	0.05
290	0.06
291	0.08
292	0.1
293	0.1
294	0.12
295	0.16
296	0.22
297	0.23
298	0.22
299	0.23
300	0.22
301	0.24
302	0.22
303	0.18
304	0.13
305	0.13
306	0.12
307	0.1
308	0.08
309	0.06
310	0.06
311	0.05
312	0.03
313	0.03
314	0.03
315	0.03
316	0.03
317	0.03
318	0.04
319	0.06
320	0.06
321	0.07
322	0.08
323	0.09
324	0.1
325	0.1
326	0.11
327	0.1
328	0.12
329	0.11
330	0.11
331	0.1
332	0.09
333	0.09
334	0.07
335	0.08
336	0.08
337	0.08
338	0.09
339	0.1
340	0.1
341	0.1
342	0.1
343	0.1
344	0.09
345	0.1
346	0.09
347	0.09
348	0.09
349	0.1
350	0.11
351	0.11
352	0.1
353	0.1
354	0.11
355	0.1
356	0.09
357	0.09
358	0.07
359	0.06
360	0.06
361	0.05
362	0.03
363	0.03
364	0.04
365	0.05
366	0.08
367	0.09
368	0.1
369	0.12
370	0.13
371	0.14
372	0.14
373	0.14
374	0.13
375	0.12
376	0.12
377	0.11
378	0.1
379	0.11
380	0.1
381	0.09
382	0.08
383	0.08
384	0.06
385	0.05
386	0.06
387	0.05
388	0.08
389	0.09
390	0.13
391	0.19
392	0.28
393	0.37
394	0.48
395	0.59
396	0.68
397	0.78
398	0.85
399	0.9
400	0.93
401	0.95
402	0.96
403	0.95
404	0.95
405	0.95
406	0.92
407	0.91
408	0.89
409	0.88
410	0.82
411	0.8
412	0.72
413	0.66
414	0.62
415	0.51
416	0.46
417	0.4
418	0.35
419	0.27
420	0.27
421	0.23
422	0.25
423	0.29
424	0.28
425	0.26
426	0.31
427	0.37
428	0.39
429	0.47
430	0.47
431	0.52
432	0.55
433	0.56
434	0.52
435	0.47
436	0.43
437	0.37
438	0.33
439	0.25
440	0.19
441	0.15
442	0.14
443	0.13
444	0.13
445	0.12
446	0.11
447	0.1
448	0.1
449	0.16
450	0.16
451	0.16
452	0.16
453	0.16
454	0.23
455	0.31
456	0.4
457	0.44
458	0.53
459	0.62
460	0.71
461	0.74
462	0.71
463	0.69
464	0.7
465	0.7
466	0.62
467	0.55
468	0.46
469	0.41
470	0.4
471	0.33
472	0.23
473	0.13
474	0.13
475	0.12
476	0.12
477	0.12
478	0.1
479	0.09
480	0.1
481	0.1
482	0.09
483	0.08
484	0.08
485	0.07
486	0.07
487	0.06
488	0.06
489	0.06
490	0.06
491	0.06
492	0.06
493	0.05
494	0.05
495	0.05
496	0.05
497	0.06
498	0.06
499	0.06

H2AVI0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer