FuNGI

H2APF1

Protein Details

Accession

H2APF1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-20	MTPTVKKSNKRSEPEQAGSK	Hydrophilic
78-97	NNHVEQRKLLKERKMQRRAG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto_nucl 11.833, cyto_mito 4.166, mito 3.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR012959 CPL_dom IPR033133 PUM-HD IPR040059 PUM3 IPR001313 Pumilio_RNA-bd_rpt
Gene Ontology	GO:0003729 F:mRNA binding GO:0017148 P:negative regulation of translation GO:0065008 P:regulation of biological quality
KEGG	kaf:KAFR_0A08170 -
Pfam	View protein in Pfam PF08144 CPL
PROSITE	View protein in PROSITE PS50302 PUM PS50303 PUM_HD

Amino Acid Sequences

MTPTVKKSNKRSEPEQAGSKTVKKARISVESSEDELDELDDLDVDEEEEEFEDEDEKEVEEGEEESGEEKKEEGAGSNNHVEQRKLLKERKMQRRAGSEIAQIKPIWEKLRCKSPPLPVEIREKLCNEIWEIAKDHIADLVLKHDASRVVQTLVKFSNKERRELICKALTGKFYQLATSSYGKYLLVKLLHYGSRDSRQLIIDELHGGLRKLMRHREGAYVVEDLFVLYSTHEQRQQMIREFWGSEYAVFRDNHGGLTIEDVTKDNIEKRNIISRNLMGTITASVEKGSAGFQILHAAMKELVKIANDKETSELIELLHEQFAELVHTPEGCFVACTLIAKATAKERKSILKTLKNHASELIKNEHGNLVFITLLMCVDDTVLVFKTFNSTIKESLNEFVVDKYGRRPFLYMLLGLDGKYFSPIIKKELTHYAVLSANTSKKDPVIRKHELLDKFALVFLNSILKNYSEILLDNFGCQFVAECLTNDGFYKELNEEGEAKFNELIDTIITLFKGDITEEDHPIHKPFSVRLLKSLIQGGNWNNKLRKLEPLGSVQGLGVPFATKFYEDIIDSSNLLSWINEPDSSFTVVALYESLKGKNEGKQFIKDLKSVSKKIEESESNKGARLLLKLMAQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.81
2	0.8
3	0.71
4	0.67
5	0.64
6	0.62
7	0.6
8	0.57
9	0.57
10	0.51
11	0.55
12	0.56
13	0.6
14	0.59
15	0.55
16	0.56
17	0.51
18	0.5
19	0.44
20	0.37
21	0.28
22	0.23
23	0.19
24	0.12
25	0.1
26	0.07
27	0.06
28	0.06
29	0.07
30	0.06
31	0.06
32	0.06
33	0.06
34	0.06
35	0.07
36	0.07
37	0.07
38	0.07
39	0.09
40	0.09
41	0.1
42	0.1
43	0.1
44	0.1
45	0.1
46	0.09
47	0.09
48	0.09
49	0.08
50	0.08
51	0.08
52	0.09
53	0.1
54	0.11
55	0.1
56	0.1
57	0.1
58	0.12
59	0.12
60	0.13
61	0.17
62	0.2
63	0.24
64	0.28
65	0.3
66	0.33
67	0.34
68	0.33
69	0.32
70	0.37
71	0.41
72	0.46
73	0.51
74	0.55
75	0.63
76	0.73
77	0.79
78	0.8
79	0.79
80	0.78
81	0.78
82	0.75
83	0.71
84	0.65
85	0.61
86	0.59
87	0.52
88	0.48
89	0.4
90	0.35
91	0.33
92	0.34
93	0.33
94	0.32
95	0.38
96	0.41
97	0.52
98	0.53
99	0.56
100	0.58
101	0.62
102	0.62
103	0.62
104	0.62
105	0.56
106	0.63
107	0.63
108	0.6
109	0.55
110	0.5
111	0.45
112	0.42
113	0.38
114	0.32
115	0.3
116	0.28
117	0.26
118	0.27
119	0.24
120	0.24
121	0.23
122	0.2
123	0.16
124	0.15
125	0.12
126	0.1
127	0.12
128	0.11
129	0.11
130	0.11
131	0.12
132	0.13
133	0.13
134	0.16
135	0.15
136	0.15
137	0.18
138	0.18
139	0.21
140	0.24
141	0.26
142	0.24
143	0.28
144	0.36
145	0.35
146	0.39
147	0.39
148	0.42
149	0.45
150	0.47
151	0.49
152	0.43
153	0.43
154	0.43
155	0.42
156	0.38
157	0.32
158	0.31
159	0.28
160	0.24
161	0.23
162	0.2
163	0.17
164	0.19
165	0.21
166	0.19
167	0.16
168	0.17
169	0.16
170	0.16
171	0.16
172	0.16
173	0.15
174	0.14
175	0.15
176	0.18
177	0.2
178	0.2
179	0.21
180	0.21
181	0.25
182	0.26
183	0.26
184	0.25
185	0.24
186	0.24
187	0.23
188	0.2
189	0.16
190	0.15
191	0.13
192	0.12
193	0.12
194	0.11
195	0.11
196	0.12
197	0.15
198	0.19
199	0.26
200	0.28
201	0.31
202	0.33
203	0.37
204	0.36
205	0.34
206	0.31
207	0.25
208	0.22
209	0.18
210	0.15
211	0.1
212	0.08
213	0.07
214	0.05
215	0.04
216	0.08
217	0.1
218	0.13
219	0.16
220	0.17
221	0.2
222	0.26
223	0.31
224	0.32
225	0.31
226	0.3
227	0.29
228	0.29
229	0.26
230	0.22
231	0.18
232	0.13
233	0.13
234	0.13
235	0.16
236	0.15
237	0.16
238	0.17
239	0.17
240	0.16
241	0.15
242	0.15
243	0.1
244	0.12
245	0.12
246	0.09
247	0.09
248	0.1
249	0.1
250	0.09
251	0.1
252	0.12
253	0.16
254	0.18
255	0.19
256	0.2
257	0.29
258	0.3
259	0.31
260	0.3
261	0.27
262	0.27
263	0.26
264	0.24
265	0.15
266	0.14
267	0.12
268	0.1
269	0.09
270	0.07
271	0.06
272	0.06
273	0.06
274	0.06
275	0.06
276	0.05
277	0.05
278	0.05
279	0.05
280	0.07
281	0.08
282	0.08
283	0.07
284	0.07
285	0.08
286	0.08
287	0.08
288	0.06
289	0.07
290	0.07
291	0.08
292	0.08
293	0.13
294	0.13
295	0.13
296	0.14
297	0.14
298	0.14
299	0.14
300	0.13
301	0.08
302	0.08
303	0.08
304	0.07
305	0.07
306	0.06
307	0.05
308	0.05
309	0.05
310	0.06
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.06
315	0.06
316	0.06
317	0.07
318	0.05
319	0.05
320	0.04
321	0.05
322	0.05
323	0.06
324	0.05
325	0.06
326	0.07
327	0.07
328	0.08
329	0.14
330	0.2
331	0.2
332	0.23
333	0.24
334	0.31
335	0.34
336	0.4
337	0.41
338	0.44
339	0.48
340	0.53
341	0.59
342	0.53
343	0.5
344	0.46
345	0.41
346	0.35
347	0.34
348	0.31
349	0.25
350	0.23
351	0.24
352	0.23
353	0.19
354	0.17
355	0.13
356	0.1
357	0.08
358	0.07
359	0.07
360	0.05
361	0.05
362	0.04
363	0.04
364	0.03
365	0.03
366	0.03
367	0.03
368	0.04
369	0.05
370	0.05
371	0.06
372	0.06
373	0.09
374	0.1
375	0.13
376	0.16
377	0.17
378	0.19
379	0.2
380	0.22
381	0.2
382	0.2
383	0.18
384	0.15
385	0.14
386	0.12
387	0.13
388	0.12
389	0.11
390	0.17
391	0.2
392	0.21
393	0.21
394	0.23
395	0.21
396	0.26
397	0.27
398	0.21
399	0.17
400	0.18
401	0.17
402	0.16
403	0.15
404	0.09
405	0.08
406	0.08
407	0.08
408	0.06
409	0.11
410	0.12
411	0.16
412	0.2
413	0.2
414	0.23
415	0.3
416	0.32
417	0.29
418	0.27
419	0.26
420	0.25
421	0.25
422	0.23
423	0.18
424	0.19
425	0.19
426	0.2
427	0.18
428	0.18
429	0.25
430	0.3
431	0.36
432	0.43
433	0.47
434	0.49
435	0.53
436	0.58
437	0.53
438	0.5
439	0.43
440	0.35
441	0.29
442	0.27
443	0.23
444	0.15
445	0.13
446	0.1
447	0.14
448	0.13
449	0.13
450	0.13
451	0.13
452	0.14
453	0.14
454	0.15
455	0.09
456	0.1
457	0.11
458	0.14
459	0.13
460	0.13
461	0.12
462	0.11
463	0.11
464	0.1
465	0.09
466	0.06
467	0.09
468	0.09
469	0.09
470	0.12
471	0.12
472	0.13
473	0.13
474	0.13
475	0.1
476	0.1
477	0.12
478	0.1
479	0.11
480	0.11
481	0.12
482	0.14
483	0.15
484	0.21
485	0.19
486	0.2
487	0.19
488	0.18
489	0.17
490	0.14
491	0.14
492	0.08
493	0.08
494	0.08
495	0.08
496	0.07
497	0.08
498	0.07
499	0.07
500	0.08
501	0.07
502	0.07
503	0.12
504	0.15
505	0.17
506	0.19
507	0.2
508	0.22
509	0.23
510	0.23
511	0.2
512	0.19
513	0.19
514	0.27
515	0.34
516	0.33
517	0.35
518	0.4
519	0.4
520	0.41
521	0.45
522	0.36
523	0.29
524	0.33
525	0.34
526	0.38
527	0.41
528	0.45
529	0.41
530	0.45
531	0.49
532	0.45
533	0.49
534	0.46
535	0.48
536	0.46
537	0.49
538	0.48
539	0.44
540	0.42
541	0.33
542	0.29
543	0.22
544	0.18
545	0.12
546	0.09
547	0.08
548	0.09
549	0.1
550	0.08
551	0.09
552	0.11
553	0.13
554	0.13
555	0.15
556	0.17
557	0.18
558	0.17
559	0.17
560	0.17
561	0.14
562	0.14
563	0.12
564	0.1
565	0.13
566	0.15
567	0.16
568	0.15
569	0.18
570	0.2
571	0.23
572	0.22
573	0.17
574	0.16
575	0.15
576	0.14
577	0.12
578	0.1
579	0.11
580	0.14
581	0.15
582	0.17
583	0.21
584	0.24
585	0.3
586	0.37
587	0.42
588	0.45
589	0.5
590	0.53
591	0.58
592	0.59
593	0.55
594	0.52
595	0.54
596	0.58
597	0.55
598	0.55
599	0.55
600	0.53
601	0.53
602	0.57
603	0.55
604	0.52
605	0.58
606	0.58
607	0.51
608	0.51
609	0.48
610	0.42
611	0.38
612	0.35
613	0.29

H2APF1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer